缩写:Ad5,腺病毒 5 型;Ad35,腺病毒 35 型;AFP,甲胎蛋白;CAR,柯萨奇病毒和腺病毒受体;CEA,癌胚抗原;CTC,循环肿瘤细胞;ctDNA,无细胞肿瘤 DNA;EGFP,增强型绿色荧光蛋白;EMT,上皮-间质转化;EV,细胞外囊泡;FSP1,成纤维细胞特异性蛋白 1;GFP,绿色荧光蛋白;HCC,肝细胞癌;HSV1,人类单纯病毒 1 型;hTERT,人类端粒酶逆转录酶;Id1,DNA 结合抑制剂 1;IL-1β,白细胞介素-1β;miRNA,微小 RNA;PDAC,胰腺导管腺癌;PDT,光动力疗法;PSA,前列腺特异性抗原;PSES,前列腺特异性增强子序列; PSMA,前列腺特异性膜抗原;RFP,红色荧光蛋白;ROS,活性氧;SEAP,分泌性胚胎碱性磷酸酶;TME,肿瘤微环境。
hc =健康对照; OC =口腔癌; OSCC =口腔鳞状细胞癌; OSMF =口服粘膜纤维化; op = oropharynx; HNSCC =头颈鳞状细胞癌; PML =预先病变; 8-OHDG = 8-羟基氧鸟苷; kif1a =运动蛋白家庭成员1a; EDNRB =内皮素受体B型; timp3 =金属蛋白酶3的组织抑制剂3; pCQAP = PC2谷氨酰胺/Q-富蛋白; PCR =聚合酶链反应; DAPK1 =与死亡相关的蛋白激酶1; OSMF =口服粘膜纤维化; RT-QMSP =实时定量甲基化特异性PCR;磷酸src =磷酸化src; TC =舌头癌; MSP =甲基化特异性PCR; maspin =乳腺丝氨酸蛋白酶抑制剂陷阱=端粒酶重复放大方案; mgmt =甲基鸟氨酸-DNA-甲基转移酶; raASF1A =含含域的含有域的蛋白; Med15 =介体复合体亚基15
摘要:端粒是专门的结构,在真核细胞中线性染色体的末端发现,在维持基因组的稳定性和完整性方面起着至关重要的作用。它们由重复的DNA序列,ssDNA悬垂和几种相关的蛋白质组成。端粒的长度与人类的细胞衰老有关,维持的缺陷与各种疾病有关。端粒的关键结构基序可保护脆弱的染色体末端。端粒DNA还具有形成各种复杂DNA高阶结构的能力,包括T环,D环,R环,G-Loops,G-Quadruplexes和I-Motifs,在互补的C-rich链中。虽然已经确定了许多端粒上的基本蛋白质,但它们的相互作用和结构细节的复杂性仍未完全了解。这种观点强调了在理解与人类端粒相关的结构方面的最新进步。它强调了端粒的意义,探索各种端粒结构基序,并深入研究端粒和端粒酶的结构生物学。还讨论了有助于保护端粒的端粒环,其拓扑结构和相关蛋白质。
ATRX-在基因表达调节BRAF V600E中起关键作用 - 在高级神经胶质瘤中很少发现。在小儿种群TERT - 端粒酶逆转录酶中常见;突变时,允许无限的增殖激活;预后/存活率不佳所指出的EGFR - 表皮生长因子受体;在许多癌症中发现与预后不良有关的高EGFR表达 - 一种细胞中的蛋白质,当细胞准备分裂时会增加,而当过表达1p / 19q时,可能会预测预后不良 - 在寡头胶状胶质瘤中可见骨骼。与对化学疗法的更好反应和改善的生存IDH - 异位酸盐脱氢酶 - 阳性与低级肿瘤一致; Associated with a more favorable prognosis TP53 - plays a role in apoptosis and suppresses the cell cycle Involved in triggering the development and spread of glioblastoma MGMT - O6-methylguanine methyltransferase - involved in repairing DNA damage in cancer cells Tumor Mutational Burden TMB – refers to the total amount of cancer tissue in the body found in <3% of glioblastoma patients Microsatellite Instability – MSI-由MMR系统中的缺陷引起的,负责校正DNA复制过程中发生的不匹配。
肝细胞癌(HCC)是上皮起源的癌。虽然有几个因素,但特定的遗传和表观遗传景观定义了HCC的起始和进展。遗传突变,尤其是错义突变,通常是包括HCC在内的癌症发作的预测指标。具体而言,与端粒酶,TP53和β-catenin(CTNNB1)相关的突变是HCC中最常见的三个最常见突变基因之一。这些遗传突变定义了HCC的特定亚型,在miRNA表达和相互作用组方面表现出特定的表观遗传表达模式。在当前的研究中,我们在三种不同的细胞系Hepg2,Huh7和QGY7703之间对表现出不同的突变模式进行了多个miRNA的差异表达分析。这是第一个基于miRNA表达的HCC细胞系的研究。我们还确定了与显着差异表达的miRNA相关的富集途径,生物信息上预测了它们的靶标,并表征了相互作用。此外,我们根据癌症样品的突变状态对可公开可用数据集的小型RNA测序数据进行了分类,并计算了与体外数据相似的MiRNA的重叠,并预测了顶级HUB基因及其相关途径,并使用集成的BioEnformic方法预测了他们相关的途径。
摘要:基于铂的药物被广泛用于化学疗法中,用于各种类型的癌症,被认为至关重要。四位价铂(PT(iv))化合物已引起了很大的关注,并已在这些药物中进行了广泛的研究。传统上,PT(IV)化合物进入细胞后,将PT(IV)化合物还原为二价铂(Pt(ii)),引起DNA病变并表现出其抗肿瘤作用。但是,可用的证据表明,某些PT(IV)衍生物可能与传统机制有所不同,并通过其整体结构发挥其抗肿瘤效应。本综述主要集中于有关靶向PT(II)和PT(IV)的现有文献,并特别强调了它们的体内作用方式以及在多功能PT(IV)化合物中释放的还原性能。本综述提供了针对PT(II)衍生物采用的设计和合成策略的全面摘要,这些策略有选择地针对各种酶(葡萄糖受体,叶酸,端粒酶等)或物质(线粒体,油酸等)。此外,它可以彻底检查并总结了新型多功能PT(IV)化合物的合理设计,抗肿瘤机理以及还原性释放能力,例如针对P53-MDM2,COX-2,COX-2,脂质代谢,Dual Drugs和药物输送系统的化合物。最后,本综述旨在为新目标PT(IV)化合物的理性设计和开发提供理论支持。
5倍交叉验证评估结果(1,2)表明,由于电离辐射和基因突变的影响,胶质瘤占中枢神经系统原发性肿瘤的27%(3-6)。胶质瘤的发病率随年龄增长而增加(1,2,6-8),不同级别的胶质瘤发病率不同。根据恶性程度,胶质瘤病理分为I至IV级,其中II级及以下为低级别胶质瘤(LGG),III级及以上为高级别胶质瘤(HGG)(9)。例如,HGG患者的中位生存期(MST)通常小于2年,而患有HGG的HGG患者的MST仅为4至9个月。此外,分子研究已发现了可增强诊断和提供生物标志物的特征(10)。异柠檬酸脱氢酶 1 和 2 (IDH1/2) 突变以及 X 编码蛋白 (ATRX) 和 TP53 突变的存在提示弥漫性星形细胞瘤,而 IDH1/2 突变与 1p19q 缺失相结合则提示少突胶质细胞瘤 (10)。受体酪氨酸激酶基因的局部扩增、端粒酶逆转录酶 (TERT) 启动子突变以及 10 号和 13 号染色体的缺失和 7 号染色体的三体性是胶质母细胞瘤的显著特征,可用于诊断目的 (10)。此外,LGG 中 B-Raf 原癌基因 (BRAF) 基因融合和突变的存在以及 HGG 中组蛋白 H3 的突变的存在也可以作为
