1 重庆医科大学附属第一医院临床分子医学检测中心,重庆,2 重庆医科大学附属第一医院重庆市分子肿瘤学与表观遗传学重点实验室,重庆,3 重庆医科大学脑科学与疾病研究所,重大脑疾病与衰老研究教育部重点实验室,重庆,4 重庆医科大学附属永川医院肿瘤科,重庆,5 高州市人民医院乳腺外科,高州,6 德国慕尼黑路德维希·马克西米利安大学普通外科、内脏外科和移植外科,7 重庆医科大学附属第一医院生物库中心,重庆,
Results: In primary outcomes, we found that a higher abundance of class Clostridia, family Family XI, genus Alloprevotella, genus Ruminiclostridium 9, and order Clostridiales predicted higher risk of CC, and a higher abundance of class Lentisphaeria, family Acidaminococcaceae, genus Christensenellaceae R7 group, genus Marvinbryantia, order维多利亚菌,肌动杆菌和小扁豆门预测CC的风险较低。在可验证的结果中,我们发现甲甲基类,家族放线菌科,家族甲状腺杆菌科,lachnospiraceae ucg属010,甲苯基菌科属,甲苯基逆葡萄菌属,命令放线菌和甲基甲基甲基菌属越高的风险和cccccund ccccccc,链球菌科,属媒介物和细菌植物属预测CC的风险较低,反之亦然。
孟德尔遗传学通常通过学生在实验室中对活果蝇(果蝇)进行实验来教授。这种方法可能受到机构资源和果蝇生命周期所要求的时间的限制。FlyBuilder 通过使用还原论纸娃娃果蝇工具包克服了这些实际限制。在这里,我们提供 FlyBuilder 作为免费的多模态遗传学课程,可以将其集成到现有课程中。FlyBuilder 使用果蝇平衡染色体和可见的“标记”突变来说明和应用隐性致死、基因型-表型配对、表型显性和果蝇转基因的例子。我们在两所大学的入门、中级和高级主题生物学和神经科学课程中使用了 FlyBuilder,它获得了学生的积极反馈和理解。首页
我们利用孟德尔随机化(MR)来评估白细胞端粒长度(LTL)和肌醇侧面硬化症(ALS)之间的因果关系以及基因组范围研究的汇总统计数据(n = 〜38,000 n = 〜38,000 for ltl and 〜31,000 for ltl and 〜81,000,欧洲人群中的ltl;我们进一步评估了脂质在从LTL到ALS的途径中的介导作用。在欧洲人群中,ALS上LTL的每标准偏差降低为1.10(95%CI 0.93-1.31,p = 0.274),在亚洲人群中为0.75(95%CI 0.53–1.07,p = 0.116)。在欧洲人口中的LTL和额颞痴呆之间也发现了这种无效的关联。但是,我们发现LTL对ALS的间接影响可能是由低密度脂蛋白(LDL)或总胆固醇(TC)介导的欧洲人群。这些结果对广泛的灵敏度分析是可靠的。总的来说,我们的MR研究不支持LTL与ALS风险之间的直接因果关系,而是为LDL或TC对LTL和ALS在欧洲人群中的影响提供了暗示性的证据。
摘要实验室研究表明脂质具有致癌作用,而他汀类药物具有抗致癌作用。在这里,我们利用人类遗传学证据评估他汀类药物治疗对癌症风险的潜在影响。我们获得了英国生物银行 367,703 人中脂质相关基因变异与总体和 22 个部位特定癌症风险的关联。总共有 75,037 人发生过癌症。代表他汀类药物治疗的替代指标 HMGCR 基因区域的变异与总体癌症风险相关(低密度脂蛋白 [LDL] 胆固醇每降低一个标准差的优势比 [OR] 0.76,95% 置信区间 [CI] 0.65–0.88,p=0.0003),但代表替代降脂治疗靶点( PCSK9、LDLR、NPC1L1、APOC3、LPL)的基因区域的变异则无关。基因预测的 LDL 胆固醇与总体癌症风险无关(OR 每标准差增加 1.01,95% CI 0.98–1.05,p=0.50)。我们的结果预测他汀类药物可降低癌症风险,但其他降脂治疗则不会。这表明他汀类药物通过胆固醇独立途径降低癌症风险。
