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通过大肠杆菌代谢工程提高微生物燃料电池的性能以实现吩嗪的生产
摘要：基于介质的微生物电化学系统（例如微生物燃料电池 (MFC)）的设计、开发和应用进展的核心作用之一是通过细胞外电子转移 (EET) 模式在导电电极表面和微生物之间建立有效且成功的通信。大多数基于微生物的系统需要使用人工电活性介质来促进和/或增强电子转移。我们之前的工作建立了一个外源性吩嗪类介质库作为介质系统，以使模型微生物大肠杆菌作为一种有前途的生物技术宿主能够进行 EET。然而，向微生物电化学系统中添加外源性介质具有某些限制性缺点，特别是关于介质对细胞的毒性和增加的运营费用。在此，我们展示了通过将来自铜绿假单胞菌的吩嗪生物合成途径引入大肠杆菌，大肠杆菌能够内源性地自生成吩嗪代谢物的代谢和遗传工程。该生物合成途径包含一个由七个基因组成的吩嗪簇，即 phzABCDEFG（phzA-G），负责从分支酸合成吩嗪-1-羧酸 (PCA)，以及两个另外的吩嗪辅助基因 phzM 和 phzS，用于催化 PCA 转化为绿脓素 (PYO)。我们展示了通过电化学测量、RNA 测序和显微镜成像收集的工程化大肠杆菌细胞的特征。最后，工程化大肠杆菌细胞用于设计性能增强的微生物燃料电池，最大功率密度从未工程化大肠杆菌细胞的 127 ± 5 mW m − 2 增加到基因工程的、产生吩嗪的大肠杆菌的 806 ± 7 mW m − 2。我们的结果表明，将异源电子穿梭引入大肠杆菌可以提高电池的性能。大肠杆菌不仅是一种有效的策略，而且是一种很有前途的策略，可以在活生物电化学系统中建立有效的电子介导，并提高与 MFC 电流产生和功率输出相关的整体 MFC 性能。关键词：微生物燃料电池、基因工程、性能改进、细胞外电子转移 ■ 介绍
重组 - 甲硫代子酶产生的大肠杆菌在微生物组中灌输了抑制原位细胞系小鼠模型中的三阴性乳腺癌
摘要。背景/目标：饮食和重组蛋白酶（RMETASE）的蛋氨酸限制对癌症治疗有效或与化学疗法药物结合在一起。我们先前表明，可以在小鼠微生物组中安装口服rmeTase产生大肠杆菌JM109（大肠杆菌JM109-RMETASE）的大肠杆菌JM109（大肠杆菌JM109-RMETASE），并抑制同步小鼠模型中的结肠癌生长。在本报告中，我们研究了口服大肠杆菌JM109-胺在原位三阴性乳腺癌（TNBC）细胞系小鼠模型中的疗效。材料和方法：首先，我们在雌性无胸腺NU/NU裸小鼠4-6周的腹部乳腺上建立了原位4T1小鼠三阴性乳腺癌。肿瘤生长后，将15只小鼠分为三组5。第1组通过每天两次口服磷酸盐缓冲盐水（PBS）作为对照。第2组由非重组大肠杆菌JM109通过每天两次口服口服的细胞作为对照。第3组由两次饲养大肠杆菌JM109-RMETASE细胞
在鉴定弯曲的大肠杆菌 - 阿莫西林 - 克拉维烷基抗抗性机制
弯曲杆菌的空肠和弯曲杆菌是全球细菌性胃炎的最常见原因（Chlebicz和Śliëewska，2018年）。它们是通过消费受污染的产品（尤其是肉类，主要是鸡肉，牛肉和猪肉）传播的食源性病原体。在2021年的欧洲，弯曲杆菌病占疾病的12万例（欧盟一人健康，2021年），而在美国，弯曲杆菌感染的数量估计为每年150万次疾病（Delahoy等人，2023年）。弯曲杆菌病可引起诸如腹部疼痛，发烧和腹泻等症状，这是生命极年龄的显着风险（Fernández-Cruz等，2010）。抗菌治疗，但是对常用的抗菌药物的耐药性是令人关注的。
评估重组侵入性，非致病性大肠杆菌作为针对细胞内病原体Brucella
