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北美家鼠快速气候适应和平行进化的基因组学
不同种群在相似的选择压力下，基因型和表型的平行变化提供了令人信服的适应性证据。家鼠（Mus musculus domesticus）最近定居在北美，生活在各种各样的环境中。在这里，我们测量了从北美西部纬度 21˚ 的五个种群中采样的家鼠的表型和基因型分化，并将我们的结果与北美东部的平行纬度梯度进行了比较。首先，我们表明小鼠在横断面之间在基因上存在差异，这表明它们在北美东部和西部的类似环境中独立定居。接下来，我们发现西部横断面两端的小鼠在体重和筑巢行为方面存在遗传差异，这与东部横断面的差异相似，表明表型发生了平行变化。然后，我们进行全基因组选择扫描和全基因组关联研究，以确定选择目标和体重候选基因。我们发现一些基因组特征是每个横断面所独有的，表明种群对选择的反应是特定的。然而，东部和西部家鼠横断面中受选择的基因之间存在显著的重叠，这证明了在北美地区相似的选择压力下，基因进化是平行的。
水稻抗稻瘟病基因的分子分析及对水稻叶瘟和穗瘟病反应的评估
摘要。在本次调查中，在印度卡纳塔克邦的 Ponnampet 和 Mandya 地区进行了稻瘟病反应的表型评估，结果表明，IR64、Jaya、KMP153、IR30864、Mandya Sona-1、Mandya Sona-2、KCP- 1、Dodda Byra 和 Malgudi Sanna 等水稻品种易受叶瘟和颈瘟的影响。此外，抗叶瘟的水稻品种如 KMP200、DHMAS70Q164-1b、Karibatta、Coimbatore Sanna 等仅对颈瘟表现出易感反应。相比之下，抗颈瘟的品种如 JyothixBR2655、Punkutt Kodi、Sirsi、222 和 Gangadale 也易受叶瘟的影响。只有一个品种 BR2655 对叶瘟和颈瘟病均表现出抗性。使用简单序列重复标记进行的基因型研究表明，通过分析所选水稻品种和来自不同生态区域的传统水稻品种的抗性基因分布和基因分型，使用等位基因特异性标记鉴定出 20 个主要的稻瘟病抗性基因。20 个主要稻瘟病抗性基因的单个基因频率从 10.34 到 100% 不等。Pi9 和 Pizt 基因中抗性基因分布频率分别较低和较高。本研究结果将有助于通过遗传学研究和植物-病原体相互作用制定提高稻瘟病抗性的策略。
前列腺癌中的聚（ADP-核糖）聚合酶抑制剂
摘要 基因组不稳定性是癌症的标志之一。在癌症进展过程中，同源重组修复基因的遗传变异发生率增加，20% 的前列腺癌 (PCas) 存在 DNA 修复基因缺陷。几种体细胞和种系基因变异驱动前列腺癌肿瘤发生，其中最重要的是 BRCA2、BRCA1、ATM 和 CHEK2。有一组 BRCAness 肿瘤与经典 BRCA 突变肿瘤具有相同的表型和基因型特性。聚（ADP-核糖）聚合酶抑制剂 (PARPis) 在同源重组基因受损的癌细胞中表现出合成致死性，具有这些变异的患者是 PARPi 治疗的候选人。雄激素剥夺疗法是 PCa 治疗的主要手段。PARPis 通过与雄激素核复合物的分子机制相互作用来降低雄激素信号传导。 PROFOUND III 期试验比较了奥拉帕尼和恩杂鲁胺/阿比特龙疗法，结果显示，在携带 BRCA1、BRCA2 或 ATM 突变的转移性去势抵抗性前列腺癌 (mCRPC) 患者中，放射学无进展生存期 (rPFS) 和总生存期 (OS) 均有所增加。PARPis 的临床疗效已在卵巢癌、乳腺癌、胰腺癌以及最近在前列腺癌亚组中得到证实。越来越多的证据表明，分子肿瘤委员会是前列腺癌肿瘤治疗方法的未来。在这篇综述中，我们总结了有关 PARPis 在前列腺癌中的分子机制以及临床前和临床数据。
靶向下一代测序用于诊断药物……
方法 在本系统评价和荟萃分析中，我们搜索了 MEDLINE、Embase、Cochrane 图书馆、Web of Science 核心合集、全球医学索引、谷歌学术、ClinicalTrials.gov 和世卫组织国际临床试验注册平台，查找从 2005 年 1 月 1 日至 2022 年 10 月 14 日期间发表和未发表的关于耐药结核病靶向 NGS 的报告，并在 2024 年 2 月 13 日之前更新了我们在 Embase 和 Google Scholar 中的搜索内容。符合系统评价条件的研究描述了使用原始样本、参考菌株集合或从疑似或确诊结核病患者中培养的分离株来预测结核分枝杆菌感染耐药性的靶向 NGS 方法。我们的搜索对研究类型或语言没有限制，但只筛选了英文、德文和法文的报告以确定是否符合条件。对于荟萃分析，我们纳入了使用任何参考标准的测试准确性研究，并使用诊断准确性研究质量评估-2 工具评估偏倚风险。荟萃分析的主要结果是靶向 NGS 诊断耐药结核病的敏感性和特异性，与表型和基因型药物敏感性测试相比。我们使用贝叶斯双变量模型生成总体和按药物和样本类型分层的汇总接收者操作特征图和诊断准确度测量。本研究已在 PROSPERO 注册，编号为 CRD42022368707。
遗传变异性和定量性状在...
