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RNase 4（NEB＃M1284）MRNA 5´CAP结构的DNA探针指导分析| neb nebnext UltraExpress FS DNA库准备套件E3340手册 化学品安全技术说明书 使用Nebridge®金门组件进行蛋白质工程的DNA洗牌 君主质粒小型套件T1010手册 新英格兰Biolabs分析证书 胜任的细胞 基因组编辑 Authenticase M0689手册 R＆D和对... 的制造支持 新英格兰Biolabs分析证书 Authenticase M0689手册 裂解靠近DNA片段的末端（线性化矢量） Nebnext Ultra DNA库Prep套件，用于Illumina E7370手册 腺病毒2 Nebnext Ultra II DNA库Prep套件，用于Illumina，用于Illumina（独特的双索引UMI适配器DNA）E7645 E7645 E7103手动 NEBNEXT微生物组DNA富集试剂盒E2612手册 DNA组装与合成生物学 DNA组装与合成生物学 通过双链DNA片段的单链DNA寡桥构建SGRNA-CAS9表达载体 nebnext®快速DNA库预备组件454 Monarch MAG病毒DNA/RNA提取套件T4010手册 新英格兰Biolabs分析证书 T4 DNA连接酶（M0202）CHN 的安全数据表 翠鸟柔性自动隔离病毒DNA/RNA的方案| neb 基因编辑 φx174
已测试至少20 nt。探针可以用3´或5´生物素/Desthiobiotin亲和力组设计，用于链霉亲和素富集（NEB＃S1421）。为了获得最佳结果，受保护的DNA：RNA杂交区应为4或5个核苷酸
通过添加蛋白酶-K和RNase的煮沸法分离大肠杆菌DNA进行纯度和浓度分析
摘要 大肠杆菌是印度尼西亚尿路感染 (UTI) 的主要原因，每年约有 180,000 例报告。UTI 病例越多，越需要使用准确、快速、简单且经济的 DNA 分离方法进行 PCR 诊断。然而，目前煮沸 DNA 分离法中没有从蛋白质和 RNA 污染物中纯化 DNA 的阶段。本研究旨在调查将蛋白酶 K 和 RNase 纳入煮沸 DNA 分离法对分离过程中大肠杆菌 DNA 纯度和浓度的影响。煮沸法涉及加热至 95 C – 100 C 导致细胞裂解并释放细胞成分，包括 DNA。尿液样本以不同的麦克法兰标准（0.25、0.5 和 1）人工污染大肠杆菌。然后进行煮沸 DNA 分离法，然后使用 NanoDrop 分光光度计分析纯度和浓度。本研究表明，煮沸 DNA 分离法中使用的蛋白酶 K 和 RNase 浓度与随后的 DNA 纯度和浓度增加之间存在正相关性。尽管与未添加蛋白酶 K 和 RNase 相比，DNA 纯度和浓度有所增加，但与未添加蛋白酶 K 和 RNase 相比，其统计学意义并不显著，DNA 纯度的 p 值为 0.245，DNA 浓度的 p 值为 0.353。建议进一步研究在煮沸 DNA 分离法中使用更高的蛋白酶 K 和 RNase 浓度，以提高大肠杆菌 DNA 的纯度和浓度。这种增强可以改善 PCR 扩增并有助于诊断大肠杆菌相关的尿路感染。关键词煮沸法、DNA 纯度、DNA 浓度、蛋白酶 K、RNase。
先天免疫核酸内切酶RNase l
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2023年10月12日。 https://doi.org/10.1101/2023.10.12.562082 doi：Biorxiv Preprint
senataxin和rNase H2起作用，以抑制类开关重组期间的基因组不稳定性
