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具有代谢活性的中性粒细胞代表了结核分枝杆菌的允许生存环境
鸣谢作者贡献声明 J. Tucker Andrews：写作——审查与编辑、调查、形式分析、数据管理、概念化。 Zijing Zhang：写作——审查与编辑、调查、形式分析、数据管理、概念化、数据管理。 GVR Krishna Prasad：写作——审查与编辑、形式分析。 Fischer Huey：写作——审查与编辑、形式分析、数据管理。 Evgenia V. Nazarova：写作——审查与编辑、形式分析、数据管理。 Jocelyn Wang：写作——审查与编辑、形式分析、数据管理。 Ananya Ranaraja：写作——审查与编辑、数据管理。 Tiffany Weinkopff：写作——审查与编辑、资源。 Lin-Xi Li：写作——审查与编辑、方法论、形式分析。 Shengyu Mu：写作——审查与编辑、方法论。 Michael J. Birrer：写作——审查与编辑、资源。 Stanley Ching-Cheng Huang：写作 - 审阅与编辑，方法论。Nan Zhang：写作 - 审阅与编辑，方法论，概念化。Rafael J. Argüello：写作 - 审阅与编辑，资源，方法论，形式分析。Jennifer A. Philips：写作 - 审阅与编辑，资源，调查，形式分析。Joshua T. Mattila：写作 - 审阅与编辑，资源，资金获取，形式分析，数据管理，概念化。Lu Huang：写作 - 审阅与编辑，写作 - 原始草稿，可视化，监督，资源，项目管理，方法论，调查，资金获取，形式分析，数据管理，概念化。
基于结构的结核病抑制剂和结核分枝杆菌的CYP142抑制剂
此外，耐药性在1955年首次在国家一级进行了研究，[2]仍代表着一个重大威胁，耐酸匹配素耐药（RR-TB）的速率（RR-TB）和多种耐药性（MDR-TB）结核病（MDR-TB）的结核病（MDR-TB）的结核病范围为3-4％，从未有过3-4％以前受过治疗的治疗方法，而该治疗的治疗率是以前的18％（以前曾经是不受欢迎的人）。[1]更令人担忧的是，在临床分离株中已经记录了对最近开发的抗菌剂，例如Bedaquiline，[3-6]和Delamanid [3,4,7,8]。对MTB基因组的分析给出了第一个迹象，即脂质和固醇降解[9]具有与其生活方式作为强制病原体的重要功能。[10]已经证明，MTB可以用胆固醇作为唯一的碳源生长[9,11]，并且发现其利用是通过一种机制在小鼠中持续存在的细菌所必需的，该机制被认为涉及颠覆IFN -γ-刺激刺激的典型碳源的消耗。[12]参与固醇分解代谢的基因也被鉴定为灵长类动物的毒力决定因素，[13]，甚至有人提出MTB具有胆固醇的专业传感器，可介导细菌与宿主细胞膜之间的相互作用。[14]胆固醇通过由MCE4操纵子编码的大型跨膜复合物转运到MTB中。[12,15–17]
耐链霉素结核分枝杆菌的全基因组 DNA 甲基化、转录组和蛋白质组概况
耐链霉素（SM）的结核分枝杆菌（ M . tuberculosis ）是结核病（TB）治疗中关注的焦点，但其具体的耐药机制尚不清楚。本研究主要通过多基因组学的联合分析，对链霉素耐药相关基因进行初步筛选。通过全基因组甲基化、转录组和蛋白质组分析，阐明结核分枝杆菌H37Rv中特定基因与链霉素耐药性的关联。甲基化分析显示，SM耐药组与正常组之间有188个基因存在差异甲基化，其中89个基因为高甲基化，99个基因为低甲基化。功能分析显示，这188个差异甲基化基因富集在74条通路中，多数富集在代谢途径中。转录组分析显示耐药组与正常组之间有516个差异表达基因，其中显著上调和下调的基因分别有263和253个。KEGG分析表明这516个基因富集在79条通路上，大多数基因富集在组氨酸代谢途径，甲基化水平与mRNA丰度呈负相关。蛋白质组分析发现56个差异表达蛋白，其中14个上调，42个下调。此外，通过综合分析获得了3个枢纽基因（coaE、fadE5和mprA）。本研究结果提示，整合的DNA甲基化、转录组和蛋白质组分析可为SM耐药结核分枝杆菌H37Rv的表观遗传学研究提供重要资源。
古代DNA揭示了阿尔巴尼亚人列昂尼达斯的起源...
