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通过长的非编码RNA（LNCRNA）的转录后调节
从真核基因组中发现了数千种非编码RNA（NCRNA）已彻底改变了生物学的“中心教条”，并转移了对RNA作为调节分子的作用的关注，而不仅仅是基因组信息的传统介体。非编码RNA是不编码蛋白质的转录本，通常根据其平均大小（<或> 200 nt）分类为短或长。在几乎所有生物体中都发现了非编码RNA。其中，长期的非编码RNA（LNCRNA）在许多生物过程中在发育和疾病中起关键作用。自发现以来，lncRNA领域已经爆炸，而lncrnas的新作用不断出现，这使得他们的研究是研究任何水平的基因表达调节的优先事项。本期特刊涵盖了NCRNA场专家的七篇评论论文和一篇原始研究文章，并说明了LNCRNA在转录后层次调节基因表达的主要机制。此文章集提供了其多功能角色的完整概述，并在基因表达和相关细胞过程的调节中提出了额外的复杂性。lncRNA的长度，低表达和缺乏序列保守性经常代表其识别和表征的主要技术限制。在他们的评论中，Carter等。提供了详尽的指南，在硅和低到高的吞吐量实验方法中，以帮助研究人员面对这一挑战。Sadeq等。在扩散的大B细胞淋巴瘤细胞中发现他们还提供了关键的见解，以促进我们对LNCRNA如何参与肿瘤发生的理解[1]。已显示出多种RNA结合蛋白（RBP）与LNCRNA合作以调节基因表达。在评论中，Briata和Gherzi引起了人们对LNCRNA – RBP关联的复杂性的关注[2]。它们说明了LNCRNA-RBP复合物可以控制细胞中所有转录过程的各种机制。讨论了内源性LNCRNA相关的DSRNA结构的耐受性，而病毒衍生的DSRNA触发了一个复杂的防御网络；并进一步研究了自身免疫性疾病和癌症治疗的潜在影响[3]。在他们的综述中，Pisignano和Ladomery描述了LNCRNA有助于调节替代剪接的多种机制，以及它们的作用如何进一步增强了mRNA刺激变体的表达，从而增加了复杂生物体中蛋白质组织的多样性[4]。在更细胞质的环境中，卡拉卡斯和Ozpolat讨论了LNCRNA如何通过控制正常和肿瘤条件下的翻译因子和信号通路来影响mRNA的翻译[5]，而Sebastian-Delacruz等。强调了LNCRNA在调节mRNA稳定性和离职率方面的重要性，这是细胞过程和稳态的正确功能的基础[6]。在这方面，在本期特刊中提出的另一项工作中，Munz等。
LncRNA PTENP1/miR-21/PTEN 轴调节癌症中的 EMT 和耐药性：DNA 损伤反应中细胞命运的动态布尔模型
摘要：众所周知，microRNA-21 (miR-21) 靶向磷酸酶和张力蛋白同源物 (PTEN)，促进癌症的上皮-间质转化 (EMT) 和耐药性。最近的证据表明，PTEN 激活其假基因衍生的长链非编码 RNA PTENP1，进而抑制 miR-21。然而，PTEN、miR-21 和 PTENP1 在 DNA 损伤反应 (DDR) 中的动态仍不清楚。因此，我们通过整合来自各种癌症的已发表文献提出了一个动态布尔网络模型。我们的模型与乳腺癌、肝细胞癌 (HCC) 和口腔鳞状细胞癌 (OSCC) 的实验结果显示出良好的一致性，阐明了 DDR 激活如何从 S 期过渡到 G2 检查点，从而导致一系列细胞反应，例如细胞周期停滞、衰老、自噬、细胞凋亡、耐药性和 EMT。模型验证强调了 PTENP1、miR-21 和 PTEN 在调节 EMT 和耐药性方面的作用。此外，我们的分析揭示了九个新的反馈回路，其中八个是正反馈回路，一个是负反馈回路，由 PTEN 介导，与 DDR 细胞命运决定有关，包括与耐药性和 EMT 相关的通路。我们的工作为研究 DDR 后的细胞反应提供了一个全面的框架，强调了在癌症治疗中靶向 PTEN、miR-21 和 PTENP1 的治疗潜力。