抽象类开关重组产生的不同的抗体同种型对鲁棒的适应性免疫系统至关重要，并且缺陷与自身免疫性疾病和淋巴瘤相关。在类开关重组期间需要转录才能募集胞苷脱氨酶AID（这是形成DNA双链断裂的重要步骤），并强烈诱导了免疫球蛋白重链链基因座内的R环形成。但是，R回路对上课开关重组期间双链断裂形成和修复的影响尚不清楚。在这里，我们报告说，缺乏参与R环去除的酶的细胞 - 纳经素和RNase H2 - 证明在免疫球蛋白重链重链链路上增加了R环的形成和基因组不稳定性，而不会影响其转录活性，辅助招募或类转换的重组效率。senataxin和RNase H2缺陷型细胞在开关连接处也表现出增加的插入突变，这是替代末端连接的标志。重要的是，在缺乏鼻蛋白酶或RNase H2b的细胞中未观察到这些表型。我们提出，Senataxin用RNase H2冗余起作用，以介导及时的R环去除，从而促进有效的修复，同时抑制辅助依赖性基因组不稳定性和插入诱变。
RNase H 依赖性 PCR 能够高度特异性地扩增单个 B 细胞中的抗体可变区
基于免疫的抗体发现平台需要稳健有效的方案来从大量 B 细胞中扩增、克隆、表达和筛选抗体，以便有效捕获经验丰富的免疫球蛋白库的多样性。多重 PCR 使用一系列正向和反向引物来从一系列不同的种系序列中回收抗体，这很有挑战性，因为引物设计需要回收全长抗体序列、低起始模板浓度，并且需要所有引物在相同的 PCR 条件下发挥作用。在这里，我们展示了将 RNase H2 依赖性 PCR (rh-PCR) 整合到高通量抗体发现平台中的几个优势。首先，rh-PCR 将引物二聚体的合成消除到可检测水平以下，从而消除了具有假阳性抗体滴度的克隆。其次，通过提高 PCR 的特异性，rh-PCR 引物增加了从单个 B 细胞中回收同源抗体可变区以及下游重组抗体滴度。最后，我们证明，在基于下一代测序的方法中，rh-PCR 引物可提供更均质的样本池和更高的序列质量，从而从大量克隆的抗体同源对中获取 DNA 序列信息。此外，rh-PCR 引物的更高特异性使天然抗体种系序列与从单个 B 细胞扩增的 VL/VH 片段之间能够更好地匹配。
nzy核糖核酸酶抑制剂
nzy核糖核酸酶抑制剂是一种从大肠杆菌中纯化的重组蛋白。它通过以1：1的比例非共归因于胰腺类型（例如RNase A，RNase B和RNase C）抑制胰腺类型的核糖核酸（RNase; EC 3.1）的活性。nzy核糖核酸酶抑制剂在RNase污染是潜在问题的任何应用中都是有用的。例如，它可用于保护cDNA合成反应，RT-PCR或体外转录/翻译中的模板RNA，并在体外复制过程中保护病毒RNA。此外，它将在RNA分离和纯化和无RNase抗体制备过程中抑制RNase。nzy核糖核酸酶抑制剂对RNase 1，RNase T1，RNase T2，S1核酸酶和RNase H.
RNase 4（NEB＃M1284）MRNA 5´CAP结构的DNA探针指导分析| neb
库由（a）10 ng和（b）200 ng的人gdna（Na19240）用6个PCR循环稀释为1：3，并在挂接的HSD1000屏幕截图上运行。图4.1.b显示了在晚期PCR周期下200 ng样品的非线性扩增阶段导致的上部标记上方的峰（由红色箭头指示）。尽管在非线性扩增阶段产生的分子是可行的，但它们在屏幕映射上的迁移速度的不同迁移速度会导致文库浓度的定量不准确。在这种情况下，我们建议使用400 bp或预期的库大小来测量纳米体或疯子上的库浓度，以将浓度值转换为纳米尔。以下方程可用于将浓度从ng/μl转换为nm：[（ng/μl中的库浓度）/（bp中的660 g/mol x库尺寸）] x 10 6 = nm中的浓度。
Genematrix通用DNA/RNA/蛋白质纯化试剂盒
注意6·通过添加能够破坏二硫键键的还原剂（例如ß-甲醇（ß -me）或二硫代硫醇（DTT））的减少剂，从而污染了污染的RNass。为了促进二硫键的还原，使用前，每1 mL缓冲液DRP加入10 µLß -ME。添加ß -ME后，DRP缓冲液保持稳定1个月。使用前，每1 ml缓冲液在使用前，在RNase无rNase无水中添加10 µl [1 m] DTT的毒性但更昂贵的替代品。dtt在缓冲区DRP中不稳定，因此不得存储DTT-供应的DRP缓冲液等分试样。[1 M] DTT储备溶液在RNase无水酶中的工作等分试样必须存储在-20°C下，以保持稳定性。设置[1 M] DTT储备溶液（MW = 154.25 g mol -1），溶解1.54 g DTT每10 ml RNase无rNase无水，并将其存储在等分试样中以进行一次使用。