CRISPR/Cas9 产生的双链断裂的致突变结果取决于切割两侧的序列和细胞 DNA 损伤修复。这些特征之间的相互作用在很大程度上尚未得到探索,这限制了我们理解和操纵结果的能力。在这里,我们测量了 18 个修复基因的缺失如何改变小鼠胚胎干细胞中 2,838 个合成靶序列中 Cas9 双链断裂产生的 83,680 个独特突变结果的频率。这项大规模调查使我们能够以无偏见的方式对结果进行分类,从而产生有关双链断裂修复新模式的假设。我们的数据表明,Prkdc(DNA-PKcs 蛋白)和 Polm(Polμ)在创建与 Cas9 切口近端核苷酸(相对于原间隔区相邻基序 (PAM))相匹配的 1bp 插入方面发挥着特殊作用,Nbn(NBN)和 Polq(Polθ)在创建不同的删除结果方面发挥着不同的作用,并且存在一类独特的单向删除结果,这些结果既依赖于末端保护基因 Xrcc5(Ku80),也依赖于切除基因 Nbn(NBN)。我们利用修复环境中可重复变异的知识,建立了 Cas9 断裂诱变结果的预测模型,该模型优于当前标准。这项工作提高了我们对 DNA 修复基因功能的理解,并为更精确地调节 CRISPR/Cas9 产生的突变提供了途径。
肾细胞癌(RCC)是一种恶性肿瘤,占成年癌症的3%,20% - 30%的患者在开始时被诊断为转移性RCC,而转移性RCC全身治疗的中位总生存期(OS)范围为16个月至16个月至50个月。免疫疗法是一种依赖于免疫细胞和肿瘤细胞特异性结合的新型疗法,可能是晚期肾细胞癌的潜在疗法。虽然已经在各种实体瘤中研究了嵌合抗原受体NK细胞(CAR-NK)疗法,但几个团队也报道了对其在RCC的应用的特定研究。在这篇综述中,我们介绍了NK细胞的细胞毒性机制,总结了RCC和NK细胞之间的联系,并对肾细胞癌Carcinaloma Car-NK治疗发布了新的见解。迄今为止,重点关注肾细胞癌和NK细胞的大多数研究仅声称NK细胞细胞毒性和NK细胞免疫抑制甚至免疫逃生的机制,但所涉及的分子也可能是肾细胞癌Carcinaroma carcinoma carcinoma car-NK疗法的有趣靶标。
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b'由于 TGF- 信号在免疫稳态中的作用,其紊乱是炎症性疾病的根本原因。许多慢性炎症性疾病都以纤维化为特征,纤维化与细胞外基质的过度沉积同时发生,导致受影响器官的正常功能丧失。TGF- 家族还通过激活成纤维细胞向肌成纤维细胞表型转变,在纤维化的启动和进展中发挥着重要作用。在肿瘤发生的早期阶段,TGF- 可能通过诱导肿瘤前细胞的细胞停滞和凋亡而充当肿瘤抑制因子。然而,在后期,当癌细胞获得致癌突变,从而脱离 TGF- 肿瘤抑制因子功能时,它会通过刺激肿瘤细胞进行上皮\xe2\x80\x93间质转化 (EMT) 而成为肿瘤促进剂,从而增加迁移和侵袭。 TGF- 在肿瘤微环境内的免疫抑制中也发挥着核心作用,最近的研究揭示了它在肿瘤免疫逃避和癌症免疫治疗反应不佳中的作用。'
对应作者:Albert-Einstein-Allee Internechance I Alexander Kleger教授,Albert-Einstein-Allee 23,89081 Ulm,德国,电话: +49-731-500-44728,传真: +49-731-731-500-444612,Alexander.klegleni-umi-ulm.dee; CécileJulier,内分泌学,代谢和糖尿病系,科钦研究所,24 Rue du Faubourg Saint-Jacques,75014法国巴黎,电话:+33.1.44.41.41.22.33#这些作者为这项工作做出了同样的贡献。*这些作者也同样贡献。作者贡献AP,SH,IGC和VS被获取,分析和解释数据,起草和修改工作。AP对项目的人类遗传部分进行了统计,遗传和生物信息学分析。SH对RNA,ATAC-SEQ和质谱法进行了PSC和准备样品的功能研究。IGC对项目进行了并定向生物信息学分析。与糖尿病患者及其家人以及德国队列的测序和基因分型。MB,ZL和GK获得了数据并进行了数据分析。ad,pz,hn,ES,TK,MW,CB,RO,JFD,BK,CDR获得了该项目的数据。