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益生菌菌株增强了鸡肉的T细胞反应
摘要：由于抗菌耐药性的增加，禁止家禽生产中的抗生素增长促进剂和其他抗菌剂会导致增加潜在替代品（如益生菌）的喂养。但是，这些饲料添加剂的作用方式尚未完全理解。他们甚至可以直接影响免疫系统。使用原发性培养的外周血单核细胞（PBMC）进行了先前建立的动物体外系统，以研究免疫调节饲料添加剂的影响。在这里，评估了两种益生菌菌株的不同制剂的免疫调节，枯草芽孢杆菌DSM 32315（BS）和B. amyloliquefaciens Cect 5940（BA）的免疫调节。以1：3（PBMCS：Bacillus）为重要BS（CD4+：P <0.05; CD4+CD25+：P <0.01）的比率为1：3（PBMCS：Bacillus）的T DIV和活化的T-助血细胞增加。此外，重要的BS增强了细胞毒性T细胞的增殖和激活（CD8+：P <0.05； CD8+CD25+：P <0.05）。BS的无细胞益生菌培养上清液增加了活化的T-辅助细胞的计数（CD4+CD25+：P <0.1）。 UV灭活的BS增加了细胞毒性T细胞的比例显着（CD8+：P <0.01）。 我们的结果表明，BS的分泌因子可能参与T-辅助细胞激活和增殖，而它可能通过表面接触刺激细胞毒性T细胞。 用不同的BS制备处理后，我们无法观察到对B细胞的任何影响。 此外，我们发现BA制剂对B细胞没有影响。BS的无细胞益生菌培养上清液增加了活化的T-辅助细胞的计数（CD4+CD25+：P <0.1）。UV灭活的BS增加了细胞毒性T细胞的比例显着（CD8+：P <0.01）。我们的结果表明，BS的分泌因子可能参与T-辅助细胞激活和增殖，而它可能通过表面接触刺激细胞毒性T细胞。用不同的BS制备处理后，我们无法观察到对B细胞的任何影响。此外，我们发现BA制剂对B细胞没有影响。用重要的BA处理后的比例为1：3（PBMCS：杆菌），T-辅助细胞的计数和活化的T-助因细胞增加（CD4+：P <0.01; CD4+CD25+：P <0.05）。BA的无细胞益生菌培养物以及紫外线灭活的BA对T细胞增殖和激活没有影响。 总体而言，我们认为这两种不同的芽孢杆菌菌株增强了T细胞的激活和增殖，这表明两种菌株在体外对鸡肉免疫细胞的免疫调节作用。 因此，我们建议服用这些益生菌可以改善鸡的细胞适应性免疫防御，从而可以预防和减少鸡肉养殖中的抗菌药物。BA的无细胞益生菌培养物以及紫外线灭活的BA对T细胞增殖和激活没有影响。总体而言，我们认为这两种不同的芽孢杆菌菌株增强了T细胞的激活和增殖，这表明两种菌株在体外对鸡肉免疫细胞的免疫调节作用。因此，我们建议服用这些益生菌可以改善鸡的细胞适应性免疫防御，从而可以预防和减少鸡肉养殖中的抗菌药物。
在菌株下闭合DNA发夹期间寡核苷酸的位移和解离
1加州大学欧文分校生物医学工程系，CA 92617，美国2，2复杂生物体系中心，加利福尼亚大学，欧文分校，CA 92697，美国，3，CHAO合成生物学中心，Chao家族综合综合癌症中心发育和细胞生物学系，加利福尼亚州，美国4.26体质de l'ecole normale sup´erieure，ENS，Universit´e PSL，CNRS，Sorbonne Universit´e，Universit´e Paris cit´e，巴黎，法国，法国，5 Kusuma生物科学学院，印度技术学院，印度技术研究所，德里，德里，110016，印度110016，印度，6个小型Biosystems，facelent de deaada de de la d de la de de de de de de de de la sica de la sica， F´ısica，巴塞罗那大学，Carrer de Mart'i franqu`ies，1，08028西班牙巴塞罗那，7纳米西亚Institut de Nanotecnologia I nanotecnologia（IN2UB），巴塞罗那大学，佩尔纳尼亚州98028 pa Barcelona，98028 pa niia pa pan pa niia pa niia pa niia pa Institut de Biologie de l'´ Ecole Normale sup´erire（Ibens），CNRS，Insers，´Ecole