定期间隔间隔的短质体重复序列(CRISPR)和与CRISPR相关的蛋白质(CAS9)系统是ARCHEA和细菌使用的一种适应性免疫反应防御机制,用于降解前遗传材料。该机制可以用于其他功能,包括用于哺乳动物系统的基因组工程,例如基因敲除(KO)(KO)(1,2)和基因激活(3-6)。CRISPR Activation Plasmid products enable the identification and upregulation of specific genes by utilizing a D10A and N863A deactivated Cas9 (dCas9) nuclease fused to a VP64 acti- vation domain, in conjunction with sgRNA (MS2), a target-specific sgRNA engineered to bind the MS2-P65-HSF1 fusion protein (6).这种协同激活介质(SAM)转录激活系统提供了一个强大的系统,以最大程度地激活内源基因表达(6)。
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CRISPR/Cas 系统是一种适应性免疫防御机制,古细菌和细菌利用该系统降解外来遗传物质。在这些生物体中,噬菌体的外来遗传物质被获取并整合到 CRISPR 基因座中 (1,2)。这种新物质也称为间隔物,可产生序列特异性片段,用于未来抵抗噬菌体感染。这些序列特异性片段被翻译成短 CRISPR RNA (crRNA),并通过 CRISPR 相关 (Cas) 蛋白的核酸酶活性引导互补入侵 DNA 的切割,该蛋白也由 CRISPR 基因座编码 (1,2)。II 型 CRISPR 系统的 Cas9 核酸酶具有 RNA 结合域、α 螺旋识别叶 (REC)、包括用于 DNA 切割的 RuvC 和 HNH 的核酸酶叶以及原间隔物相邻基序 (PAM) 相互作用位点 (1,2)。 crRNA 通过与 REC 叶内的桥螺旋结合与 Cas9 核酸酶形成复合物,并与 crRNA 的骨架形成多个盐桥 (1,2,3)。
一种理论模型,该模型试图考虑到革兰氏阴性细菌中的周质 / - 乳糖确定的青霉素抗性水平(22)。The relevant parameters are the kinetic characteristics (Ki,m Vmax, and amount of enzyme produced) of the /)-lactamase, a perme- ability parameter (C) for the diffusion of the antibiotic across the outer membrane, and the concentration of the ,8-lactam antibiotic in the periplasmic space (Sp), specifically the concen- tration, SP, necessary for lethal inhibition内膜中的位点(一个或多个青霉素结合蛋白[17])。使用这种方法Zimmermann和Rosselet(22)成功地解释了TEM,B-乳糖果酶(在这种情况下,由R Plasmid RTEM编码)赋予Escherichia coli K-12的Ampicilin抗性,以及该enzyme diseme concememe conceporance conceporance的无能为力。对于阴茎lin g,该方法失败了。作者考虑了这样的解释,即在微型抑制浓度(MIC)检测过程中,外膜的屏障功能发生了变化(22)。但是,他们对SP的估计也可能是错误的。此处报告的实验为模型提供了不同的测试。通过使用对几种底物的亲和力改变的突变Fi-内酰胺酶,我们避免了估算SP的必要性,而是比较了由突变体直接确定的青霉素耐药性与由野生型酶确定的抗性。