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高分子 - 重量-DNA-DNA-萃取 -
该协议详细介绍了海洋大藻类组织的高分子量DNA提取。海洋大量藻类包含各种独特的细胞壁成分，包括硫酸化的多糖和多酚。这些成分通常与高分子量（HMW）DNA共同流行，并导致文库准备和测序结果减少。该方案融合了聚乙烯 - 丙烯吡啶酮（PVPP）和β-莫咖啡乙醇（BME），以减少多酚污染，并以乙酸钾（KOAC）（KOAC）的早期盐盐措施来解决多糖。该方案在很大程度上是从牛津纳米孔HMW DNA从拟南芥叶片中提取的，该叶子叶结合了QIAGEN血液和细胞培养DNA MIDI KIT进行柱清洁。DNA产品通常需要在洗脱后进行额外的清理，我们建议所有HMW应用的Bluepippin 15KB尺寸选择。
应用-基因组 DNA 提取-飞秒脉冲-...
Agilent Femto Pulse 系统的革命性设计使其成为唯一能够自动对高分子量 (HMW) gDNA 进行脉冲场凝胶电泳 (PFGE) 分析的仪器。与 PFGE 分析相比，Femto Pulse 系统能够在极短的时间内对 gDNA 大小和完整性进行定性分析。第三代测序或长读测序平台在从小型基因组分析到复杂基因组从头组装等各种应用方面的进步，对 HMW gDNA 样本提出了高质量标准。有多种方法可用于从真核和原核来源中分离 gDNA，这些方法针对特定的下游应用量身定制。因此，分离的 gDNA 的大小和质量会受到不同提取方法的影响，因此需要对 gDNA 样本进行可靠的质量评估。Agilent 基因组 DNA 165 kb 试剂盒专为在 Femto Pulse 系统上分离 HMW gDNA 而设计，可提供准确且可重复的大小和质量评估。使用 Femto Pulse 系统上的五种不同 gDNA 提取方法和基因组 DNA 165 kb 分析对 gDNA 的大小和质量进行了比较。
开发用于从遥远个体获得基因检测的生物样品的方案
Omega Bio Tek E.Z.N.A. 组织DNA KIT D3396-01 OMEGA BIO TEK MAG-BIND®血液和组织DNA HDQ 96 KIT M6399-00 OMAMGA BIO TEK E.Z.N.A. Kit CMG-196 Promega Wizard Genomic DNA Purification Kit A1120 Promega Wizard SV Genomic DNA Purification System A2360 Promega MagaZorb DNA Mini-Prep Kit MB1004 Promega ReliaPrep gDNA Tissue Miniprep System A2051 Promega Wizard HMW DNA Extraction Kit A2920 Promega ReliaPrep™ Blood gDNA Miniprep System A5081 Qiagen DNEasy Blood and Tissue Kit 69504 Qiagen QIAamp Fast DNA Tissue Kit 51404 Qiagen Puregene Tissue Kit 158063 Qiagen QIAGEN Genomic-tips 20/G 10223 Qiagen MagAttract HMW DNA Kit 67563 Qiagen QIAamp DNA Blood Mini Kit 51104 Qiagen Blood & Cell Culture DNA Mini Kit (25) 13323 Sigma-Aldrich Extract-N-AMP Tissue PCR Kit XNAT2-1KT Sigma-Aldrich GenElute Blood Genomic DNA Kit NA2010-1KT Takara NucleoSpin Tissue 740952.5 Takara NucleoMag Tissue 744300.1 Takara NucleoSpin® 96 DNA RapidLyse 740110.1 Takara NucleoBond HMW DNA 740160.2 Takara NucleoMag DNA Swab 744601.1 Takara NucleoSpin® Blood 740951.5 Takara NucleoMag® Blood 200 µL 744501.1 Thermo DNA Extract All Reagents Kit 4403319 Thermo MagMax DNA Multi-Sample Kit 4413020 Thermo JetFlex Genomic DNA Purification Kit A30700 Thermo GeneJet Genomic DNA Purification Kit K0721 Thermo GeneJet Genomic DNA Purification Kit K0721 Thermo PureLink Genomic DNA Mini Kit K182001 Thermo PureLink Genomic DNA Mini Kit K182001 Thermo ChargeSwitch gDNA Mini Tissue Kit CS11204 Zymo Quick-DNA MiniPrep D3024 Zymo Quick-DNA Miniprep Plus D4068 Zymo Quick-DNA magbead Plus Kit D4081 Zymo Quick-DNA HMW HMW Magbead d6060Omega Bio Tek E.Z.N.A.