Normale Sup´erieure，PSL研究生，F-75005，F-75005，法国，法国，10化学和生物化学系，加利福尼亚Los Angelles，Los Angelles，Los Angelles，Ca 90095法国1加州大学欧文分校生物医学工程系，CA 92617，美国2，2复杂生物体系中心，加利福尼亚大学，欧文分校，CA 92697，美国，3，CHAO合成生物学中心，Chao家族综合综合癌症中心发育和细胞生物学系，加利福尼亚州，美国4.26体质de l'ecole normale sup´erieure，ENS，Universit´e PSL，CNRS，Sorbonne Universit´e，Universit´e Paris cit´e，巴黎，法国，法国，5 Kusuma生物科学学院，印度技术学院，印度技术研究所，德里，德里，110016，印度110016，印度，6个小型Biosystems，facelent de deaada de de la d de la de de de de de de de de la sica de la sica， F´ısica，巴塞罗那大学，Carrer de Mart'i franqu`ies，1，08028西班牙巴塞罗那，7纳米西亚Institut de Nanotecnologia I nanotecnologia（IN2UB），巴塞罗那大学，佩尔纳尼亚州98028 pa Barcelona，98028 pa niia pa pan pa niia pa niia pa niia pa Institut de Biologie de l'´ Ecole Normale sup´erire（Ibens），CNRS，Insers，´Ecole Normale Sup´erieure，PSL研究生，F-75005，F-75005，法国，法国，10化学和生物化学系，加利福尼亚Los Angelles，Los Angelles，Los Angelles，Ca 90095法国
T 中单轴菌株的紧密结合研究T
摘要使用最接近的邻居，紧密结合（TB）模型研究了单轴菌株在扶手椅，具有对称和不对称结构的T-格芬烯纳米纤维（ATGNR）中的作用。具有结构对称性和两个亚晶格结构的ATGNR在零应变时表现出狄拉克点。将单轴应变应用于这些系统会在压缩下引起多个dirac点（高达-20％的应变），其中这些点的数量与沿单位电池宽度的四碳基底单位数量相称，还考虑了结构的镜像对称性。在拉伸，单轴菌株（延伸最高20％）下，碳四脑碳诱导的不对称性导致零点的数量减少，尽管由于对称性ATGNR的基本镜像对称，但最小数量被保留。不对称的ATGNR是半导体，显示出可调的带隙，其降低是色带宽度和单轴应变的函数。单轴菌株在高压下（> 16％）下在这些系统的带边缘诱导一个单一的狄拉克点，并且带隙的闭合与对称性诱导的扰动有关，从而超过了对称性破坏对称性的，间隙开放机制。总而言之，结核病模型显示ATGNR具有适合柔性电子应用的设备功能，例如带隙调整以及相对论特性的应变工程。
Weissella cibaria W25的基因组分析，这是一种潜在的细菌蛋白产生菌株，这些菌株是从Campos Das Vertentes，Minas Gerais，Brazil
对乳制品和非乳制环境中微生物多样性的研究在理解这些生态系统中这些微生物的存在及其对最终产物的影响方面起着关键作用，尤其是当我们指的是传统和手工产物时。每个环境都有偏爱并允许不同细菌物种发展的独特和特定的特征[1]。手工奶酪和生乳被认为是实验室新菌株的潜在来源[2]。制作这些奶酪的方式可以确定由放牧，动物皮肤，器皿，表面和其他可能与奶酪接触的细菌进行的发酵[3]。对手工奶酪中存在的细菌菌株的研究表明，存在尚未与奶酪有关的物种和具有差异化技术特征的乳酸细菌多样性[4]。此外，除了草，不同类型的青贮饲料甚至动物皮肤等非乳制环境也是已适应的新型菌株的重要来源，因此可以提供有趣的特征来探索[5]。从乳制品和非乳制环境中分离出来的魏森氏菌的多样性对于在最终产物中了解这种微生物的知识的丰富而引起了人们的极大兴趣。Weissella属由分类为革兰氏阳性，过氧化氢酶阴性，非孢子形成，球形形态或短芽孢杆菌的细菌组成。它们属于实验室，这主要是由于碳水化合物的发酵产生乳酸[6]。这项研究的主要目的是宣布和分析魏森氏菌W25基因组的测序和注释，并进行全面的比较基因组
