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基因靶向聚合物theta缺乏拟南芥
tumefaciens介导的转化一直是生成转基因植物的首选工具。在此过程中，携带转基因的T-DNA从细菌转移到植物细胞，在该细菌中，它通过聚合酶theta（Pol H）介导的末端连接（TMEJ）随机地整合到基因组中。通过同源重组（HR）将T-DNA靶向特定的基因组基因座（HR），但这种基因靶向（GT）事件以低频发生，几乎总是伴随着随机整合事件。另一个复杂性是，T-DNA和目标基因座之间的重组的乘积不仅可以映射到目标基因座（TRUE GT），还可以映射到基因组中的随机位置（异位GT）。在这项研究中，我们通过使用用于Tebichi基因的Tebichi Gene突变的拟南芥，研究了TMEJ功能如何影响植物中GT的生物学，该基因编码为polH。虽然在TMEJ-Profientient植物中，我们主要发现GT事件伴随着随机T-DNA整合，而在TEB突变体背景中获得的GT事件缺乏其他T-DNA拷贝，从而证实了POL H在T-DNA整合中的基本作用。pol H的表现也阻止了异位GT事件，这表明导致此结果的事件顺序需要TMEJ。我们的发现提供了见解，可用于制定策略以获得农作物中的高质量GT事件。
与肌萎缩性侧向硬化逆转表型
将来自22名参与者的ALS反转参与者与PGB主要队列（n = 103）和目标ALS验证队列（n = 140）进行了比较。两个遗传基因座符合统计显着性的预定标准（两侧置换p≤0.01），并在绘制细节后仍然是合理的。第一个基因座的铅单核苷酸变体（SNV）为rs4242007（主要同类gwas OR = 12.0，95％CI 4.1至34.6），它在IGFBP7内含子中，并且在近乎完美的链接中与Snnv in in In iN in igfbpp7 spection in igfbp7中。两个SNV都与EQTL数据集中的额叶皮层IGFBP7表达降低有关。值得注意的是，3个反转，但没有一个典型的进步个体（n = 243），对于RS4242007而言。鉴于附近基因转录的相关影响，位于Grip1附近的第二个基因座的重要性是不确定的。
将细胞融合与 CRISPR-Cas9 编辑相结合，在酵母中克隆较大的 DNA 片段或完整的细菌基因组
图 1：CReasPy-Fusion 方法的实验流程示意图。步骤 1（借用 CReasPy-Cloning 策略，左栏）：用两个质粒转化酵母，从而表达 Cas9 核酸酶和 gRNA。步骤 2（借用 Fusion Cloning 策略，右栏）：在线性重组模板（由酵母元件 CEN-HIS3 组成，带有或不带有 ARS，两侧是与目标基因座两侧相同的两个重组臂和一个抗生素抗性标记）存在下，将预装 pCas9 和 pgRNA 的酵母细胞与支原体细胞接触。步骤 3：进入酵母细胞后，目标基因组被 Cas9 切割，随后由酵母同源重组系统使用提供的线性 DNA 片段作为模板进行修复。因此，细菌基因组现在包括插入到精确位置的酵母元素，并由酵母作为着丝粒质粒携带。
将细胞融合与 CRISPR-Cas9 编辑相结合，在酵母中克隆较大的 DNA 片段或完整的细菌基因组
图 1：CReasPy-Fusion 方法的实验流程示意图。步骤 1（借用 CReasPy-Cloning 策略，左栏）：用两个质粒转化酵母，从而表达 Cas9 核酸酶和 gRNA。步骤 2（借用 Fusion Cloning 策略，右栏）：在线性重组模板（由酵母元件 CEN-HIS3 组成，带有或不带有 ARS，两侧是与目标基因座两侧相同的两个重组臂和一个抗生素抗性标记）存在下，将预装 pCas9 和 pgRNA 的酵母细胞与支原体细胞接触。步骤 3：进入酵母细胞后，目标基因组被 Cas9 切割，随后由酵母同源重组系统使用提供的线性 DNA 片段作为模板进行修复。因此，细菌基因组现在包括插入到精确位置的酵母元素，并由酵母作为着丝粒质粒携带。
孟加拉国人民的遗传景观描绘...
