XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemQTL
使用更新的橄榄 F2 'Koroneiki' 连锁图首次对低活力性状的 QTL 进行定位
橄榄树 ( Olea europaea L. ) 是地中海盆地农业的特色，它在适应高密度果园和机械化栽培方面面临着挑战。这项研究解决了一个关键问题：控制树木大小以提高橄榄种植的效率和可管理性。利用基因作图方法，我们已鉴定出与橄榄树低活力性状相关的重要数量性状位点 (QTL) 和候选基因。我们对 ' Koroneiki ' F2 后代的研究已确定了一个与树干基部直径相关的 QTL——根据形态测量，该性状与植物高度相关。结果强调这些性状受到强大的遗传控制，并且随着时间的推移观察到一致的相关性。我们确定了两个候选基因——酸性磷酸酶 1、莽草酸 O-羟基肉桂酰转移酶和可能与钙反应蛋白相关的 SNP 标记——每个候选基因都可能与植物激素相互作用从而影响生长。控制橄榄树的大小面临着若干挑战，包括大小和活力等多基因性状的遗传复杂性以及有限的砧木选择。通过将参考基因组与我们的基因分析相结合，我们提供了一种概念上的进步，与传统方法相比，它可以大大加快育种时间表。尽管由于橄榄遗传学的复杂性和该物种对转化的顽固性，基因组编辑在未来仍然是一种可能性，但我们的研究为指导未来的育种计划奠定了基础。通过针对已确定的候选基因，这项研究代表着朝着选择新的低活力基因型和砧木迈出了关键的一步，为橄榄种植的创新做出了贡献。
通过从xanthomonas oryzae PV中筛选稻米魔法种群中鉴定出的抗性和敏感性QTL。 oryzae
大米的细菌疫病（BB）的抗抗病性抗病性是由于病原体xanthomonas oryzae PV的进化和适应而是一项持续挑战。oryzae（XOO），耕种水稻品种。对这种病原体的毒力的基础是转录激活剂（TAL）效应子，可激活宿主基因的转录，对病原体的毒力，效果或两者兼而有之。宿主植物的耐药性预计如果针对影响病原体毒力和舒适性的策略性毒力因子会更耐用。我们表征了TAL7B，这是一种导致大米病原体毒力的少量毒力因子，是病原体的效果因子，并且在XOO的地理上多样化的菌株中广泛存在。为了识别对这种保守效应器的抵抗来源，我们使用了带有质粒寄生的TAL7B副本的高毒素菌株来筛选Indica多父母的高级高级杂交（魔术）种群。，特定于TAL7B（QBB-TAL7B）。总体而言，有150个预测TAL7B基因靶标与QBB-TAL7B QTL重叠。其中21个在预测的效应结合元件（EBE）位点中显示了多态性，而23个完全失去了EBE序列。接种和生物信息学研究表明，TAL7B特异性QTL之一QBB-TAL7B -8中的TAL7B靶向是一个疾病敏感性基因，并且该基因座的抗性机制可能是通过易感性丧失。我们的工作表明，较小的毒力因素显着促进疾病，并提供了一种潜在的新方法来识别有效的疾病抗性。
元素QTL分析和候选基因，用于野生Emmer
野生Emmer（Triticum turgidum ssp。dicoccoides）基因型的高核值和对各种压力的良好耐受性；因此，已经进行了一些QTL（定量性状基因座）研究，以发现有利的等位基因被渗入现代小麦品种。鉴于QTL性质的复杂性，它们与环境的相互作用以及其他QTL的相互作用，因此在小麦育种计划中使用了少量基因型。meta-QTL（MQTL）分析有助于简化现有的QTL信息，识别稳定的基因组区域和可能的候选基因，以进一步等位基因渗入。这项研究旨在使用过去14年的QTL信息来鉴定在不同的环境条件和遗传背景之间稳定的QTL区域，以基于17个独立研究的野生Emmer中的不同特征。总共将41个特征分类为质量特征（16），矿物组成性状（11），与非生物相关的特征（13）和与疾病有关的特征（1）。分析揭示了852个QTL分布在所有14种染色体上的野生Emmer，平均每个染色体61 QTL。质量特征的QTL数量最高（35％），其次是矿物质含量（33％），与非生物相关的特征（28％）和与疾病相关的特征（4％）。谷物蛋白含量（GPC）和千核重量（TKW）与检测到的大多数QTL有关。总共确定了43个MQTL，简化了信息，并将平均置信度间隔（CI）从22.6厘米降低到4.78 cm。这些MQTL与不同类别的多个特征有关。九个候选基因被鉴定为几个稳定的MQTL，有可能导致诸如质量，矿物质含量和非生物应力抗性之类的特征。 这些基因在各种植物过程中起着至关重要的作用，例如碳水化合物代谢，氮同化，细胞壁生物发生和细胞壁可扩展性。 总体而言，这项研究强调了在小麦育种计划中考虑MQTL分析的重要性，因为它确定了与多种特征相关的稳定基因组区域，从而为改善各种环境条件下的小麦品种提供了潜在的解决方案。九个候选基因被鉴定为几个稳定的MQTL，有可能导致诸如质量，矿物质含量和非生物应力抗性之类的特征。这些基因在各种植物过程中起着至关重要的作用，例如碳水化合物代谢，氮同化，细胞壁生物发生和细胞壁可扩展性。总体而言，这项研究强调了在小麦育种计划中考虑MQTL分析的重要性，因为它确定了与多种特征相关的稳定基因组区域，从而为改善各种环境条件下的小麦品种提供了潜在的解决方案。
