Ragunathan,P。,Dick,T。&Grüber,G。(2022)。 结核病的抗毛细菌脓肿活性F ‑ ATP合酶抑制剂GAMF1。 抗菌剂和化学疗法,66(5),E00018-22-。 https://dx.doi.org/10.1128/aac.00018-22Ragunathan,P。,Dick,T。&Grüber,G。(2022)。结核病的抗毛细菌脓肿活性F ‑ ATP合酶抑制剂GAMF1。抗菌剂和化学疗法,66(5),E00018-22-。https://dx.doi.org/10.1128/aac.00018-22
1994 年,CDC 发布了《预防医疗机构中结核分枝杆菌传播的指南,1994》。发布该指南是为了应对以下情况:1) 美国在 20 世纪 80 年代中期和 90 年代初结核病 (TB) 疾病的复发,2) 记录到几起与结核病和人类免疫缺陷病毒 (HIV) 合并感染患病率上升有关的备受关注的医疗保健相关(以前称为“院内”)疫情,3) 感染控制措施失误,4) 传染性结核病患者的诊断和治疗延误,以及 5) 耐多药 (MDR) 结核菌株的出现和传播。 1994 年指南继承了 1982 年和 1990 年的声明,提出了基于风险评估过程的结核病感染控制建议。该过程根据结核病风险类别对医疗机构进行分类,并采取相应的行政、环境和呼吸保护控制措施。CDC 于 1994 年建议的结核病感染控制措施在美国医疗机构中得到了广泛实施。结果,报告给 CDC 的医疗机构结核病暴发数量减少,医疗相关性结核分枝杆菌向患者和医务人员 (HCW) 的传播减少。与此同时,全国结核病控制项目的动员成功扭转了报告结核病病例激增的趋势,随后 10 年发病率有所下降。研究结果表明,尽管 2004 年的结核病发病率是美国自 1953 年开始全国报告以来的最低水平,但 2003 年(2.3%)和 2004 年(3.2%)的发病率下降幅度却是 1993 年以来最小的。此外,某些种族/族裔人群的结核病感染率仍然高于美国平均水平。耐多药结核病的威胁正在降低,由于感染控制措施的实施和社区结核病发病率的降低,医疗机构中结核分枝杆菌的传播持续减少。鉴于流行病学的变化和消除结核病咨询委员会 (ACET) 对审查和更新 1994 年结核病感染控制文件的请求,CDC 重新评估了医疗机构的结核病感染控制指南。本报告更新了结核病控制建议,反映了过去十年美国结核病流行病学的变化、科学认识的进步和医疗保健实践的变化。在医疗相关结核分枝杆菌传播风险降低的背景下,本文件强调采取行动,保持势头和专业知识,以避免结核病再次复发,并消除对医护人员的持续威胁。主要来自未怀疑或未确诊传染性结核病的患者或其他人员。CDC 在咨询了结核病、感染控制、环境控制、呼吸保护和职业健康方面的专家后制定了现行指南。新指南的范围有所扩大,涉及更广泛的概念;医疗相关场所超出了先前定义的设施。“医疗场所”一词包括多种类型,例如住院场所、门诊场所、结核病诊所、提供医疗保健的惩教设施中的场所、提供家庭医疗保健和紧急医疗服务的场所,以及处理可能含有结核分枝杆菌的临床标本的实验室。选择“场所”一词取代了先前指南中使用的“设施”,以扩大本指南适用的潜在场所。
结核分枝杆菌是结核病 (TB) 的病原体,仍然是全球健康负担。虽然结核分枝杆菌主要是一种呼吸道病原体,但它可以扩散到其他器官,包括大脑和脑膜,导致结核性脑膜炎 (TBM)。然而,人们对导致跨器官差异疾病的免疫机制知之甚少。人们的注意力集中在控制肺部结核分枝杆菌的 T 细胞反应差异上,但新出现的数据指出抗体作为疾病控制的生物标志物和抗菌分子发挥着作用。鉴于人们对血脑屏障跨区室抗体反应的认识日益加深,我们在此表征了 TBM 中血液和脑区室的抗体谱,并确定肺部结核分枝杆菌感染 (肺结核) 和 TBM 之间结核分枝杆菌特异性体液免疫反应是否不同。采用高通量系统血清学方法,我们深入分析了 HIV 阴性成人肺结核 ( n = 10) 和 TBM ( n = 60) 患者针对 10 种不同结核分枝杆菌抗原(包括脂阿拉伯甘露聚糖 (LAM) 和纯化蛋白衍生物 (PPD))的抗体反应。抗体研究包括免疫球蛋白同种型 (IgG、IgM、IgA) 和亚类水平 (IgG1–4) 的分析以及结核分枝杆菌特异性抗体结合 Fc 受体或 C1q 并激活先天免疫效应功能(补体和自然杀伤细胞活化;单核细胞或中性粒细胞吞噬作用)的能力。机器学习方法被用于表征 TBM 中的血清和 CSF 反应,确定与疾病严重程度相关的预后因素,并确定区分 TBM 和肺结核的关键抗体特征。在患有 TBM 的个体中,我们发现脑脊液特异性抗体谱标志着针对结核分枝杆菌的独特且区室化的体液反应,其特征是结核分枝杆菌特异性抗体的富集,这些抗体能够强效激活补体并驱动单核细胞和中性粒细胞的吞噬作用,所有这些都与表现时的 TBM 严重程度较低有关。此外,与患有肺结核的个体相比,患有 TBM 的个体血清中存在结核分枝杆菌特异性抗体,激活单核细胞吞噬作用的能力增强,尽管 IgG 滴度和 Fc γ 受体结合能力较低。总的来说,这些数据表明体液反应在功能上有所不同,具体取决于感染部位(即肺部与大脑),并表明 TBM 中脑脊液内存在高度区室化的结核分枝杆菌特异性抗体反应。此外,我们的结果表明,吞噬作用和补体介导的抗体可能促进神经病理学减弱和 TBM 疾病减轻。