长链非编码RNA HOTAIR在晚期肝细胞癌中的表达及其与舒尼替尼治疗预后的关系
引言：本研究旨在评估长链非编码RNA HOTAIR (lncRNA HOTAIR)在晚期肝细胞癌(HCC)患者组织和外周血中的表达情况。此外，我们还研究了晚期HCC患者和舒尼替尼单药治疗时肿瘤组织和外周血中lncRNA HOTAIR表达水平之间的预后相关性。材料和方法：研究纳入60例接受舒尼替尼单药治疗的晚期HCC患者和同期在体检中心体检的另外60例健康个体。采用实时定量PCR (RT-QPCR)检测HCC患者肿瘤组织、癌旁组织、外周血以及健康对照者外周血中lncRNA HOTAIR的相对表达情况。此外，收集临床病理信息、总生存期(OS)和无进展生存期(PFS)，并进行与lncRNA HOTAIR表达的相关性分析。结果：肿瘤组织中lncRNA HOTAIR的表达显著高于癌旁组织（t=9.03，p<0.001）。HCC患者外周血中lncRNA HOTAIR的表达高于健康对照者（t=8.04，p<0.001）。HCC患者肿瘤组织与外周血中lncRNA HOTAIR的表达存在相关性（r=0.638，p<0.001）。肿瘤组织中lncRNA HOTAIR表达低的患者OS（13.4 vs. 9.5，p<0.001）和PFS（8.4 vs. 6.2，p<0.001）显著长于高表达患者。始终如一，外周血中低表达lncRNA HOTAIR的患者与高表达患者相比，OS（12.8 vs. 9.1，p < 0.001）和PFS（8.9 vs. 6.4，p < 0.001）显著延长。与其他患者相比，肿瘤组织和外周血中表达均低的患者OS（14.3 vs. 8.8，p < 0.001）和PFS（10.6 vs. 6.0，p < 0.001）延长。Cox回归分析表明，肿瘤组织和外周血中lncRNA HOTAIR的表达水平是舒尼替尼治疗晚期HCC患者OS和PFS的独立预测因素。结论：晚期HCC患者肿瘤组织和外周血中lncRNA HOTAIR表达上调。此外，lncRNA HOTAIR的表达水平是预测舒尼替尼治疗有效性的指标之一。
通过作用长
高吞吐量测序技术和色度状态图表明，真核细胞产生了许多非编码转录本1-3。任意定义为200多个不属于任何其他明确定义的非编码RNA的核苷酸的转录本，例如核糖体RNA。通过各种机制，LNCRNA与各种细胞过程有关，包括转录调控，分化，细胞重编程和许多其他细胞（在其他地方4-6中综述）。具有不同水平的证据，LNCRNA也与各种人类疾病有关7 - 9。lncRNA由RNA聚合酶II（POL II）转录，它们的生物发生与mRNA相似，因为它们被封闭和聚腺苷酸化。lncRNA通常也被剪接，尽管它们的外显子数和剪接效率平均低于mRNAS 10-13的外显子数。然而，由于LNCRNA主要由排除标准定义，因此注释为lncRNA的基因包含许多不同的子基团，体现了多样化的结构性和功能特征。将LNCRNA分配给不同的官能团对于识别常见的原理至关重要，因此在开始阐明其角色时，构成了关键步骤。这一步骤仍然非常挑战，在过去十年的LNCRNA研究中取得了有限的进展。一种类型的LNCRNA分类基于LNCRNA相对于其转录位点功能的位置。他们的trans-作用LNCRNA被转录，处理，然后撤离其转录部位，以在其他地方（类似于mRNA）发挥其功能。
长的非编码RNA DLEU2和ROR1途径在乳腺癌中诱导上皮到间质转变和癌症干细胞