我们的方法利用非病原性大肠杆菌在递送和呈递抗原时模仿细胞内病原体的布鲁氏菌融合体来刺激TH1和CTL反应。大肠杆菌通常是细胞外的，而布鲁氏菌是细胞内细菌。因此，我们启动了大肠杆菌（DH5α），以表达含有耶尔森氏菌的INV基因的质粒，单核细胞增生李斯特氏菌的基因和HLY基因[31]。通过结合αβ1-整合素异二聚体来引入宿主细胞的大肠杆菌侵袭。整合素的聚类后，Inva-sin激活了信号级联。一种信号通路会导致局灶性粘附组分的激活，包括SRC，局灶性粘附激酶和细胞乳蛋白蛋白，导致形成伪足，使细菌吞噬细菌进入宿主细胞。侵入蛋白与β1-整合蛋白的结合是必要的，并且足以诱导细菌的吞噬，即使是非专业的吞噬细胞。第二个途径，包括Rac1，NF-κB的激活和有丝分裂原激活的蛋白激酶，导致促炎细胞因子的产生[32]。互隔化后，将大肠杆菌带入发生细菌裂解的吞噬体/溶酶体。HLY基因产物以及其他细菌蛋白被释放到乳胶囊泡中。硫酸激活的Hly，也称为李斯特氏蛋白酶O（LLO）是一种在低pH值下的结合和孔形吞噬体膜的孔形成细胞溶胶蛋白酶。此批判步骤将抗原从大肠杆菌出口到细胞质细菌的细胞质含量可以通过LLO产生的孔中逃脱到乳腺细胞的胞质区室。
通过添加蛋白酶-K和RNase的煮沸法分离大肠杆菌DNA进行纯度和浓度分析
摘要 大肠杆菌是印度尼西亚尿路感染 (UTI) 的主要原因，每年约有 180,000 例报告。UTI 病例越多，越需要使用准确、快速、简单且经济的 DNA 分离方法进行 PCR 诊断。然而，目前煮沸 DNA 分离法中没有从蛋白质和 RNA 污染物中纯化 DNA 的阶段。本研究旨在调查将蛋白酶 K 和 RNase 纳入煮沸 DNA 分离法对分离过程中大肠杆菌 DNA 纯度和浓度的影响。煮沸法涉及加热至 95 C – 100 C 导致细胞裂解并释放细胞成分，包括 DNA。尿液样本以不同的麦克法兰标准（0.25、0.5 和 1）人工污染大肠杆菌。然后进行煮沸 DNA 分离法，然后使用 NanoDrop 分光光度计分析纯度和浓度。本研究表明，煮沸 DNA 分离法中使用的蛋白酶 K 和 RNase 浓度与随后的 DNA 纯度和浓度增加之间存在正相关性。尽管与未添加蛋白酶 K 和 RNase 相比，DNA 纯度和浓度有所增加，但与未添加蛋白酶 K 和 RNase 相比，其统计学意义并不显著，DNA 纯度的 p 值为 0.245，DNA 浓度的 p 值为 0.353。建议进一步研究在煮沸 DNA 分离法中使用更高的蛋白酶 K 和 RNase 浓度，以提高大肠杆菌 DNA 的纯度和浓度。这种增强可以改善 PCR 扩增并有助于诊断大肠杆菌相关的尿路感染。关键词煮沸法、DNA 纯度、DNA 浓度、蛋白酶 K、RNase。
菲律宾Losbaños的自流井水域的多药耐药大肠杆菌
由于商业饮用水的成本上涨，居民（尤其是在农村地区）越来越依赖自流井水，而自流井水通常是未经处理的，并且没有经常测试是否有损坏。这可能导致摄入对抗生素耐药性的微生物的摄入风险更高。因此，这项研究的重点是从菲律宾Losbaños，菲律宾的Losbaños中检测出来自选定Barangays（Bayog，Malinta和Mayondon）的自流井水样品的粪便（特别是大肠杆菌）。分离的大肠杆菌以获得抗菌素耐药性。使用多管发酵法确定，在30个水样中，大肠菌群的八个水样呈阳性。在八个样品（MY2-2，ML2-3和ML2-4）中，有三个获得了大肠杆菌分离株，如通过表型和分子表征所识别的。使用磁盘扩散测定法，在分离株中鉴定出抗生素头孢唑酮，Meropenem，loxacinem和甲氧苄啶磺胺甲恶唑的耐药模式。的结果表明，MY2-2对头孢曲松，MeropeNem和甲氧苄啶磺胺甲氧唑具有抗性。 ML2-3对头孢唑酮和MeropeNem具有抗性，而ML2-4对所有四种抗生素具有抗性。聚合酶链与引物检测到TEM基因的反应，这是一种扩展的β-内酰胺酶基因，表明分离株对氨苄西林和青霉素具有抗性。表型和分子方法的结果表明分离株具有多药耐药性。根据家庭访谈，隔离了MY2-2的自流井水被10个家庭用来饮酒。因此，地方政府部门应定期监测自流井水的微生物质量，进行教育和信息运动，以了解可以从消耗不洁的水中染上的疾病，并确保可以使用饮用水，尤其是对于没有净化水的家庭。
