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探测FMOC-苯丙氨酸/石墨烯氧化物杂交水凝胶
摘要：N-氟苯基-9-甲状腺甲苄酰基（FMOC）-pro-tected氨基酸已经显示出很高的抗菌施用潜力，其中苯丙氨酸衍生物（FMOC-F）是最著名的代表。但是，FMOC-F的活性谱仅限于革兰氏阳性细菌。对有效抗菌材料的需求扩大了石墨烯及其衍生物的研究，尽管报告的结果有些争议。在此，我们将氧化石墨烯（GO）与FMOC-F氨基酸结合在一起，首次形成FMOC-F/GO混合水凝胶。我们研究了每个成分对凝胶化的协同作用，并评估了材料对革兰氏阴性大肠杆菌（大肠杆菌）的杀菌活性。go片本身不会影响FMOC-F自组装本身，而是调节凝胶的弹性并加快其形成。杂化水凝胶会影响大肠杆菌的存活，最初导致细菌死亡突然死亡，然后由于接种效应（IE）而恢复了存活的细菌。石墨烯与氨基酸的组合是发展抗菌凝胶的一步，因为它们易于制备，化学修饰，石墨烯功能化，成本效益以及每个成分的物理化学/生物学协同作用。■简介
使用 EasyGuide CRISPR 系统设计适应大肠杆菌在蔗糖上生长的等位基因
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证下可用（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2024 年 12 月 22 日发布。；https://doi.org/10.1101/2024.12.20.629655 doi：bioRxiv 预印本
具有抗菌 CRISPR–Cas 的工程噬菌体可选择性地减少小鼠中的大肠杆菌负担
抗生素治疗会对微生物群产生有害影响并导致抗生素耐药性。为了开发一种针对多种临床相关的大肠杆菌的噬菌体疗法，我们筛选了一个包含 162 种野生型 (WT) 噬菌体文库，确定了 8 种对大肠杆菌具有广泛覆盖度、与细菌表面受体互补结合并能稳定携带插入货物的噬菌体。选定的噬菌体经过尾纤维和 CRISPR-Cas 机制改造，以专门针对大肠杆菌。我们发现，工程噬菌体可以靶向生物膜中的细菌，减少噬菌体耐受性大肠杆菌的出现，并在共培养实验中胜过其祖先 WT 噬菌体。四种最具互补性的噬菌体的组合，称为 SNIPR001，在小鼠模型和小型猪中均具有良好的耐受性，并且比单独的组成部分更好地减少小鼠肠道中的大肠杆菌负荷。 SNIPR001 目前正在临床开发中，旨在选择性杀死大肠杆菌，大肠杆菌可能会导致血液癌症患者出现致命感染。
移动 CRISPRi 集合可实现大肠杆菌必需基因的遗传相互作用研究
未经同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者（此版本于 2023 年 4 月 22 日发布。；https://doi.org/10.1101/2023.04.21.537703 doi：bioRxiv preprint
遗传决定因素是大肠杆菌中β-内酰胺/β-内酰胺酶抑制剂耐药性的进行性表型的遗传决定因素
此预印本的版权持有人（本版本发布于2023年5月25日。; https：//doi.org/10.1101/2023.05.24.542208 doi：Biorxiv Preprint
小分子调控的 sgRNA 能够通过 Cas9 控制大肠杆菌中的基因组编辑
CRISPR-Cas9 已为广泛应用的基因编辑带来了巨大进步。为了进一步发挥 Cas9 的效用，人们一直在努力实现对其核酸酶活性的时间控制。虽然不同的方法都侧重于调节哺乳动物细胞中的 CRISPR 干扰或编辑，但所有报道的方法都无法控制细菌中的核酸酶活性。在这里，我们开发了 RNA 接头，将茶碱和 3-甲基黄嘌呤 (3MX) 结合适体与 sgRNA 结合起来，从而实现大肠杆菌中的小分子依赖性编辑。这些可激活的向导 RNA 能够实现对体内基因编辑的时间和转录后控制。此外，它们还减少了因基因组切割而导致的宿主细胞死亡，这是 CRISPR 介导的细菌重组的主要限制。
