大约20年前,在与以前的3M处置设施相关的东部双子城的地表水和地下水中发现了每种和多氟烷基物质(PFA)。今天,明尼苏达州卫生部(MDH)估计,140,000多个明尼苏达州人的饮用水供应受到PFA的污染,覆盖150平方英里。 明尼苏达州污染控制机构(MPCA)随后确定了其他PFA来源,包括垃圾填埋场,废水处理设施和数十个行业。 法规继续降低环境中的允许水平。 现有的PFA的清洁技术仅限于在集中位置提取地下水后的地上或点源处理。 例如,伍德伯里市建立了一个临时设施,以解决PFAS影响的地下水,耗资超过1100万美元。 其他补救技术,例如饮用水处理厂,通过机械操作将PFA浓缩,或使用吸附剂或树脂将PFA与替代培养基结合。 由于密集的基础设施成本,实施非常昂贵,再加上仍然需要正确管理的高能源投入和残留废物产品。 对现场规模生物修复技术的关注很少,以破坏PFA,这将减轻对接触点的治疗技术的需求。 海湾韦斯特(Bay West)具有独特的资格来应对这一挑战。今天,明尼苏达州卫生部(MDH)估计,140,000多个明尼苏达州人的饮用水供应受到PFA的污染,覆盖150平方英里。明尼苏达州污染控制机构(MPCA)随后确定了其他PFA来源,包括垃圾填埋场,废水处理设施和数十个行业。法规继续降低环境中的允许水平。现有的PFA的清洁技术仅限于在集中位置提取地下水后的地上或点源处理。例如,伍德伯里市建立了一个临时设施,以解决PFAS影响的地下水,耗资超过1100万美元。其他补救技术,例如饮用水处理厂,通过机械操作将PFA浓缩,或使用吸附剂或树脂将PFA与替代培养基结合。由于密集的基础设施成本,实施非常昂贵,再加上仍然需要正确管理的高能源投入和残留废物产品。对现场规模生物修复技术的关注很少,以破坏PFA,这将减轻对接触点的治疗技术的需求。海湾韦斯特(Bay West)具有独特的资格来应对这一挑战。
收到2022年12月4日; 2023年8月3日接受;出版于2023年8月17日作者隶属关系:1分子环境微生物学实验室,韩国首尔韩国环境科学与生态工程系,韩国共和国。*信件:Woojun Park,WPARK@韩国。AC。KR关键词:抗生素耐药性;生物膜; DNA甲基化;外排泵;表观遗传学;甲基转移酶。缩写:AR,抗生素耐药性; Azi,阿奇霉素; CCCP,羰基氰化物3-氯苯基氢气; Col,Colistin; Ery,红霉素; Etbr,溴化乙锭; Gen,庆大霉素; IPD,脉间持续时间; Kan,Kanamycin; 6mA,n -6-甲基丹宁; 4MC,n -4-甲基环肽; 5MC,5-甲基胞嘧啶; MEM,MeropeNem; MIC,最小抑制浓度; MTase,甲基转移酶;小睡,核苷相关蛋白;也不,诺福路吗? OMV,外膜外囊泡; PMB,多粘蛋白B; rif,利福平; RM,限制修改; SEM,扫描电子显微镜; SMRT-SEQ,单分子实时测序; TF,转录因子; TMP,甲氧苄啶。†这些作者对此工作数据声明也同样贡献:本文或通过补充数据文件中提供了所有支持数据,代码和协议。本文的在线版本可以使用三个补充数据和六个补充表。001093©2023作者
摘要 动机:CRISPR/Cas9 技术已被开发为最有效和最广泛使用的基因组编辑工具,用于修改众多植物的基因组,其中双链 DNA 中的 cas9 切割由单个向导 RNA(sgRNA)中包含的 20 个核苷酸序列驱动。然而,使用 CRISPR/Cas9 同时编辑多个目标仍然是该领域的技术挑战(Ma 等人,2014 年)。方法:在本研究中,使用 Golden Gate Assembly 克隆策略生成多个 CRISPR/cas9 编辑结构以用于蓖麻植物。模块化克隆系统使用 IIS 型酶在其识别位点外切割,从而允许有效组装具有兼容突出端的 DNA 片段,从而同时促进多个序列的正确取向(Engler 等人,2014 年)。我们的主要目标是获得一种遗传构建体,允许在同一个质粒载体中表达两个 sgRNA 和 cas9 核酸酶,以便通过农杆菌感染转化蓖麻。选择了两个针对 FAH12 蓖麻羟化酶的 CRISPR 靶标以避免可能的脱靶。这些靶标包含在 sgRNA 中并克隆到 0 级质粒中,每个质粒两侧都有 BsaI 酶的限制位点。Golden Gate 1 级反应包括几个 BsaI 消化和连接循环,将 U6 启动子与两个 sgRNA 分别组装到 1 级质粒中,两侧都有 BpiI 限制位点。同时,cas9 酶在双强 35S 启动子的控制下克隆,随后是来自 0 级质粒的胭脂碱合酶 (nosT) 终止子,包括这些元素,克隆到另一个 1 级质粒中,两侧也有 BpiI 限制位点。然后,用 BpiI 消化所有 1 级元件(U6-sgRNA1、U6-sgRNA2、2x35S-cas9-nosT)时,会出现兼容的突出端,这些突出端可以以正确的顺序和方向组装成 2 级结构。最终结果是 2 级质粒,其中包括 FAH12 羟化酶的 CRISPR/cas9 多重基因组编辑所需的所有元件。该构建体将转移到农杆菌中,以便以后进行蓖麻胚转化。