摘要:我们探讨了与 DNA 双链断裂反应和修复相关的基因缺陷导致口腔潜在恶性疾病 (OPMD) 恶性转化为口腔鳞状细胞癌 (OSCC) 的可能性。同源重组/范康尼贫血 (HR/FA) 缺陷,而非非同源末端连接缺陷,导致 DNA 修复途径似乎与易患 OSCC 的家族性疾病特征一致 (FA、布卢姆综合征、毛细血管扩张性共济失调);对于发生在年轻患者身上的 OSCC 来说也是如此,有时这些患者很少或没有接触过经典风险因素。即使在先天性角化不良症(一种也易患 OSCC 的端粒酶复合物疾病)中,维持端粒长度的尝试也涉及一条具有共享 HR 基因的途径。因此,HR/FA 途径中的缺陷似乎在易患 OSCC 的疾病中起着关键作用。还有一些证据表明,HR/FA 通路异常与偶发病例 OPMD 和 OSCC 的恶性转化有关。我们提供的数据表明,与致命细胞系相比,一系列 OPMD 衍生的永生角质形成细胞系中 HR/FA 基因以细胞周期依赖性方式过度表达。本研究中的观察结果有力地证明了 HA/FA DNA 修复通路在 OSCC 发展中的重要作用。
摘要 ◥ 由于缺乏同源模型,导致上皮细胞永生化的基因组畸变研究在技术上具有挑战性。为了解决这个问题,我们使用了不同遗传祖先的健康原发性乳腺腔上皮细胞及其 hTERT 永生化对应物来识别与永生化相关的转录组变化。TONSL(Tonsoku 样,DNA 修复蛋白)表达升高被确定为永生化过程中最早的事件之一。TONSL 位于染色体 8q24.3 上,在约 20% 的乳腺癌中被发现扩增。TONSL 本身使原发性乳腺上皮细胞永生化并增加端粒酶活性,但过度表达不足以导致肿瘤转化。然而,过表达特定致癌基因的 TONSL 永生化原代细胞在小鼠中产生了雌激素受体阳性腺癌。对约 600 个肿瘤的乳腺肿瘤微阵列的分析表明,过表达 TONSL 的肿瘤患者的总体生存率和无进展生存率较差。TONSL 增加了染色质对促癌转录因子(包括 NF-kB)的可及性,并限制了对肿瘤抑制因子 p53 的可及性。TONSL 过表达导致与 DNA 修复中心相关的基因表达发生显著变化,包括同源重组 (HR) 和范康尼贫血途径中几个基因的上调。与这些结果一致,过表达 TONSL 的原代细胞通过 HR 表现出上调的 DNA 修复。此外,TONSL 对
端粒酶逆转录酶(TERT)启动子突变经常发生在癌症中,与TERT表达和细胞增殖增加有关,并可能影响黑色素瘤的治疗方案。作为TERT表达在恶性黑色素瘤中的作用和TERT的非规范功能,我们的目的是通过分析几个高度注释的高度注释的黑色素瘤队列来扩展当前对TERT启动子突变和肿瘤进展中表达改变的知识。使用多元模型,我们发现在免疫检查点抑制下,没有用于TERT促进突变突变或TERT表达与黑色素瘤同龄人的存活率的稳定关联。然而,CD4+ T细胞的存在随TERT表达而增加,并且与耗尽标记的表达相关。虽然启动子突变的频率没有随着勃斯洛的厚度而变化,但在较薄的原始引起的转移中,TERT表达增加了。作为单细胞RNA - 序列(RNA-Seq)表明,TERT表达与细胞迁移的基因和细胞外基质的动力学有关,这表明TERT在侵袭和转移过程中的作用。在几个大肿瘤和单细胞RNA-seq队列中发现的共同调节基因也表明,与线粒体DNA稳定性和核DNA修复有关的TERT的非传统功能。这种模式在胶质母细胞瘤和其他实体中也很明显。因此,我们的研究增加了TERT表达在癌症转移中的作用,并可能具有免疫抵抗力。