电子和光学特性。例如,通过 PES 和 DFT 计算研究了掺杂一个和两个 V 原子的 Si 3–6,表明 V 2 Si 3–6 中存在强的 V–V 键。30 结合 PES 测量和 DFT 计算对 V 3 Si 3 14 31 和 V 1 3 Si 12 21 进行研究,可以识别它们的结构,并发现 V 3 Si 12 中的亚铁磁序。通过比较测量的红外多光子解离光谱和模拟的红外吸收光谱,确定了 n = 6–9 和 12–16 的 VSi n + 的结构。52–54 在为数不多的较大团簇研究中,PES 和 DFT 计算相结合表明 V 2 Si 20 采用类似富勒烯的 Si 20 笼,内部封装着 V 2 单元。55 另一项理论研究预测了 Si 14–18 V + 的结构。 40 然而,缺乏 VSi n 和 VSi n for n Z 14 的实验数据。本文,我们基于 PES 测量和 DFT 计算,对掺杂单个 V 原子的中尺寸 Si 团簇 VSi n ( n = 14–20 ) 进行了系统的研究。
图 1:单层结构,(ab) 碘化铅-PbI 2 ,(cd) 氧化铅 PbO ,(ef) 氧化锡 SnO ,(gh) 硫化铟-InS ,(ij) 硒化铟-InSe ,分别为顶视图和透视侧视图。(k) PbO 和 SnO ,(l) PbI 2 ,InS 和 InSe 的第一布里渊区路径。原子颜色代码:黑色=Pb,紫色=I,红色=O,浅蓝/灰色=Sn,浅粉色=In,黄色=S,绿色=Se
引言 生命系统中的生理过程受制于有规律的周期性波动——生物节律 [1]。生命组织各个层面的生物功能的周期性是生物系统的主要特性之一 [2]。昼夜节律似乎是所有生物节律中最具价值的 [3],属于自由发展的内源性节律 [4],大约持续 24 小时 [3]。昼夜节律与昼夜节律变化有关,即地球绕地轴旋转 [5]。如今,运动活动、体温与皮肤温度、脉搏和呼吸频率、血压、利尿等都有昼夜节律 [4]。24 小时昼夜睡眠-觉醒周期是人类所特有的 [6],尽管睡眠不仅仅是昼夜节律系统的一部分 [7]。睡眠约占人类生命的三分之一,睡眠质量决定了总体健康水平 [8]。睡眠是一个复杂的生理过程,需要大脑各个区域的相互作用 [9]。睡眠包括两个阶段:慢波睡眠和快速眼动睡眠 [8]。夜间睡眠由 4-5 个这样的周期组成,持续约 90-100 分钟 [4]。调节睡眠-觉醒周期的一个重要组成部分是位于下丘脑前部的结构,
1)牛津大学牛津大学的克拉伦登实验室,牛津奥克斯11 3PU,英国2)劳伦斯·利弗莫尔国家实验室,7000 East Ave,Livermore,CA 94550,美国3)约克等离子研究所,约克大学,约克大学,赫斯林顿,约克YO10 5DD,UK 4)NIKHEF,NIKHEF,NIKHEF,NIKHEF,NIKHEF XG,阿姆斯特丹,荷兰5)差异 - 荷兰基本能源研究所,荷兰埃因霍温6)荷兰研究所6)de plasmas efusão核,上级核,1049-001,利斯本,利斯博亚,里斯本,里斯本,葡萄牙7),葡萄牙7)桑迪亚国家实验室,1515年,美国87号欧巴克,新米布克,新米布克,新米布克。伦敦帝国学院,伦敦,SW7 2AZ,英国9)数学与物理学院,贝尔法斯特皇后大学,贝尔法斯特,贝尔法斯特,BT7 1NN,英国10)激光努力赛实验室,纽约州罗切斯特大学,纽约州罗切斯特大学,美国11号)荷兰国家数学与计算机科学中心(CWI) Aldermaston,Reading,RG4 7PR,英国
