在这些书签中以及电影的结尾处,如此包中概述了一些问题要询问和讨论。您的角色是确保小组充分涵盖每个要点。每个问题都是粗体。这不是脚本 - 您可能希望讨论其他内容,或者可能会出现其他问题,但是,这些是要涵盖的关键点。
大小标准由已知长度的荧光标记 DNA 片段组成,可作为分子标尺。大小标准标记的荧光染料与 MLPA 探针产品不同。当片段根据大小迁移时,毛细管电泳仪中的检测器会检测到大小标准和 MLPA 扩增子的荧光 - 小片段比大片段通过得更快。将每个 MLPA 扩增子的迁移与大小标准的每个片段的迁移进行比较,以确定大小,从而确定 MLPA 扩增子的身份。
基于 CRISPR 的基因激活 (CRISPRa) 是一种通过以组织/细胞类型特异性的方式靶向启动子或增强子来上调基因表达的策略。在这里,我们描述了一个实验框架,该框架将高度多路复用的扰动与单细胞 RNA 测序 (sc-RNA-seq) 相结合,以识别细胞类型特异性、CRISPRa 响应的顺式调控元件及其调控的基因。将许多 gRNA 的随机组合引入许多细胞中的每一个,然后对其进行分析并分成测试组和对照组,以测试 CRISPRa 对增强子和启动子的扰动对邻近基因表达的影响。将该方法应用于 493 个 gRNA 文库,这些 gRNA 靶向 K562 细胞和 iPSC 衍生的兴奋性神经元中的候选顺式调控元件,我们识别出能够特异性上调预期靶基因且 1 Mb 内没有其他邻近基因的 gRNA,包括导致神经元中六种自闭症谱系障碍 (ASD) 和神经发育障碍 (NDD) 风险基因上调的 gRNA。一致的模式是,单个增强子对 CRISPRa 的响应受细胞类型的限制,这意味着成功激活基因依赖于染色质景观和/或其他反式因子。本文概述的方法可能有助于大规模筛选以细胞类型特异性方式激活基因的 gRNA。
荧光寿命成像显微镜(FLIM)是区分荧光分子或探测其纳米级环境的强大工具。传统上,FLIM使用时间相关的单光子计数(TCSPC),由于其对点检测器的依赖,因此精确但本质上的低通量。尽管时间门控摄像机已经证明了具有致密标记的明亮样品中高通量FLIM的潜力,但尚未广泛探索它们在单分子显微镜中的使用。在这里,我们报告了使用商业时间门控的单光子摄像头快速准确的单分子flim。我们优化的采集方案以仅比TCSPC少三倍的精度实现单分子寿命测量,同时允许同时进行超过3000个分子的多种多样。使用这种方法,我们证明了在受支持的脂质双层上的大量标记的孔形成蛋白以及在5-25 Hz处的多重时间单分子恢复能量传递测量值的平行寿命测量。此方法具有前进的多目标单分子定位显微镜和生物聚合物测序的有力希望。
摘要 - 机器人灵巧的手负责抓握和灵巧的操纵。电动机的数量直接影响了此类系统的敏捷性和成本。在本文中,我们提出了Muxhand,这是一种使用时间分割多路复用电动机(TDMM)机制的机器人手。该系统允许仅4电动机独立控制9条电缆,从而显着降低了成本,同时保持高敏度。为了提高抓握和操纵任务期间的稳定性和平滑度,我们将磁接头整合到了三个3D打印的手指中。这些关节具有出色的影响力和自我测量能力。我们进行了一系列实验,以评估Muxhand的抓握和操纵性能。结果表明,TDMM机制可以精确控制连接到手指接头的每个电缆,从而实现强大的抓握和灵活的操作。此外,指尖载荷能力达到1.0 kg,磁接头有效地吸收了冲击和校正未对准而不会损坏。
