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SPO11二聚化控制减数分裂DNA双链断裂的形成
SPO11 二聚化控制减数分裂 DNA 双链断裂形成 Cédric Oger 1 和 Corentin Claeys Bouuaert 1，* 1 鲁汶生物分子科学与技术研究所，鲁汶天主教大学，1348 Louvain-La-Neuve，比利时。 * 通讯地址：corentin.claeys@uclouvain.be。SPO11 通过诱导程序性 DNA 双链断裂 (DSB) 来启动减数分裂重组，但这种催化活性从未在体外重建。在这里，我们使用小小鼠 SPO11 报告了一个重现减数分裂 DSB 形成所有特征的生化系统。我们表明，SPO11 在没有任何伴侣的情况下催化断裂形成，并保持与 5 ¢ 断裂链的共价连接。我们发现 SPO11 的靶位选择受 DNA 底物的序列、可弯曲性和拓扑结构的影响，并提供了 SPO11 可以重新修复单链 DNA 断裂的证据。此外，我们表明 SPO11 在溶液中是单体，而切割需要二聚化才能重建两个混合活性位点。SPO11 及其伴侣 TOP6BL 形成 1:1 复合物，该复合物催化 DNA 切割，其活性与单独的 SPO11 相似。然而，该复合物以更高的亲和力结合 DNA 末端，表明在切割后可能发挥作用。我们提出了一个模型，其中体内 DSB 形成所需的 SPO11 的其他伴侣组装生物分子凝聚物，招募 SPO11-TOP6BL，从而实现二聚化和切割。我们的工作确立了 SPO11 二聚化是控制减数分裂 DSB 诱导的基本机制。
异常微生物组与杂交小鼠中抗生素耐药性基因载量的增加有关
抗生素耐药性是由微生物群落内的生态进化动态及其在哺乳动物宿主界面或地理规模上的相互作用引起的公共卫生问题。在居住在异质环境中的自然种群中，必须更好地理解哺乳动物宿主遗传学，细菌肠道群落和抗菌抗性基因（ARG）含量之间的联系。杂交，遗传分歧的杂交影响了肠道微生物群落的不同组成部分。然而，它对细菌性状（例如抗生素耐药性）的影响尚不清楚。在这里，我们提出杂交可能塑造细菌群落并发生ARG。我们使用扩增子测序研究肠道微生物组并预测房屋小鼠天然种群（Mus musculus）中的ARG组成。我们比较了欧洲室内小鼠杂交区的纯纯和杂种基因型梯度的胃肠道细菌和ARG多样性，组成和丰度。我们观察到杂交小鼠中ARG的总体预测性增加。我们通过特异性细菌分类群和ARGS（主要是多药耐药基因）在杂化小鼠中的共同充足性和检测到的杂化小鼠的极端丰度的表型发现了细菌的相互作用。我们的工作表明哺乳动物宿主遗传变异会影响肠道微生物组和染色体ARG。但是，它提出了有关哺乳动物宿主遗传学如何通过微生物组动力学或环境协变量影响的进一步疑问。
在总胆固醇水平和糖尿病的小鼠主动脉组织学特征中，非洲叶乙醇提取物的作用2
摘要本研究旨在确定非洲叶乙醇提取物对降低糖尿病2型糖尿病的小鼠总胆固醇水平和主动脉组织学的影响。本研究使用了一个完整的随机设计，具有阴性对照组（标准纯化的饲料），一个阳性对照组（HFD + Alloxan一水合物），一个辛伐他汀组和用乙醇提取物，以75、100和125 mg/kgbb的剂量用乙醇提取物，具有四个重复和治疗时间为7天。在高脂饮食之前，在第0天（HFD之后）和第8天之前测量了总胆固醇水平。通过100倍和400倍宏伟的光显微镜检查大鼠主动脉的组织学。总胆固醇水平和变化的数据进行了方差分析和邓肯测试。使用Welch的ANOVA测试分析了主动脉腔直径的数据。使用Kruskal-Wallis和Mann-Whitney测试分析了动脉粥样硬化评分。分析的结果表明，以不同剂量降低总胆固醇水平和动脉粥样硬化评分的非洲叶乙醇提取物的给药。总而言之，非洲叶乙醇提取物的剂量会影响糖尿病2型糖尿病的小鼠的总胆固醇水平和主动脉组织学，剂量125 mg/kgbb是最佳剂量，是可以降低胆固醇水平的最佳剂量，并可以降低总胆固醇水平，并修复糖尿病型糖尿病的主动脉组织学剂量。关键字：动脉粥样硬化；高脂饮食；高胆固醇血症
如何将有机体变成10“ Easy”的模型生物...
