用分子胶化合物靶向蛋白质降解(TPD)是一种突破性的治疗方式,可消除以前认为不可用的疾病蛋白质。尽管具有巨大的潜力,但迄今为止,新型分子胶的系统发现及其细胞降解靶标仍然具有挑战性。在这里,我们提出了一个深度的蛋白质组学筛选和验证平台,以在各个阶段推进TPD药物发现计划,并创建新型高价值目标的广泛管道。深蛋白质组学筛选是基于数据独立的采集(DIA)技术,用于在空前的吞吐量,覆盖范围和敏感性下针对细胞蛋白质组的(潜在)分子胶的筛选化合物库。它从用分子胶水处理的细胞系中识别并量化了每样品的11,000多个蛋白质,从而实现了综合蛋白质组学的药物和药物靶标的发现。