量子态初始化或量子态准备 (QSP) 是量子算法中的一个基本子程序。在最坏的情况下,一般的 QSP 算法由于需要应用多个控制门来构建它们而成本高昂。在这里,我们提出了一种算法,该算法可以检测给定的量子态是否可以分解为子态,从而提高在初始化具有一定程度解缠状态时编译 QSP 电路的效率。通过消除量子多路复用器的控制来实现简化,从而显著减少电路深度和 CNOT 门的数量,并且执行和编译时间比以前的 QSP 算法更短。从深度和 CNOT 门数量方面的效率来看,我们的方法与文献中的方法不相上下。但是,在运行时间和编译效率方面,我们的结果明显更好,实验表明,通过增加量子比特的数量,方法的时间效率之间的差距会增加。
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本(未经同行评审认证)提供的,他已授予Biorxiv的许可证,以在2024年9月7日发布的此版本中在版权所有者中显示预印本。 https://doi.org/10.1101/2024.09.06.611659 doi:Biorxiv Preprint
摘要:靶向PD1/PD-L1免疫检查点路径 - 迅速成为黑色素瘤患者的治疗策略。的确,在某些情况下,在黑色素瘤样品中通过IMO组织化学(IHC)对PD-L1表达(IHC)的量化已经允许访问抗PD-1/PD-1/PD-L1免疫疗法。尽管对PD-L1测试的需求不断增加,但在评估和量化中的累积经验的增加并行,但公平地认识到,黑色素瘤样品中的PD-L1评估仍然带来了一些关键问题。该技术报告的目的是为Ventana台式中的PD-L1/SOX10开发和验证多重双染色方案以进行常规实践。我们的结果表明,双重标记提供了必要的工具,可以清楚地识别PD-L1 + Mela-Noma细胞。同时可视化2种不同的蛋白质靶标,可以在组织形态的背景下评估2个标记之间的地形关系。需要未来的研究来测试该技术在实施互助学家协议中的现实世界中的适用性和有效性。
微流体学优化实验程序,但通常需要外部泵才能精确,稳定和低流速。这些程序通常需要进行长时间实验的延长,连续操作。我们引入了双含量连续泵送机理(DSCPM),这是具有输入多路复用能力的微流体应用的低成本,精确且连续的泵。具有3D打印的外壳和标准组件,DSCPM易于制造和访问。DSCPM以每分钟的流量为单分钟,使用流体桥的整流,将注射泵的精度与连续输注相结合。我们验证了微流体“细胞陷阱”中的层流流,而不会破坏微生物的生长。comsol模拟确认了安全的剪切应力水平。我们还开发并测试了流体多路复用器,以获得更大的模块化和自动化。解决当前的泵限制,例如不连续性和高成本,DSCPM可以增强实验能力并提高效率和精度,同时增加许多领域的硬件自动化的可访问性。
合成生物学需要高效的系统来支持多个基因的良好协调共表达。在这里,我们发现了一个 9 bp 核苷酸序列,它能够在酵母和丝状真菌中实现高效的多顺反子基因表达。将多顺反子表达与多路复用、无标记、基于 CRISPR/Cas9 的基因组编辑相结合,我们开发了一种称为 HACKing(通过将基因破解到基因组中实现高效和可访问的系统)的策略,用于组装多基因途径。HACKing 允许通过将每种酶的翻译与在所需发酵条件下具有预定丰度的宿主蛋白质的翻译联系起来来预先校准每种酶的表达水平。我们通过快速构建高效的酿酒酵母细胞工厂来验证 HACKing,这些细胞工厂表达 13 种生物合成基因,并产生模型内源性(1,090.41 ± 80.92 mg L − 1 角鲨烯)或异源性(1.04 ± 0.02 mg L − 1 mogrol)萜类化合物产品。因此,HACKing 满足了合成生物学对真菌途径工程的可预测性、简单性、可扩展性和速度的需求,以获得有价值的代谢物。