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RB1，癌症谱系可塑性和治疗性抗性
谱系可塑性，即细胞切换谱系限制基因的能力。癌症谱系可塑性越来越多地视为抗治疗的一种机制，尤其是分子靶向疗法。这些疗法通常将其优势效果归功于其治疗靶标的谱系限制性，因此癌症可以通过改变谱系状态来逃避此类疗法。由于部署了越来越有效的分子靶向疗法，因此癌症谱系可塑性可能是一个越来越多的临床问题。谱系可塑性反映了一种不可逆转的转录适应性，但致癌遗传突变可能会驱动典型的癌细胞的谱系可塑性升高。在此提出了与癌症谱系可塑性相关的关键概念，审查了RB1肿瘤抑制基因在驱动癌症谱系可塑性中的丧失的证据，并讨论了对抗癌症谱系可塑性的可能治疗方法。
流感B维多利亚谱系细胞培养衍生1候选人...
流感b维多利亚谱系细胞培养的1种候选疫苗病毒或重组疫苗抗原（S）用于开发和生产疫苗，用于在2025年2025年使用认证的细胞系中使用的2025年南半球流感季节人流感流感病毒（例如MDCK 33016 PF A，NIID-MDCK b）由WHO全球流感监测和响应系统（GISRS）的WHO合作中心（CCS）进行。WHO CCS还对细胞培养的候选疫苗病毒（CCCVV）进行抗原和遗传分析。除非另有说明，否则这些CCCVV已通过对细胞培养的双向出血抑制（HI）测试（HI）试验传播了与WHO建议2相匹配的原型病毒。WHO CCS对这些CCCVV进行了其他测试（包括不定代理）。国家或区域控制当局通常批准每个国家使用的流感疫苗的制造，组成和制定3。制造商应就使用这些CCCVV进行流感疫苗生产的适用性咨询相关的国家或区域控制当局。
评估M/ ... div>的长短期限内存网络
抽象增强器协调驱动多细胞发展和谱系承诺的基因表达程序。因此，人们认为增强子的遗传变异通过改变细胞命运承诺会导致发育疾病。然而，尽管已经确定了许多含有变异的增强子，但缺乏内生测试这些增强剂对谱系承诺的影响的研究。我们执行一个单细胞CRISPRI筛选，以评估与先天性心脏缺陷（CHD）有关的25种增强子和推定心脏靶基因的内源性作用。我们确定了16个增强剂，其抑制导致人类心肌细胞（CMS）的分化不足。专注的CRISPRI验证屏幕表明，TBX5增强剂的抑制延迟了从中期到后期CM状态的转录开关。两个TBX5增强剂表观遗传扰动的内源性遗传缺失。共同确定了心脏发育的关键增强子，并表明这些增强剂的不正调可能导致人类患者的心脏缺陷。
乙型流感维多利亚谱系细胞培养衍生1候选...
乙型流感维多利亚谱系细胞培养衍生的 1 候选疫苗病毒用于开发和生产 2020-2021 年北半球流感季节使用的疫苗，世卫组织全球流感监测和应对系统 (GISRS) 的世卫组织合作中心 (CC) 已使用认证细胞系（如 MDCK 33016 PF a、NIID-MDCK b）分离人流感病毒。世卫组织合作中心还会根据指示对细胞培养的候选疫苗病毒 (ccCVV) 进行抗原和遗传分析。除非另有说明，这些 ccCVV 已通过针对符合世卫组织建议 2 的细胞培养繁殖原型病毒的双向血凝抑制 (HI) 测试。世卫组织合作中心尚未对这些 ccCVV 进行任何其他测试（包括外来因子）。国家或地区监管部门通常会批准每个国家使用的流感疫苗的生产、成分和配方 3 。制造商应咨询相应的国家或地区监管部门，了解这些 ccCVV 是否适合用于流感疫苗生产。
BMP4 触发指定心脏中胚层谱系的调节电路
© 2023. 由 The Company of Biologists Ltd. 出版。这是一篇开放获取的文章，根据知识共享署名许可条款分发（http://creativecommons.org/licenses/by/4.0），允许在任何媒体中不受限制地使用、分发和复制，前提是原始作品得到适当的署名
单细胞谱系追踪揭示抗...的克隆动态