低屈服和质量差的基因型的增长是埃塞俄比亚芝麻生产的主要限制之一。实验，以评估芝麻基因型中遗传变异和性状遗传的程度。在2018年的裁剪季节，使用简单的晶格设计评估了四十九个芝麻基因型。方差的组合分析在所有定量性状的基因型中显示出高显着的差异（p <0.01）。每植物的分支，每植物胶囊，生物量产量，收获指数，千种种子重量和细菌疫病严重程度显示出中等的表型和基因型变异系数。种子产量，生物量产量，每植物胶囊，细菌疫病的严重程度和每植物的分支显示出适中的遗传力，而遗传进步高为平均百分比。千种子体重显示出较高的遗传力，而中等遗传进展为平均百分比。收获指数显示中等的遗传力和遗传进步百分比。虽然所有其余的特征均显示出较低的遗传性，而遗传进展低为平均百分比。通常，这项研究表明了测试的芝麻基因型之间存在显着的遗传变异，以及在随后的繁殖世代中获得遗传进步的可能性。关键字：遗传进步，遗传力，芝麻（芝麻insamum l.），
ACE基因多态性和约旦成年人口中高血压的易感性
高血压是与遗传和环境风险因素相关的最常见和最复杂的疾病之一。血管紧张素转换酶（ACE）在肾素 - 血管紧张素系统途径中很重要。ACE的基因表达已被研究为可能的高血压标记。这项研究调查了约旦人口中ACE1中的多态性与ACE2基因的多态性与高血压敏感性之间的关联。该研究总共包括200名高血压患者和180个健康控制。进行了聚合酶链反应（PCR），以基因型的基因型ACE1GENE的候选多态性（RS4646994）。使用ACE1和ACE2基因的Luminex DNA阵列技术用于基因分型SNP（RS4359，RS4344，RS4341，RS4343和RS2106809）。我们的发现表明，SNP与高血压之间没有有关理和基因型频率的关联。然而，rs4359与饮食（PP = 0.049），知识HTN（P = 0.042）和DM年数（P = 0.003）显着相关。rs4341与饮食（p = 0.032），周围血管疾病（p = 0.005）和慢性肾脏病有关（p = 0.049）。虽然rs4343与饮食（p = 0.031），糖尿病（p = 0.032）和其他药物（p = 0.025）相关。此外，ACE1基因的四个SNP的单倍型与HTN患者和健康对照没有显着关联。我们的发现表明，ACE基因中的多态性与约旦成年人口的过度张力发展的风险之间没有关联。
诺如病毒疫苗（mRNA-1403＆mRNA-1405）
本演示文稿包含1995年《私人证券诉讼改革法》的含义，包括：关于：现代疫苗候选者应对与诺如病毒基因型多样性和可变性相关的挑战的能力；预期的市场机会；和发展候选活动。在某些情况下，可以通过术语来识别前瞻性陈述，例如“可能”，“应该”，“期望”，“打算”，“计划”，“目标”，“预期”，“相信”，“估计”，“预测”，“预测”，“继续”，“继续”，“继续”，或者对这些术语的负面术语或其他前瞻性的词语，尽管这些术语或其他不同意的说法都包含所有这些词，但这些词都不好。本演示文稿中的前瞻性陈述既不是承诺，也不是保证，您不应对这些前瞻性陈述不依赖，因为它们涉及已知和未知的风险，不确定性和其他因素，其中许多因素超出了Moderna的控制范围，并且可能导致实际结果与这些前瞻性陈述表达或暗示的实际结果。这些风险，不确定性和其他因素包括ModernA最近向美国证券交易委员会（SEC）提交的10-K表格的年度报告中所述的这些风险，以及在SEC网站www.sec.gov网站上提供的ModernA随后提交的申请。除法律要求外，ModernA违反了在新信息，未来的发展或其他方式的情况下，在本演示文稿中更新或修改任何前瞻性陈述的任何意图或责任。这些前瞻性陈述是基于现代的当前期望，并且仅在首页引用的日期开始。
GRAS 通知编号 GRN 000971
