保守的整个真核生物,尚不清楚核小体重塑是否需要。我们在SWI/SNF的催化亚基中发现了At钩,通过调节催化亚基的固有DNA依赖性ATPase活性,而不影响SWI/SNF的DNA亲和力,可以通过调节固有的DNA依赖性ATPase活性来重塑。AT钩对于SWI/SNF调节很重要,如小鼠胚胎干细胞中的细胞谱系启动所需的所需,以及调节酵母中氨基酸生物合成的基因。at-hook
摘要背景:具有亚皮质囊肿(MLC)是一种涉及白质的罕见和进行性神经退行性疾病,并未被当前疾病模型充分概括。体细胞重编程,以及基因组工程的进步,可以允许建立用于疾病建模和药物筛查的MLC的体外人类模型。在这项研究中,我们利用细胞重编程和基因编辑技术来开发MLC的诱导多能干细胞(IPSC)模型来概括经典MLC影响的神经系统的细胞环境。方法:外周患者衍生的血液单核细胞(PBMC)的体细胞重编程用于开发MLC的IPSC模型。CRISPR-CAS9基于系统的基因组工程也用于创建该疾病的MLC1敲除模型。以2D细胞培养形式进行了IPSC与神经干细胞(NSC)和星形胶质细胞的分化,然后进行各种细胞和分子生物学方法,以表征疾病模型。结果:由体细胞重编程和基因组工程建立的MLC IPSC的多能性具有很好的特征。IPSC随后与疾病相关的细胞类型分化:神经干细胞(NSC)和星形胶质细胞。 MLC NSC的RNA测序分析揭示了与神经系统疾病和癫痫有关的一组差异表达的基因,这是MLC疾病中常见的临床发现。 该基因集可以作为筛查该疾病潜在治疗性的药物筛查的靶标。IPSC随后与疾病相关的细胞类型分化:神经干细胞(NSC)和星形胶质细胞。MLC NSC的RNA测序分析揭示了与神经系统疾病和癫痫有关的一组差异表达的基因,这是MLC疾病中常见的临床发现。该基因集可以作为筛查该疾病潜在治疗性的药物筛查的靶标。在分化与疾病相关的细胞类型 - 星形胶质细胞后,明确观察到了MLC特征液泡,这在对照组中显然不存在。这种出现概括了该疾病的显着表型标记。结论:通过MLC的IPSC模型的创建和分析,我们的工作解决了对MLC相关细胞模型的迫切需求,用于用于疾病建模和药物筛查测定法。进一步研究可以利用MLC IPSC模型以及生成的转录组数据集和分析,以确定这种衰弱疾病的潜在治疗干预措施。关键字:体细胞重编程,CRISPR-CAS9系统,指示分化引言概括性白细胞脑病带有皮层囊肿(MLC)是一种涉及白质的缓慢进行性退化性脑疾病,它是MLC1或GLC1或GLIAL CAMCAM CAMES跨越的病原变异的结果。这种疾病首先是由荷兰的Marjo van der Knaap博士独立发现的(van der Knaap等,1995),印度阿格拉瓦尔社区中的Bhim Sen Singhal博士(Singhal等,1996)。因此,MLC也被称为Van der Knaap-Singhal疾病(Van der Knaap等,2012)。因果变异的三个主要类别是:MLC1中的常染色体隐性突变,一种常染色体隐性隐性和glialcam中的常染色体显性突变(Capdevila-Nortes等,2013)。MLC1是第一个引起MLC并映射到22QTEL染色体的基因(Topçu等,2000; Leegwater等,2001)。MLC1转化为主要在大脑内的星形胶质细胞中表达的蛋白质(MLC1),尤其是在与血脑屏障的星形细胞末端脚接触(Masaki et al。,2012),在PIA MATER中,以及在Synaptic Cleft(Kater等人2023)中存在的星形胶质细胞。MLC患者的结构特征和观察到的大脑缺陷,例如脑水肿,液体填充囊肿,星形胶质细胞的空泡和降低降低,这表明MLC1可能调节