20世纪的许多主要生物学发现仅使用六种物种进行：大肠杆菌细菌，酿酒酵母和schizosacachomyces pombe酵母，caenorhabdision秀素秀丽隐杆线虫，秀丽隐杆线虫，果蝇黑色素肉眼素的肉质片和musculus小鼠。我们对细胞分裂周期，胚胎发育，生物钟和代谢的分子理解均通过使用这些物种的遗传分析获得。然而，“大6”并未以遗传模型生物（以下简称“模型生物”）开始，那么它们如何成熟到如此强大的系统中？首先，这些模型生物是丰富的人类分子：它们是我们肠道中的细菌，啤酒和面包中的酵母，堆肥堆中的线虫，厨房中的苍蝇和墙上的小鼠。因此，它们在实验室中便宜，容易，迅速繁殖，此外也可以接受遗传分析。我们应该如何以及为什么要在此阵容中添加其他物种？我们认为，专业物种将在生物学的重要领域揭示新的秘密，并且随着现代技术创新（例如下一代测序和CRISPR-CAS9基因组编辑）的现代技术，现在已经成熟了，超越了6大>在这篇评论中，我们利用自己在伊德斯埃及埃及蚊子上的经验为达到这一目标的10步途径，我们在十年内将其建立在神经生物学模型生物体中。对这种致命疾病载体的生物学的见解要求我们与蚊子本身合作，而不是在其他物种中对其生物学进行建模。
H。Bakeri，H。Polygyrus和H. Glareoli
线虫spicules在拥有它们的物种的生殖活性中起着至关重要的作用。我们的主要目标是比较实验室小鼠（Mus musculus）的spicul骨长度 - 维持的分离株H. bakeri-与天然感染的木鼠（apodemus sylvaticus）的h. polygyrus的长度。在更有限的范围内，我们还包括来自银行田鼠（Myodes glareolus）的H. glareoli，该物种比以前的两个物种中的任何一个。总共测量了1264个Spicules（H. Bakeri，n = 614; H. polygyrus n = 582;和H. Glareoli，n = 68）。与不列颠群岛的11个不同地区的诺丁汉维持诺丁汉的贝克利（平均= 0.518毫米）的Spicule长度之间存在很大的差异。比较了在3个大洲的4个不同实验室中维持的面包杆菌的Spicules的比较显示，平均值从0.518至0.540毫米，而来自澳大利亚野生房屋小鼠的蠕虫的平均值较短（0.480毫米）。来自不列颠群岛的木鼠的H. polygyrus的平均值范围为0.564至0.635毫米，尽管该物种的分离株来自挪威的Spicules较长（0.670 mm）。与文献一致，谷杆菌的spicules却更长（1.098毫米）。由于Spicules在拥有它们的线虫的繁殖中起着至关重要的作用，因此，Bakeri和H. polygyrus之间的Spicule长度差异增加了越来越多的证据，表明这2种是完全不同的物种，并且可能是生殖分离的。
菠萝皮提取物水凝胶贴剂的应用开发（菠萝皮提取物水凝胶贴剂的应用开发
摘要 糖尿病是一种由高血糖引起的慢性代谢紊乱疾病。糖尿病患者的一个常见并发症是糖尿病溃疡。研究表明，菠萝皮含有黄酮类化合物，这种活性化合物具有抗炎和抗菌特性，可以加速伤口愈合。本研究旨在确定将含菠萝皮提取物 (Ananas comosus L.) 的水凝胶贴剂作为伤口敷料对患有糖尿病溃疡的雄性白鼠 (Mus musculus) 的效果。研究涉及几个阶段，包括菠萝皮提取、水凝胶贴剂制备、抗菌活性测试以及将水凝胶贴剂应用于测试动物。该研究使用 20 只 Deutschland Denken Yoken (DDY) 品系的雄性白鼠，分为 5 组。