由于Feynman [1]和Lloyd [2]的第一个开创性作品,量子计算被认为是探索与经典计算工具相关的强大相关多体系统的量子动力学的可能途径。哈密顿模拟算法的最新进展[3-6]允许对像计算不平衡外的dynamics [7]一样多样化的计算成本,独特的散射跨点[8,9]和基态能量估计[10]。大多数提出的算法仍然需要许多门太大,无法在NISQ设备上进行应用[11],并且需要更多的工作才能降低这些成本(例如,请参阅Eg。[9]最近分析了中微子核散射的要求)。在Somma [12]的最新工作中,我们在这项工作中提出了一种新的量子算法,具有几乎最佳的计算成本(就甲骨文调用而言),以研究光谱密度估计问题。尤其是给定栖息地操作员ˆ O,这项工作的目的是获得有效的算法,以近似频谱密度操作员ˆρ(ω)=δ(ω -− ˆ o),并使用DIRAC DIRAC DELTA函数。使用操作员的特征态ˆ o我们具有以下频谱表示
4GB 512M x 64 W3J512M64X-XPB2X 800-1600 K=1.35,G=1.5 543 PBGA 23 毫米 x 32 毫米 C、I、M 4GB 512M x 72 W3J512M72X-XPB2X 800-1600 K=1.35,G=1.5 543 PBGA 23 毫米 x 32 毫米 C、I、M 4GB 512M x 64 W3J512M64X-XLB2X 800-1600 K=1.35,G=1.5 543 PBGA 23 毫米 x 32 毫米 C、I、M 4GB 512M x 72 W3J512M72X-XLB2X 800-1600 K=1.35,G=1.5 543 PBGA 23 毫米 x 32 毫米 C、I、M 4GB 高清 512M x 64 W3J512M64X(T)-XHDX 800-1600 K=1.35,G=1.5 399 PBGA 14 毫米 x 21.5 毫米 C、I、M 4GB 高清 512M x 72 W3J512M72X(T)-XHDX 800-1600 K=1.35,G=1.5 399 PBGA 14 毫米 x 21.5 毫米 C、I、M 8GB 8GB x 64 W3J1G64X-XPBX 800-1600 K=1.35,G=1.5 543 PBGA 24 毫米 x 32 毫米 C、I、M 8GB 8GB x 72 W3J1G72X-XPBX 800-1600 K=1.35,G=1.5 543 PBGA 24 毫米 x 32 毫米 C、I、M
此预印本的版权所有者于 2020 年 3 月 6 日发布此版本。;https://doi.org/10.1101/2020.03.02.19010173 doi: medRxiv preprint
引入多细胞生物中的细胞能够感知细胞细胞的结合及其密度,以控制正确的组织形态发生和器官大小(1,2)。当细胞密度增加时,接触抑制会迫使增殖细胞进入生长停滞。当接触抑制受异常调节时,增生控制的损失是启动各种癌症的关键步骤(3)。尽管已经证明细胞连接络合物在接触抑制中起重要作用,但细胞增殖和肿瘤发生的潜在调节机制仍然鲜为人知。河马途径已被证明通过灭活YAP/TAZ信号传导来调节细胞生长的接触抑制作用起着至关重要的作用(4-8)。此途径由核心
在原子细节中解决蛋白质 - 配体相互作用是了解小分子如何调节大分子功能的关键。尽管最近的低温电子显微镜(Cryo-EM)进行了分解,但可以对许多复杂的生物分子进行高质量的重建,但是结合的Lig-和S的分辨率通常相对较差。此外,将分子模型构建和完善分子模型的自动化方法主要集中在蛋白质上,并且可能不会针对小分子配体的各种特性进行优化。在这里,我们提出了一种将生成性人工智能(AI)与低温EM密度引导的模拟整合在一起,以将配体拟合到实验图中。使用三个输入:1)蛋白质氨基酸序列,2)配体规范,以及3)实验性的冷冻EM图,我们验证了我们在一组生物医学相关的蛋白质配体复合物上验证了我们的方法,包括激酶,GPCR和溶质转运蛋白,在AI培训数据中都不存在。在生成AI不足以预测实验姿势的情况下,将柔性拟合整合到分子动力学模拟中,相对于沉积的结构从40-71%到82-95%的分子模拟拟合的整合改善了配体模型对图。这项工作提供了一个直接的模板,用于集成生成的AI和密度引导的模拟,以在配体 - 蛋白质复合物的低温EM地图中自动化模型构建,并在新型调节剂和药物的表征和设计中使用潜在的应用。