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第7课，落叶森林生物群落的生物多样性如何？
落叶森林生物群落被人们大量人群。随着人口的成长，人们已经砍伐了树木以清理土地以供农业和定居点（建造房屋）。因此，落叶林的数量已经下降。，例如，400年前，西欧，英国和美国东部地区的大部分地区都覆盖了落叶林。去除森林通过减少生物群落中的树木数量和类型来降低生物多样性。因此，随着栖息地和粮食供应的下降，可以生存的动物的数量和类型会减少。
微生物群落概况的土壤元蛋白质组学
抽象土壤代表一个复杂而动态的生态系统，拥有无数的微生物，它们在营养循环和有机物转化中共存并起着至关重要的作用。在这些微生物中，细菌和真菌是微生物群落的关键成员，在陆地环境中深刻影响了氮，硫和碳的命运。构成了土壤生态系统的复杂性和微生物群落策划的生物过程，因此需要深入研究其组成和代谢活动。下一代测序和“魔术”技术（例如宏基因组学和元蛋白质组学）的出现，彻底改变了我们对微生物生态学的理解和土壤微生物群落的功能动态。宏基因组学可以鉴定土壤中的微生物群落组成，而元蛋白质组学则阐明了这些社区所执行的当前生物学功能。但是，元蛋白质组学提出了技术和计算的几个挑战。诸如腐殖酸的存在和提取方法中的变化等因素会影响蛋白质产量，而没有高分辨率的质谱和全面的蛋白质数据库限制了蛋白质鉴定的深度。尽管存在这些局限性，MEDAPRO-TEMOMICS仍然是揭示土壤微生物群落的复杂生物学过程和功能的有效工具。在这篇综述中，我们深入研究了土壤研究中元蛋白质组学的方法和挑战，涵盖了诸如蛋白质提取，鉴定和生物信息学分析等方面。此外，我们探讨了元蛋白质组学在土壤生物修复中的应用，强调了其在应对环境挑战方面的潜力。
南极表面沉积物中的锰还原和相关的微生物群落
极性区域是地球上最快的变暖场所。加速的冰川融化会导致养分的增加，例如金属氧化物（即铁和锰氧化物）进入周围环境，例如波特湾的海洋沉积物，乔治岛国王岛/伊斯兰国王25 de Mayo（西南极半岛）。微生物氧化物还原和相关的微生物群落在南极沉积物中的理解很少。在这里，我们通过对原位沉积物孔水的地球化学测量以及伴随16S rRNA测序的泥浆孵育实验进行了调查。脱母瘤属的成员是孵化中锰氧化锰和乙酸盐修正的主要响应者。与锰和/或乙酸盐利用相关的其他生物包括去硫纤维瘤，sva1033（脱硫素甲甲藻家族）和未分类的Arcobacteraceae。我们的数据表明，Desulfuromonadales的不同成员最活跃于有机型锰的降低中，从而提供了有力的证据，证明了它们与永久冷南极沉积物中锰减少的相关性。
合成微生物群落促进细菌群落，导致沙漠土地上的土壤多功能性
1个国家主要实验室农作物压力抗性和高效率生产，shaanxi农业和环境微生物学的主要实验室，西北A＆F大学生命科学学院，中国西安扬大学712100； Xinweihao1995@163.com（X.H.）; wangxiaoyx@nwafu.edu.cn（X.W.）; 15612250872@163.com（C.C.）; wangcc@nwafu.edu.cn（c.w.）2 Qingyang Longfeng Sponge City City Mandercant and Operation Co.，Qingyang 745000，中国； gyz0916@sina.com（y.g。）; 15688943689@163.com（H.Z.）3中国农业科学院草原研究所，中国霍霍特010013； Xiaozhenliu88@163.com（X.L.）; zhangxiaoqing@caas.cn（X.Z.）4中国地球科学研究所地质过程和矿产资源的国家主要实验室，中国北京100083； wellwoodliu@163.com *通信：xihuishen@nwsuaf.edu.cn
外肌肉真菌改变土壤食物网和细菌群落的功能潜力
摘要地球的大部分树木都依赖于外生菌根真菌（ECMF）释放并提供的关键土壤养分，并且地球上的所有土地植物都与Bacte RIA相关，这些植物可以帮助它们在自然中生存。然而，我们对ECMF的存在如何修饰土壤细菌群落，土壤食物网和根化学的理解需要直接的实验证据，以理解ECMF在地下植物中可能产生的影响。为此，我们在接种ECMF和本地森林细菌群落或仅是本地细菌群落的土壤中种植了Pinus Muricata植物。然后，我们介绍了土壤细菌群落，应用的代谢组学和脂质组学，以及连接的OMICS数据集，以了解ECMF的存在如何修饰地下生物地球化学，细菌群落结构及其功能潜力。我们发现，ECMF（i）的存在丰富了与自然界增强植物生长有关的土壤细菌，（ii）改变脂质和非脂质土壤代谢物的数量和组成，（iii）将植物的根化学变化为病原体抑制，酶促保存，酶促氧和反应性氧气探测。使用这种多摩变方法，我们表明这种广泛的真菌共生可能是构建土壤食物网的常见因素。
原生物群落作为肥料诱导的富含物种的草地生态系统变化的指标