阴性对照组接受不含提取物的水凝胶贴剂，而阳性对照组接受水胶体敷料。治疗组 I、II 和 III 分别使用含有 10%、20% 和 30% 菠萝皮提取物的水凝胶贴剂。结果表明，含有菠萝皮提取物的水凝胶贴剂可加速糖尿病溃疡模型中的伤口愈合。抗菌活性测试表明，它对糖尿病溃疡中常见的金黄色葡萄球菌具有抗菌活性。水凝胶贴剂的应用减少了实验动物的炎症并改善了皮肤组织结构，证明了菠萝皮提取物水凝胶贴剂作为糖尿病溃疡有效替代伤口敷料的潜力。关键词：糖尿病溃疡、菠萝皮提取物、水凝胶贴剂、伤口敷料
使用纳米孔测序对印迹差异甲基化区域进行全基因组检测
摘要 印记是哺乳动物正常胚胎发育的关键部分，由确定的亲本来源 (PofO) 差异甲基化区域 (DMR)（称为印记控制区）控制。直接纳米孔测序 DNA 提供了一种检测等位基因甲基化的方法，并克服了甲基化阵列和短读技术的缺点。在这里，我们使用 12 个标准 B 淋巴细胞细胞系的公开纳米孔测序数据来获取人类印记间隔的全基因组图谱。利用测序数据，我们能够对 95% 的人类甲基化组进行分期，并检测出 94% 的先前已充分表征的印记 DMR。此外，我们发现了 42 个新的印记 DMR（16 个生殖系和 26 个体细胞），这些印记 DMR 已使用全基因组亚硫酸盐测序 (WGBS) 数据得到确认。对小鼠 ( Mus musculus )、恒河猴 ( Macaca mulatta ) 和黑猩猩 ( Pan troglo- dytes ) 的 WGBS 数据的分析表明，其中 17 个印记 DMR 是保守的。一些新的印记间隔位于没有已知 DMR 的印记基因内或附近。我们还检测到了细微的亲本甲基化偏差，跨越七个已知印记簇的几千个碱基。在这些区块，高甲基化发生在具有互斥的 H3K36me3 和 H3K27me3 等位基因组蛋白标记的表达等位基因的基因体上。这些结果扩展了我们目前对印记的了解和纳米孔测序的潜力，它仅使用亲本-后代三重奏来识别印记区域，而不是像以前那样需要大量的多代谱系。
胚泡sp的分子研究。中国内蒙古自治区和狮子省的野生啮齿动物感染：ST4
摘要 - 野生啮齿动物是各种人类病原体的关键携带者，包括胚泡属。我们的研究旨在评估内蒙古自动地区和中国骗子的野生啮齿动物中胚泡的流行和遗传特征。从2023年11月至2024年2月，在这些地区捕获了486个啮齿动物。新鲜的粪便，以分离脊椎动物细胞色素B（CYTB）基因的DNA和PCR扩增，以鉴定啮齿动物。随后，利用核糖体RNA（RRNA）基因的部分小亚基的PCR分析和测序来检测所有粪便样品中的胚泡。发现27.4％（133/486）为胚泡阳性。结果表明，在拉特斯·诺维古斯（Rattus Norvegicus）中感染了四种感染胚泡的啮齿动物，32.3％（63/195），在Mus musculus中为15.1％（16/106），20.2％（18/89）在Apodemus agrarius in Apodemus agrarius，以及37.5％（37.5％）（36/96/96/96）中。序列分析确立了五个胚泡亚型的存在：ST1（n = 4），ST2（n = 2），ST4（n = 125，主要的亚型），ST10（n = 1）和新的ST（n = 1）。识别的人畜共患亚型（ST1，ST2，ST4和ST10）突出了野生啮齿动物在胚泡向人类传播中所起的可利用作用，从而提高了人类感染的机会。同时，新序列的发现还为该寄生虫的遗传多样性提供了新的见解。
主动脉瘤
