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World File Search SystemHMW
程序和清单 - 使用纳米素试剂盒从培养的悬浮细胞中提取HMW DNA
PANDNA试剂盒包含3个洗涤缓冲液（CW1，CW2和PW1），以提取各种样品类型。CBB套件仅包含2个洗涤缓冲液（CW1和CW2）。缓冲CW1，CW2和PW1作为浓缩物提供。CW1和CW2的最终乙醇浓度使用60％。PW1最终乙醇浓度使用70％。在使用之前，如瓶子上所示，将适当的乙醇量（96-100％）添加到缓冲液CW1，CW2和PW1中。
程序和清单 - 使用Nanobind试剂盒从培养的粘附细胞中提取HMW DNA
仅研究使用。不适用于诊断程序。©2024加利福尼亚州的太平洋生物科学（“ PACBIO”）。保留所有权利。本文档中的信息如有更改，恕不另行通知。PACBIO对本文档中的任何错误或遗漏不承担任何责任。某些通知，条款，条件和/或使用限制可能与您使用PACBIO产品和/或第三方产品有关。请参阅适用的PACBIO销售条款和条件以及PACB.com/license的适用许可条款。太平洋生物科学，PACBIO徽标，PACBIO，Circulomics，Omniome，Smrt，Smrtbell，Iso-Seq，Secel，Sequel，Nanobind，sbb，Revio，Revio，Onso，Apton，Apton，Kinnex和Puretarget是Pacbio的商标。
优化的HMW DNA提取，样品制备和测序的工作流程Pacbio Revio System上的海洋脊椎动物
•海洋基因组计划已在PACBIO Revio系统上建立了用于HMW DNA提取，自动化库制备和HIFI测序的优化的高通量工作流程。•通过Biomek i7自动化的效率提高，动手时间降低，并提高了各种DNA输入的样品一致性。•此工作流程导致了130多个海洋脊椎动物的HIFI数据，提供了无价的保护和研究工作的数据。
技术概述 - 使用Nanobind HT套件的PACBIO长阅读测序的自动高通量HMW DNA提取
纳米生HT CBB试剂盒（102-762-700; 96 rxn）•最多可用于200μl人/哺乳动物血液，非哺乳动物动物血液1，培养的细胞和细菌•预期的HMW DNA产量：血液和培养的哺乳动物细胞和2-10μg的3-15μg
使用纳米宾HMW DNA提取，PACBIO为来自多样性的高质量基因组提供了完整的端到端工作流程
摘要PACBIO测序技术提供了最完整，最准确，连续的基因组，并已被用作许多生物多样性，保护和农业类似学计划中的核心技术。在这里，我们在工作流程中提出了重大的进步，这些进步通过提供DNA隔离的方法进一步促进测序工作，并为库准备过程提供了增强的尺寸选择。这些改进应用于各种植物，昆虫和动物样品，并在新的Revio系统上进行了测序，从每个库中产生了90多个GB的数据。
程序和清单 - 使用纳米宾pandna试剂盒从人类全血中提取HMW DNA
PANDNA试剂盒包含3个洗涤缓冲液（CW1，CW2和PW1），以提取各种样品类型。CBB套件仅包含2个洗涤缓冲液（CW1和CW2）。缓冲CW1，CW2和PW1作为浓缩物提供。CW1和CW2的最终乙醇浓度使用60％。PW1最终乙醇浓度使用70％。在使用之前，如瓶子上所示，将适当的乙醇量（96-100％）添加到缓冲液CW1，CW2和PW1中。
程序和清单 - 使用Nanobind套件从DNA Genotek Oragene设备中收集的唾液中提取纳米宾HMW DNA
初始版本2024年10月1日仅研究使用。不适用于诊断程序。©2024加利福尼亚州的太平洋生物科学（“ PACBIO”）。保留所有权利。本文档中的信息如有更改，恕不另行通知。PACBIO对本文档中的任何错误或遗漏不承担任何责任。某些通知，条款，条件和/或使用限制可能与您使用PACBIO产品和/或第三方产品有关。请参阅适用的PACBIO销售条款和条件以及PACB.com/license的适用许可条款。太平洋生物科学，PACBIO徽标，PACBIO，Circulomics，Omniome，Smrt，Smrt，Smrtbell，Iso-Seq，Sequel，sequel，Nanobind，sbb，sbb，sbb，revio，onso，apton，apton，kinnex，peretarget和sprq是Pacbio的商标。
使用Promega'sWizard®HMWDNA提取试剂盒从蓝细菌中提取高分子重量DNA，并具有修改的方案，Metis
提取高分子量（HMW）DNA进行长读测序，几乎没有碎片和高纯度是从蓝细菌物种中获取的。在这里，我们描述了一种使用Promega的向导R○HMW DNA提取试剂盒从两个蓝细菌物种中获取高分子量DNA的修改方法。套件中使用的协议是“ 3.D。从革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌中分离HMW DNA”方案。在协议中的关键步骤中，我们建议除去细胞碎片的挥之不去的残留物，例如蓝细菌物种的粘液层，以防止其粘在产生的DNA颗粒上。此自定义的修改是在步骤11和12之间进行的，并称为METIS（最大化提取，转移异丙醇步骤）。此步骤大大减少了剩余的粘液层，如果保留将粘贴在DNA上，并使DNA不适合敏感的下游下一代测序，例如PACBIO测序。该方案已用于组装来自蓝细菌的两个基因组（Sychococcussp。和微囊孢子虫），一个来自革兰氏阴性细菌，lacibacter。它还允许在不使用有毒化学物质（例如苯酚）的情况下快速提取HMW DNA，而无需购买额外的试剂。
从葡萄藻生物质中分离高分子量基因组DNA的方法
开发非模型物种的高分子量 (HMW) 基因组 DNA (gDNA) 提取方案对于充分利用长读测序技术以生成有助于解答有关这些生物的复杂问题的基因组组装至关重要。获取足够的高质量 HMW gDNA 对这些物种来说可能具有挑战性，尤其是对于富含多糖的组织，例如来自葡萄藻属内物种的生物质。基于柱式 DNA 提取和生化裂解试剂盒的现有方案效率低下，并且由于生物质多糖含量的变化可能没有用。我们开发了一种优化的方案，用于从葡萄藻生物质中有效提取 HMW gDNA，以用于长读测序技术。该方案利用山梨糖醇作为初始洗涤步骤去除多糖，并产生浓度高达 220 ng/μL 的高纯度 HMW gDNA。然后，我们证明了从该方案中分离出的 HMW gDNA 适用于在 Oxford Nanopore PromethION 平台上对三种葡萄藻进行长读测序。我们的方案可用作在富含多糖的微藻中高效提取 HMW gDNA 的标准，并可适用于其他具有挑战性的物种。
生命的桑格树碎片DNA清理：手动SPRI
使用sanger of Life of Life HMW DNA碎片剪切的DNA：DIAGENODEMEGAUPTOR®3用于PACBIO HIFI协议，使用0.6倍Ampure PB珠与DNA体积的比例。对于使用生命的Sanger树剪切的DNA HMW DNA碎片：DIAGENODEMEGAUPTOR®3用于LI PACBIO协议，使用1倍Ampure Pb珠与DNA体积的比例。对于使用生命的Sanger树剪切的DNA HMW DNA碎片：用于ULI PACBIO协议的G-Tube，使用0.6倍AMPURE PB珠与DNA体积的比例。为了允许执行QC并满足Sanger进行测序的内部需求，在步骤13中添加了49 µL的EB（3 µl为QC，45.4 µL用于测序），但是可以使用任何数量的EB缓冲液来洗脱剪切的DNA。