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突变和基因编辑 | HL IB 生物学复习笔记 2025
静默突变 – 突变不会改变多肽的氨基酸序列（这是因为某些密码子可能编码相同的氨基酸，因为遗传密码是退化的）错义突变 – 突变改变多肽链中的单个氨基酸（镰状细胞性贫血症是一种由单一替代突变改变序列中的单个氨基酸而引起的疾病）无义突变 – 突变产生过早的终止密码子（信号，让细胞停止将 mRNA 分子翻译成氨基酸序列），导致产生的多肽链不完整，从而影响最终的蛋白质结构和功能（囊性纤维化是一种由无义突变引起的疾病，尽管这并不总是唯一的原因）
一种新颖的发现：1961年的Poly-U Matthaei-Nirenberg实验不能充当mRNA
表明，“ poly-u刺激了许多其他许多其他氨基酸纳入蛋白质，例如亮氨酸，异亮氨酸，苏胺，苏氨酸，精氨酸，精氨酸，组氨酸，赖氨酸，丝氨酸，色氨酸和脯氨酸””由poly-u刺激，也不知道为什么马特塞伊（Matthaei）和尼伦贝格（Nirenberg与苯丙氨酸相对应的聚-U刺激”意味着“总4个碱基的特异性”仅对应“总4种4种氨基酸”，而不是“总共20种氨基酸”。“特殊性”的概念是一个理论上的错误）。
出口受限的生物项目
Andes病毒禽流感（AI）病毒被确定为具有高致病性（HP），如下：A.4.A. AI病毒在大于1.2的6周龄鸡中具有静脉注射指数（IVPI）；或A.4.B. AI病毒在4至8周大的鸡中至少引起75％的死亡率。 Note: Avian influenza (AI) viruses of the H5 or H7 subtype that do not have either of the characteristics described in 1C351.a.4 (specifically, 1C351.a.4.a or a.4.b) should be sequenced to determine whether multiple basic amino acids are present at the cleavage site of the haemagglutinin molecule (HA0). 如果氨基酸基序与其他HPAI分离株相似，则应将测试的分离物视为HPAI，并且该病毒在1C351.A.4下受到控制。 炭疽芽孢杆菌双菌（Cochliobolus miyabeanus，helminthosporium oryzae）蓝光病毒Andes病毒禽流感（AI）病毒被确定为具有高致病性（HP），如下：A.4.A.AI病毒在大于1.2的6周龄鸡中具有静脉注射指数（IVPI）；或A.4.B.AI病毒在4至8周大的鸡中至少引起75％的死亡率。Note: Avian influenza (AI) viruses of the H5 or H7 subtype that do not have either of the characteristics described in 1C351.a.4 (specifically, 1C351.a.4.a or a.4.b) should be sequenced to determine whether multiple basic amino acids are present at the cleavage site of the haemagglutinin molecule (HA0).如果氨基酸基序与其他HPAI分离株相似，则应将测试的分离物视为HPAI，并且该病毒在1C351.A.4下受到控制。炭疽芽孢杆菌双菌（Cochliobolus miyabeanus，helminthosporium oryzae）蓝光病毒
随机饱和诱变生成高度多样化的定向进化文库
为了了解每种野生型氨基酸对不同侧链性质的可及性，我们将所有 20 种氨基酸分为 8 类：非极性（NP、M、I、L、V、A）、极性不带电（PU、S、T、Q、N）、带正电荷（PC、R、K、L）、带负电荷（NC、D、E）、芳香族（Ar、F、T、Y）和三个特殊基团 P、C、G，由于其性质不同，每个基团仅由一个氨基酸组成。通过易错 PCR，每种野生型氨基酸都有一些不可接近的性质类别，如图 4c 所示。此外，在
2025 年 Hanna H. Gray 研究员计划竞赛 成功科学研究提案示例
摘要 mTORC1 蛋白激酶响应各种输入（包括氨基酸）调节细胞生长，这些输入向 Rag GTPases 发出信号，促进 mTORC1 易位到溶酶体表面（其激活位点）。这种途径在许多疾病中失调，包括糖尿病和癌症；然而，我们对氨基酸激活 mTORC1 的机制的理解并不完整。长期以来，一个谜团是氨基酸缺乏时抑制 mTORC1 的成分的身份。作为一名研究生，我推断负调节剂可能会影响 Rags，因为它们在营养感知中起着核心作用。我们对 Rags 进行了免疫沉淀，然后进行质谱分析 (IP/MS)，结果发现了两个相互作用的蛋白质复合物，我们称之为 GATOR1 和 GATOR2。GATOR2 正向调节 mTORC1 并在 GATOR1 上游或与 GATOR1 并行发挥作用，GATOR1 是一种 Rag GTPase 激活蛋白，也是 mTORC1 的关键抑制剂。 GATOR1 成分在癌症中发生突变，可能有助于识别对 mTORC1 抑制有反应的癌症。第二个未解之谜是 mTORC1 上游氨基酸传感器的身份。为了识别假定的传感器，我们对已知的 mTORC1 调节剂进行了广泛的 IP/MS。我们发现 Sestrin2 和 CASTOR1 是与 GATOR2 相互作用的蛋白质，分别起到亮氨酸和精氨酸传感器的作用。Sestrin2 和 CASTOR1 与 GATOR2 结合以抑制 mTORC1，并且在存在氨基酸的情况下这种抑制会得到缓解。重要的是，这些传感器的氨基酸结合能力是 mTORC1 感知氨基酸存在所必需的。总之，这些成分的发现澄清了我们对氨基酸如何向 mTORC1 发出信号的理解，并提供了在疾病状态下调节 mTORC1 活性的目标。
