溶血性尿毒症综合征、脑膜炎、脑膜炎症、脓毒症、手术部位感染、尿路感染和医院获得性肺炎均与 ExPEC 有关 [1]。禽致病性大肠杆菌 (APEC) 是 ExPEC 的一个亚型,已成为禽类宿主的主要病原体,可引起禽类大肠杆菌病,这是一种以多种局部和全身感染为特征的综合征 [2]。最常见的病变是脐炎、蜂窝织炎、心包炎、肝周炎、气囊炎、心包炎、卵腹膜炎、输卵管炎、大肠杆菌肉芽肿和全身感染。导致疾病的大肠杆菌菌株中存在许多毒力因子 (VF),这些毒力因子编码在质粒、噬菌体或致病岛 (PAI) 内的细菌染色体上,以及其他移动元件 [3]。致病性大肠杆菌菌株通过染色体或染色体外转移从非致病性菌株获得毒力操纵子 [4]。多项研究表明,由不同基因编码的一些 VF 增强了 APEC 的致病性,导致大肠杆菌病和肉鸡组织中的生长 [5, 6]。实验室用于识别大肠杆菌的传统诊断技术
青霉素结合蛋白(PBPS)的D,D-转肽酶活性是β-乳用于阻断肽聚糖多物种的β-乳酰胺抗生素的众所周知的主要靶标。β -lactam诱导的细菌杀死涉及复杂的下游反应,其原因和后果很难解决。在这里,我们使用β-乳酰胺不敏感的L,D- trans-肽酶对PBP的功能替代,以鉴定在积极分裂细菌中β-l -lactams在β -lactams灭活PBP所必需的基因。通过这种方法鉴定的179个有条理的基本基因的功能远远超出了肽聚糖聚合的L,D-转肽酶伴侣,包括包括参与胁迫反应的蛋白质和外膜外聚合物的组装。β-乳转酰胺的未引起的作用包括脂蛋白介导的共价键的丧失,该键将外膜与肽聚糖连接到肽聚糖,不动deptagi-lization,尽管有效地具有有效的肽聚糖交叉链接,并增加了外膜外膜的渗透性。后一种效应表明β-乳酰胺的作用方式涉及通过外膜自促进的穿透力。
(未经同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者此版本于 2020 年 8 月 15 日发布。;https://doi.org/10.1101/2020.08.15.251348 doi:bioRxiv preprint
摘要:炎症性肠病(IBD)的特征是慢性肠炎,没有治愈和有限的治疗选择,通常具有全身性副作用。在这项研究中,我们开发了一种特定于目标的系统,可以通过设计益生菌大肠杆菌Nissle 1917(ECN)来潜在地处理IBD。我们的模块化系统包括三个组成部分:基于转录因子的传感器(NORR),能够检测炎症生物标志物一氧化氮(NO),1型血素蛋白分泌系统以及由人类抗TNFα纳米型的库组成的治疗货物。尽管敏感性降低,但我们的系统表现出对NO的浓度依赖性反应,成功地分泌了与常用药物adalimumab相当的结合亲和力的功能性纳米型,如酶联免疫吸收测定和体外分析所证实。这个新验证的纳米库库扩展了ECN治疗功能。也可以在ECN中首次表征所采用的分泌系统,可以进一步改编为筛选和净化感兴趣的蛋白质的平台。此外,我们提供了一个数学框架来评估工程益生菌系统中的关键参数,包括相关分子的产生和扩散,细菌定植率和粒子相互作用。这种综合方法扩展了用于基于ECN的疗法的合成生物学工具箱,提供了新颖的零件,电路和炎症热点可调反应的模型。关键字:工程益生菌,IBD,渗透性,E。Coli Nissle 1917(ECN),一氧化氮,TNFα,纳米型■简介
结果:结果表明,所有40种分离的大肠杆菌菌株均表现出对磺胺嗪钠,Enrorofuins和环丙沙星的耐药性,其中90%的菌株易受多型多糖质B。值得注意的是,应变11、23和24表现出严重的抗性。抗生素耐药性基因TEM-1,TEM-206,Stra,Strb,Qach和Blactx的检测率为100%,表明这些基因的患病率很高。此外,大多数菌株携带抗生素抗性基因与其抗性表型一致。wg菌株11、23和24个揭示了4,897,185 bp,4,920,234 bp和4,912,320 bp的基因组大小。这些菌株分别携带两个,一个和两个质粒。抗生素抗性基因的预测显示了基因组中的这些基因中的大量数量,菌株24具有最高数量,总计77个含有88种抗生素耐药基因的亚种。
hatzimanolis,精神分裂症患者衍生的嗅觉神经元干细胞中的橡木失调的循环RNA是与细胞迁移和亚细胞组织相关的疾病相关性状的基础
