缩写:SMA,α平滑肌肌动蛋白;AA,氨基酸;BME,Eagle基础培养基;BMP4,骨形态发生蛋白-4;BFP,蓝色荧光蛋白;CoQH2,还原辅酶Q;CHP,氢过氧化异丙苯;DR,耐药;EBSS,Earle平衡盐溶液;EGF,表皮生长因子;FBS,胎牛血清;eIF2,真核起始因子2α;FACS,荧光激活细胞分选术;FITC,异硫氰酸荧光素;GAPDH,3-磷酸甘油醛脱氢酶;GFP,绿色荧光蛋白;GSH,谷胱甘肽;GSSG,谷胱甘肽二硫化物;GPX4,谷胱甘肽过氧化物酶4;HGF,肝细胞生长因子;HPLM,人血浆样培养基; iRFP,近红外荧光蛋白;Mel-MPM,黑色素瘤导向模块化生理培养基;MPM,模块化生理培养基;NAD,烟酰胺腺嘌呤二核苷酸;NAMPT,烟酰胺磷酸核糖转移酶;NAMPTi,烟酰胺磷酸核糖转移酶抑制剂;NEAA,非必需氨基酸;NHDF,正常人真皮成纤维细胞;PI,碘化丙啶;ROS,活性氧;Se,亚硒酸盐;SLC3A2,溶质载体家族 3 成员 2;SLC7A11,溶质载体家族 7 成员 11;xCT,胱氨酸/谷氨酸转运蛋白
染色体碎裂、染色体合成和染色体复合等现象被称为染色体再生,它们构成了新型的复杂重排,包括许多仅位于少数染色体区域的基因组改变。近十年来,这些现象的发现改变了我们对染色体异常的形成及其病因的认识。尽管这些新的灾难性机制各有特点,但它们通常发生在单个细胞周期内,并且它们的出现与基因组不稳定性密切相关。人们已经提出了各种能够产生染色体再生的非排他性外源性或细胞机制。然而,最近的实验数据揭示了两个主要过程,这两个过程在染色体有丝分裂分离出现缺陷后,可产生一系列细胞事件,从而导致染色体再生。这些机制包括整合分离染色体物质的微核的形成,以及由于端粒融合而导致染色体物质周围出现染色质桥。在这两种情况下,受损染色体物质的碎裂、修复和传递的细胞和分子机制与染色体再生相关的复杂染色体重排的特征一致。在本综述中,我们介绍了每种类型的染色体再生,并描述了实验模型,这些模型可用于验证染色体再生事件的存在,并更好地了解其形成和传递的细胞机制,以及它们对基因组稳定性和可塑性的影响。21
几十年来,药物治疗中“一刀切”的理想概念面临着患者反应各异的挑战。这一概念逐渐被精准剂量所取代,在精准医疗的保护下,患者接受个性化治疗,以最大限度地降低潜在药物不良反应或无效的风险(Darwich 等人,2021 年)。由于遗传和环境因素的多样性,个体间治疗反应经常存在很大差异。决定药效学差异的协变量尚未充分研究。然而,定义药代动力学变异性的个体属性已经得到充分证实。这些在精准剂量中发挥着重要作用,涉及 I 期和 II 期药物代谢酶的遗传多态性、药物间相互作用 (DDI)、疾病本身对功能的调节作用以及酶和转运蛋白的活性等因素。在个体水平上确定影响酶和转运蛋白活性的主要因素对于个性化治疗至关重要。 然而,多种因素之间的复杂相互作用导致复杂的药物-药物-基因-疾病相互作用,难以预测,有时还会导致致命的后果 ( Storelli 等人,2018 )。 因此,迫切需要增加迄今为止收集的有关这些变异源的知识在临床实践中的应用。 模型知情精准给药 (MIPD) 以及更好的患者特征描述是帮助临床医生进行个性化患者护理的有力工具。 这些基于计算机的建模和模拟技术可以整合有关个体酶和转运蛋白能力的信息以及许多其他因素,以预测特定患者的药物剂量并管理复杂的药物-药物-基因-疾病情景 ( Polasek 等人,2019 )。因此,本期杂志致力于研究精准剂量以及细胞色素 P450 (CYP)、转运蛋白基因多态性、药物相互作用和疾病对药物安全性和有效性的影响。在肿瘤学中,酪氨酸激酶抑制剂 (TKI) 的发展通过提高患者存活率,特别是血液肿瘤患者,彻底改变了抗癌靶向治疗。然而,20-25% 的慢性粒细胞白血病 (CML) 患者治疗失败
摘要背景基因组编辑为优化 T 细胞的功能特性以实现过继细胞转移目的提供了独特的视角。到目前为止,PDCD1 编辑已主要在嵌合抗原受体 T (CAR-T) 细胞和人类原代 T 细胞中成功测试。尽管如此,对于实体瘤患者,过继转移针对肿瘤抗原的效应记忆 T 细胞仍然是一种相关的选择,而使用缺乏程序性细胞死亡-1 (PD-1) 表达的高亲和力 T 细胞可能会提高这些治疗的治疗效果。方法在这里我们使用 CAS9/sgRNA 核糖核蛋白复合物的转染来编辑针对黑色素瘤抗原 Melan-A 的人类效应记忆 CD8 + T 细胞中的 PDCD1 基因。我们克隆了编辑的 T 细胞群,并通过每个 T 细胞克隆中的测序和流式细胞术验证了 PDCD1 编辑,以及 T 细胞受体 (TCR) 链的测序。我们还对野生型 (WT) 和编辑的 T 细胞克隆进行了全转录组分析。最后,我们通过在 NOD scid gamma (NSG) 小鼠中的过继转移,在体外和体内记录了表达相同 TCR 的 WT 和 PD-1KO T 细胞克隆的抗肿瘤特性。结果在这里,我们证明了在人类效应记忆黑色素瘤特异性 T 淋巴细胞中编辑 PDCD1 基因的可行性。我们表明,在 PDCD1 编辑的 T 细胞克隆上,PD-1 表达显著降低或完全缺失。对表达相同 TCR 并表现出相似功能亲和力的一组 T 细胞克隆的广泛表征表明,它们对表达 PD-L1 的黑色素瘤细胞系具有优异的抗肿瘤反应性。转录组分析显示,在 PD-1 缺陷的 T 细胞克隆中,参与增殖和 DNA 复制的基因下调,而参与代谢和细胞信号传导的基因上调。最后,我们证明了 PD-1 缺陷型 T 细胞在 NSG 小鼠模型中显著延缓 PD-L1 表达人类黑色素瘤生长的卓越能力。结论 将此类淋巴细胞用于过继细胞转移目的,结合其他调节肿瘤微环境的方法,将成为改善实体肿瘤免疫治疗效果的有希望的替代方法。
