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从环境中分离出的颜料产生的微生物及其抗菌活性
摘要。在食品行业中，总是有对色彩鲜艳，外观吸引人的食品的需求，并且具有营养和健康增强的特性，以吸引消费者的注意。合成色素被广泛用于全球市场，但是它们可能引起许多副作用，例如高过敏性，致癌性和其他毒理学问题。最近的研究表明，微生物是自然色的丰富来源，可以使工业生产安全，环保的生物降解色素。这项工作的目的是将色素微生物从环境样品中分离出来，选择的发酵条件，从微生物中分离色素并检查其抗菌活性。颜料已经从各种来源分离出来，例如土壤，食物浪费，面粉等。生长生产微生物的生长参数，例如生长温度，pH，类酮和NaCl浓度，以评估色素的产生。发酵后，用超声浴和溶剂提取通过细胞裂解来分离五种类型的色素。研究了提取的色素的抗菌活性。在研究期间，确定了微生物生长的最佳条件：温度为30°C，pH 7，浓度为3％胰蛋白酶和6％NaCl。甘油被发现是一种额外的碳源，对色素产生产生积极影响。粉红色的色素对测试的致病细菌表现出最高的抗菌活性。提取的颜料的抗菌作用结果表明，铜绿假单胞菌对颜料的作用最敏感。关键词：色素，微生物，隔离，发酵。
蓝细菌的资格和定量...
海洋蓝细菌是一类灭绝的光合细菌，可以追溯到350万年。最珍贵的海洋微生物是针对各种色素提取的。他们的有益的代谢产物的产生很丰富。颜料是用于赋予其他材料颜色的明亮物质。真正的色素构成了这些着色剂的大多数，它们也称为生物色素或生物色素。这些生物色素通常被用作固体和液体的混合物，因为它们不溶于水。颜料是由生物产生的，特定的光吸收方法赋予了它们的颜色。自然选择已在数百万年内完善其代谢产物，以对一系列生物靶标产生影响。食物，饲料，化妆品，药物，营养和水产养殖领域都广泛使用了海洋色素。这项研究的目的是评估许多海洋蓝细菌物种微囊藻，lyngbya limnetica，oscillatoria roai，uscillatoria acuminata和uscillatoria princes，它们引起了一些兴趣。这些物种是为了研究其生物色素的研究，例如叶绿素颜料，植物素，β-胡萝卜素和植酸酯。已经对所有生物色素估计进行了初步研究，包括β-胡萝卜素，类胡萝卜素结合，植物蛋白酶，植酸盐和叶绿素颜料的估计。在5.9％的情况下，振荡王子的叶绿素含量最大。微囊藻的类胡萝卜素量为1.7％和1.8％。振荡器和振荡王子的植物素含量分别更高，0.78％和0.85％。和lyngbya limnetica。微囊藻sp。表现出高达1.5％的β-胡萝卜素水平。
指示进化预测细胞色素b G37V目标位点修饰是Zymoseptoria tritici
。cc-by-nd 4.0国际许可证。是根据作者/筹款人提供的预印本（未经同行评审证明）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2021年9月4日发布的此版本中在版权所有者中显示预印本。 https://doi.org/10.1101/2021.09.09.03.458847 doi：biorxiv preprint
色素位点作为查加斯病媒介 Rhodnius prolixus 基因组编辑的标记
。CC-BY 4.0 国际许可，根据 未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者（此版本于 2020 年 4 月 29 日发布。；https://doi.org/10.1101/2020.04.29.067934 doi：bioRxiv 预印本
新型QSAR模型，用于预测细胞色素P450酶的可逆和时间依赖性抑制
carboxamid e carboxylate carboxylic acid ether halide hydrazine hydroxylamine imine iminomethyl ketone nitrile quinones sulfide sulfonamide sulfone sulfoxide urea CYP3A4 4.673 -1.657 1.259 -0.5551 -2.915 5.568 1.027 9.7 0.22 3.645 1.812 -8.266 -3.206 -0.72 4.486 -2.023 3.258 -1.178 -4.696 -1.171 0.2793 2.299 2.656 2.656 -2.057 -2.223 4.487 CYYP3A4 MBI COPT 1.056 1.124 -3.735 3.305 2.279 -0.2916 -0.5531 1.76 -1.762 -1.122 0.0924 -1.604 -0.185 0.7485 -0.8378 -1.71 -2.679 CYP2C9 -1.714 -1.019 0.5386 -1.888 -0.4591 -4.956 0.6673 -1.543 -5.244 -1.749 -2.953 -2.057 1.877 2.274 -3.064 