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2023年6月16日。 https://doi.org/10.1101/2023.03.22.533820 doi：Biorxiv Preprint
阐明石墨烯量子点对结核分枝杆菌感染的潜力
基于碳的纳米材料（CNM）治疗，尤其是石墨烯 - 氧化物（GO）已经显示出对分枝杆菌的有希望的活性（De Maio等，2019）。即使GO没有显示直接的杀菌活性，它也能够将分枝杆菌置于网中，从而干扰正常的巨噬细胞感染（De Maio等，2019）。此外，由于活性氧（ROS）产生的增加，二线抗TB药物LineZolid的共同给药导致了协同的抗MTB效应（De Maio等人，2020年）。然而，GO板与异念珠菌或amikacin的相互作用干扰并阻碍了抗生素活性（De Maio等，2020）。此外，当基于外周血单核细胞的MTB感染模型中使用GO时，我们观察到控制分枝杆菌复制的失败，这在很大程度上是由于抗单核细胞和CD4 T细胞的毒性（Salustri et al。，2023）。
重新探索水杨酰基支架，以抑制结核分枝杆菌中的霉菌酸合成
全球结核病报告2023。（世界卫生组织，日内瓦，2023年）； Butler，M。S。等。对具有新作用模式的抗菌候选者的审查。ACS感染。dis。10，3440–3474（2024）; Gavalda，S。等。PKS13/FADD32串扰结核分枝杆菌中霉菌酸的生物合成。生物学杂志284，19255–19264（2009）; Galandrin，S。等。用于鉴定分枝杆菌FADD32活性抑制剂的测定开发。SLAS Discovery 18，576–587（2013）; Le，N.-H。等。针对分枝杆菌脂肪酰基 - A酰基 - AM-AMP连接酶FAAL32的药物筛查方法更新了Salicylanilide药物团在抗结结核病中的兴趣。生物有机和药物化学71，116938（2022）。
基于多模式的基于机器学习模型，用于区分非结核分枝杆菌与结核分枝杆菌
结果：基于临床数据的模型包含年龄，性别和IL-6，而RandomForest算法则达到了最佳学习模型。确定了CT图像的两个关键放射线特征，然后用于建立放射线模型，发现Logistic算法的模型是最佳的。多模型模型包含年龄，IL-6和2个放射线特征，最佳模型来自LightGBM算法。与最佳的临床或放射线学模型相比，最佳的多模型模型具有最高的AUC值，准确性，灵敏度和负预测值，并且在外部测试数据集中还验证了其“优惠性能”（准确性= 0.745，敏感性= 0.900）。此外，多模型模型的性能优于放射科医生，NGS检测和现有机器学习模型的性能，其精度分别为26％，4和6％。
结核分枝杆菌二氢叶酸还原酶抑制剂：过去20年的先进状态
摘要：结核病是一种具有高发病率和死亡率的疾病。由于与当前疗法有关的问题，开发新药进行治疗是必要和迫切的。二氢叶酸还原酶（DHFR）是多种药物作用的公认靶标。与人DHFR（H DHFR）相比，结核分枝杆菌DHFR（MT DHFR）DHFR（MT DHFR）的3D结构阐明了配体特异性的主要氨基酸残基和结构基础。本文旨在就过去二十年来开发的新MT DHFR抑制剂提供有关最先进的观点。这项研究表明，功效与特定组的存在之间的相关性，例如与酶活性位点结合的二氨基吡啶环与经典DHFR抑制剂甲氨蝶呤的结合的相似性。在此，还报道了最近开发分子非传统核心的努力，这可能更有选择性和有效地抵抗结核病。
固定后时间的影响