大肠杆菌血清型O157：H7的生理和转录组分析响应鼠李菜脂治疗 开发用于欧洲进行性脑部疾病的量身定制的剪接开关寡核苷酸：开发，调节和实施Consi 转录因子FOXM1在糖尿病及其... 中的作用 Lelliottia amnigena和Pseudomonas putida与关键SARS-COV-2感染相关的共同感染：病例报告 多个免疫细胞中的蛋白O-Glcnacylation及其治疗势 具有库存管理的绿色供应链网络设计的综合优化模型
摘要：rhamnolipid（RL）可以抑制大肠杆菌O157：H7的生物膜形成，但关联机制仍然未知。我们在这里对用RL和未经处理的培养物处理的培养物进行了比较生理和转录分析，以阐明RL可能抑制大肠杆菌O157：H7中生物FM形成的潜在机制。抗生物膜测定法显示，用0.25-1 mg/ml的RL处理抑制了超过70％的大肠杆菌O157：H7生物膜形成能力。细胞水平的生理分析表明，高浓度的RL显着降低了外膜的疏水性。大肠杆菌细胞膜完整性和渗透性也受到RL的显着影响，这是由于细胞膜脂多糖（LPS）的释放增加。此外，与未经处理的细胞相比，在用RL处理的细胞中，转录组促进显示了2601个差异表达的基因（1344个上调和1257个下调）。功能富集分析表明，RL治疗负责负责LPS合成，外膜外蛋白合成和型脂肪组装以及型多N-乙酰基 - 葡萄糖胺生物合成和基因所需的下调基因。总而言之，RL处理抑制了大肠杆菌O157：H7生物膜形成，通过修饰关键的外膜表面特性和粘附基因的表达水平。
https://doi.org/10.15159/ar.21.131关于在建筑材料中使用天然纤维的文献计量分析G.M.G. Ferreira 1，D。Cecchin1，*
摘要：猪被称为主要的弯曲杆菌储层。弯曲杆菌病是人类中最常见的胃肠道疾病，主要是由于禽肉的食用而引起的，对猪肉的作用知之甚少。猪通常与c有关。大肠杆菌，包括抗菌抗性分离株。因此，必须将整个猪肉生产链视为抗菌抗菌c的重要来源。大肠杆菌。 这项研究旨在确定弯曲杆菌属的抗菌素耐药性。 在五年的时间内，从爱沙尼亚屠宰场的捕获猪的盲肠样品中分离出来。 弯曲杆菌的比例为52％。 将所有弯曲杆菌分离株鉴定为c。 大肠杆菌。 高比例的分离株对大多数研究的抗菌剂具有抗性。 对链霉素，四环素，cipro bloffro oxacin和nalidixic酸的抗性分别为74.8％，54.4％，34.4％和31.9％。 此外，分离株的高比例（15.1％）具有多种耐药性，总共93.3％对至少一种抗菌剂具有抵抗力。大肠杆菌。这项研究旨在确定弯曲杆菌属的抗菌素耐药性。在五年的时间内，从爱沙尼亚屠宰场的捕获猪的盲肠样品中分离出来。弯曲杆菌的比例为52％。将所有弯曲杆菌分离株鉴定为c。大肠杆菌。 高比例的分离株对大多数研究的抗菌剂具有抗性。 对链霉素，四环素，cipro bloffro oxacin和nalidixic酸的抗性分别为74.8％，54.4％，34.4％和31.9％。 此外，分离株的高比例（15.1％）具有多种耐药性，总共93.3％对至少一种抗菌剂具有抵抗力。大肠杆菌。高比例的分离株对大多数研究的抗菌剂具有抗性。对链霉素，四环素，cipro bloffro oxacin和nalidixic酸的抗性分别为74.8％，54.4％，34.4％和31.9％。此外，分离株的高比例（15.1％）具有多种耐药性，总共93.3％对至少一种抗菌剂具有抵抗力。
ptpn2在肠病和肠肠肠道e的小鼠模型中调节细菌清除率。大肠杆菌感染