摘要：我们已经证明，内皮特异性 DHFR（二氢叶酸还原酶）缺乏是 eNOS（内皮 NO 合酶）解偶联和腹主动脉瘤 (AAA) 形成的原因。在本文中，我们研究了 microRNA-192-5p 在介导 NOX（NADPH 氧化酶）依赖性 DHFR 缺乏和 AAA 形成中的新作用。microRNA-192-5p 预计以 DHFR 为靶点。有趣的是，人类 AAA 患者的智人 - microRNA-192-5p 表达显著上调。在暴露于过氧化氢 (H 2 O 2 ) 的人主动脉内皮细胞中，智人 - microRNA-192-5p 表达显著上调。这伴随着 DHFR mRNA 和蛋白质表达的显著下调，而智人 - microRNA-192-5p 特异性抑制剂可恢复这种下调。值得注意的是，microRNA-192-5p 表达在血管紧张素 II（血管紧张素 II）输注的 hph-1（高苯丙氨酸血症 1）小鼠中显著上调，而在 hph-1–NOX1、hph-1–NOX2、hph-1–中性粒细胞胞质因子 1 和 hph-1–NOX4 双突变小鼠中减弱，AAA 发病率也消失，表明 microRNA-192-5p 在 NOX 激活后具有下游效应作用。在超声和尸检中，用小鼠–microRNA-192-5p 抑制剂进行体内治疗可减弱血管紧张素 II 输注的 hph-1 小鼠的腹主动脉扩张。它还逆转了血管重塑的特征，包括基质降解、外膜肥大和腔内血栓形成。这些动物恢复了 DHFR mRNA 和蛋白质表达，减弱了超氧化物的产生，重新偶联了 eNOS，并保留了 NO 的生物利用度。总之，我们的数据首次证明了 microRNA-192-5p 在介导 NOX 依赖性 DHFR 缺乏和 AAA 形成中起着关键作用，抑制 DHFR 缺乏和 AAA 形成可有效减缓 AAA 的发展。由于小鼠和人类 microRNA-192-5p 序列相同，microRNA-192-5p 抑制剂可能很容易转化为治疗 AAA 的新型疗法。（高血压。2021；78：282–293。DOI：10.1161/HYPERTENSIONAHA.120.15070。）• 数据补充
模式生物概念的多样化
套用克罗格 (Krogh) 的原则 1 （后来由克劳德·伯纳德 (Claude Bernard) 2 重新表述），生物实验设计发展中的第一个重要步骤是选择相关的模型生物。将所获得的知识推广到研究样本之外对于将我们的理解扩展到众多物种确实至关重要。因此，模型生物的概念很广泛，其选择取决于研究问题和目标。由于其在生物学中的重要性以及分子生物学和基因工程的重大进步，这一关键概念已被重新研究。正如 Ankeny 和 Leonelli 3 最近所讨论的那样，应该在实验生物和模型生物之间做出主要区分。实验生物被选择用于研究特定的生物过程，并且仅作为其密切相关物种的模型，而模型生物允许研究特定的过程，并且其遗传学和生理学（例如）可以投射到更广泛的物种上，通常包括人类。因此，模型生物的概念基于进化保守性原则。被视为合适模型的生物体的其他标准通常包括：i)“简单”和跨实验室的普遍适用性，ii)遗传稳定性，确保一致地生产相同的生物体而不会发生遗传漂变，iii)基因组和/或转录组资源，以及iv)用于进行基因丢失或基因增益实验的基因组编辑工具4。因此，只有有限数量的候选者满足上述所有要求，因此只有少数模型生物能够推动生命科学的重大进展5。例如，蛔虫（秀丽隐杆线虫）、果蝇（果蝇）、斑马鱼（斑马鱼）和植物（拟南芥）开创了发育遗传学 6 ，细菌大肠杆菌帮助揭示了转录调控的基本概念 7 ，芽殖酵母（酿酒酵母）使人们能够解读真核细胞周期和网络相互作用 8 ，小鼠（小家鼠）已成为人类首选的生理和疾病模型 9 。