使用AMPFLSTR®Yfiler®PCR扩增系统在404名属于孟加拉国三个最大族裔群体的男性受试者中使用AMPFLSTR®Yfiler®PCR扩增系统进行了 17个微卫星基因座。 分别以73.885％，65.563％和81.250％的相应歧视能力检测到chakma的150个单倍型，Tripura的144个，来自Khasia的144个。 在Tripuras的DyS391基因座中检测到0.828的最高等位基因频率，而在同一基因座，对于chakma种群，检测到0.009的最低等位基因频率。 在Khasias的DyS385a/b基因座处观察到最高的基因多样性（0.964），而Tripuras人群中DyS391基因座的最低基因多样性（0.301）。 研究人群的整体单倍型多样性为0.986141。 邻居的树木和成对的遗传距离都表明，脉轮更接近由Tripuras（Khagrachari，孟加拉国）和Tripuri（印度Tripura）组成的进化枝。 相比之下，卡西亚斯与Oraon（印度恰蒂斯加尔邦）的亲和力非常亲密，其次是Santals。 种群和人群之间的Y-STR单倍型匹配概率表明chakma，Tripura和Khasia在遗传上是100％不同的。 研究的种族人群对于单倍群L和Q表现出较高的频率，而不是在孟加拉人种群中发现的单倍群R1A，H和L。 关键字：Y-STR，歧视，单倍型，多样性，单倍群，网络。 电子邮件：sazaman@du.ac.bd17个微卫星基因座。分别以73.885％，65.563％和81.250％的相应歧视能力检测到chakma的150个单倍型，Tripura的144个，来自Khasia的144个。在Tripuras的DyS391基因座中检测到0.828的最高等位基因频率，而在同一基因座，对于chakma种群，检测到0.009的最低等位基因频率。在Khasias的DyS385a/b基因座处观察到最高的基因多样性（0.964），而Tripuras人群中DyS391基因座的最低基因多样性（0.301）。研究人群的整体单倍型多样性为0.986141。邻居的树木和成对的遗传距离都表明，脉轮更接近由Tripuras（Khagrachari，孟加拉国）和Tripuri（印度Tripura）组成的进化枝。相比之下，卡西亚斯与Oraon（印度恰蒂斯加尔邦）的亲和力非常亲密，其次是Santals。种群和人群之间的Y-STR单倍型匹配概率表明chakma，Tripura和Khasia在遗传上是100％不同的。研究的种族人群对于单倍群L和Q表现出较高的频率，而不是在孟加拉人种群中发现的单倍群R1A，H和L。关键字：Y-STR，歧视，单倍型，多样性，单倍群，网络。电子邮件：sazaman@du.ac.bd中值结网的网络表明，L和R1A的人口中最紧凑的聚类是最紧凑的聚类，其次是单倍型Q和H。Haplogroup R1a的存在表明，孟加拉语可能是通过西方迁移的，而Shaplogroup L和Q的范围内的均具有较大的群体，而较大的群体则是一个非常重要的群体，其范围是在研究中的范围内的范围，并且是在研究中的一定范围，并且是在研究中的Quarge and-east Spristion，其起源于较高的亲属关系，是east的范围。蒙古种群。收到：2024年3月9日，接受：2024年5月18日 *通讯作者：Sharif Akhteruzzaman博士，孟加拉国达卡1000号基因工程与生物技术系，基因工程与生物技术系。
使用系统发育
