1 -Idibe,Miguel Herna´ndez大学,03202麋鹿PJO JARAMILLILLO ALVARADO S/N, LOJA, 110111 LOJA, ECUADOR 3-INSTITUTE OF BIOCOMPUTATION AND PHYSICS OF COMPLEX SYSTEMS-JOINT UNIT GBSC-CSIC-BIFI, UNIVERSITY OF ZARAGOZA, 50018 ZARAGOZA, SPAIN 4-CNR-NAN Physics, University of Calabria, 87036 Rende, Italy 5 - Investigation Unit, Foundation为了促进瓦伦西亚社区(FISABIO)的健康和生物群落调查,埃尔奇大学通用大学医院,卡米·德·阿拉扎拉(Camí'del'Allazara),西班牙6,艾丽奇(Alicante),第6章,第6章 - 康塞尔·马塞尔(Recherche Marseille Etologique de luminy,13288年法国马赛
摘要:氢键 (HB) 是生物系统中最丰富的基序。它们在确定蛋白质-配体结合亲和力和选择性方面起着关键作用。我们设计了两个对药物有益的 HB 数据库,数据库 A 包括约 12,000 个蛋白质-配体复合物,约 22,000 个 HB 及其几何形状,数据库 B 包括约 400 个蛋白质-配体复合物,约 2200 个 HB,它们的几何形状和键强度通过我们的局部振动模式分析确定。我们确定了七种主要的 HB 模式,可用作从头 QSAR 模型来预测特定蛋白质-配体复合物的结合亲和力。据报道,甘氨酸是供体和受体谱中最丰富的氨基酸残基,而 N–H · · · O 是数据库 A 中最常见的 HB 类型。HB 倾向于处于线性范围内,且线性 HB 被确定为最强的。HB 角在 100–110° 范围内的 HB 通常形成分子内五元环结构,表现出良好的疏水性和膜通透性。利用数据库 B,我们发现了 2200 多种蛋白质-配体 HB 的广义 Badger 关系。此外,每种氨基酸残基和配体功能团之间的强度和出现图为新颖的药物设计方法和确定药物选择性和亲和力提供了极具吸引力的可能性,它们也可作为命中到先导化合物过程的重要工具。
1斐济国立大学电气和电子工程学院,斐济苏瓦2号2 2医学科学数学实验室,生物科学系,东京大学科学学院,东京大学,113-0033,日本113-0033,日本3,医学科学数学实验室,计算生物学和医学科学学院,研究生科学,研究生,科学研究生,纽约市。 0033,日本4医学科学数学实验室,Riken综合医学科学中心,横滨,230-0045,日本5日本5综合和智能系统研究所,格里菲斯大学,内森,布里斯班,QLD,QLD,4111,澳大利亚 *,应向他们致辞。电子邮件地址:rs:sharmaronesh@yahoo.com tt:tsunoda@bs.s.s.u-tokyo.ac.ac.jp as:alok.fj@gmail.com
1化学系,科学学院,阿拉马·伊克巴尔公开大学,伊斯兰堡44000,巴基斯坦; uzmarajpoot123@gmail.com(U.P.); overlord.scorpion6@gmail.com(m.i.m.)2基础科学与人文科学系,达沃德工程技术大学,卡拉奇74800,巴基斯坦; pervaiz.ali@duet.edu.pk 3,伊斯兰堡45320,Quaid-i-Azam大学化学系; asaeed@qau.edu.pk(A.S。); aahmed@chem.qau.edu.pk(A.A.)4牙科科学系,牙科学院,国王沙特大学,利雅得,沙特阿拉伯11545; wsaeed@ksu.edu.sa 5跨学科工程与科学学院(SINES),国立科学与技术大学(NUST),伊斯兰堡44000,巴基斯坦; fouzia@sines.nust.edu.pk(F.P.); basitazad50@gmail.com(B.A.)6医疗保健生物技术Atta-ur-Rehman Applied Biosciences,国立科学与技术大学(NUST),伊斯兰堡44000,巴基斯坦; javedaneela19@asab.nust.edu.pk 7 Gujrat大学生物化学与生物技术系,古吉拉特大学,巴基斯坦50700; Hammad.ismail@uog.edu.pk 8德克萨斯州A&M健康科学中心,Joe H. Reynolds Medical Build,美国德克萨斯州77843,美国大学; isaackhan1@tamu.edu *通信:nasimaa2006@yahoo.com或nasima.arshad@aiou.edu.edu.pk
