抽象土壤代表一个复杂而动态的生态系统,拥有无数的微生物,它们在营养循环和有机物转化中共存并起着至关重要的作用。在这些微生物中,细菌和真菌是微生物群落的关键成员,在陆地环境中深刻影响了氮,硫和碳的命运。构成了土壤生态系统的复杂性和微生物群落策划的生物过程,因此需要深入研究其组成和代谢活动。下一代测序和“魔术”技术(例如宏基因组学和元蛋白质组学)的出现,彻底改变了我们对微生物生态学的理解和土壤微生物群落的功能动态。宏基因组学可以鉴定土壤中的微生物群落组成,而元蛋白质组学则阐明了这些社区所执行的当前生物学功能。但是,元蛋白质组学提出了技术和计算的几个挑战。诸如腐殖酸的存在和提取方法中的变化等因素会影响蛋白质产量,而没有高分辨率的质谱和全面的蛋白质数据库限制了蛋白质鉴定的深度。尽管存在这些局限性,MEDAPRO-TEMOMICS仍然是揭示土壤微生物群落的复杂生物学过程和功能的有效工具。在这篇综述中,我们深入研究了土壤研究中元蛋白质组学的方法和挑战,涵盖了诸如蛋白质提取,鉴定和生物信息学分析等方面。此外,我们探讨了元蛋白质组学在土壤生物修复中的应用,强调了其在应对环境挑战方面的潜力。
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