摘要我们分析了迄今为止收集的结核分枝杆菌复合物（MTBC）的最多样化基因组数据集的泛基因组和基因含量调节。MTBC的封闭泛基因组的特征是辅助和特异性基因组的降低，与其克隆性质兼容。然而，随着MTBC基因组的系统发育距离的增加，共享基因家族大大少得多。这种效应仅在种间比较中观察到，而不是SPE内部的CIE，这表明物种特异性的生态特征与基因含量的变化有关。基因丢失是由于基因组缺失和伪源性元素引起的，可驱动基因含量的变异。MTBC物种和谱系之间的这种基因侵蚀也有所不同，即使在结核分枝杆菌中，L2的基因损失比L4更大。我们还表明，系统发育近端并不总是与MTBC中基因含量相关性的良好替代性，因为MyCobacte Rium Africanum L6的基因曲目偏离了其预期的系统发育生物的保守主义。以伪元注释代表的毒力因子的基因破坏大多不是保守的，是MTBC生态型的预测因素。每个MTBC生态型都具有自己的附件基因组，可能受宿主和地理等不同选择压力的影响。重要的是研究基因丧失如何赋予MTBC菌株的新适应性特征。检测到的异质基因损失在阐明负责MTBC中观察到的各种表型的遗传因素方面构成了重大挑战。通过详细介绍特定的基因损失，我们的研究是研究MTBC表型及其免疫逃避策略的研究人员的资源。
使用RNA生物标志物在结核分枝杆菌中加快药物易感性测试
科学和C服务细菌疾病 - 人类的传染病，科学疾病，朱丽叶·维特斯曼斯特拉特（Juliette wytsmanttrat），布鲁塞尔（Brussels），1050年，比利时B国家转诊和结核病的国家转诊，科学人，朱丽叶（Socientan），朱丽叶（Socient）里尔，CNRS，Inserm，Institute Pasteur de Lille，U1019 -UMR 9017-中心 - 里尔，里尔，59000，59000，法国D大学感染和免疫中心。里尔，CNRS，Inserm，Chu Lille，Institut Pasteur de Lille，US 41- UMS 2014 -PLBS，Lille，59000，法国E，MIT和哈佛大学，Main Street，Main Street 415，Cambridge，Cambridge，MA，MA，MA，02142，美国，美国，美国，MASSACHUSETS 4121142142 for Interventional Studies, Scienti fi c Direction Infectious Diseases in Humans, Sciensano, Rue Juliette Wytsmanstraat 14, Brussels, 1050, Belgium h Department of Molecular Biology, Massachusetts General Hospital, 55 Fruit Street, Boston, MA, 02114, USA i Laboratory of Microbiology, Parasitology and Hygiene, Faculty of Pharmaceutical, Biomedical and Veterinary Sciences, University of Antwerp, Universiteitsbaan 212, Antwerp, 2610, Belgium j Institut Pasteur, Université Paris Cité, CNRS UMR 6047, Unit for Integrated Mycobacterial Pathogenomics, Paris, 75015, France k Division of Molecular Biology and Human Genetics, SAMRC Centre for Tuberculosis Research, DST/NRF生物医学结核病卓越中心研究，医学和健康科学学院，斯特伦博斯大学，泰格伯格，泰格伯格，7505，南非，l Sciensano，Sciensano，Sciensano，Juliette wytsmanttsmantsmanttraat 14，Brusstrait，Brussirenty，Belgium Mycobciiguim Mycobci，Mycobcii，Mycobcii，热带医学研究所，国家埃斯特拉特（Nationalestraat）155，安特卫普（Antwerp），2000年，比利时n分枝杆菌培养物收集比利时比利时比利时协调的微生物藏品，《国家埃斯特拉特155》，安特卫普，2000年，比利时，比利时