在连续培养中进化的大肠杆菌菌株甲酸属依赖型的遗传和生物催化基础
Valley Delmech，Nadia Perthat，Oriane Monet，外国Marion，Darii Ecataria和Al。插入Methabolia，2022，72，pp.200-214。10.1016/j.ymben.2022.03.010。
YDAT的DNA结合的结构基础，YDAT是来自Escherichia Coli O157：H7
ydat在某些lambdoid噬菌体和预言中相当于CII阻遏物的功能。ydat可作为DNA结合蛋白起作用，并识别5 0 -TTGATTN 6 AATCAA-3 0倒置重复。DNA结合结构域是一个螺旋 - 螺旋 - 螺旋（HTH）含有POU域，其次是长螺旋（6），形成了一个反平行的四螺旋束，形成了四聚体。与典型的HTH基序相比，HTH基序中的螺旋2和识别螺旋3之间的循环异常长，并且在YDAT家族内的序列和长度高度变化。POU结构域具有相对于自由结构中的螺旋束相对于螺旋束的自由度，但是它们的方向固定在DNA结合上。
大肠杆菌亮氨酸响应调节蛋白在体内桥接 DNA，并在外源亮氨酸存在下可调地解离
摘要 盛宴-饥荒反应蛋白是原核生物中一类广泛保守的全局调节蛋白，其中研究最多的是大肠杆菌亮氨酸反应调节蛋白 (Lrp)。Lrp 能够感知环境营养状况，并随后直接或间接地调节大肠杆菌中多达三分之一的基因。Lrp 主要以八聚体和十六聚体 (16 聚体) 的形式存在，其中亮氨酸被认为会使平衡向八聚体状态移动。在本研究中，我们分析了三种寡聚状态的 Lrp 突变体在其与 DNA 结合和调节外源亮氨酸引起的基因表达的能力方面的影响。我们发现二聚体以上的寡聚化是 Lrp 的调节活性所必需的，并且与之前的推测相反，外源亮氨酸仅通过抑制 Lrp 与 DNA 结合来调节其靶启动子处的 Lrp 活性。我们还证明了 Lrp 结合可以在数千碱基的长度范围内连接 DNA，揭示了 Lrp 介导的转录调控的一系列新机制。
耐多药的扩展光谱β-内酰胺酶（ESBL） - 在乳制牛群中产生大肠杆菌：分布和抗菌抗性曲线
摘要：这项研究调查了延伸谱β-内酰胺酶（ESBL）的存在，分布和抗菌抗性谱，在意大利北部的乳制品群中生产大肠杆菌。收集了临床健康的犊牛，母亲和接受乳腺炎处理的奶牛的粪便，以及水，环境样品和废物牛奶的粪便，并在Chromagar TM ESBL板上接受了细菌培养。进行了问卷调查以识别风险因素。通过MALDI-TOF MS将分离株鉴定为大肠杆菌，并进行双盘协同测试（DDST）和最小抑制浓度（MIC）测定。结果，从37个（75.67％）小牛的28个粪便中分离出ESBL大肠杆菌，3（66.67％）处理过的奶牛的粪便，14个（57.15％）环境样本中的8个（57.15％）和废牛奶。所有ESBL分离株均显示出多种电阻，并被归类为抗多药（MDR）。确定了ESBL大肠杆菌选择和扩散的几种危险因素，包括缺乏对小牛喂养和住房设备的常规清洁，将废牛奶施用到雄性小牛和毛毯干牛治疗。总而言之，这项研究强调了大多数奶牛粪便中MDR，ESBL大肠杆菌的存在及其与不同样品来源的关联。因此，增加了抗生素的审慎使用，采用适当的农场卫生和生物安全措施也可能有助于防止Esbl E. Coli在牧群中的传播和传播。