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蛋白质组是在特定时间由基因组，细胞，组织或生物体表达的完整蛋白质集。复杂性来自几个关键因素，包括：大量不同的蛋白质，给定蛋白质的潜在蛋白质成型数量以及生理相关蛋白质浓度的广泛动态范围。此外，蛋白质组处于恒定状态，并且可以随着时间的推移明显变化。在蛋白质组学中，这种变化用于将特定蛋白质与其功能和健康或疾病状态相关联。反过来，这些知识被利用用于诊断疾病和开发新药物靶标。
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