心血管疾病是全球死亡的最常见原因。冠心病(CHD)是最常见的心血管疾病类型。它的特征是由于冠状动脉变窄而导致心肌功能障碍,导致血液供应不足。CHD是全球老年患者的死亡原因之一,其风险持续上升。在小鼠模型中,可以通过肠道微生物(GM)转移传播对CHD和血栓形成的敏感性(Brown and Hazen,2018)。这种传播可能与以下事实有关:微生物群落影响宿主代谢,并通过微生物相关的分子模式通过宿主模式识别受体感知,这会影响心血管疾病的发病机理。针对微生物的治疗策略有望预防或治疗心血管疾病(Brown and Hazen,2018)。正常个体和冠状动脉疾病患者之间的GM组成中存在显着差异。在健康的人中,肠道菌群主要包括坚硬,细菌植物,肌动杆菌和子宫菌,它们在维持肠道健康和免疫系统方面起着关键作用。相比之下,冠心病患者的肠道成分和结构发生了显着变化。这些变化包括某些细菌组的增加或减少,例如毛霉菌蛋白酶科和Ruminococaccaceae,以及病原体或机会性病原体的数量增加(Dai等人,2020年)。迄今报道的潜在生物标志物包括三甲胺氧化胺(TMAO),短链脂肪酸(SCFA)和次胆汁酸。例如,tmao是一种肠道的代谢产物,与动脉粥样硬化的形成密切相关和CHD的发展。研究表明,TMAO通过影响血小板活性和胆固醇代谢来促进动脉粥样硬化的形成(Tang and Hazen,2017; Witkowski等,2020)。先前的研究表明,GM与CHD之间存在很强的因果关系(Jiang等,2023; Yang等,2024),GM和代谢物的丰度变化可能会影响CHD的进展(Wang等,2024)。大量证据表明,转基因在诸如代谢性疾病和心血管疾病等疾病的发作和进展中起着至关重要的作用(Wen等,2022; Qiao等,2023)。临床研究发现,CHD和认知障碍患者的GM发生了显着变化(Sun等,2019; Paiva等,2020)。GM的变化可以通过诸如慢性炎症,促进动脉粥样硬化和促进血栓形成的机制来介导CHD的发展(Liyu等,2022)。一项研究从转录组的角度分析了GM和CHD之间的关系,发现fusicatenibacter可以通过影响几个与CHD相关的靶标,即GBP2,MLKL和CPR65高度相关(Chen等,2023)。另一项研究表明,与CHD相关的肠道菌群中的性别营养不良,有可能导致心血管疾病发生率中观察到的性别差异(Garcia-Fernandez等,2024)。许多草药也可以通过调节GM的组成,降低三甲胺-N-氧化物(TMAO)水平来对CHD进行干预,从而增加
摘要本研究旨在评估血压(BP)与2型糖尿病(T2D)的因果关系,并评估韩国未来临床的高BP或血糖的遗传倾向的累积作用。评估大型生物库中禁食血糖(FBS)和收缩压(SBP)之间的双向因果关系,五个MR方法(一个2阶段最小二乘(2SL)回归(2SLS)回归,逆变量(IVW),2个基于中位数(IVW),2个基于中间的(简单和MR的评分)和MRSCRETS和MRSCERTS和MR ISCERT SPERT SPERT SPERT SPERT SPERT SEPTIED(WISCERT)。在所有五种方法中都发现了双向因果关系,并且没有水平的多效性。使用2SLS回归方法,基因确定的10 mm/hg SBP升高导致0.63 mmol/L FBS增加(P <0.0001)。男人的双向因果关系特别牢固。使用基于组的轨迹建模(GBTM)确定基于遗传确定的SBP和FBS水平的不同预测轨迹。进行了每种轨迹中随后的高血压或T2D的风险,COX比例危害模型和调整后的协变量(包括WGR)。一个不控制的SBP模式(浮动图)的子序列T2D风险高于对照预测的模式(HR:1.25,95%CI:1.00 - 1.58)。在韩国中年,有明显的证明,高BP和T2D之间存在双向因果关系,这与以前的欧洲研究不同。特别是,遗传变异的累积高血压倾向可能会影响T2D发病率的风险。必须在寿命中遵循高bp的预防。