摘要 减数分裂在真核生物中是保守的,但其执行细节各不相同。本文我们描述了一种用于减数分裂分子分析的新型比较模型系统,即线虫 Pristionchus pacificus,它是广泛研究的模型生物秀丽隐杆线虫的远亲。P. pacificus 具有许多解剖学和其他特征,这些特征有助于分析秀丽隐杆线虫的减数分裂。然而,秀丽隐杆线虫失去了减数分裂特异性重组酶 Dmc1 并进化出一种重组独立的机制来使其染色体联会,而 P. pacificus 同时表达 DMC-1 和 RAD-51。我们发现 SPO-11 和 DMC-1 是稳定同源配对、联会和交叉形成所必需的,而 RAD-51 对这些关键的减数分裂过程而言是可有可无的。 RAD-51 和 DMC-1 在减数分裂前期按顺序定位到染色体上,并显示不重叠的功能。我们还展示了 P. pacificus 的新遗传图谱,该图谱揭示了与 C. elegans 非常相似的交叉景观,尽管这些谱系之间在联会和交叉的调节方面存在明显差异。
属于基本螺旋环螺旋(BHLH)家族的转录因子是开发过程中细胞命运规范和分化的关键调节因子。它们的失调不仅与发育异常有关,还与各种成人疾病和癌症有关。最近,BHLH因子的能力已在细胞置换疗法的重编程策略中被利用。这样一个因素是NeuroD1,它与表观遗传景观的重编程和潜在具有先锋因素能力,启动神经元发育程序以及执行胰腺内分泌差异有关。审查旨在巩固对人和小鼠细胞分化的多方面角色和机械途径的当前知识,并重新编程,探讨神经轨道在指导神经内分泌细胞谱系的发展和重编程中的作用。综述着重于NeuroD1的分子机制,其与其他转录因子的相互作用,其作为染色质重塑的先驱因子的作用以及其在细胞重编程中的潜力。我们还显示了神经1在分化神经元和胰腺内分泌细胞中的不同潜力,突出了其治疗潜力以及进一步研究的必要性,以充分理解和利用其功能。
抽象的体细胞年龄和死亡,但细菌谱系是不朽的。在秀丽隐杆线虫中,种系永生涉及每一代开始时的蛋白质结构,当时卵母细胞成熟信号触发了精子的卵母细胞成熟信号触发碳苯链蛋白和蛋白质聚集物的清除。在这里,我们在全基因组RNAi筛选的背景下探索了这种蛋白质抗体更新的细胞生物学。卵母细胞成熟信号通过溶酶体酸化引发蛋白质聚集的去除。我们的发现表明,溶酶体由于内质网活性的变化而被酸化,允许溶酶体V-ATPase组装,这又允许溶酶体通过微嗜碱性脂蛋白清除聚集体。我们为线粒体定义了两个函数,它们似乎都独立于ATP生成。屏幕上的许多基因还调节体内的溶酶体酸化和年龄依赖性蛋白质聚集,这表明种系中蛋白质的更新与体细胞寿命之间存在基本的机械联系。
表皮生长因子受体基因 (EGFR) 的体细胞变异会导致激酶信号异常激活,大约 15% 的非小细胞肺癌 (NSCLC) 会出现这种情况。确诊为 EGFR 突变型 NSCLC 的患者对 EGFR 酪氨酸激酶抑制剂 (EGFR TKI) 有良好的初始临床反应,但肿瘤复发很常见并且发展很快。过去十年,人们对 EGFR TKI 获得性耐药机制进行了广泛研究。在理解治疗失败的两种主要途径方面取得了巨大进展:EGFR 基因的其他基因组变异和替代激酶信号激活(所谓的“旁路激活”)。多种旨在克服这些 EGFR TKI 耐药模式的药物已获得 FDA 批准或正在临床开发中。表型转化是一种不太常见且不太清楚的 EGFR TKI 耐药机制,尚待临床解决。在获得性 EGFR TKI 耐药性的情况下,表型转化包括上皮-间质转化 (EMT)、肺腺癌 (LUAD) 向鳞状细胞癌 (SCC) 或小细胞肺癌 (SCLC) 的转化。SCLC 转化或神经内分泌分化与 TP53 和 RB1 信号失活有关。然而,允许谱系转换的确切机制需要进一步研究。