评论文章 - 蛋白质和肽药物输送系统
蛋白质是氨基酸链，每个氨基酸链通过特定类型的共价键与其相邻氨基酸连接。肽键聚合 L-α 氨基酸形成了蛋白质的基本结构。蛋白质是指由约 50 种氨基酸组成的样本。肽是指由不到 50 种氨基酸组成的颗粒 (Bhargav, 2017)。蛋白质和肽是一种非常有潜力的治疗药物，目前蛋白质药物市场预计每年超过 400 亿美元，处方行业占 10%。这些蛋白质和肽有一些局限性，例如生物利用度较低和代谢责任。肽主要针对广泛的分子，并在肿瘤学、免疫学、传染病和内分泌学等领域提供了无限的可能性 (Bruno、Miller 和 Lim, 2013)。蛋白质和肽是水解后含有两个或多个氨基酸的生物聚合物。它们的原理是细胞的原生质，分子量更大
审查由肽两亲物形成的纳米结构
肽和蛋白质分别是氨基酸的短链和长链。表达的肽和蛋白质在生物学变异中起着重要而突出的作用，包括控制代谢，调节骨骼代谢，清除自由基，改变睾丸激素水平以及对某些疾病的治疗[1-6]。令人惊讶的是，只有二十个基因编码的氨基酸是自然界中发现的肽的基础，可以将其分为两个主要类别的亲水性和疏水性氨基酸。如方案1所示，ALA，Val，Leu，Ile，Met，Phe，Phe，Tyr和TRP的非极性烃链使它们成为亲脂性，疏水性氨基酸。虽然官能团的存在，例如羟基，酰胺，吡唑，鸟苷，胺，羧酸和硫醇，导致SER，THR，THR，THR，ASN，ASN，GLU，HIS，HIS，LYS，LYS，LYS，LYS，LYS，ASP，ASP，GLU，GLU，GLU，GLU，GLU，GLY，GLY，GLY和CYS的亲水性能（方案2）。这些氨基酸的排列共同导致具有不同亲水性，疏水性或两亲性特性的肽折叠[7]。
固态发酵将米糠转化为高...
饲喂试验后对斑节对虾幼虾进行的氨基酸分析表明，饲喂 50% FRB 替代 SBM 的虾的赖氨酸水平明显高于对照组。赖氨酸和各种其他氨基酸对虾的味道至关重要。这些氨基酸的增加将进一步增强理想的味道，而下降则会导致虾的感官特性发生变化。此外，饲喂 50% FRB 的斑节对虾的谷氨酸（https://doi.org/10.1081/FRI-100000515）——一种负责海鲜产品鲜味的物质——高于对照组。这些结果表明，FRB 可以改善斑节对虾的感官特性，对虾味道至关重要的氨基酸数量增加就是明证。
机器的补充信息...
材料。Fmoc-β-amino acids, including Fmoc- L -β-homoalanine, Fmoc- L -β-homoisoleucine, Fmoc- L -β-homoleucine, Fmoc- L -β-homophenylalanine, Fmoc-(1S,2S)-2-aminocyclopentane carboxylic acid, Nβ-Fmoc-Nω-Boc- L -β-homolysine, Fmoc-O-tert-butyl- L -β-homoserine, and Fmoc-α-amino acids, including Fmoc-glycine, Fmoc- L -alanine, Fmoc- L -isoleucine, Fmoc- L - leucine, Fmoc- L -phenylalanine, Fmoc-O-tert-butyl- L -serine, FMOC-L-β-双晶，FMOC-L-主要酸β-TERT-丁基酯，FMOC-L-谷氨酸γ-tert-叔丁基酯，Nα-FMOC-Nε-boc-l-赖氨酸是从Chem-impex International，Inc.（Wood Dale，Inc.，IL，USA，USA，USA）购买的。fmoc-l-脱毛氨酸是从热科学化学品购买的。FMOC-L-Norvaline购自Santa Cruz Biotechnology。hatu是从奥克伍德化学品获得的。Tentagel S RAM FMOC购自Advanced Chemtech（肯塔基州路易斯维尔）。Menadione，N，N-二异丙甲胺，Mueller Hinton肉汤和磷酸二氮的磷酸钠，是从Sigma-Aldrich（密苏里州圣路易斯）获得的。3-（n-甲磷脂）丙烷磺酸（MOPS）获自Fisher Scientific（宾夕法尼亚州匹兹堡）。2,3-双（2-甲氧基-4-硝基-5-磺苯基）-2H-四唑-5-羧基（XTT）购自从Invitrogen购买。Gibco Brand RPMI 1640粉末（含有苯酚红和L-谷氨酰胺，没有碳酸氢钠或HEPES）和Dulbecco的磷酸盐缓冲盐水（DPB，无钙或镁）是从Thermo Fisher Scientific（MA）获得的。使用Millipore过滤系统纯化水（18.2MΩ）。细胞滴度GLO 2.0分析套件来自Promega（WI）。