Silico生物学中的摘要被认为是一种有效且适用的方法来启动各种研究，例如生物多样性分类学保护。在用于兰花物种的硅分类法中使用的系统发育分析可以提供有关遗传多样性和进化关系的数据。在分类学研究中可用于评估基因基因座特定靶标的一种特殊方法是DNA条形码。进行了这项研究，以使用MAT K，RBC L，RPO C1和NRDNA标记来确定特定的靶基因基因基因，用于使用系统发育分析在硅方法中使用Silico方法的Coelogyne属的DNA条形码。所有标记序列均从NCBI网站收集，并使用多种软件和方法进行分析，即用于样品序列对齐的Clustal X和用于系统发育树的结构和分析的Mega 11。恢复表明，建议使用的基因基因座是nrDNA基因基因座。系统发育分析表明，NRDNA基因基因座的使用能够将17种coelogyne物种与两个外群物种分开，即Cymbidium和Vanilla，然后与1,5-双磷酸羧化酶/氧合酶/氧合酶/氧合酶/氧合酶大型亚基（RBC l）一起，而其他基因群和其他polim subiN locase and n namely malsy matulase k（rbc l）（namely kita k）（namely malsy matuly k）（namy k'' RPO C1）提供了一种视觉植物树，其中两个外群物种与Coelogyne物种相同。因此，这项研究的结果可用作支持Coelogyne育种和保护计划的参考。版权所有：©2023，J。热带生物多样性生物技术（CC BY-SA 4.0）
待办事项和新闻创新：让新闻更能响应社区需求
问题：本文是“解读创新：媒体与变革的轨迹”一期的一部分，由 Scott A. Eldridge II（格罗宁根大学）、Frank Harbers（格罗宁根大学）和 Sandra Banjac（格罗宁根大学）编辑，完全开放访问，网址为 https://doi.org/10.17645/mac.i397
稳定表达 Cas9 和 T7 RNA 聚合酶的利什曼原虫 (Viannia) braziliensis 的有效基因组编辑
直到 2015 年，阐明利什曼原虫蛋白质功能的功能丧失研究都依赖于通过同源重组进行基因破坏。随后，CRISPR/Cas9 革命影响到了这些原生动物寄生虫，只需一轮转染即可实现有效的基因组编辑。此外，LeishGEdit 的开发（一种基于 PCR 的工具包，用于使用 CRISPR/Cas9 生成敲除和标记系）使基因组编辑更加直接有效。在此系统中，质粒 pTB007 被递送至利什曼原虫，在 b-微管蛋白基因座中进行游离表达或整合，并稳定表达 T7 RNA 聚合酶和 Cas9。在南美洲，尤其是在巴西，利什曼原虫 (Viannia) braziliensis 是皮肤利什曼病最常见的病原体。与利什曼原虫相比，L. braziliensis b-微管蛋白基因座表现出显著的序列差异，这阻碍了 pTB007 的有效整合和 Cas9 的稳定表达。为了克服这一限制，pTB007 中存在的 L. major b-微管蛋白序列被利什曼原虫 (Viannia) b-微管蛋白保守序列取代，从而产生了 pTB007_Viannia 质粒。这一修改使 pTB007_Viannia 盒式磁带成功整合到 L. braziliensis M2903 基因组中，并且计算机预测表明这也可以在其他 Viannia 物种中实现。通过敲除鞭毛蛋白 PF16 来评估 Cas9 的活性，这导致这些转染子中出现不动表型。内源性PF16也成功被mNeonGreen标记，并采用基因座互补策略将PF16基因的C端标记拷贝返回到原始基因座，从而恢复游泳能力。
影响力的msphere：用单位蛋白质组学扩展CRISPR领域
摘要露西·格洛弗（Lucy Glover）的研究着重于DNA修复和重新组合在寄生虫锥虫瘤抗原变异中的作用，寄生虫锥虫是人类和非洲非洲锥虫病的致病药物。在这种影响力的这种情况下，她反映了Z. J. Waldrip，S。D. Byrum，A。J. Storey，J。Gao等人如何对“基于CRISPR的蛋白质组学分析方法进行蛋白质组学分析”。（Epigenet-ICS 9：1207–1211，2014，https：//doi.org/10.4161/epi.29919）通过获得CRISPR-CAS9的精确性并重新陈述它来查看单位基因局蛋白质组学，从而对她的研究产生了影响。通过在锥虫中使用这项技术，Glover博士和她的同事可以研究修复蛋白的动态积累，并在特定的损害后，并深入了解了双链断裂（DSB）的位置如何决定修复途径的选择以及这可能会在这些寄生虫中影响免疫免疫。