近 30 年来,以“绑定问题”为中心的视觉研究对视觉感知的架构有了丰富的见解:当对多个对象进行编码或将它们保存在工作记忆中时,我们如何能够正确地表示特定特征与其对应对象之间的对应关系(Treisman,1996 年、1998 年;von der Malsburg,1995 年;Zhang,Zhang,& Fang,2020 年)?例如,当面对一个红色圆圈和一个蓝色正方形时,我们的视觉系统如何不将其表示与红色正方形和蓝色圆圈的表示混淆?绑定问题不太可能通过连接编码(即代表多个视觉特征的同一群神经元,Di Lollo,2010 年、2012 年)完全解决,因为我们能够将新的特征配置绑定在一起,我们也可以将两个大致相同的对象表示为两个独立的对象,而不是一个。此外,
本报告中与勘探结果和勘探目标有关的信息基于澳大利亚采矿和冶金学院成员Justin Brown先生汇编的信息。在编译了勘探结果和勘探目标时,布朗先生是Element 25 Limited的雇员。布朗先生是一位地质学家,具有足够的经验,与正在考虑的矿产和矿床类型以及他所从事的活动相关的经验与2012年版的“澳大利亚守则报告勘探结果,矿产资源和矿石储量”的活动所定义的活动相关。布朗先生同意将此信息包含在本报告中出现的形式和上下文中。
摘要:硅阳极需要机械强度高且电化学稳定的聚合物粘合剂体系,以适应循环操作过程中经历的剧烈体积膨胀。在此,我们报告使用聚(丙烯酸)接枝苯乙烯-丁二烯橡胶(PAA- g- SBR)和 80% 部分中和的 Na-PAA 作为硅石墨阳极的粘合剂体系。PAA- g -SBR 接枝共聚物是通过将丙烯酸叔丁酯接枝到 SBR 上并用 H 3 PO 4 处理中间体合成的。发现 PAA- g -SBR/Na-PAA 粘合剂体系比 Na-PAA/SBR 体系具有更好的电化学性能。Na-PAA/PAA- g -SBR 体系在 130 次循环中具有稳定的 673 mAh g -1 容量保持率,而 Na-PAA/SBR 体系的容量保持率立即下降。 Na-PAA/PAA- g -SBR 体系还表现出更好的机械性能,与 Na-PAA/SBR 体系相比,杨氏模量值更低,失效应变更大。总体而言,这些发现表明,在下一代锂离子电池中,硅阳极应用是一种有前途且坚固的聚合物粘合剂体系。关键词:锂离子电池、硅电极、PAA-g-SBR 聚合物、丙烯酸叔丁酯、交流阻抗、电极粘附、储能应用■ 介绍
基因表达的抽象调节是细胞生物学的重要组成部分。转录因子蛋白经常结合旋转启动位点上游的调节DNA序列,以促进RNA聚合酶的激活或抑制。研究实验室已经专门用于了解转录因子的转录调节网络,因为这些受调节的基因为宿主生物的生物学提供了重要的见解。各种体内和体外测定已被开发,以阐明转录调节网络。包括SELEX-SEQ和CHIP-SEQ在内的几种测定法捕获了结合DNA结合的转录因子,以确定首选的DNA结合序列,然后可以将其映射到宿主有机体的基因组以鉴定候选调节基因。在此方案中,我们描述了一种使用限制性核酸内切酶,保护,选择和放大式(REPSA)来确定兴趣转换因子的DNA结合序列的替代性迭代选择方法。与基于传统抗体的捕获方法相反,REPSA通过用IIS型限制性核酸内切酶来挑战结合反应来选择转录因子结合的DNA序列。耐裂解的DNA物种通过PCR扩增,然后用作下一轮REPSA的输入。重复此过程,直到通过凝胶电泳观察到受保护的DNA物种,这表明成功的REPSA实验。随后的REPSA选择的DNA的高通量测序以及伴随基序发现的epsa选择的DNA,可以使用扫描分析来确定转录因子共识结合序列和潜在的调节基因,并在确定生物体的转录调节网络方面提供了关键的第一个步骤。
请注意,由于它们的高负电荷,我们排除了两个裸露的DNA(U DD <0)之间吸引人的可能性。上面的这三个条件可以在物理上理解如下。由于DNA无法单独与二氧化硅结合,因此结合剂和DNA之间的吸引力(条件2)将确保DNA粘在结合剂上,而复合物(DNA+结合剂)与二氧化硅结合。结合剂必须与二氧化硅结合才能发生(条件1)。但是,如果两种结合剂之间存在吸引力,则在两个结合剂之间形成复合物,而不是DNA结合剂复合物(条件3),它在能量上更有利。这将降低DNA的结合概率与二氧化硅。在这里值得一提的是,在这项工作中为参数扫描所选择的范围由我们较早的作品12,43指导,其中进行了广泛的无偏见和偏见的分子动力学模拟(伞采样模拟),以评估参数。在此,由于系统的复杂性,我们无法评估参数的确切值,因此尝试了参数扫描。在上述所有计算中,我们将结合剂与DNA(rθ)的浓度比为5。
摘要:RNA 在基因表达中发挥着许多重要作用,并参与各种人类疾病。尽管基因组编辑技术已经建立,但与基于核苷酸的 RNA 操作技术(如 siRNA 和 RNA 靶向 CRISPR/Cas)相比,操纵特定细胞 RNA 分子的序列特异性 RNA 结合蛋白的工程化尚不成熟。在这里,我们展示了一种使用含五肽重复 (PPR) 基序的蛋白质的多功能 RNA 操作技术。首先,我们开发了一种基于 PPR 的设计序列特异性 RNA 结合蛋白的快速构建和评估方法。该系统已经能够稳定构建数十种针对长 18 nt RNA 的功能性设计 PPR 蛋白,该蛋白针对哺乳动物转录组中的单个特定 RNA。此外,设计 PPR 蛋白的细胞功能首次通过控制报告基因或内源性 CHK1 mRNA 的可变剪接得到证明。我们的研究结果展示了一种使用 PPR 蛋白的多功能蛋白质 RNA 操作技术,该技术有助于理解未知的 RNA 功能和创建基因回路,并有可能用于未来的治疗。