图。5:用酪蛋白钝化的悬臂背面的AFM图像在0.5pm T5溶液的溶液中孵育1.5h(箭头标记T5噬菌体或可能的酪蛋白聚集体)请注意,这里的条件与手稿中呈现的原位实验不同。
Salmonella Kentucky带来的全球公共卫生风险(S。肯塔基州)正在上升,特别是由于人类和动物种群中抗菌抗性基因的传播。这种血清在非洲普遍存在,已成为人类非脑性胃肠炎的显着原因。在这项研究中,我们使用了一种生物信息学方法来开发基于肽外膜蛋白A,C和F的基于肽的疫苗。肯塔基州。此外,我们采用了鼠伤寒沙门氏菌的鞭毛蛋白(FLIC)(s。鼠伤寒)作为增强疫苗有效性的佐剂。通过这种方法,我们确定了14个CD8+和7个CD4+ T细胞表位,这些表位预先限制为各种MHC I类和MHC II类等位基因。预计的表皮预计将在疫苗配方中使用时达到94.91%的覆盖率。此外,我们确定了七个高度免疫原性的线性B细胞表位和三个构象B细胞表位。然后,使用适当的接头将这些T细胞和B细胞表位连接起来,以创建多角色疫苗(MEV)。增强了肽构建体的免疫原性,从s。鼠伤寒在N末端包括在内。由此产生的MEV结构表现出高结构质量和有利的理化特性。通过Toll样受体1、2、4和5进行了分子对接研究,然后进行分子动力学模拟,表明疫苗受体综合在能量上是可行的,稳定的和健壮的。免疫模拟结果表明,MEV引起的显着反应,包括IgG,IgM,CD8+ T细胞,CD4+ T-细胞和各种细胞因子(IFN-γ,TGF-β,IL-2,IL-10和IL-12),以及抗原水平的显着降低。尽管有这些有希望的内部发现结果,但进一步验证
背景:2型糖尿病(T2DM)是一个普遍的公共卫生问题,由于其造成的综合性,死亡率很高。但是,最近的数据表明,虹膜蛋白可能在防止T2DM的发展和减少动脉粥样硬化的发生方面起重要作用。我们研究的目的是研究虹膜蛋白在T2DM和颈动脉内膜膜厚度(C-IMT)的发展中的E%ECT,这是没有已知心血管疾病(CVD)的糖尿病患者动脉粥样硬化受试者的早期指标。方法:我们的研究包括41名健康志愿者和93例诊断为T2DM的患者。虹膜蛋白水平通过使用Elabscience®人Irisin Elisa Kit H6120的三明治酶连接的免疫吸附测定法确定。C-IMT测量。在T2DM组中,除了低,中和高虹膜蛋白水平的患者外,还将患者分为患有或没有亚细胞性动脉粥样硬化的患者,并进行了比较。结果:我们发现T2DM患者的虹膜蛋白水平明显低于健康对照组(P <.001)。在我们的患者组中,患者年龄的每10年增加C-IMT增加了0.06 mm(95%置信区间(CI):0.03-0.08)mm,并且男性C-IMT增加0.117 mm(95%CI:0.068-0.166)。在C-IMT和IRISIN水平之间发现了负线性关系,该关系没有达到统计学意义(r =&0.145,p = .165)。与虹膜蛋白水平较高的患者相比,虹膜蛋白水平较低的患者的C-IMT值厚0.113 mm(0.734±0.129 mm和0.621±0.140 mm,P = .004)。结论:我们的发现表明,低虹膜蛋白水平有助于T2DM的发展并增加糖尿病并发症,例如亚临床动脉粥样硬化和糖尿病性肾病。关键字:糖尿病,虹膜蛋白,动脉粥样硬化,颈动脉内膜–Media厚度
Majed Modaresi 1,†,+,‡,Ryosuke Sugiyama 2,3,4,†,Nhan Dai Thien Tram 2,†,Roman P. Jakob 1,Chin-Soon Phan 2,Chin-soon-phan 2,§§ 1,Preston Shi Yang Long 2,Phillipe A Lehner 1,Zhen Heng Lim 2,Morris Degen 1,Ziwei Yao 2,Timm Maier 1,Timm Maier 1,Yuxin Hou 2,Jia Ying Lee 2,Jian Xu 2,Jian Xu 2,Jian Xu 2,Andrew Yeo Jung Yeat 2,Andrew Yeo Jung Yeat 2,Kenny Ting Sween Koh 2,Kenny Ting Koh 2,Wei Yi Yag Youg Yang Yang 2,Share ling Y. Chua 5,Mami Yamazaki 3,4,Pui Lai Rachel EE 2,*,Sebastian Hiller 1*和Brandon I Morinaka 2,*