引言肠上皮调节营养，液体和电解质吸收，充当防止细菌入侵宿主的物理障碍，并为潜在的免疫系统提供了重要的线索，以维持对食物抗原的耐受性和儿童抗原的耐受性（1-3）。反过来，免疫细胞通过提供刺激来促进肠上皮细胞（IEC）屏障功能和屏障密封分子的表达来影响上皮屏障的功能（4，5）。在胃肠道感染期间，肠中的免疫细胞诱导强烈的免疫反应以消除入侵的病原体（4、6、7）。这些免疫反应可能会对上皮产生不利的影响，启动IEC过早死亡，同时还促进液体分泌以帮助消除身体中的病原体（8）。除了引发强烈的免疫反应以消除感染剂外，还必须控制感染后对炎症反应的控制，以防止过度和/或慢性炎症反应（4，6）。属于IEC的肠道巨噬细胞通过促进IEC的屏障功能并防止违反上皮屏障的细菌的全身传播（4，6）来影响人体对入侵病原体的反应（4，6）。在生理条件下，肠道宏分泌大量的抗炎细胞因子和其他免疫细胞中的烙印耐受性（6、9、10），但在存在入侵病原体的情况下迅速获得炎症表型。因此，肠道巨噬细胞对于安装有效的保护性免疫反应是必不可少的（4，9）。Previous studies have investigated how macrophages and other mononuclear phago- cytes interact with other immune cells and how they directly react to bacterial products to provide pro- tection against pathogens (6, 11), but it is still poorly understood how macrophage–IEC interactions contribute to combating invading pathogens or how disturbed macrophage–IEC interplay affects the ability of the body to defeat infections.我们最近证明了蛋白酪氨酸磷酸酶非受体2型（PTPN2）的丧失从批判性的角度改变了IEC与巨噬细胞的相互作用，并损害了
限制植物类黄酮3'-羟化酶和4'-O-甲基转移酶的滥交可改善（2s） - hisperetin在E. coli
摘要：在适应环境挑战时，酶滥交在进化上是在植物上获得新酶功能的有利有利的。但是，这种滥交会对微生物中植物酶编码的基因的表达产生负面影响。在这里，我们表明，精炼类黄酮3' - 羟化酶（F3'H）和4'-O -O-甲基转移酶（F4'OMT）的滥交可改善（2 s） - 大肠杆菌中的粘蛋白蛋白产生。首先，我们采用了反分子对接来筛选来自Tricyrtis hirta的高底物特异性Thf3'h，可以选择性地将100 mg l-1（2 s） - 纳林蛋白转换为（2 s）-eriodictyol，但不是（2 s） - sososakuranetin，with airair cyto p450 p450。第二，我们采用了一种定向的进化方法来限制Mentha×Piperita的MPOMT的滥交。携带MPOMT S142V突变体的菌株表现出对（2 s）eriodictyol的偏爱。最后，产生了27.5 mg l-1（2 s） - hisperetin，而仅少量的（2 s） - eriodictyol和（2 s） - 苏瓜氏素作为副产物积累。该值与父母菌株相比，（2 s） - 嵌素增加了14倍，以及侧产物的急剧减少。我们的工作强调了减轻微生物细胞工厂生产天然产物时植物酶滥交的好处。关键字：酶混合，类黄酮，（2s） - hesperetin，定向进化，类黄酮3' - 羟化酶，黄酮4''-o-甲基转移酶■简介黄酮类黄酮是遥远的基本c 6 -c 6 -c 6 -c 6 -c 6 -c 6 carbon carbon carbone carbon car car car the care1除了它们的生态重要性外，2种类黄酮施加抗氧化剂，3，4抗癌，5和肝保护活性。6最近，报告了类黄酮对SARS-COV19的积极作用。7在2020年，全球类黄酮市场的价值为1.497亿美元，预计到2030年将达到2.7178亿美元（按产品类型，表格，应用程序，应用：全球机会分析和行业预测，2021 - 2030年）。尤其是O-甲基化的类黄酮已成为具有众多生物学和药理特性的8-11