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通过从xanthomonas oryzae PV中筛选稻米魔法种群中鉴定出的抗性和敏感性QTL。 oryzae
大米的细菌疫病（BB）的抗抗病性抗病性是由于病原体xanthomonas oryzae PV的进化和适应而是一项持续挑战。oryzae（XOO），耕种水稻品种。对这种病原体的毒力的基础是转录激活剂（TAL）效应子，可激活宿主基因的转录，对病原体的毒力，效果或两者兼而有之。宿主植物的耐药性预计如果针对影响病原体毒力和舒适性的策略性毒力因子会更耐用。我们表征了TAL7B，这是一种导致大米病原体毒力的少量毒力因子，是病原体的效果因子，并且在XOO的地理上多样化的菌株中广泛存在。为了识别对这种保守效应器的抵抗来源，我们使用了带有质粒寄生的TAL7B副本的高毒素菌株来筛选Indica多父母的高级高级杂交（魔术）种群。，特定于TAL7B（QBB-TAL7B）。总体而言，有150个预测TAL7B基因靶标与QBB-TAL7B QTL重叠。其中21个在预测的效应结合元件（EBE）位点中显示了多态性，而23个完全失去了EBE序列。接种和生物信息学研究表明，TAL7B特异性QTL之一QBB-TAL7B -8中的TAL7B靶向是一个疾病敏感性基因，并且该基因座的抗性机制可能是通过易感性丧失。我们的工作表明，较小的毒力因素显着促进疾病，并提供了一种潜在的新方法来识别有效的疾病抗性。
将全基因组的 CNV 整合到 QTL 和高置信度 GWAScore 区域中，可确定绵羊经济性状的候选位置
拷贝数变异（CNV）是遗传变异的重要来源，它通过多种机制影响多种经济性状。此外，基因组扫描可以识别许多影响经济性状的数量性状位点（QTL），而全基因组关联研究（GWAS）可以定位与表型变异相关的遗传变异。在本研究中，我们开发了一种称为 GWAScore 的方法，该方法收集 GWAS 汇总数据以识别潜在候选基因，并将 CNV 整合到 QTL 和高置信度 GWAScore 区域以检测影响绵羊生长性状的关键 CNV 标记。我们得到了 197 个与候选 CNV 重叠的候选基因。一些关键基因（MYLK3、TTC29、HERC6、ABCG2、RUNX1 等）显示出比其他候选基因显著更高的 GWAScore 峰值。在本研究中，我们开发了 GWAScore 方法来挖掘候选基因作为绵羊分子育种标记的潜在价值。