ydat在某些lambdoid噬菌体和预言中相当于CII阻遏物的功能。ydat可作为DNA结合蛋白起作用,并识别5 0 -TTGATTN 6 AATCAA-3 0倒置重复。DNA结合结构域是一个螺旋 - 螺旋 - 螺旋(HTH)含有POU域,其次是长螺旋(6),形成了一个反平行的四螺旋束,形成了四聚体。与典型的HTH基序相比,HTH基序中的螺旋2和识别螺旋3之间的循环异常长,并且在YDAT家族内的序列和长度高度变化。POU结构域具有相对于自由结构中的螺旋束相对于螺旋束的自由度,但是它们的方向固定在DNA结合上。
在动物肠道中未被宿主使用的铁可以直接由微生物(尤其是有害的生物)使用。有机铁(例如Fe-Gly)在体内具有较高的消化率和吸收效率。目前尚不清楚它是否可以减少ETEC对铁的利用,从而减轻ETEC感染造成的伤害。该实验主要研究将Fe-gly添加到饮食中对被ETEC感染的断奶小猪的生长性能,铁营养状况和肠形态的影响。研究发现,在饮食中增加50 mg的Fe-gly会显着增加30.6和35.3%(p <0.05),并减轻了腹泻问题,并降低了ETEC感染引起的生长绩效。腹泻率降低了40%(从31.25%降低至18.75%)。除了保护小猪的健康外,添加Fe-gly还可以提高Piblet血清中的TIBC水平(P <0.05),从而增强了它们结合和转运铁的能力。从基因表达结果和组织段结果中,添加Fe-Gly也可以减轻ETEC挑战在某种程度上引起的空肠的损害(p <0.05)。总而言之,增加50毫克的Fe-gly可以满足小猪的每日需求,提高铁的利用效率并减少肠中的残留铁。这减少了用于肠道病原性微生物的铁,从而抑制了肠道病原体的增殖并确保小猪的肠道健康。
摘要 菌毛介导的初始粘附是产肠毒素大肠杆菌 (ETEC) 感染所需的初始和关键步骤。因此,已经开发出针对这些菌毛并诱导特异性抗菌毛抗体以阻断 ETEC 初始粘附的候选疫苗。虽然这种疫苗可以有效预防 ETEC 相关的断奶后腹泻 (PWD),但由于这些抗原之间的免疫异质性,开发一种广泛有效的针对 ETEC 初始粘附的疫苗仍然是一个具有挑战性的问题。在这里,我们应用多表位融合抗原 (MEFA) 技术构建了 FaeG–FedF–FanC–FasA–Fim41a MEFA,使用主要菌毛 K88 和 F18 的粘附亚基作为骨架,它还整合了来自稀有菌毛 K99、987P 和 F41 的粘附亚基的表位;然后我们生成了一个 MEFA 计算模型并在免疫小鼠中测试了这种 MEFA 蛋白的免疫原性。接下来我们通过体外评估其抗菌毛、抗体导向的细菌粘附抑制作用,评估了针对菌毛的 MEFA 作为疫苗候选物有效预防 PWD 的潜力。计算模型表明,所有相关表位都暴露在 MEFA 表面,并且用 MEFA 蛋白皮下免疫的小鼠产生了针对所有五种菌毛的 IgG 抗体。此外,MEFA 蛋白诱导的抗菌毛抗体显著抑制了 K88 + 、F18 + 、K99 + 、987P + 和 F41 + ETEC 菌株对猪小肠 IPEC-1 和 IPEC-J2 细胞系的粘附。综合起来,这些结果表明 FaeG–FedF–FanC–FasA–Fim41a MEFA 蛋白诱导了针对五种目标菌毛的特异性抗菌毛中和抗体。至关重要的是,这些结果显示了菌毛靶向 MEFA 的潜力,并表明它们有望成为一种广泛有效的 PWD 疫苗。关键词:ETEC、PWD、菌毛、MEFA、疫苗
肠道沙门氏菌和大肠杆菌是与人类和动物中食源性疾病有关的众所周知的细菌。为它们的进化,毒力因素和抗药性确定提供了宝贵的见解。这项研究旨在表征先前分离的沙门氏菌(n = 14)和e。大肠杆菌(n = 19),使用全基因组测序中的牛奶,肉及其相关的餐具。在加纳,大多数沙门氏菌血清射手(弗雷斯诺,普利茅斯,iftantis,fivantis,give和orle-ans)在加纳尚待报道。大多数沙门氏菌分离株都是泛敏感的,但是赋予fosfomycin的抗性的基因(Fosa7。2)和四环素(TET(a))分别在一个和三个分离株中检测到。七个沙门氏菌分离株带有INCI1-I(Gamma)质粒复制子。尽管在沙门氏菌菌株中抗菌抗性并不常见,但大多数(11/19)E。大肠杆菌菌株至少具有一个分辨率基因,近一半(8/19)具有多药耐药性和携带质粒。19 e中的三个。大肠杆菌菌株属于通常与肠道e e相关的血清。大肠杆菌(EAEC)病原体。虽然属于毒力相关谱系的菌株缺乏关键质粒编码的毒力质粒,但在大多数E中都检测到了几种质粒复制子。大肠杆菌(14/19)菌株。被这些病原体污染的食物可以作为疾病传播的工具,带来严重的公共卫生风险,并需要严格的食品安全和卫生习惯,以防止爆发。因此,需要进行持续的监视和预防措施,以阻止食源性病原体的传播并降低加纳相关疾病的风险。