MB,RG,MHE和TS修订了手稿。具体来说,MB和AI进行了hESC和初始功能分析的基因编辑。Zl,GK和XZ进行了chip-seq,Zl,GK和MSC进行ATAC-SEQ和ZL,GK,MSC和QL RNA-SEQ生物信息信息分析。RR获得了数据并对工作进行了大量修订。MHO对患者成纤维细胞和IPSC分析进行了重编程。SL解释了数据并修改了工作。JRB生成的记者ESC线路。对WES数据进行了生物信息学分析,并在临床上描述了黎巴嫩患者及其家人的PZ。MSA解释了提供的数据,提供了材料,修改了工作。JK获得并分析了质谱数据。AW awed并提供了RG提供芯片序列数据。 kg,JC解释了遗传学数据,而GN提供了来自分化MEL1 HESC的RNA。 Bob,FO,MN,CJ和AK负责获取和分析数据的起草和修订。 此外,鲍勃(Bob)也指导了有关德国患者队列和解释遗传学数据的研究,FO表达和分析了TFS和ONECUT1变体,MN确定并临床表征了患者1及其大家庭,并解释了人类的遗传和临床数据。 此外,CJ和AK设计了工作,解释了数据并用所有作者的输入起草了手稿。 cj指导项目的遗传部分,并进行了人类遗传分析。 AK指导该项目的功能研究。AW awed并提供了RG提供芯片序列数据。kg,JC解释了遗传学数据,而GN提供了来自分化MEL1 HESC的RNA。Bob,FO,MN,CJ和AK负责获取和分析数据的起草和修订。此外,鲍勃(Bob)也指导了有关德国患者队列和解释遗传学数据的研究,FO表达和分析了TFS和ONECUT1变体,MN确定并临床表征了患者1及其大家庭,并解释了人类的遗传和临床数据。此外,CJ和AK设计了工作,解释了数据并用所有作者的输入起草了手稿。cj指导项目的遗传部分,并进行了人类遗传分析。AK指导该项目的功能研究。
进化是小步前进还是大步前进?进化的可重复性如何?进化过程受到多大限制?回答进化生物学中这些长期存在的问题对于理解现存生物多样性如何进化以及预测未来生物和生态系统如何应对不断变化的环境都是必不可少的。了解自然种群表型多样化和物种形成的遗传基础是正确回答这些问题的关键。基因组测序技术的飞跃使得研究遗传结构以及识别自然种群中适应和物种形成的变异位点变得越来越容易。此外,基因组编辑技术的最新进展使得研究自然种群生物中每个候选基因的功能成为可能。在本文中,我们讨论了这些最新技术进步如何使分析致病基因和突变成为可能,以及这种分析如何帮助回答长期存在的进化生物学问题。本文是主题期刊“适应和物种形成的遗传基础:从位点到致病突变”的一部分。
理论上,将冰岛突变引入阿尔茨海默病高风险人群的基因组中可以预防或减缓疾病的进展。“不幸的是,我们无法回到过去修复导致神经元死亡的损伤,”研究人员说。“因此,这种治疗方法特别适合受遗传性疾病影响的家庭,这种疾病表现为 35 至 40 岁之间的记忆问题。如果成功,它还可能用于治疗最常见的阿尔茨海默病患者,这种疾病发生在 65 岁以后,是疾病的早期迹象。”
摘要:异质性超导性发作是Cuprate和基于铁的家族的高-T C超级导管的常见现象。它是由从金属到零抗性状态的相当广泛的过渡表现出来的。通常,在这些强烈的各向异性材料中,超构型(SC)首先显示为孤立域。这会导致t c以上的各向异性过量电导率,并且传输测量值提供了有关样品内部深处的SC结构域结构的宝贵信息。在大量样品中,这种各向异性SC发作给出了SC晶粒的平均形状,而在薄样品中,这也表明SC晶粒的平均大小。在这项工作中,在各种厚度的FESE样品中,测量了层中的和内层的电阻率。为了测量层间电阻率,使用FIB制造了跨层的FESE MESA结构。随着样品厚度的降低,观察到超导过渡温度T C的显着增加:T C在厚度〜40 nm的微生物中从散装物质的8 K提高到12 K。我们应用了分析和数值计算来分析这些数据和早期数据,并发现了FESE中SC域的纵横比和大小与我们的电阻率和Diamamnetic响应测量相一致。我们提出了一种简单且相当准确的方法,用于估计各种小厚度样品中T C各向异性的SC域的长宽比。讨论了FESE中的nematic和超导域之间的关系。我们还将分析公式推广到异质各向异性超级导管中的电导率,以与两个具有相等体积分数的两个垂直方向的细长SC结构域的情况,对应于基于Fe的各种FE基超导体中的nematic结构域结构。