乳腺癌（BC）患者因延长时间而接受化学疗法的患者可能会因上皮到中层过渡（EMT）机制（EMT）机制和富集的癌症干细胞（CSC）而引起的转移和临床结局产生深远的影响。在淋巴细胞性白血病-2（LNCRNA DLEU2）和I型酪氨酸激酶样孤儿受体ROR1（ROR1）中表达高水平LNCRNA的BC细胞可能在激活EMT和CSC诱导的增强能力中起作用。在这里我们发现，与TCGA，PubMed Geo数据集和来自存档的乳腺癌肿瘤组织的样品相比，在肿瘤组织中特异性上调了lncRNA dleu2和ror1。化学疗法后，在BC肿瘤细胞中增强了LNCRNA dleu2和ROR1，并与CSC，EMT相关基因和BMI1的表达结合。机械上，ROR1和LNCRNA DLEU2过表达导致肿瘤细胞增殖增强，抑制凋亡，细胞周期失调，化学耐药性以及BC细胞侵入，迁移，发展球体的能力。这些发现意味着lncRNA dleu2和ror1在BC治疗衰竭中的作用在很大程度上归因于EMT，这与富集的CSC相关。总而言之，我们的发现表明LNCRNA DLEU2和基于ROR1的调节环控制EMT和CSC自我更新，这意味着针对这种调节途径可以改善患者对化学疗法和存活的反应。
鉴定阿尔茨海默氏病中不受管制的lncRNA
Non coding RNAs (ncRNAs), as long non coding RNAs (lncRNAs), circular RNAs (circRNAs) and microRNA (miRNAs) are key regulators of many cellular processes and are known to be widely expressed in the brain where they play crucial roles in proliferation, survival, metabolism and differentiation of neuronal cells ( Salta and De Strooper, 2017 ).在NCRNA中，LNCRNA在转录和转录后水平上的基因表达的新型表观遗传调节剂受到了越来越多的关注（Nadhan等，2022）。随着测序技术的进步，转录组学研究逐渐识别出新的LNCRNA，即使仍然缺乏全面的功能注释。据估计，大约40％的lncRNA在脑组织中特异性表达，它们参与了不同的脑生理功能（Zimmer-Bensch，2019; Srinivas et al。，2023）。在几种神经退行性病理中，LNCRNA的失调表达与神经元损伤有关，例如AD，帕金森氏病（PD），肌萎缩性侧面硬化症（ALS）和亨廷顿氏病（HD）（HD）（HD），但如何影响这些疾病的疾病，这些疾病是否仍未影响这些疾病的发作（srinivas et srinivas等）。到目前为止，在AD中，最有记录的LncRNA放松管制是lncRNA，是源自已知的AD相关基因的MRNA的反义转录，作为Bace1-AS，51A，17A和BC200，这些基因已直接参与A iposition和neuromation（Fagsphopphormation and neuromation and flagiration and a a a a iarlimation（fagsphoft）。等人，2012年； Ahmadi等人，2020年；此外，对死后人类大脑的转录组分析表明，尽管LNCRNA在疾病发作中的作用仍然难以捉摸，但AD患者的基因表达显着改变（Cain等，2023）。这一证据，以及他们对新的AD治疗策略的开采的可能性，逐渐要求对LNCRNA在AD中的作用进行更深入的研究（Balusu等，2023）。
长非编码RNA在心血管疾病中的作用