个性化医学杂志
摘要：每行（KNR）的内核数是玉米（Zea Mays L.）谷物产量（GY）的重要组成部分，并且了解其遗传机制对于改善GY至关重要。在这项研究中，使用温带 - 热带 - 热带渗入线TML418和一个热带近交系列CML312作为女性父母和一个骨干玉米玉米玉米作为常见男性父母，创建了两个F 7重组近交系（RIL）种群。双向定量性状基因座（QTL）映射和全基因组关联分析（GWAS）。这项研究的目的是：（1）检测与KNR相关的基因组区域和/或基因组区域； （2）确定控制KNR的候选基因； （3）分析候选基因是否有助于改善GY。作者报告说，通过双期QTL映射与KNR密切相关的总共7个QTL，并通过GWAS识别了与KNR相关的21个SNP。在其中，在Dehong和Baoshan的两个位置检测到了一个高度凸的基因座QKNR7-1，两种映射方法。在此基因座，确定了三个新型候选基因（ZM00001D022202，ZM00001D022168，ZM0000001D022169）与KNR相关。这些候选基因主要参与与复合代谢，生物合成，蛋白质修饰，降解和变性有关的过程，所有这些都与影响KNR的渗透性发展有关。这三个候选基因先前尚未报告，被认为是KNR的新候选基因。杂种YE107×TML418的后代对KNR表现出很强的杂种，作者认为这可能与QKNR7-1有关。这项研究为玉米中KNR的遗传机制的未来研究提供了理论基础，并使用异性模式来发展高产混合体。
映射定量性状基因座
摘要现在可以使用完整的遗传连锁图来定位染色体区域上的主要定量性状基因座（QTL）。QTL映射的当前方法（例如，一次使用一对或两对侧翼标记时进行映射的间隔映射）可能会受到其他链接的QTL对染色体的影响，因为遗传背景不受控制。结果，QTL的映射可能是偏差的，并且映射的分辨率不是很高。理想情况下，当我们测试QTL标记间隔时，我们希望我们的测试统计量独立于染色体其他区域可能的QTL的影响，以便可以将QTL的效果分开。可以通过使用一对标记来定位测试位置，同时使用其他标记来通过多个回归分析来控制遗传背景。理论是在本文中开发的，旨在通过多元回归分析探讨条件测试的概念。研究了有关QTL图的多种回归分析的各种概述。理论分析表明，构建用于映射QTL的测试程序是有利的，并且这种测试可能会大大提高QTL映射的精度。
玉米中与耳朵相关性状的定量性状基因座和候选基因的热点区域：文献综述
摘要：在这项研究中，热点区域，QTL簇和候选基因具有八个与耳朵相关的玉米特征（耳长，耳长，耳道，内核行号，每行的内核数，内核长度，内核宽度，内核宽度，内核厚度和100个内核重量），并总结了三个十二次。本评论的目的是（1）全面总结和分析与这八个与耳朵相关性状相关的QTL的研究，并确定位于玉米染色体上的热点式bin区域以及与耳朵相关性状相关的关键候选基因，以及与QTL和稳定的QTL和QTL clusers和QTL clusers相关的杂物和QTL clusique和QTL clusequique and Migapppers的信息，并兴起。用于高收益和高质量玉米的映射，基因克隆和育种。先前的研究表明，与耳朵相关性状的QTL分布在玉米中的所有十种染色体上，而表型变异的解释为单个QTL范围为0.40％至36.76％。总共确定了所有十种染色体的耳朵相关性状的23个QTL热点箱。最突出的热点区域是4号染色体上的bin 4.08，其中15个QTL与八个与耳朵相关性状有关。此外，本研究确定了与耳朵相关性状相关的48个候选基因。在这些研究中，有五个被克隆和验证，而QTL热点中的二十8个候选基因是由本研究定义的。本评论对QTL映射的进步以及与八个与耳朵相关特征相关的关键候选者的识别提供了更深入的了解。这些见解无疑将帮助玉米育种者制定策略来开发高产玉米品种，从而有助于全球粮食安全。
与病原体感染期间与苹果内生菌相关的定量性状基因座