Results: Through forward and reverse MR analyses, we found the risk of lymphoid leukemia was signi fi cantly associated with the abundance of phylum Cyanobacteria, order Methanobacteriales, class Methanobacteria, family Peptococcaceae, family Methanobacteriaceae, and genera Lachnospiraceae UCG010, Methanobrevibacter, Eubacterium brachy组和丁二维伯里奥(Butyrivibrio)。The risk of myeloid leukemia was signi fi cantly associated with the abundance of phylum Actinobacteria, phylum Firmicutes, order Bi fi dobacteriales, order Clostridiales, class Actinobacteria, class Gammaproteobacteria, class Clostridia, family Bi fi dobacteriaceae, and genera Fusicatenibacter, Eubacterium Hallii Group,Blautia,Collinsella,Ruminococcus Gauvreauii组和双杆菌。Hodgkin淋巴瘤的风险与丰富的梭子座Vadinb60组,peptocococus属和Ruminococcaccaceae UCG010属显着相关。恶性等离子体细胞肿瘤的风险与丰富的Romboutsia属和卵细菌的丰度显着相关。弥漫性大B细胞淋巴瘤的风险与丰富的Erysipelatoclostridium和Eubacterium coprostanolostanoligenes组显着相关。成熟T/NK单元的风险
简介:先前的研究报告了三甲胺N-氧化物(TMAO)和帕金森氏病(PD)之间的潜在关联。这项研究的目的是检查循环TMAO及其前体的水平与使用两样本的孟德尔随机化(MR)方法之间的潜在关系。材料和方法:我们从三个全基因组社会研究(国际帕金森氏病基因组学,帕金森氏病,帕金森的研究:有组织的遗传学计划和Genepd和Finngen)中汇总了数据,以提取与单核苷酸多态性(SNP)(SNP)与TMAO,Carnitine,Carnitine和Betnitine的循环浓度相关。这些SNP被用作随机效应模型中的仪器变量,以评估TMAO循环浓度及其前体的循环浓度与帕金森氏病的风险,并通过估计的优势比与伴随的95%置信区间来评估循环变量。主要分析采用了反向差异加权(IVW)方法,该方法与MR-Egger回归分析相辅相成。结果:使用IVW方法进行的分析,该方法汇总了三个数据库的数据,并未显示循环浓度TMAO及其前体之间的因果关系,并且PD的风险(P> 0.05)。MR-Egger分析的结果进一步证实了这一发现。灵敏度分析表明,结果不受任何偏见的影响,异质性测试表明SNP之间没有显着差异。有必要进行进一步的调查,以确定这种关联是否确实存在。结论:这项研究没有发现循环浓度或其原始物质与PD风险之间的因果关系的任何结论性证据。
8犹他大学,美国盐湖城,犹他州84132,美国27 9 9 9下,宾夕法尼亚州费城,宾夕法尼亚州费城,宾夕法尼亚州费城,宾夕法尼亚州费城,宾夕法尼亚州,费城大学,宾夕法尼亚大学,宾夕法尼亚州,19104年,19104年,19104年,美国29 11 11 Atlanta va va va va va va va va va va va va va va va antlanta Carey and decatib and 3033333333333333333333.埃默里大学医学院31医学院,佐治亚州亚特兰大,30307,美国32 13压力与心理健康卓越中心,弗吉尼亚州圣地亚哥医疗保健系统,加利福尼亚州圣地亚哥,加利福尼亚州,33 92161,美国34 14 14陈化行为遗传学中心,加利福尼亚大学医学院,加利福尼亚大学,加利福尼亚大学,圣地亚哥,圣地亚哥,35 Co exior,35 Co,92093,92093:35 CAEN:在150个单词中39个上下文中的研究:141个单词中的141个单词40