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证下可用（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2024 年 1 月 2 日发布。；https://doi.org/10.1101/2023.04.04.535588 doi：bioRxiv 预印本
体验 ProvLake 来管理 AI 工作流的数据沿袭
摘要。机器学习 (ML) 是人工智能系统背后的核心概念，它由数据驱动并生成 ML 模型。这些模型用于决策，因此，信任它们的输出至关重要，例如，了解它们导出的过程。解释 ML 模型导出的一种方法是跟踪整个 ML 生命周期，生成其数据沿袭，这可以通过来源数据管理技术来实现。在本文中，我们介绍了在油气勘探中必不可少的井顶采选的 ML 生命周期中使用 ProvLake 工具进行 ML 来源数据管理。我们展示了 ProvLake 如何支持 ML 模型的验证、对 ML 模型是否根据领域特征进行概括的理解及其导出。
新确定的非洲分枝杆菌10，中非
由于广泛使用全基因组测序（WGS），对引起人类和动物结核病的细菌毒剂的限制性多样性的传统观点进行了修订。除了分枝杆菌CANETTII（代表东非东部结核杆菌的特殊，非克隆，进化的分支谱系）外，在过去的十年中，已经在AFRICA中鉴定出了几种以前未知的结核分枝杆菌谱的谱系。M.结核病复杂谱系7（L7）在非洲的角和非洲大湖地区的L8中发现（1，2）。Afri-Canum L9仅在吉布提和索马里发现。相比之下，其他2个主要的非洲主要菌落 - 相关的谱系对结核病Burden，L5和L6产生了基本贡献，主要是在西非的（3）。在芽孢杆菌的进化史上，东非和西非之间的途径尚不清楚。我们描述了与中非相关的新发现的L6和L9的姐妹谱系，并讨论了确定相关非洲谱系L5，L6和L9的进化历史的含义。我们基于公开数据的研究，因此不批准道德批准。
人胎盘中合成肌细胞细胞谱系发育的关键调节剂
背景。胎盘是一种瞬态器官，在怀孕期间形成以支持胎儿发育并调节影响慢性疾病风险的环境线索的暴露。胎盘在许多方面支持胎儿发育，包括促进营养和氧气交换，去除有害废物产品，产生关键的激素（例如人类绒毛膜促性腺激素）以及提供免疫保护。这些功能在很大程度上是由被称为合胞素细胞和额外滋养细胞细胞的终末分化的滋养细胞执行的。尽管合成肌细胞细胞和跨性滋养细胞细胞的重要性，但仍不清楚它们如何专门支持最佳胎儿发育。目标。使用功能方法丧失来确定合成肌细胞细胞谱系发育的转录调节因子。方法。候选转录因子（TBX3，VGLL3和ATF3）使用慢病毒介导的短发蛋白RNA（SHTBX3，SHTBX3，SHVGLL3或SHATF3）使用胞质衍生的人滋养细胞干细胞中击倒。将非特异性shRNA（SHCONTROL）用作对照。转导后，使用紫霉素选择细胞，并分别通过RT-QPCR和Western印迹在转录本和蛋白质水平上确认敲低效率。通过功能和转录组评估评估了转录因子敲低对滋养细胞干细胞分化为合成型肉芽细胞的影响。结果。结论。未来的方向。与用SHControl转导的细胞相比，SHTBX3和SHVGLL3的转导在合成型细胞细胞分化后导致形态异常。 可以使用滋养细胞干细胞中的功能方法丧失来评估候选转录调节剂对合成细胞细胞谱系发育的关键贡献。 初步结果表明，TBX3和VGLL3对于建立合成型细胞细胞谱系至关重要。 然而，需要更深入的表征来识别TBX3和VGLL3调节合成细胞成分的发育的分子机制。 未来的研究将包括完成剩余的候选转录因子，ATF3，全基因组评估（例如ATAC-SEQ）的shRNA敲低，以及所有SHRNA转换的其他功能输出，例如人类绒毛膜促性腺激素的产生。在合成型细胞细胞分化后导致形态异常。可以使用滋养细胞干细胞中的功能方法丧失来评估候选转录调节剂对合成细胞细胞谱系发育的关键贡献。初步结果表明，TBX3和VGLL3对于建立合成型细胞细胞谱系至关重要。然而，需要更深入的表征来识别TBX3和VGLL3调节合成细胞成分的发育的分子机制。未来的研究将包括完成剩余的候选转录因子，ATF3，全基因组评估（例如ATAC-SEQ）的shRNA敲低，以及所有SHRNA转换的其他功能输出，例如人类绒毛膜促性腺激素的产生。