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套用克罗格 (Krogh) 的原则 1 (后来由克劳德·伯纳德 (Claude Bernard) 2 重新表述),生物实验设计发展中的第一个重要步骤是选择相关的模型生物。将所获得的知识推广到研究样本之外对于将我们的理解扩展到众多物种确实至关重要。因此,模型生物的概念很广泛,其选择取决于研究问题和目标。由于其在生物学中的重要性以及分子生物学和基因工程的重大进步,这一关键概念已被重新研究。正如 Ankeny 和 Leonelli 3 最近所讨论的那样,应该在实验生物和模型生物之间做出主要区分。实验生物被选择用于研究特定的生物过程,并且仅作为其密切相关物种的模型,而模型生物允许研究特定的过程,并且其遗传学和生理学(例如)可以投射到更广泛的物种上,通常包括人类。因此,模型生物的概念基于进化保守性原则。被视为合适模型的生物体的其他标准通常包括:i)“简单”和跨实验室的普遍适用性,ii)遗传稳定性,确保一致地生产相同的生物体而不会发生遗传漂变,iii)基因组和/或转录组资源,以及iv)用于进行基因丢失或基因增益实验的基因组编辑工具4。因此,只有有限数量的候选者满足上述所有要求,因此只有少数模型生物能够推动生命科学的重大进展5。例如,蛔虫(秀丽隐杆线虫)、果蝇(果蝇)、斑马鱼(斑马鱼)和植物(拟南芥)开创了发育遗传学 6 ,细菌大肠杆菌帮助揭示了转录调控的基本概念 7 ,芽殖酵母(酿酒酵母)使人们能够解读真核细胞周期和网络相互作用 8 ,小鼠(小家鼠)已成为人类首选的生理和疾病模型 9 。

模式生物概念的多样化

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