本通知的主题是克劳氏碱盐杆菌菌株 MCC 0538 1（A. clausii MCC 0538）孢子制剂，使用水平高达 2 x 10 9 菌落形成单位（CFU）/作为配料 2 用于烘焙食品和烘焙混合物；早餐谷物；奶酪；非酒精饮料和饮料基质；咖啡和茶；牛奶和奶制品；乳制品类似物；脂肪和油；果汁；调味品和调味品；糖果和糖霜；冷冻奶制品和混合物；水果和冰块；明胶、布丁和馅料；果酱和果冻；谷物制品和面食；硬糖和止咳糖；软糖；口香糖；草药、种子、香料、调味品、混合物、提取物和调味品；坚果和坚果制品；植物蛋白制品；加工水果；加工蔬菜和蔬菜汁；零食汤和汤混合物；糖；以及甜酱、配料和糖浆。通知告诉我们，Advanced Enzymes 认为 A. clausii MCC 0538 孢子制剂的这些用途是通过科学程序实现的 GRAS。Advanced Enzymes 将 A. clausii MCC 0538 孢子制剂描述为浅棕色至棕色粉末。Advanced Enzymes 指出，A. clausii MCC 0538 是一种无致病性、无毒的革兰氏阳性、运动性、产孢、杆状细菌。该菌株存放在印度浦那国家微生物资源中心 (NCMR) 的菌株收藏中。Advanced Enzymes 讨论了用于确认菌株身份的表型和基因型表征结果。Advanced Enzymes 描述了 A. clausii MCC 0538 孢子制剂的制造
特异性和个性化医学：一种新颖的癌症管理方法
摘要随着精度和个性化医学（PPM）的出现，医疗服务现在可以根据每个患者的独特需求来量身定制。癌症是印度死亡的主要原因之一。尽管缺乏长期有效性和显着的副作用，但在癌症患者中使用最大化疗方案。开发了一种称为PPM的新工具，以改善治疗的成功。对药物基因组学的见解有助于个性化癌症治疗的发展和可能性。在现代PPM中，有关特定患者的遗传或其他信息系统地用于选择或优化该患者的预防和治疗疗法。了解患者的蛋白质，遗传和代谢特征可以帮助医生为他们提供最佳护理。开发使用分子测定法来测量蛋白质，基因或特定突变以对疾病状态进行分层，选择适当的药物并相应调整剂量的伴侣诊断，这是该医疗策略的核心特征。结果，肿瘤学的最新突破引起了对整个领域的兴趣，并促使呼吁更加强调肿瘤科或医疗保健系统在追求更高准确性和个性化方面的作用。在本文中，我们将回顾艺术的状态，并讨论可能有助于加速PPM药物的未来发展，以治疗已经对个别患者的标准疗法具有抵抗力的癌症。重点是表型（基于活性），而不是用于PPM发育的基因型（基于机制的）方法及其如何使癌症患者受益。文章的观点侧重于肿瘤的特定变化，为精确和个性化的治疗开辟了道路。
非O1/non ...
摘要：非O1和非O139弧菌霍乱（NOVC）会引起人类胃肠道感染。被污染的食物，尤其是海鲜，是人类感染的重要来源。在这项研究中，从零售海鲜中分离出的63个NOVC菌株的毒力潜力在基因型和表型水平上被表征。尽管没有菌株编码霍乱毒素（CTX）和毒素调节的pilus（TCP），但包括Hlya Hymolysin，cholix Toxin CHXA，热稳定的肠毒素STN，以及针对3型和6型分泌系统编码的基因。所有菌株均表现出针对人和绵羊红细胞的溶血活性：90％（n = 57）形成强生生物膜，52％（n = 33）在37℃时高度运动，只有8％（n = 5）和14％（n = 9）可以抗拒60％和≥40％的人类血清。生物膜形成和毒素调节基因。CGMLST分析表明，来自临床NOVC菌株的海鲜簇的NOVC菌株。抗菌易感性测试（AST）导致对五种菌株的鉴定，这些菌株针对β-内酰胺类（包括青霉素，碳碳素，碳酸苯甲酸酯和头孢菌素），多酰氧蛋白，多酰氧蛋白和硫酰胺和硫酰胺的物质产生了非wildtype表型（中和耐药性）。表型抗性模式可以部分归因于在计算机分析中通过鉴定的获得的耐药性决定因素。我们的结果表明，从零售海鲜产品中分离出的分析的NOVC的毒力潜力差异，可以考虑进一步的致病性评估以及对未来海鲜监测中NOVC分离株的风险评估。