目标:多囊卵巢综合征(PCOS)是一种常见的内分泌疾病,影响了生殖年龄的女性,通常以胰岛素抵抗,高雄激素和代谢障碍为特征。这项研究旨在研究PCOS女性的血清虹膜蛋白水平之间的关系,一种参与能量调节的肌动物和胰岛素抵抗。方法:对诊断为PCOS的90名妇女进行了一项前瞻性研究,分为两组:45个具有胰岛素耐药性,而无需45组。使用胰岛素抵抗(HOMA-IR)的稳态模型评估评估胰岛素抵抗。 使用酶联免疫吸附测定法(ELISA)测量血清虹膜蛋白水平。 实力分析,包括相关和回归测试,用于评估血清虹膜蛋白水平与各种代谢和激素参数之间的关系。 结果:具有胰岛素抵抗(3.66±2.69 ng/ml)的PCOS患者与没有胰岛素耐药性的PCOS患者之间没有显着差异(2.77±1.72 ng/ml)(P = 0.065)。 在血清虹膜素水平和胰岛素,HOMA-IR,免费睾丸激素和总睾丸激素水平之间鉴定出弱相关性。 与胰岛素(P <0.001)和HOMA-IR(P = 0.008)观察到显着的正相关,而与游离睾丸激素(P = 0.029)和总睾丸激素(P = 0.013)发现了负相关性。 此外,在患有和没有代谢综合征的患者之间,血清虹膜蛋白水平没有显着差异。 需要进行较大的研究来进一步探索虹膜蛋白在PCOS中的作用及其作为治疗靶标的潜力。胰岛素抵抗。血清虹膜蛋白水平。实力分析,包括相关和回归测试,用于评估血清虹膜蛋白水平与各种代谢和激素参数之间的关系。结果:具有胰岛素抵抗(3.66±2.69 ng/ml)的PCOS患者与没有胰岛素耐药性的PCOS患者之间没有显着差异(2.77±1.72 ng/ml)(P = 0.065)。在血清虹膜素水平和胰岛素,HOMA-IR,免费睾丸激素和总睾丸激素水平之间鉴定出弱相关性。与胰岛素(P <0.001)和HOMA-IR(P = 0.008)观察到显着的正相关,而与游离睾丸激素(P = 0.029)和总睾丸激素(P = 0.013)发现了负相关性。此外,在患有和没有代谢综合征的患者之间,血清虹膜蛋白水平没有显着差异。需要进行较大的研究来进一步探索虹膜蛋白在PCOS中的作用及其作为治疗靶标的潜力。结论:尽管观察到血清虹膜素水平和胰岛素抵抗标记之间的弱相关性,但在具有和没有胰岛素抵抗的PCOS患者之间未发现显着差异。这些发现表明,血清虹膜蛋白可能不是与胰岛素抵抗有关的PCOS病理生理学的关键因素。关键字:超雄激素,胰岛素抵抗,虹膜蛋白,代谢综合征,多囊卵巢综合征(PCOS)
。圣地亚大学,加利亚,加利亚,15706年,UPSALA,SE 750 02,SWEED医院Universitorio,33011电子邮件:ng.teran@cinn; Modsim Pharmar AB,Box 2022,SE-75002BMC -BMC -BMC -Box 596,Uppsala,SE电子邮件:悬挂。副编辑:
Benjamin B. Johnson, 1 Marie-Victoire Cosson, 2,3,9 Lorenza I. Tsansizi, 2,3,9 Terri L. Holmes, 1 Tegan Gilmore, 2 Katherine Hampton, 1 Ok-Ryul Song, 2,4 Nguyen TN Vo, 5 Aishah Nasir, 5 Alzbeta Chabronova, 6 Chris Denning, 5 Mandy J. Peffers, 6 Catherine LR Merry, 5,7 John Whitelock, 5,8 Linda Troeberg, 1 Stuart A. Rushworth, 