0.9572 1.215 -0.9967 -2.176 1.688 -1.019 -0.5739 5.121 5.445 -1.431 -1.756 CYP2C19 -2.273 -1.076 2.023 -1.003 0.6657 -0.6112 0.8963 -7.442 -2.295 -0.02369 -3.314 0.04706 -1.89 -2.443 0.2077 0.062 -1.207 -3.293 -0.1096 1.859 4.388 -0.701 -2.874 -2.715 -3.454 CYP2D6 5.566 -1.377 -3.444 -3.224 -2.803 10.12 -0.9736 -1.175 -16.24 -7.884 -2.954 -11.59 -0.9727 -2.91 -4.197 -1.804 0.6502 -3.126 -2.019 -0.9496 -1.377 3.191 -4.559 -3.354 -1.54 1.906
Geobacter OmcZ 细丝的结构表明细胞外细胞色素聚合物多次独立进化
摘要 虽然早期的基因和低分辨率结构观察表明，Geobacter 等金属还原生物的细胞外导电丝由 IV 型菌毛组成，但现在已经确定细菌 c 型细胞色素可以聚合形成能够进行长距离电子传输的细胞外丝。有两种这样的细胞色素丝具有原子结构，它们由六血红素细胞色素 OmcS 和四血红素细胞色素 OmcE 形成。由于中心 OmcS 和 OmcE 核心内的血红素包装高度保守，并且亚基之间血红素配位模式相同，因此有人认为这些聚合物具有共同的起源。我们现在使用低温电子显微镜 (cryo-EM) 来确定第三种细胞外丝的结构，它由 Geobacter sulphurreducens 八血红素细胞色素 OmcZ 形成。与来自同一生物体的 OmcS 和 OmcE 中的线性血红素链相比，OmcZ 中的血红素堆积、血红素：血红素角度和亚基间血红素配位截然不同。OmcZ 内的分支血红素排列导致每个亚基中血红素高度暴露在表面，这可能解释了导电生物膜网络的形成，并解释了 OmcZ 细丝测量到的更高电导率。这一新的结构证据表明，导电细胞色素聚合物不止一次独立地从不同的祖先多血红素蛋白中出现。
由细胞色素药物 - 代谢酶介导的药物 - 毒与基因相互作用的表型模型
信函：roberto.viviani@uibk.ac.t在药物代谢酶中抽象的遗传多态性和药物 - 药物相互作用是药物暴露不足的主要来源，并且反应不足或反应不足。评估用于开发精确剂量调整建议系统的药物 - 药物基因相互作用（DDGI）的挑战是同时考虑两者。在这里，我们从体内数据分析了DDGI的静态模型，并着重于共同建模抑制和遗传多态性的近调转换概念。这些模型适用于缺少药代动力学信息并将其用于临床支持系统和共识剂量调整指南的数据集。我们表明，所有此类模型都可以通过相同的正式框架来处理，并且一见一见钟情的模型都是相同的线性平衡模型的所有版本。该模型包括线性药物遗传学和抑制模型作为特殊情况。我们重点介绍了这项努力和未来研究的开发DDGI模型中的挑战。
社论：精准医学：细胞色素 P450 和转运蛋白基因多态性、药物相互作用、疾病对
几十年来，药物治疗中“一刀切”的理想概念面临着患者反应各异的挑战。这一概念逐渐被精准剂量所取代，在精准医疗的保护下，患者接受个性化治疗，以最大限度地降低潜在药物不良反应或无效的风险（Darwich 等人，2021 年）。由于遗传和环境因素的多样性，个体间治疗反应经常存在很大差异。决定药效学差异的协变量尚未充分研究。然而，定义药代动力学变异性的个体属性已经得到充分证实。这些在精准剂量中发挥着重要作用，涉及 I 期和 II 期药物代谢酶的遗传多态性、药物间相互作用 (DDI)、疾病本身对功能的调节作用以及酶和转运蛋白的活性等因素。在个体水平上确定影响酶和转运蛋白活性的主要因素对于个性化治疗至关重要。 然而，多种因素之间的复杂相互作用导致复杂的药物-药物-基因-疾病相互作用，难以预测，有时还会导致致命的后果 ( Storelli 等人，2018 )。 因此，迫切需要增加迄今为止收集的有关这些变异源的知识在临床实践中的应用。 模型知情精准给药 (MIPD) 以及更好的患者特征描述是帮助临床医生进行个性化患者护理的有力工具。 这些基于计算机的建模和模拟技术可以整合有关个体酶和转运蛋白能力的信息以及许多其他因素，以预测特定患者的药物剂量并管理复杂的药物-药物-基因-疾病情景 ( Polasek 等人，2019 )。因此，本期杂志致力于研究精准剂量以及细胞色素 P450 (CYP)、转运蛋白基因多态性、药物相互作用和疾病对药物安全性和有效性的影响。在肿瘤学中，酪氨酸激酶抑制剂 (TKI) 的发展通过提高患者存活率，特别是血液肿瘤患者，彻底改变了抗癌靶向治疗。然而，20-25% 的慢性粒细胞白血病 (CML) 患者治疗失败
色素细胞模型的谱系调节和细胞清除率在普兰氏菌中地中海
好......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 71