植物植物层由微生物群落定植，这些群落可能会影响其宿主的舒适性和生长，包括宿主对植物病原体的韧性。在塑造细菌和真菌内生菌的组合中，有多个因素，包括宿主遗传学和环境，包括宿主遗传学和环境。在这项工作中，宿主遗传学在植物 - 微生物组装组装中的作用是在感染了真菌病原体Neonectria ditissima的苹果（Malus X Forefla）树中的全同胞家族中研究的。定量性状基因座（QTL）分析表明，有多个基因座影响了单个内生类群的丰富性，而大多数QTL对内生细长的丰度具有中度到大作用（20-40％）。QTL区域在LG 1、3、4、5、10、12、13、14和15上被证明会影响多个分类单元。只有一小部分总体分类组合物的变化受宿主基因型的影响，主要成分的QTL命中显着，分别解释了细菌和真菌组成的总方差<8％和<7.4％。识别的QTL中有四个与对新生儿ditissima的耐受性相关的先前识别区域共定位。这些结果表明，构成苹果内生菌组成的遗传基础，并且可以通过育种来定制苹果中的微生物 - 宿主相关性。
大豆中的种子重量[甘氨酸
种子大小和形状是确定大豆产量和质量的重要特征。种子大小和形状对于豆腐，纳托，味o和毛豆等特殊大豆食品也是可取的。为了发现稳定的定量性状基因座（QTL）和候选基因种子形状和100种子重量，目前的研究使用了蔬菜类型和种子大豆衍生的F 2和F 2：3映射种群。总共映射了42个QTL，分散在13个染色体上。确定七个是稳定的QTL，其中五个是主要的QTL，即QSL-10-1，QSL-4-1，QSW-4-1，QSV-4-1，QSV-4-1，QSLW-10-10-1和QSLH-10-1。在当前研究中检测到的42个QTL中的13个是在已知基因座发现的，而其余的29则是第一次发现。在这29个新颖的QTL中，有17个是主要的QTL。基于通过进化关系（Panther），基因注释信息和文献搜索的蛋白质分析，预计七个稳定的QTL中的66个基因被预计可能是可能调节大豆中种子形状和种子体重的候选基因。当前的研究确定了控制大豆种子形状和体重的关键候选基因和定量性状基因座（QTLS），这些结果将非常有助于标记辅助育种，以开发具有改善种子体重和所需种子形状的大豆品种。
生菜对虫害坏死病毒的遗传和生理决定因素
结果：14个领域实验中的平均DI范围为2.1％至70.4％。在经过测试的加入中观察到了DI的高度差异，在红色品种中，DI最低的DI在红色品种中检测到了最低的DI，Reed of the良好的选择，红色飞溅COS，步兵，甜蜜的情人节，Annapolis和Velvet。多个线性回归模型揭示了在DI上的四个分析决定因素中的小但显着的影响（P <0.005）。DI值较低的加入的植物发育较慢（PD，r = 0.352），ACI含量较高（r = - 0.284），TFD较低（r = 0.198）和较低的SPAD含量（r = 0.125）。一项全基因组关联研究显示，在九个生菜染色体中，位于八个di的13个QTL（例外是Chr。8）。最常见的QTL（QINSV2.1）位于Chr上。2。DI的DI QTL与PD，ACI和SPAD的QTL相同的基因组区域。chr上的di的另外三个QTL。5和8。
识别涉及混合性能和杂种群体互补性的QTL：应用于阶乘和混合拨号玉米玉米混合动力面板的新GWAS模型
抽象密钥消息提出了一个原始的GWAS模型，该模型集成了等位基因的祖先，并允许探测背景特定的添加剂和优势QTL，涉及异性群互补性和混合性能。抽象的玉米遗传多样性被构造成彼此选择和改善的遗传群体。此过程会随着时间的流逝而增加组的互补性和分化，并确保由小组间杂交产生的杂种表现出较高的表现和异性症。为了确定与混合性能和杂种群体互补涉及的基因座，我们引入了一个原始的关联研究模型，该模型将等位基因的异性群的起源与异性构成群体分离，并将其与常规的添加剂/优势模型进行了比较。这个新模型应用于凹痕和弗林特线之间的阶乘，以及具有两种不同分析层的凹痕混合线之间的拨号线：在每个环境中和多种环境中。我们确定了所有特征的几个强大的添加剂QTL，包括一些用于开花时间的众所周知的加性QTL（在染色体8上的VGT1/2区域）。屈服特征在拨号面板中显示出显着的非加性效果。大多数检测到的产量QTL表现出过度势力或更有可能的伪过分效应。在这些QTL上明显过度污染，导致了遗传组互补性的一部分。环境之间的比较显示，添加QTL效应的稳定性高于非添加效应。我们还揭示了显示遗传群起源作用的大型染色体区域。根据局部杂种群的起源，几个QTL显示出效应的变化。总的来说，我们的结果说明了混合面板如何与专用的GWAS建模相结合，允许识别新的QTL，这些QTL无法通过通过传统建模分析的经典混合面板无法揭示的新QTL。