携带 BRAF V 600 突变的转移性黑色素瘤患者可以用 BRAF 和 MEK 抑制剂(BRAFi/ MEKi)联合治疗,但不可避免地会产生先天和获得性耐药性。预测患者对靶向治疗的反应对于指导临床决策至关重要。我们在此描述了一种高效的患者来源异种移植模型的开发,该模型适用于患者黑色素瘤活检,使用禽胚胎作为宿主(AVI-PDX TM )。在这个体内范例中,我们描述了一种在胚胎皮肤内快速且可重复的患者样本肿瘤植入,保留了关键的分子和表型特征。我们表明,在这些 AVI-PDX TM 中可以可靠地模拟对 BRAFi/MEKi 的敏感性和耐药性,以及与其他药物的协同作用。我们进一步提供概念证明,AVI-PDX TM 在几天内模拟黑色素瘤患者对 BRAFi/MEKi 的反应多样性,因此将其定位为设计个性化药物检测和评估新型组合策略的有价值的工具。
% Percent AAV-2 Adeno-associated virus serotype 2 AE Adverse event AHRQ Agency for Healthcare Research and Quality AUC Area under the curve BCVA Best corrected visual acuity BLA Biologics license application CDR Clinical trial Diversity Rating CE Cost-effectiveness CI Confidence interval evLYs Equal value of life years FDA Food and Drug Administration FrACT Freiburg Visual Acuity Test Gc Genome copies Gc/eye Genome copies per eye GDP Gross domestic product HD High-dose HIDI Health Distribution Index IRD Inherited retinal disease IVT Intravitreal treatment LD Low-dose LogMAR Logarithmic minimum angle of resolution LSM Least-squares mean LYs Life years MCO-010 Multi-characteristic opsin mITT Modified intention-to-treat population MLSDT Multi-luminance shape discrimination test MLYMT多亮度y运动测试n数字n总数n/a不适用na nr nr nr nr nr nr nr nr n nr nr n nr n n n n n n drestighos prisma均可用于系统评价和荟萃分析的QALY质量质量质量质量质量为rct的随机率很高关心美国美国
(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2025年2月6日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.05.636637 doi:Biorxiv Preprint
皮肤黑色素瘤是一种高度侵袭性的肿瘤,尽管最近出现了一些治疗方法,但大多数晚期转移性黑色素瘤患者的临床预后不佳。黑色素瘤中最常见的突变会影响 BRAF 致癌基因,它是 MAPK 信号通路的蛋白激酶。针对 BRAF 和 MEK 的疗法仅对 50% 的患者有效,并且几乎系统地产生耐药性。与黑色素瘤细胞的强烈异质性和可塑性相关的遗传和非遗传机制被认为有利于耐药性,但人们对其了解甚少。最近,我们引入了一种新的数学形式,可以表示肿瘤异质性和耐药性之间的关系,并提出了几种用 BRAF/MEK 抑制剂治疗的黑色素瘤产生耐药性的模型。在本文中,我们使用一种新的计算模型进一步研究了这种关系,该模型可以处理用 BRAF/MEK 抑制剂治疗的黑色素瘤中单细胞 mRNA 测序数据识别的多种细胞状态。我们使用该模型来预测不同治疗策略的结果。参考疗法称为“连续”疗法,其包括不间断地应用一种或多种药物。在“联合疗法”中,几种药物按顺序使用。在“适应性疗法”中,当肿瘤大小低于下限时中断药物应用,当肿瘤大小超过上限时恢复药物应用。我们表明,与直觉相反,在 BRAF/MEK 抑制剂与假设药物(针对在肿瘤对激酶抑制剂的反应过程中后期发展的细胞状态)的联合疗法中,最佳方案是先用这种假设药物治疗。此外,尽管连续疗法和适应性疗法之间出现耐药性的时间差别不大,但在适应性疗法的情况下,不同黑色素瘤亚群的空间分布更加分区化。
研究了由生物防治剂产生的抗真菌剂绿青霉素与不产生绿青霉素的微生物的生物转化。结果表明,一些环境非目标微生物能够还原已知的植物毒素绿青霉素及其 3-差向异构体中的绿青霉素。因此,这种还原在某些情况下通过解毒机制发生,在植物病害的生物防治中可能对植物造成灾难性的影响。然而,发酵/生物转化工艺可能是制备这种植物毒素的有效方法。