1 Andreia S. Bernardo, 2,3, * 和 James GW Smith 1,10, * 1 诺维奇医学院代谢健康中心,东英吉利大学,诺维奇研究园,诺维奇 NR4 7UQ,英国 2 弗朗西斯·克里克研究所,伦敦 NW1 1AT,英国 3 NHLI,伦敦帝国理工学院,伦敦,英国 4 高通量筛选科学技术平台,弗朗西斯克里克研究所,伦敦 NW1 1AT,英国 5 医学院,再生和建模组织,生物发现研究所,诺丁汉大学公园分校,诺丁汉 NG7 2RD,英国 6 生命历程和医学科学研究所,威廉亨利邓肯大厦,西德比街 6 号,利物浦 L7 8TX,英国 7 医学生物化学和微生物学系,乌普萨拉大学,瑞典乌普萨拉 8 新南威尔士大学生物医学工程研究生院,悉尼,新南威尔士州 2052,澳大利亚 9 这些作者贡献相同 10 主要联系人 * 通信地址:a.bernardo@imperial.ac.uk (ASB),jgsmith@uea.ac.uk (JGWS) https://doi.org/10.1016/j.celrep.2023.113668
摘要:蛋白质动力学和功能与发生的能量流有很强的联系。肌红蛋白(MB)及其突变是研究分子水平上振动能传递(VET)过程的理想系统。使用色氨酸(TRP)探针在不同的MB位置引入的抗stokes紫外线共振拉曼研究通过氨基酸替代提出,这表明兽医的量取决于相对于血红素组的TRP探针的位置。受到这项实验工作的启发,我们探索了非共价π相互作用的强度,以及最初由局部振动模式分析(LMA)与铁在Aquotem-MB中结合的轴向和远端配体的共价相互作用,最初是由Konkoli和Cremer开发的。研究了两组非共价相互作用:(1)水配体和TRP环之间的相互作用,以及(2)TRP与血红素基团的卟啉环之间的相互作用。我们通过特殊的局部模式力常数评估了这些非共价相互作用的强度。使用气相和QM/MM计算,研究了基态下的各种TRP模型的水结合的水结合的MB蛋白(总共6个)。我们的结果揭示了兽医确实取决于TRP探针相对于血红素组的位置,也取决于远端组氨酸的互变异群的性质。他们提供了有关如何评估利用LMA的蛋白质中非共价π相互作用以及如何使用这些数据探索兽医的新准则,更通常是蛋白质动力学和功能。1 - 3■引言肌球蛋白(MB)是球蛋白超级家族的杰出成员,在心脏和骨骼肌的众多生理功能中具有重要作用,对于脊椎动物,它负责氧气的储存。
1 巴西圣保罗联邦大学-保利斯塔医学院 (UNIFESP/EPM) 微生物学、免疫学和寄生虫学系,2 巴西圣保罗大学 (USP) 生物医学科学研究所寄生虫学系,3 巴西圣保罗大学 (USP) 生物医学科学研究所微生物学系,4 巴西圣保罗以色列爱因斯坦医院,5 美国俄亥俄州克利夫兰凯斯西储大学凯斯综合癌症中心,6 巴西库亚巴马托格罗索联邦大学病毒学实验室,7 巴西圣保罗大学巴斯德科学平台,8 圣保罗国家免疫学研究科学技术研究所 (INCT) (iii)巴西圣保罗
摘要:过去四年中,独特的跨膜 (TM) 蛋白质结构的数量翻了一番,这可以归因于低温电子显微镜的革命。此外,AlphaFold2 (AF2) 还提供了大量高质量的预测结构。但是,如果研究的对象是特定的蛋白质家族,那么尽管存在通用和蛋白质域特定的数据库,收集该家族成员的结构仍然极具挑战性。在这里,我们证明了这一点,并评估了通过 ABC 蛋白质超家族自动收集和呈现蛋白质结构的适用性和可用性。我们的流程使用 PFAM 搜索识别和分类跨膜 ABC 蛋白质结构,并旨在根据特殊几何测量 conftors 确定它们的构象状态。由于 AlphaFold 数据库仅包含单个多肽链的结构预测,我们对作为二聚体发挥作用的人类 ABC 半转运蛋白进行了 AF2-Multimer 预测。我们的 AF2 预测警告称,有关相互作用伙伴的一些生化数据的解释可能存在歧义,需要进一步进行实验和实验结构确定。我们通过网络应用程序提供了我们预测的 ABC 蛋白质结构,并加入了 3D-Beacons 网络,通过 PDBe-KB 等平台覆盖更广泛的科学界。