摘要 为探讨COVID-19与白塞氏病(BD)关系的潜在作用,寻找相关的生物标志物。采用生物信息学方法下载COVID-19患者外周血单核细胞(PBMCs)和BD患者PBMCs的转录组数据,筛选COVID-19与BD之间的共同差异基因,进行基因本体(GO)和通路分析,构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选枢纽基因并进行共表达分析。此外,还构建了基因-转录因子(TFs)-miRNA网络、基因-疾病网络和基因-药物网络,以深入了解两种疾病之间的相互作用。我们使用了GEO数据库(GSE152418、GSE198533)中的RNA测序数据集。通过交叉分析获得461个上调的共同差异基因和509个下调的共同差异基因,绘制PPI网络,并利用Cytohubba筛选出关联最强的15个基因作为枢纽基因(ACTB、BRCA1、RHOA、CCNB1、ASPM、CCNA2、TOP2A、PCNA、AURKA、KIF20A、MAD2L1、MCM4、BUB1、RFC4、CENPE)。筛选出具有统计学意义的枢纽基因,发现ACTB在BD和COVID-19中均处于低表达状态,ASPM、CCNA2、CCNB1、CENPE在BD中处于低表达状态,而在COVID-19中处于高表达状态。随后进行GO分析和通路分析,获得共同的通路和生物反应过程,提示BD与COVID-19之间存在共同的关联。基因-TFs-miRNA网络、基因-疾病网络和基因-药物网络也在两种疾病的相互作用中发挥重要作用。COVID-19和BD之间存在相互作用。ACTB、ASPM、CCNA2、CCNB1和CENPE是两种疾病的潜在生物标志物。
同源重组修复缺陷的肿瘤通常对针对 DNA 修复途径的药物敏感,包括 PARP 抑制剂 (PARPi) 和铂类药物。尽管 PARP1/2 抑制剂具有临床益处,且已获 FDA 批准用于治疗某些 BRCA 突变癌症,但许多患者的疾病控制并不完全并且产生了耐药性。PARP 抑制剂已被证明可与化疗和铂类药物产生协同作用,但由于毒性重叠,此类组合在临床上受到限制,这凸显了对新组合策略的需求。我们之前报告已鉴定出 USP1 可选择性杀死 BRCA1/2 突变癌细胞的靶点。TNG348 是一种口服、变构和强效的 USP1 (USP1i) 抑制剂。这里我们介绍了 TNG348 在多种 BRCA1/2 突变体和其他同源重组缺陷 (HRD) 肿瘤模型中的作用机制和临床前疗效,证明了其治疗潜力。在临床前模型中,当与针对 DNA 修复途径的药物(包括 PARP 抑制剂)结合时,TNG348 活性会进一步增强。在获得性 PARPi 耐药性的 PDX 模型中,TNG348 表现出与 PARPi 的强大组合活性,证明了 USP1i + PARPi 能够在获得性耐药的情况下恢复对 PARPi 的敏感性。有和没有 PARPi 或 USP1i 的基于 CRISPR 的药物锚定筛选表明,这种协同作用是由不重叠的作用机制驱动的。虽然对 USP1i 或 PARPi 的敏感性与 HRD 状态有关,但对 PARPi 而非 USP1i 的耐药性发生在屏蔽蛋白成分的敲除和其他先前报道的机制下。相比之下,通过敲除参与 PCNA 泛素化和跨损伤合成的基因,可以独特地获得对 USP1i 的抗性。总之,这些数据支持临床开发计划,以评估 TNG348 作为单一药物和与 PARP1i 联合用于 BRCA1/2 突变体和其他 HRD 肿瘤患者。