组织DNA KIT D3396-01 OMEGA BIO TEK MAG-BIND®血液和组织DNA HDQ 96 KIT M6399-00 OMAMGA BIO TEK E.Z.N.A. Kit CMG-196 Promega Wizard Genomic DNA Purification Kit A1120 Promega Wizard SV Genomic DNA Purification System A2360 Promega MagaZorb DNA Mini-Prep Kit MB1004 Promega ReliaPrep gDNA Tissue Miniprep System A2051 Promega Wizard HMW DNA Extraction Kit A2920 Promega ReliaPrep™ Blood gDNA Miniprep System A5081 Qiagen DNEasy Blood and Tissue Kit 69504 Qiagen QIAamp Fast DNA Tissue Kit 51404 Qiagen Puregene Tissue Kit 158063 Qiagen QIAGEN Genomic-tips 20/G 10223 Qiagen MagAttract HMW DNA Kit 67563 Qiagen QIAamp DNA Blood Mini Kit 51104 Qiagen Blood & Cell Culture DNA Mini Kit (25) 13323 Sigma-Aldrich Extract-N-AMP Tissue PCR Kit XNAT2-1KT Sigma-Aldrich GenElute Blood Genomic DNA Kit NA2010-1KT Takara NucleoSpin Tissue 740952.5 Takara NucleoMag Tissue 744300.1 Takara NucleoSpin® 96 DNA RapidLyse 740110.1 Takara NucleoBond HMW DNA 740160.2 Takara NucleoMag DNA Swab 744601.1 Takara NucleoSpin® Blood 740951.5 Takara NucleoMag® Blood 200 µL 744501.1 Thermo DNA Extract All Reagents Kit 4403319 Thermo MagMax DNA Multi-Sample Kit 4413020 Thermo JetFlex Genomic DNA Purification Kit A30700 Thermo GeneJet Genomic DNA Purification Kit K0721 Thermo GeneJet Genomic DNA Purification Kit K0721 Thermo PureLink Genomic DNA Mini Kit K182001 Thermo PureLink Genomic DNA Mini Kit K182001 Thermo ChargeSwitch gDNA Mini Tissue Kit CS11204 Zymo Quick-DNA MiniPrep D3024 Zymo Quick-DNA Miniprep Plus D4068 Zymo Quick-DNA magbead Plus Kit D4081 Zymo Quick-DNA HMW HMW Magbead d6060
简短读取消除器（SRE）XS和XL套件
恢复效率和简短读取器套件的尺寸选择性能取决于输入DNA均匀且完全在解决方案中。HMW DNA有时在提取后很难重新启动并导致不均匀样本。，如果与短读取器套件一起使用，此类样品将导致低产量和较短的DNA。如果HMW DNA样品不均匀或包含粘性果冻，我们建议用5-10倍用26克针头进行针头剪切，然后允许DNA在室温下过夜，然后开始选择大小。可以通过进行一式三份浓度测量并验证浓度CV <20％来评估样品同质性。
IDT高通量杂交捕获术的长基因组片段的富集证明了协议（RUO23-2352_001 09/23）