最近的报告表明,LUAD 和 SCLC 具有共同的细胞起源,并且在适当的条件下会发生转分化。目前,EGFR 突变型 SCLC 的治疗靶向选择仅限于传统的基因毒性化疗。同样,EMT 相关耐药性的基础尚不清楚。EMT 是一个复杂的过程,其特征是一系列中间状态,上皮和间质因子的表达各不相同。在获得性 EGFR TKI 耐药性的情况下,EMT 经常与旁路激活同时发生,因此很难确定 EMT 对治疗失败的确切贡献。EMT 相关耐药性的可逆性表明其表观遗传起源,并在疾病进展过程中发生其他调整,例如基因改变和旁路激活。本综述将讨论与表型转化相关的 EGFR TKI 耐药性的机制基础,以及在 EGFR 突变型 NSCLC 中解决此类靶向治疗耐药性的挑战和机遇。
对投资者的关注是我们与Roche和Genentech的合作伙伴关系,我们很高兴宣布一项新的服务协议,反映了Genentech对Opregen计划的利益的额外承诺。我们认为,该协议将使我们的合作伙伴能够利用我们的细胞移植专业知识,以更充分地研究Opregen计划的潜在潜力,并以具有成本效益的方式进行。我们还计划将我们的第二个细胞移植计划OPC1今年带入诊所,以使人们对其未满足需求和商业机会的认识越来越多。最后,我们继续通过提高我们的早期管道来建立价值,这可以通过利用持续验证我们的细胞移植方法来帮助创造价值。”
在许多动物中,生殖系在胚胎发生早期就已分化,因此只有在生殖细胞中积累的突变才会被后代遗传。这一发育过程的例外可能表明已经进化出其他机制来限制有害突变积累的影响。石珊瑚是可以存活数百年的动物,人们一直认为它们从体细胞组织中产生配子。为了澄清关于珊瑚生殖系-体细胞区别的相互矛盾的证据,我们对亲本珊瑚分支及其精子库进行了高覆盖率的全基因组测序和技术重复。我们确定了每个亲本分支独有的胚胎后单核苷酸变异 (SNV),然后检查每个 SNV 是否由各自的精子库共享。26% 的胚胎后 SNV 由精子共享,74% 则不是。我们还确定了生殖系 SNV,即存在于精子中但不存在于亲本中的 SNV。这些数据表明,自我更新的干细胞在群落的成年期会分化为生殖细胞和体细胞,而 SNV 率和模式在干细胞、体细胞和生殖细胞谱系中存在显著差异。除了为后生动物生殖细胞的进化提供信息外,这些见解还揭示了珊瑚如何产生应对全球气候变化所必需的适应性多样性。
识别细胞起源并绘制神经元的树突状和轴突轴的绘制已经是世纪以来的历史,以了解这些脑细胞之间的异质性。当前基于脑弓的转基因动物将多光谱标记的优势与邻近的细胞或谱系区分开,但是,它们的应用受到颜色容量的限制。为了改善分析吞吐量,我们设计了Bitbow,这是Brainbow的数字格式,该格式将调色板呈指数扩展,以提供成千上万的频谱分辨出的独特标签。我们生成了转基因位果蝇线,已建立的统计工具以及简化的样品制备,图像处理和数据分析管道,以方便地绘制神经谱系,研究神经元形态并揭示了具有前所未有的速度,尺度,尺度和分辨率的神经网络模式。
梭状芽胞杆菌差的差异(以前是梭状芽胞杆菌[1])是发达国家与医院相关腹泻的主要原因。近年来,其流行率归因于高呼吸菌株的出现,尤其是属于BI/NAP1/PCR Ribotype 027(RT 027)的菌株的出现,这些菌株会详细征集毒素A/B的高滴度,从而产生二元毒素,并产生二元毒素并表现出增加孢子的倾向[2]。将其基因组测序的第一个RT 027菌株是R20291菌株[3],负责2006年在英国Stoke Mandeville医院发生重大爆发。,R20291已成为研究最多的实验室菌株之一。对梭形基因组序列数据的全面开发依赖于正向和反向遗传学工具的应用[4],最著名的是基于内含子重新定位的封闭技术[5]。初始