摘要：长的非编码RNA（LNCRNA）是非编码的RNA分子，超过200个nu螺旋体，在转录，转录后和翻译水平上调节基因表达。在许多人类疾病中已经鉴定出LNCRNA的异常表达。 对诊断，预后和治疗技术的未来改善将通过对疾病病因的深入了解来促进。 心血管疾病（CVD）是全球死亡的主要原因。 心脏发育涉及LNCRNA，它们的异常与许多CVD有关。 本综述研究了LNCRNA在各种CVD中的关系和功能，包括动脉粥样硬化，心肌梗塞，心肌肥大和心力衰竭。 在其中，还将讨论LNCRNA在临床诊断，预后和治疗应用中的潜在利用。在许多人类疾病中已经鉴定出LNCRNA的异常表达。对诊断，预后和治疗技术的未来改善将通过对疾病病因的深入了解来促进。心血管疾病（CVD）是全球死亡的主要原因。心脏发育涉及LNCRNA，它们的异常与许多CVD有关。本综述研究了LNCRNA在各种CVD中的关系和功能，包括动脉粥样硬化，心肌梗塞，心肌肥大和心力衰竭。在其中，还将讨论LNCRNA在临床诊断，预后和治疗应用中的潜在利用。
NHL和CLL中的PI3K抑制剂：未实现的承诺
目的：积累证据表明，长的非编码RNA（LNCRNA）在胃癌化学抗性（GC）中起着至关重要的作用。目前的系统评价总结了与化学抗性有关的LNCRNA的新兴作用，潜在目标或途径以及调节机制，并提出了LNCRNA作为GC的新治疗靶点的许多临床意义。方法：对参与GC化学抗性的LNCRNA的研究进行了系统的综述，直到2020年7月在PubMed和Web of Science数据库中进行了研究，并且详细概述了表达形式，在化学耐药性，靶或途径中的作用，相应的药物和相关LNCRNAS的潜在机制。结果：该系统综述总共包括48项研究。在这些研究中，有32个涉及单一耐药性，16个涉及多药耐药性（MDR）。收集的48项研究描述了GC药物耐药细胞中的38个LNCRNA，包括33个上调和5个下调的LNCRNA。顺铂（DDP）是研究最多的药物，LncRNA Malat1是与GC化学耐药性有关的研究最多的LNCRNA。GC中LNCRNA的化学耐药性的潜在机制主要包括凋亡的减少，自噬的诱导，DNA损伤的修复，促进上皮 - 间质转变（EMT）和相关信号通路的调控。结论：lncRNA在GC的化学上起着至关重要的作用，并且是该疾病的新型治疗靶标。迫切需要详细的化学抗性机制，翻译研究和临床试验GC中的LNCRNA。关键字：胃癌，GC，长的非编码RNA，LNCRNA，化学抗性，多药耐药性，MDR
长的非编码RNA在植物免疫中的作用
au：PleaseconfirmthatalleheadinglevelsarerepresentedCorrectedCorcely：稳健的植物免疫系统受蛋白质编码基因和非编码RNA的微调。长的非编码RNA（LNCRNA）是指rNA，其长度超过200 nt，通常没有蛋白质编码功能，并且不属于任何其他众所周知的非编码RNA类型。LNCRNA的非蛋白质编码，低表达和非保守特征限制了它们的识别。尽管对植物中LNCRNA的研究处于早期，但新兴的研究表明，植物采用LNCRNA来调节植物免疫。响应应力，差异表达了许多LNCRNA，这表现出低表达LNCRNA的作用，并使植物 - 微生物/昆虫相互作用成为研究LNCRNA功能的方便系统。在这里，我们总结了植物LNCRNA的当前进展，讨论它们在植物免疫的不同阶段的调节作用，并突出了它们在各种植物 - 微生物/昆虫相互作用中的作用。这些见解不仅会增强我们对lncrnas在植物 - 微生物/昆虫相互作用中的作用和作用的理解，而且还提供了对植物免疫反应的新见解，也可以为该领域的进一步研究提供基础。
长链非编码 RNA 及其在糖尿病肾病中的治疗前景
大规模 RNA 测序和全基因组分析项目的最新进展揭示了一组异质性 RNA，统称为长链非编码 RNA (lncRNA)，它们在许多不同的生物过程中发挥着核心作用。重要的是，据报道，lncRNA 的异常表达与多种人类病理学有关，包括多种肾脏疾病。这些观察结果提出了 lncRNA 可能代表肾脏疾病尚未开发的潜在治疗靶点的可能性。然而，关于 lncRNA 的功能及其对肾脏疾病的影响的几个重要问题仍有待仔细解决。在这里，我们概述了 lncRNA 的主要功能和作用机制，以及它们作为肾脏疾病治疗靶点的前景，强调了一些最典型的 lncRNA 在糖尿病肾病的发病机制和进展中的作用。