由于广泛使用全基因组测序(WGS),对引起人类和动物结核病的细菌毒剂的限制性多样性的传统观点进行了修订。除了分枝杆菌CANETTII(代表东非东部结核杆菌的特殊,非克隆,进化的分支谱系)外,在过去的十年中,已经在AFRICA中鉴定出了几种以前未知的结核分枝杆菌谱的谱系。M.结核病复杂谱系7(L7)在非洲的角和非洲大湖地区的L8中发现(1,2)。Afri-Canum L9仅在吉布提和索马里发现。相比之下,其他2个主要的非洲主要菌落 - 相关的谱系对结核病Burden,L5和L6产生了基本贡献,主要是在西非的(3)。在芽孢杆菌的进化史上,东非和西非之间的途径尚不清楚。我们描述了与中非相关的新发现的L6和L9的姐妹谱系,并讨论了确定相关非洲谱系L5,L6和L9的进化历史的含义。我们基于公开数据的研究,因此不批准道德批准。
吡嗪酰胺是一种促毒物,需要MTBC转换为其活跃的金吡嗪酸(POA)。吡嗪酰胺通过被动扩散进入分枝杆菌细胞,随后通过蛋白质PNCA在细胞质中转化,蛋白质PNCA是一种非必需的细胞内烟碱烟碱酶,其具有吡嗪酰胺酶(PZase)活性,由PNCA基因编码。POA积聚在细胞质中,并被推定的外排泵积极排出。 在杆菌外,POA被质子化并重新进入质子释放的生物,导致酸性细胞质越来越多,POA的积累。 这破坏了膜的渗透性和运输,导致细胞损伤。 10–12虽然这种作用机理一直是普遍的理论,但其他人则提出,POA可能不负责细胞质的酸化,但可能仅在压力条件下(例如低氧)抑制对细菌必不可少的靶标。 最近,Gopal等人最近。 发现与天冬氨酸脱羧酶的POA在细菌细胞中pand结合,触发其降解并阻止必需辅酶A的生物合成A. 17 [参见正在进行的研究领域]POA积聚在细胞质中,并被推定的外排泵积极排出。在杆菌外,POA被质子化并重新进入质子释放的生物,导致酸性细胞质越来越多,POA的积累。这破坏了膜的渗透性和运输,导致细胞损伤。10–12虽然这种作用机理一直是普遍的理论,但其他人则提出,POA可能不负责细胞质的酸化,但可能仅在压力条件下(例如低氧)抑制对细菌必不可少的靶标。最近,Gopal等人最近。 发现与天冬氨酸脱羧酶的POA在细菌细胞中pand结合,触发其降解并阻止必需辅酶A的生物合成A. 17 [参见正在进行的研究领域]最近,Gopal等人最近。发现与天冬氨酸脱羧酶的POA在细菌细胞中pand结合,触发其降解并阻止必需辅酶A的生物合成A.17 [参见正在进行的研究领域]
展出的CLPC1是针对结核病1-4的最有前途的药物靶标之一。这种AAA +进化酶与CLPP1P2蛋白酶合作起作用,是至少四种天然产物抗生素(NPA)的靶标:环粒蛋白5 - 8,Ecumicin 9,10,Lassymycin 11,12和Rufonycin 13-15。的确,艾普素,环瘤,鲁霉素和lassomycin均针对CLPC1,是最近出现的最强大的抗TB分子之一。例如,欧洲蛋白酶显示出有效的选择性抗结核活性,其MIC值比利福平或异尼氏酶低50倍,这是治疗结核病10的第一行药物。clpc1是II类AAA +蛋白质家族的成员,其中包含N末端结构域(NTD)和两个不同的ATP结合模块D1和D2。我们最近确定了CLPC1在其APO和2种不同抗生素结合状态2的全长结构2。尽管仅代表了全蛋白的一小部分,但所有NPA都被证明与CLPC1-NTD结构域结合,结合位点的高分辨率X射线结构可用于环粒蛋白,古素蛋白和rufomycin(图。1 A – C)5、9、12、13。最近,与lassomycin结合的CLPC1-NTD的X射线结构也发表了12。虽然这允许对NPA的结合口袋进行正确的映射,但仍不清楚与NTD结合如何转化为剩余蛋白质的功能障碍。