图1。高通量杂交捕获量的长基因组片段工作流程。 （a）高分子量（HMW）基因组DNA需要长片段的制备和富集。 （b）使用高通量兼容的G管将HMW DNA碎片至〜10 kb。 （c）使用特殊准备的尺寸选择珠通过尺寸选择去除多余的较小片段。 （d）尺寸选定的片段被最终修复（ER）A-Tail（AT），并将适配器连接到适配器序列，并带有样品识别条形码序列。 （e）样品池与XGEN自定义HYB面板杂交，并捕获并富集。 （f）富集的目标片段通过远程PCR扩增。 （g）放大的富集片段是第二次尺寸选择的或清理以进行最佳测序读取长度。 然后，富集和条形码的样品池接受所需的第三代测序工作流程。高通量杂交捕获量的长基因组片段工作流程。（a）高分子量（HMW）基因组DNA需要长片段的制备和富集。（b）使用高通量兼容的G管将HMW DNA碎片至〜10 kb。（c）使用特殊准备的尺寸选择珠通过尺寸选择去除多余的较小片段。（d）尺寸选定的片段被最终修复（ER）A-Tail（AT），并将适配器连接到适配器序列，并带有样品识别条形码序列。（e）样品池与XGEN自定义HYB面板杂交，并捕获并富集。（f）富集的目标片段通过远程PCR扩增。（g）放大的富集片段是第二次尺寸选择的或清理以进行最佳测序读取长度。富集和条形码的样品池接受所需的第三代测序工作流程。
技术说明 - 使用 DNA Genotek Oragene 设备收集并使用 Nanobind 试剂盒提取的唾液 DNA 样本的 HiFi 测序性能
采集了 30 位捐献者的唾液样本，其中 90% 的分析前 DNA 质量 >2 µg。从 27 个样本中提取了 HMW DNA，其中 93% 的产量 >500 ng。提取后，使用 Qubit dsDNA BR 检测试剂盒对 DNA 进行定量，并使用 Femto Pulse 系统（安捷伦科技公司）进行表征。使用 SMRTbell ® 制备试剂盒 3.0 为部分样本制备 HiFi 文库，并使用 SPRQ™ 化学方法在 Revio 系统上进行测序。每个样本都在一个 Revio SMRT 测序池上进行测序。表 1 总结了五个代表性样本的测序数据。这些样本产生了 4.7 到 15.9 µg 的 HMW DNA。HiFi 测序产量为 119 到 133 Gb 的 HiFi 数据，每个基因组的覆盖率为 27 到 40 倍，足以进行全面的 WGS 变异检测。 75% 到 95% 的读数映射到人类参考基因组 (GRCh38)。
主任E. Viari
ac =帐户文员AC II =帐户文员LV。2 Acct Tech = Accounting Technician ASO = Administrative Services Officer Assoc CE = Associate Civil Engineer Assoc Land Arch = Associate Lanscape Architect Assoc Planner = Associate Planner Assoc TE = Associate Transportation Engineer Asst EC II = Assistant Engineer – Civil Level 2 BMW = Bridge Maintenance Worker BO = Bridge Operator Eng Tech II = Engineering Technician II HMEO = Highway Maintenance Equipment Operator HMW = Highway Maintenance Worker OS II = Office专业级别2 Prin Eng Tech =首席工程技术员SR AC =高级帐户店员SR BMW =高级桥梁维护工人SR Eng Tech Sr Eng Tech =高级工程师SR HMW =信号高速公路维护高速公路维护工作人员SR Arch Arch Arch Arch Arch Arch Arch Arch Arch =高级Landscape Sr Scape Srscape Srscape Srscape Srscape Srscape Srscape Srscape Srscipner Sr Planner Sr Sr OS SR SR OS SR SR SR SR TSR TSR TSR TSL TSLT =高级信号=高级信号=技术交通标志维护工人tt =树修剪
无细胞的DNA筛选分析
已经开发了无细胞的DNA筛选分析，用于将CFDNA样品从50 bp到800 bp进行分离和分析，包括检测高分子量（HMW）DNA污染。cfDNA样品质量控制从来都不是那么容易 - 只需将贴皮系统加载到无单元的DNA屏幕截图设备，加载尖端和样品中的管条或96孔板中，然后每样品少于2分钟获得结果。
指南和概述 - Nanobind CBB套件
纳米素是一个新型的磁盘，上面覆盖了高密度的微型和纳米结构二氧化硅，可用于快速提取和纯化高质量的DNA和RNA。高表面积和独特的结合机制使其具有非凡的结合能力，可以在微离心管格式中隔离高纯度，高分子量（HMW）DNA。它使用标准的液化，绑定，洗涤和洗脱程序，对于二氧化硅DNA提取技术是常见的。每个管中使用一个磁盘。但是，与磁珠和二氧化硅自旋柱不同，这些磁珠剪切了大DNA，纳米蛋白磁盘结合并释放了DNA而不破碎的DNA，以将DNA长到巨囊中。
为...提供研发和制造支持
检测、分析、扩增或操作 DNA 和 RNA 的工作流程通常需要从生物样本和/或酶促反应中提取和纯化。Monarch 核酸纯化试剂盒使用一流的硅胶柱技术和基于玻璃珠的新型 HMW DNA 提取方法，可从各种来源快速可靠地纯化高质量的 DNA 和 RNA。使用 Monarch 试剂盒纯化的 DNA 和 RNA 纯度高，适用于各种下游应用，包括测序、克隆、PCR 和其他酶促操作。Monarch 试剂盒的设计考虑到了可持续性；它们使用更少的塑料，并采用负责任采购的可回收材料包装。为方便起见，Monarch 缓冲液和柱也可单独购买。