多(MDR),广泛(XDR),极度(XXDR)和总(TDR)耐药性结核分枝杆菌(M. tubercolcolcosis)菌株被认为是潜在的全球流行威胁,需要需要开发新的结核病(TB)预防和治疗策略。大麻结核病在感染和逃避宿主免疫系统中的效力部分是由于其独特而动态的细胞包膜,主要由脂质和碳水化合物组成。动态细胞包膜会改变以响应局部环境因素来适应不同的肺微环境,并且由于其低渗透性而保护病原体免受恶劣环境和许多抗菌药物的保护。因此,抗TB剂的大多数组合处理靶向分枝杆菌细胞包膜。对药物敏感的结核病的标准临床治疗包括服用四种一线药物6个月(2个月的Isoniazid,Rifampicin,Ethambutol和吡嗪酰胺进行了2个月,其次是4个月的异尼氏酶和利福平),成功率为85%(WHO,2019年)。然而,近年来,全球抗药性菌株的出现,尤其是在结核病地区,构成了全球威胁。[1]
引言世界卫生组织 (WHO) 估计,2023 年全球将有 1080 万人患上结核病 (TB),120 万人死于该疾病 [1]。药物敏感 (DS) 结核病需要 4 至 6 个月的标准化联合疗法 [2]。对于对利福平和异烟肼产生耐药性的结核病(定义为耐多药 (MDR) 结核病)或单独对利福平产生耐药性的结核病(RR-TB),目前建议大多数患者采用 6 个月的二线抗结核药物联合疗法 [3,4]。无论结核分枝杆菌是否对药物产生耐药性,都应监测治疗效果,以确保充分的治疗反应,并评估患者对接触者的传染性 [5,6]。
引言世界卫生组织 (WHO) 估计,2023 年全球将有 1080 万人患上结核病 (TB),120 万人死于该疾病 [1]。药物敏感 (DS) 结核病需要 4 至 6 个月的标准化联合疗法 [2]。对于对利福平和异烟肼产生耐药性的结核病(定义为耐多药 (MDR) 结核病)或单独对利福平耐药的结核病(RR-TB),目前建议大多数受影响患者采用 6 个月的二线抗结核药物联合疗法 [3,4]。无论结核分枝杆菌是否对药物产生耐药性,都应对治疗效果进行监测以确保充分的治疗反应,并评估患者对接触者的传染性 [5,6]。
摘要:结核分枝杆菌(MTB)是一种已知的细菌,可以靶向,感染和破坏肺部细胞以及体内的结缔组织。该细菌在全球范围内普遍存在,已感染了当前世界人口的四分之一,成为历史上最成功的病原体之一。由于其作为空降病原体的极端传播速率,MTB菌株已被抗生素(例如利福平和异念珠菌)处理,这些抗生素抑制了人体细菌感染。这些第一轮药物仍然是减慢病原体和杀死病原体的成功机制,特别是通过利福平抑制RNA - 聚合酶和以异oni氮的停止形成细菌细胞壁的能力。然而,由于最近发现了多药耐药性结核病菌株,TB已被证明是威胁,使这些第一轮药物无效。本研究的主要目标是1)回顾有关结核病的最新发表文献,2)检查突变对结核病菌株中抗生素耐药性的作用,3)分享我们关于全球结核病治疗的成功和挑战的综合。我们的研究是通过NCBI Genbank中可用的数据和文献综述的。为了实现这些目标,我们回顾了有关结核分枝杆菌的相关文献,以收集病理生理数据,结核病突变的趋势以及当今该疾病如何在全球范围内不断流行的应用。我们从国家医学图书馆的GenBank收集了抗生素响应式RPO B基因序列,以评估四个国家的特定结核病的突变。我们发现,随机突变引起了具有有效抗生素耐药性的结核病菌株的演变,并且药物的选择性可以鼓励这些抗生素耐药基因。新药,例如Bedaquiline,进行了大量研究,但有效地发现了针对这些耐药性分枝杆菌的新靶标。但是,尽管有一些新开发的药物,但MDR结核病仍然仍然是一个相当大的威胁。
杭州盛廷医疗科技有限公司拥有一款基于靶向二代测序(NGS)的试剂盒,用于同时识别分枝杆菌种类并预测结核分枝杆菌复合群(MTBC)菌株的耐药性。该试剂盒 TBseq® 可直接应用于痰液、支气管肺泡灌洗液、胸腔积液或分枝杆菌阳性培养物等临床标本。它依赖于引物多重扩增混合物的深度测序,针对与一线和二线抗结核(抗 TB)药物(利福平、异烟肼、吡嗪酰胺、乙胺丁醇、氟喹诺酮类、阿米卡星、卡那霉素、卷曲霉素、链霉素、对氨基水杨酸、环丝氨酸、乙硫异烟胺/丙硫异烟胺、贝达喹啉、氯法齐明和利奈唑胺)耐药相关的 21 种主要 MTBC 基因。分枝杆菌种属鉴定是通过针对 16S 和 hsp65 基因区域进行的。
GenoScreen 拥有基于新一代测序 (NGS) 的试剂盒,可同时识别分枝杆菌种类、进行基因分型并预测结核分枝杆菌复合群 (MTBC) 菌株的耐药性;该试剂盒 (Deeplex® Myc-TB) 可直接用于临床样本 (1) 。该检测依赖于单个 24 重扩增子混合物的深度测序,针对与一线和二线抗结核药物(利福平、异烟肼、吡嗪酰胺、乙胺丁醇、氟喹诺酮类、阿米卡星、卡那霉素、卷曲霉素、链霉素、乙硫异烟胺、贝达喹啉、氯法齐明和利奈唑胺)耐药性相关的 18 个主要 MTBC 基因区域。 hsp65 基因是分枝杆菌种属识别的靶标,而 spoligotyping 靶标(CRISPR/直接重复 [DR] 基因座)和耐药相关靶标中的系统发育单核苷酸多态性 (SNP) 用于 MTBC 菌株基因分型。