细胞和转录组对致病性和非致病性弧菌性副溶血性菌株的菌株，导致急性肝癌坏死疾病（AHPND）litopenaeus vannamei
。cc-by 4.0国际许可（未经Peer Review尚未获得认证）是作者/资助者，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。这是该版本的版权所有，该版本发布于2023年11月8日。 https://doi.org/10.1101/2023.11.08.566166 doi：biorxiv preprint
野生型果蝇melanogaster菌株对紫藤酮暴露的反应差异
果蝇Melanogaster已被确立为研究人类疾病的可靠模型。然而，此类研究的各种设计以及菌株的不同起源显着导致菌株之间的代谢和分子差异。帕金森氏病（PD）是一种神经退行性疾病，涉及多巴胺能神经元的丧失，导致各种运动和非运动症状，包括但不限于Bradykinesia，姿势不稳定，认知能力下降，认知能力下降和胆汁性营养不良。长期暴露于毒素（例如烤）可以诱导神经元细胞死亡。我们通过直接喂养烤烤面包酮的食物向果蝇Melanogaster野生型菌株开发了一种零星的PD模型，以前已证明该菌株会导致神经元细胞死亡，并用于模仿果蝇中的PD。在两种野生型菌株（俄勒冈-R和Canton-S）中暴露于鱼藤酮后，监测其攀爬能力和寿命的差异。我们发现，与年龄匹配的广州苍蝇相比，俄勒冈-R紫红酮暴露时的运动缺陷程度更高。我们还观察到，与俄勒冈-r蝇相比，广州蝇（烤面包酮喂养的和非洛诺酮）的生存百分比较低。但是，广州蝇中的攀爬缺陷并不像俄勒冈-r蝇中那样明显。在不同野生型果蝇菌株中涉及这种差异效应的机制尚待探索，并可能对属于不同人口统计学的PD患者的差异症状提供视角。
工程大肠杆菌菌株用于生产长的单链DNA
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。它是此预印本版本的版权持有人，该版本发布于2024年2月29日。 https://doi.org/10.1101/2024.02.29.582813 doi：Biorxiv Preprint
从厌氧木质素中分离的 Sodalis ligni 菌株 159R
摘要 具有木质素解聚、分解代谢或两者兼有能力的新型细菌分离物可能与木质纤维素生物燃料应用有关。在本研究中，我们旨在识别能够解决微生物介导的生物技术所面临的经济挑战（例如需要曝气和混合）的厌氧细菌。利用从温带森林土壤中接种并在缺氧条件下以有机溶剂木质素作为唯一碳源进行富集的菌体，我们成功分离出一种新型细菌，命名为 159R。根据 16S rRNA 基因，该分离物属于 Bruguierivoracaceae 科的 Sodalis 属。全基因组测序显示基因组大小为 6.38 Mbp，GC 含量为 55 mol%。为了确定 159R 的系统发育位置，使用 (i) 其最亲属的 16S rRNA 基因、(ii) 100 个基因的多位点序列分析 (MLSA)、(iii) 49 个直系同源群 (COG) 结构域簇和 (iv) 400 个保守蛋白质重建了它的系统发育。分离株 159R 与枯木相关的 Sodalis 行会密切相关，而与采采蝇和其他昆虫内共生体行会关系较弱。估计的基于基因组序列的数字 DNA-DNA 杂交 (dDDH)、基因组保守蛋白质百分比 (POCP) 以及 159R 与 Sodalis 进化枝物种之间的比对分析进一步支持分离株 159R 属于 Sodalis 属的一部分和 Sodalis ligni 的一个菌株。我们建议将之命名为 Sodalis ligni str。 159R (=DSM 110549 = ATCC TSD-177)。
自闭症谱系障碍儿童父母的护理人员菌株的预测指标
与其他残疾儿童的父母相比，自闭症谱系障碍（ASD）儿童的父母面临更高水平的护理人员压力。这项研究检查了儿童临床特征，这些特征可以预测374名ASD儿童父母的高水平护理人菌株。护理人员菌株。验证性因素分析表明对原始CGSQ三因素解决方案具有可接受的拟合。CGSQ子量表中最强大的儿童预测因子是：客观应变，自闭症的严重程度和主观内部菌株的破坏性行为的破坏性行为，对主观外部化菌株的对立行为和过度活跃。符合父母菌株特定要素的个性化干预措施可以减少压力并改善家庭健康。