肠球菌Mundtii是一种共生肠道细菌,可抑制某些结核分枝杆菌的生长(MTC)物种,引起人类和哺乳动物的结核病。为了进一步探索这一初步观察,我们使用标准化的定量琼脂良好的扩散测定法对五个MTC物种的五个E. mundtii菌株和七个MTC菌株代表。在10 Macfarland校准的所有五个E. mundtii菌株都抑制了所有具有各种敏感性曲线的结核分枝杆菌菌株的生长,但在较低的接种物中观察到没有抑制作用。Further, eight E. mundtii freeze-dried cell-free culture supernatants (CFCS) inhibited the growth of M. tuberculosis , Mycobacterium africanum, Mycobacterium bovis and Mycobacterium canettii , the most susceptible MTC species (inhibition diameter 25±1 mm), proportionally to CFCS protein concentra- tions.此处报告的数据表明,大肠杆菌的分泌组抑制了所有MTC的医疗利益物种的生长,该物种拓宽了先前报道的数据。在肠道中,大肠杆菌分泌组可能调节结核病的表达,表现出抗结核作用,在人类和动物健康中具有一些保护作用。
摘要临床样品中基于聚合酶链反应(PCR)的检测是基于结核分枝杆菌(M.结核病)复合物(M. toberculosis)复合物(MTC),是一种诊断临床微生物学实验室中结核病的第一线方法。在这项研究中,使用繁荣的3,156个分枝杆菌基因组的全基因组培养确定了CRISPR-CSM4基因作为MTB的特定。实时(RT)-PCR和CRISPR-CSM4的PCR序列,对20 MTC和5个无效的分枝杆菌进行了测试,并确认了20个MTC分离株,而未检测到5个无效的分离株。此外,有65个剩余的临床样本,包括25个GenExpert阳性和40个GenExpert阴性样品,用于评估在临床微生物实验室环境中CRISPR-CSM4-MTB分析的评估,在每种情况下都会产生预期的预期结果,从而进一步允许M. tonberculculsis M. tonbercijing Lineage。rt-PCR和CRISPR-CSM4的PCR序列可以植入临床微生物学实验室,以补充当前使用的测定法,并有可能增加负责结核病的MTC病原体的规范。
抽象的舌头拭子(TS)采样与定量PCR(QPCR)结合检测结核分枝杆菌(MTB)DNA是痰液测试结核病(TB)诊断的有希望的替代方法。在先前的研究中,擦拭舌头的敏感性通常低于痰液。在这项研究中,我们评估了两种提高灵敏度的策略。一方面,用于从2 ml悬浮液中浓缩舌头细菌,这些悬浮液从高容量的泡沫拭子样品中洗脱。将沉淀重悬于500 µL悬浮液中,然后在双目标qPCR之前机械裂解以检测MTB插入元件为6110,为1081。分级实验表明,可沉积分数中存在临床拭子样品中的大多数MTB DNA信号(99.22%±1.46%)。当适用于从124个具有推定性结核病的南非人收集的存档泡沫拭子时,该策略表现出83%的敏感性(71/86)和100%特异性(38/38),相对于痰液微生物学参考标准(MRS; Sputum; Sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum; sputum》;第二种策略使用了序列特异性磁捕获(SSMAC)来浓缩从MTB细胞释放的DNA。该方案是在存档的Copan floqswabs蜂拥而至的木材样品上进行了评估,这些拭子样品是从128个具有推定性结核病的南非参与者中收集的。将洗脱为500 µL缓冲液的材料机械裂解。通过蛋白酶K消化悬浮液,与生物素化的双靶寡核苷酸探针杂交,然后使用磁分离浓缩约20倍。在对浓缩物的双目标qPCR测试后,该策略相对于痰液MRS表现出90%的敏感性(83/92)和97%的特异性(35/36)。这些结果指向了用于检测TS中MTB DNA的可自动性高敏性方法的道路。
EMB 抗性菌株的最低抑菌浓度 (MIC) 往往在 7.5 μg/mL 至 40 μg/mL 范围内。8–11 5 μg/mL 的测试浓度(使用分枝杆菌生长指示管 (MGIT))可以区分大多数敏感菌株和抗性菌株。除了传统的基于生长的药物敏感性测试 (DST) 之外,DNA 突变的分子检测也可以提供预测耐药性的宝贵信息。虽然 MTBC 对 EMB 的耐药机制尚不明确,基因组靶点也未得到充分记录,12 但许多研究人员已将研究重点放在 embCAB 操纵子的作用上,特别是 embB 基因。多名研究人员发现,embB 密码子 306 的突变是最常见的点突变,50–70% 的分离株含有赋予 EMB 抗性的突变。 5,8,11,13–16 然而,embB 中的其他突变,以及 embC 和 embA 中的突变,也已被证实