摘要 内质网 (ER) 驻留蛋白 TANGO1 在 ER 出口位点 (ERES) 周围组装成一个环,并将 ER 腔内的前胶原与细胞质中的 COPII 机制、系绳和 ER-Golgi 中间区室 (ERGIC) 连接起来 (Raote 等人,2018)。在这里,我们提出了一种理论方法来研究 TANGO1 环组装的物理机制以及 COPII 聚合、膜张力和力如何促进前胶原输出的运输中间体的形成。我们的结果表明,TANGO1 环通过充当 linactant 来稳定新生 COPII 芽的开放颈部。然后通过两种互补机制促进这种芽伸长成与大块前胶原相称的运输中间体:(i) 通过缓解膜张力,可能是通过 TANGO1 介导的逆向 ERGIC 膜融合和 (ii) 通过施加力。总之,我们的理论方法确定了 TANGO1 驱动的前胶原输出中的关键生物物理事件。
结果:在一个实验中靶向多个基因,通过优化的CRISPR/CAS9系统将112个与植物发育相关的基因拆除。我们优化了合并的SGRNA组装方法的关键步骤,该方法通过该方法将116个SGRNA合并为4组(每组由29个SGRNA组成)。每组SGRNA都是在一个PCR反应中编译的,随后经过一轮矢量构建,转化,SGRNA鉴定以及一轮遗传转化。通过遗传转化介导的农杆菌,我们成功地产生了800多个植物。 对于突变体识别,已经使用了下一代测序技术,结果表明所有产生的植物都是阳性的,并且涵盖了所有靶向基因。 有趣的是,在所有转基因植物中,85%通过遗传转化介导的农杆菌,我们成功地产生了800多个植物。对于突变体识别,已经使用了下一代测序技术,结果表明所有产生的植物都是阳性的,并且涵盖了所有靶向基因。有趣的是,在所有转基因植物中,85%
预印本(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此版本的版权持有人于2021年2月26日发布。 https://doi.org/10.1101/2021.02.25.432823 doi:Biorxiv Preprint
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图 7 FITC 标记的 EGF-纳米粒子(绿色)的共聚焦成像,显示 HT-1080 细胞的细胞摄取(蓝色:Hoechst)(每个时间点:顶行 = 20 X,底行 = 63 X;比例尺:20 μ m [20 X] 和 10 μ m [63 X];20 X 和 63 X 图像是在不同的视野 (FoV) 下拍摄的,因此每个细胞中的纳米粒子密度不能直接比较)。EGF,表皮生长因子;FITC,荧光素-5-异硫氰酸酯。
进入门槛低。虽然经典的基于胶带的剥离方法易于学习,但在扩展方面受到严重限制。[1,2] 理想情况下,不仅应保持起始晶体的高质量,而且其横向尺寸也应反映在剥离产率中。在这里,金介导的剥离开始大放异彩,[3–8] 其中干净光滑的金表面提供了必要的相互作用,以剥离整个层状材料阵列。[4,5] 所得单层区域主要受母晶区域限制,接近 1 的剥离产率,从而允许大规模单层作用。[3,9–11] 这种相互作用本质上是非共价的,并且高度依赖于金表面的状况,即使是轻微的污染也会降低剥离产率。 [5] 最近,界面应变被认为是金介导剥离成功的另一个关键因素,通过破坏层间堆叠促进单层剥离。[12,13] 如前所述,将金的成功剥离扩展到其他贵金属被证明是困难的。[12] 以 MoS 2 为例,按照纯结合能论证,其他几种贵金属应该能够实现类似的性能。然而,金仍然无人能及,与下一个最佳竞争对手银相差两个数量级。[12] 其他金属(如铂、钯和铜)的表现甚至更差。[12] 这些金属性能不佳的原因是缺乏抗氧化性和金属贵重性降低。[12] 然而,银的表现优于铂和钯,使其成为所述趋势的异常值。这一例外是由于晶格失配导致 MoS 2 /Ag 界面处应变过大。不过,较大的应变分散暗示了应变不均匀,这是由于银界面的氧化造成的。很明显,成功的金属介导剥离的两个关键因素是均匀施加在界面上的大界面应变和无氧化物金属表面的清洁度。[5,12] 平衡这两个因素是高单层剥离产量的关键,迄今为止这对银来说很难做到。金通过高抗氧化性和在剥离前精心准备新鲜表面来实现这一点。获得适合此任务的金属表面的一种方法是模板剥离。[14,15] 使用热蒸发在光滑的模板(例如抛光硅晶片)上覆盖一层薄薄的金属层(≈ 200 纳米)。该膜可以通过