摘要 结核病 (TB) 的表型药物敏感性测试 (DST) 需要数周才能产生结果。虽然分子测试可以快速检测出耐药相关突变 (DRM),但它们无法扩展到覆盖整个基因组和可以预测耐药性的许多 DRM。全基因组测序 (WGS) 方法是可扩展的,但如果直接在痰液上进行,通常需要目标富集步骤,例如核酸扩增。我们开发了一种靶向等温扩增-纳米孔测序工作流程,用于快速预测结核病分离株的耐药性。我们使用重组酶聚合酶扩增 (RPA) 对结核分枝杆菌基因组内的三个区域进行靶向等温扩增(37°C,90 分钟),然后在 MinION 上进行纳米孔测序。我们检测了 29 种耐药性 (DR) 结核病患者的分枝杆菌基因组 DNA 提取物,并将我们的结果与 Illumina 的 WGS 和表型 DST 的结果进行比较,以评估对利福平和异烟肼耐药性的预测准确性。RPA 扩增的保真度与高保真度 PCR 相当(100% 一致)。纳米孔测序产生的 DRM 预测与 WGS 相同,测序运行时间明显更快,只需几分钟而不是几天。我们工作流程对利福平耐药性预测的灵敏度和特异性分别为 96.3%(95% 置信区间 [CI],81.0 至 99.9%)和 100.0%(95% CI,15.8 至 100.0%)。对于异烟肼耐药性预测,敏感性和特异性分别为 100.0%(95% CI,86.3 至 100.0%)和 100.0%(95% CI,39.8 至 100.0%)。每个样本的工作流程耗材成本不到 100 英镑。我们快速且低成本的药物耐药性基因分型工作流程可准确预测利福平和异烟肼耐药性,适合在资源有限的环境中使用。
3.1在GenExpert仪器系统上执行的XPERT MTB/XDR分析是一种嵌套的实时聚合酶链反应(PCR),用于在体外诊断测试中检测耐药性(XDR)耐药(XDR)结核病(MTB)的毒性(MTB)复合物中的毒液毒和浓度的DNA,浓度的DNA,浓度为浓度的DNA或分枝杆菌生长指示灯管(MGIT™)培养物。在检测到MTB的标本中,XPERT MTB/XDR分析还可以检测Katg和FabG1基因中的异念珠菌(INH)抗性突变,Oxyr-AHPC基因间区域和INHA启动子;仅与INHA启动子突变相关的乙二酰胺(ETH)抗性; Gyra和Gyrb喹诺酮耐药性确定区域(QRDR)中的氟喹诺酮(FLQ)抗性相关突变; RRS基因和EIS启动子区域中的第二线注射药物(SLID)相关突变。
艾滋病 - 获得的免疫障碍综合征,这是由结核分枝杆菌疾病引起的一种耐药结核病-TB,其中免疫系统是弱化的生物体,能够在A存在的情况下生长,因此较少能够引发某些感染和特定药物;对至少一种疾病具有抗性的结核病;艾滋病是由人类抗TB药物免疫降解病毒(HIV)的感染引起的,对药物抗药性的结核病(XDR TB) - 一种肺泡 - 肺的小型空气囊,在MDR TB的末端,对Isoniaiazid和Rifampin抗性的MDR TB末端;当液滴核进入这些空气囊时,TB加上对任何Fuoroquinolone的耐药性,至少一种感染开始了三种可注射的抗TB药物(例如氨基氨基霉素,卡纳霉素或co霉素)皮质激素的皮质类固醇(通常是一种天然或男子),或者是某些疾病,或者是某些疾病,或者是某种疾病,或者是某些疾病 - 除肺部以外的其他免疫疾病,例如淋巴结,胸膜,大脑,肾脏或骨骼;大多数类型的糖尿病 - 一种疾病,其中血糖的血糖不是传染性水平,高于正常水平;糖尿病可以增加对某些传染病的敏感性,包括TB FRST LINE TB治疗药物(已批准的TB,异尼氏二氮,Rifampin,Ethambutol和Essemented TB - TB - TB - TB-结核吡嗪酰胺被认为是FRSTLINE抗抗抗糖药时发生的TB疾病;杆菌进入血液或淋巴系统,它们是标准治疗方案的核心。直径)含有可能是fuoroquinolones的结核分枝杆菌 - 当一个患有感染性TB咳嗽,抗菌药物的人时,一类合成的广谱被排出。携带到身体生长的所有部位,被认为是“ frst line”,因为它们在多个部位引起疾病,例如,mialiary TB构成了最强大,最不昂贵,最不昂贵,大多数液滴核 - 很小的液滴(1至5微忍受的治疗方案。fuoroquinolones的例子使用了打喷嚏,说话或唱歌;液滴可以保留以治疗结核病是左伏福昔着这一点和莫西福沙星。在空气中悬浮了几个小时,具体取决于环境HIV - 人类免疫障碍病毒,导致AIDS的病毒