是一个用于固体有机废物利用的江苏省密钥实验室，中国有机肥料的关键实验室，江苏固体有机废物的合作创新中心，资源储蓄肥料的教育部工程中心，省资源的肥料中心6700 AA，荷兰C学系，真正的JardínBot'anico-csic，马德里，西班牙，草药改善的国家主要实验室和草原农业生态系统，兰州生态学院，兰州兰州大学，兰州，兰州，兰州，甘努省，甘苏省，甘苏省，甘苏省，gepole of caul o ecologe e Ecologe of Ecology of Ecologe of Ecology of Ecologe of Ecology of Ecology of Ecologe of Ecologe of Ecologe of Ecologa宾夕法尼亚州大学公园，宾夕法尼亚大学公园，宾夕法尼亚州16802，植物科学与哈克生命科学研究院，宾夕法尼亚州立大学，宾夕法尼亚州立大学，美国宾夕法尼亚州立大学公园，美国宾夕法尼亚州大学公园，美国生态学和生物多样性小组，宾夕法尼亚州立大学公园，宾夕法尼亚州立大学，宾夕法尼亚州立大学，宾夕法尼亚州生命科学研究所，宾夕法尼亚州16802 3584 CH，荷兰
强烈的消毒程序对从猪肉加工厂的地板排水所回收的细菌群落的影响
结果：是存在的过程，但根据植物和植物的面积而对不同的细菌进行了不同。降低了TPC和TMC，最多可在2-3天内返回至IS水平。IS对冷却器中微生物的影响各不相同，降低了2-4 log 10，需要2到4周才能返回前IS水平。混合了靠近制造线的结果，一种植物的变化几乎没有显着变化，而另一个植物则显示了4至6 log 10减少。对QAC的耐药性和植物之间以及植物区域之间的生物膜对沙门氏菌的保护。在该属水平上对细菌的社区分析表明，物种的多样性降低，而破坏导致了新的社区组成，在某些情况下，即使在15到16周之后，这些组成也没有恢复到前州。
中国东北部不同温带森林类型中土壤酸性群落的多样性和组成
摘要：要深入了解典型温带森林生态系统中五种不同森林类型的土壤酸性多样性和组成，并探索它们与土壤养分的关系。通过高通量测序技术确定土壤酸性的多样性。土壤酸性叶酸的α多样性指数和土壤养分含量在不同的森林类型之间差异很大。β多样性和土壤酸性杆菌的组成在森林类型之间也有所不同。酸性属属，例如酸性_gp1，酸性杆菌_GP4和酸眼酸_gp17，在不同森林中起关键作用。RDA分析指出，土壤pH，可用的氮（AN），碳与氮（c/n）比，可用的磷（AP），总碳（TC）和总磷（TP）是影响不同森林类型中土壤酸性土壤的重要因素。在这项研究中，分析了温带森林生态系统中不同森林类型的土壤酸性杆菌的多样性和组成，揭示了它们与土壤物理化学特性之间的复杂关系。这些发现不仅增强了我们对土壤微生物生态学的理解，而且还为温带森林生态系统的生态保护和恢复策略提供了重要的指导。
bn-bacarena：Bacarena的贝叶斯网络扩展，用于微生物群落的动态模拟
1 ，纳瓦拉大学，圣塞巴斯蒂大学工程学院，圣塞巴斯蒂，AN，20018年，西班牙2，2生物医学工程中心，大学校园，大学纳瓦拉纳瓦拉，纳瓦拉31009，西班牙31009，西班牙31西班牙3号研究所，数据科学与人工智能学会（DATARARRA），纳瓦尔（Dataii Intifellient of Navarra）马德里28660号政治上的政治ecnica de Madrid大学，西班牙5地区和卫生局，卡洛斯三世卫生研究所，马德里28029，西班牙7，西班牙7营养学系，研究中心，研究中心，研究中心，研究中心，埃迪卡，布拉纳达大学的营养与技术研究所，布拉纳达研究所，研究所。 div>格拉纳达，格拉纳达大学，格拉纳达大学，18012年，西班牙对应。 div>纳瓦拉大学工程学院生物医学工程与科学系，纳瓦拉大学，曼努埃尔·德拉迪扎巴尔13号，圣塞巴斯蒂，AN，20018年，西班牙。 div>电子邮件：fplanes@technun.es（F.J.P。） div>电子邮件：fplanes@technun.es（F.J.P。） div>
对表面沉积物中微生物群落的宏基因组学和培养基分析，以及原始河中抗生素抗性基因的流行：
摘要：居住在河流地区沉积环境中的微生物群落是原始河流生态系统的关键指标。虽然已经建立了抗生素抗性与致病性与核心肠道细菌之间的相关性，但存在着一个很大的知识差距，即抗生素抗性基因（ARGS）与人类病原细菌（HPB）与河流中的特定微生物的相互作用，通常引用了“ terrestrial terestrial gut”。在自然栖息地内，了解微生物组成，包括细菌和居民遗传因素，例如ARGS，HPB，移动遗传因素（MGE）和毒力因子（VFS）（VFS），在全球变化的背景下是必须的。为了解决这一差距，在本研究中进行了一种基于富集的培养基互补培养物和宏基因组学，以表征微生物生物库，并提供初步的生态见解，以介绍兰坎河源流域中ARG的传播。根据我们的发现，在兰开河源盆地的主流中，有674种细菌菌株在厌氧条件下包括540个菌株，在有氧条件下有124个菌株，已成功地分离出来。其中，有98种被确定为已知物种，而4种是潜在的新物种。在这98种中，有30种与人类健康有关的HPB。此外，Baca和Bacitracin分别作为该河中最丰富的ARG和抗生素出现。此外，对ARGS的风险评估主要表明危害人类健康的风险等级（等级IV）。总而言之，基于富集的培养基学被证明可有效分离稀有和未知细菌，尤其是在厌氧条件下。ARG的出现显示与MGE的相关性有限，表明对兰开河源源盆地主流内人类健康的威胁很小。