摘要:近年来,成年人类齿状回(DG)的神经源性潜力已广泛争论。本研究旨在提供有关人脑在转录组水平上人脑中成年海马神经发生(AHN)程度的新见解。使用10倍基因组学的空间基因表达平台在年轻(n = 2,平均年龄= 23.5岁)和中年神经型雄性(n = 2,平均年龄= 42.5岁)和中年神经型雄性(n = 2,平均年龄= 23.5岁)上使用10倍的空间基因表达平台(douglas-bell Canada Brain Bank),我们计算了各种Neurosis Markers of neurogens of neurogens of the dgers of neurogens of the d d d dgers n d d d d dgers n = 2。我们还评估了来自婴儿(n = 1,年龄= 2岁),青少年(n = 1,年龄= 16岁)和使用中等年龄的男性(n = 6,n = 6,n = 43.5岁的年龄)的DG细胞(n = 1岁)的DG细胞中特异性的标志物(NSC),增殖细胞和未成熟颗粒神经元的增生细胞和未成熟的颗粒神经元(n = 1,年龄= 2岁)杂交(RNASCOPE; ACD BIO)。我们的森林数据表明,神经发生标志物可以映射到DG的DG细胞和区域DG,DG,Hampocampal神经源性壁iche外部(SGZ)以外的区域,证实了使用多个标记物表征人类海马中不同神经源细胞类型的重要性。例如,我们观察到NSC特异性标记NES在空间上解析为DG中的细胞和富含少突胶质细胞前体细胞特异性标记的区域。我们还发现,增殖标记PCNA和MCM2非常低表达,未成熟的神经元标记DCX在DG中显示了分散的表达。我们还鉴定了成人DG中的Prox1 + DCX + CalB2 +未成熟的颗粒神经元。使用rnascope,我们发现很少有表达NSC特异性标记和增殖细胞的细胞,但从童年到中年发现了SGZ中SGZ中表达DCX的平均表达细胞的稳定。在各个时代,大多数DCX + DG细胞表示抑制性神经元标记GAD1,而其余的则显示出兴奋性表型(SLC17A7 +)或不承诺。此外,在表达神经胶质标记物(例如TMEM119和ALDH1L1)的细胞中检测到DCX表达,虽然很少,却在非神经发生的脑区域中。我们的发现表明,由于缺乏NSC和来自儿童时期的增殖标记的表达,人脑的AHN水平非常低。
虽然免疫检查点阻滞(ICB)疗法已大大改善了黑色素瘤的治疗方法,但大多数患者无法实现持久的反应。因此,迫切需要提高我们对黑色素瘤免疫逃避机制的理解,并确定能够增强ICB反应的新目标。MZB1(边缘区B和B1细胞特异性蛋白)在转移性黑色素瘤中差异表达。在有限数量的癌症中,MZB1已被证明充当癌基因或肿瘤抑制剂。然而,其在黑色素瘤中的作用和意义尚不清楚。在这项研究中,我们使用MZB1过表达(OE)(在SK-MEL-2和SK-MEL-2和SK-MEL-28)和CRISPR敲除(KO)(KO)(在A375和HS294T)线上确定了MZB1在人黑色素瘤细胞系中MZB1的功能显着性和免疫调节机制。MZB1 OE显着增加了黑色素瘤细胞的增殖和增殖标记物KI67和PCNA的表达,而MZB1 KO产生了相反的作用。为了鉴定与MZB1相关的免疫调节机制,我们使用纳米串NCounter技术对770个免疫相关基因进行了差异基因表达分析。nsolver分析确定了153个差异表达的基因(DEG)是HS294T细胞中MZB1敲除的结果(调整后的P <0.05,1.5倍变化截止)。MZB1 KO强烈降低了HLA II类家族基因的表达,并改变了各种细胞因子的表达,表明MZB1的免疫调节作用。此外,MZB1 KO显着下调了与癌症进展和转移促进有关的基因。此外,MZB1 KO降低了常见的“癌细胞”基因的表达,例如RXRG,ALDH1A1,AQP1,NFATC2,LPAR1,表明黑色素瘤中MZB1表达可能会促进推断分化的或神经裂纹的状态。此外,对DEG的Ingenuity途径分析(IPA)显示,MZB1 KO时发生了许多与癌症相关的功能(P调节<0.05),并显示出癌症促进途径在内的肿瘤生长,转移,转移和增殖的负富集。IPA调节分析预测MZB1 KO会减少包括PI3K,MEK和ERK1/2在内的致癌信号传导组件的激活。此外,IPA预测,MZB1抑制作用可以通过激活与T细胞增殖和激活,白细胞迁移和巨噬细胞激活相关的机制来积极地对更高的免疫反应敏感。总体而言,我们的研究表明,MZB1促进黑色素瘤中的致癌信号传导,以驱动增殖和去分化,并调节可能导致黑色素瘤细胞免疫逃避的广泛免疫基因。因此,MZB1值得进一步研究,以确定靶向MZB1产生的免疫后果是否可以补充黑色素瘤治疗中的ICB方法。