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尿路感染的晚期分子测试
摘要：在这篇评论文章中，人们强调，采用先进的分子诊断对于现代UTI管理至关重要，与传统方法相比，采用更全面，准确和快速的方法。标准尿培养的局限性包括低灵敏度和无法培养某些微生物的培养，导致未诊断的病例和发病率增加。晚期分子技术，例如多重PCR和合并的抗生素敏感性测试，已显示可大大减少经验治疗和负面结果。和晚期分子方法（如宏基因组学（MNG））提供了全面的病原体检测，而无需先前了解目标生物，从而提高了诊断产量。这些方法还检测到抗生素耐药性基因，有助于精确的治疗策略并改善患者预后。采用先进的分子诊断对现代UTI管理至关重要，与传统方法相比，提供了更全面，准确和快速的方法。这些技术对于改善患者护理和对抗抗生素耐药感染至关重要。关键字：尿路感染（UTI），多数菌感染，抗生素耐药性，尿液微生物组，宏基因组学，精密医学，慢性UTI。版权所有©2024作者：这是根据Creative Commons Attribution 4.0国际许可（CC BY-NC 4.0）分发的开放访问文章，允许在任何非商业用途的媒介中使用，不受限制地使用，分发和再现，以提供原始作者和源头。i ntroduction
由于尿路感染而de妄...
摘要：目的：分析尿路感染对老年患者del妄发展的影响。方法：使用BVS，Medline，PubMed和Google Scholar数据库进行了综合文献书目审查。选择了基于定义的包含和排除标准的22项研究。结果：Delirium是老年人中常见的神经精神综合征，通常由ITUS沉淀。妄想的患病率在ICU和姑息治疗等医院环境中很高。ITU期间的全身性炎症反应会导致脑神经化学功能障碍，导致del妄。诊断需要详细的临床评估和实验室测试。跨学科管理对于优化治疗至关重要。预防包括足够的水摄入量，会阴卫生和药物审查。结论：得出的结论是，早期的识别和适当的管理可以显着改善受影响的老年人的健康状况和生活质量。预防策略，例如促进综合卫生保健和药物的合理使用，对于减少在这个脆弱人群中与ITU相关的de妄的发生至关重要。
生产来自西班牙的大肠杆菌分离株
抗生素耐药性大肠杆菌是导致社区获得性和院内感染的主要病原体之一，发病率和死亡率较高 ( Hu et al., 2022 )。它们被认为是泌尿道感染 (UTI)、菌血症和腹腔内感染 (IAI) 的主要原因之一 ( Balasubramanian et al., 2023 )。大肠杆菌具有获得抗生素耐药基因 (ARG) 的能力，例如 bla CTX-M-15 超广谱 b -内酰胺酶 (ESBL)，并迅速在整个社区传播它们 ( Gonza ́ lez et al., 2020 )。与其他产碳青霉烯酶的肠杆菌（如肺炎克雷伯菌和阴沟肠杆菌复合体）相比，产碳青霉烯酶大肠杆菌 (CP-Eco) 在临床环境中分离的频率并不高，但尤其令人担忧。这是因为它们的患病率正在上升（Cañada-Garc ı ́ a 等人，2022 年），人们担心它们会以类似于 ESBLs 的方式在社区中传播碳青霉烯酶基因（Gonza ́ lez 等人，2020 年）。此外，这些分离株通常对其他几种抗生素具有耐药性，因此难以治疗相关感染（Boutzoukas 等人，2023 年）。所有主要的碳青霉烯酶家族均已在 CP-Eco 中检测到 (Grundmann 等人，2017 年)，此外还有多种对临床结果产生负面影响的毒力决定因素 (C ̌ urova ́ 等人，2020 年)。所有这些促使世界卫生组织宣布 CP-Eco 是一个关键的优先问题 (Tacconelli 等人，2018 年)。在全球范围内，抗生素耐药性大肠杆菌在中高收入国家医院内感染的发生率最高，每年造成 300 万至 2500 万人感染 (Balasubramanian 等人，2023 年)。在欧洲，2015 年 CP-Eco 引起的感染人数中位数为 2,619 人，死亡人数中位数为 141 人 (Cassini 等人，2019 年)。在西班牙，CP-Eco 的发病率已从 2013 年的孤立病例（ Oteo 等人，2015 年）发展到 2019 年在西班牙 10 个不同的省份中被发现（ Cañada-Garc ı ́ a 等人，2022 年）。
老年人的尿路感染（UTI）
Geri-RxFiles: UTIs in Older Adults Abbreviations: = dose for renal dysfunction ac =before meals ACEi =angiotensin converting enzyme inhibitor AE =adverse event(s) AMMI =Association of Medical Microbiology and Infectious Diseases of Canada amox =amoxicillin aOR =adjusted odds ratio ARNI =angiotensin receptor-neprilysin inhibitor ARB =angiotensin II receptor blocker B =American Geriatrics Society Beers Criteria for potentially inappropriate medication use in older adults BG =blood glucose BID =twice daily BPH =benign prostatic hyperplasia C.diff =Clostridium difficile CAM =confusion assessment method CBC =complete blood count cc =with food CI =confidence interval cipro =ciprofloxacin Clav =clavulanate CrCl =creatinine clearance C&S =culture & sensitivity d =day(s) DS =double strength (1DS tab= 160/800mg) E.coli = Escherichia coli ESBL =extended spectrum beta-lactamases FQ =fluoroquinolones ID =infectious diseases IDSA =Infectious Diseases Society of America hr =hour(s) IV =intravenous L =litre(s) LTC =long-term care min =minute(s) mL =millilitres mo(s) =month(s) Na + =sodium NNH =number needed to harm NNT =number needed to treat NSAID =non-steroidal anti-inflammatory drug(s) po =oral QT =QT interval QID =four times daily RCT =randomized controlled trial S =STOPP (screening tool of older persons' prescriptions) SCr =serum creatinine SHA =Saskatchewan Health Authority SK =Saskatchewan SMX =sulfamethoxazole SOGC =Society of Obstetricians and Gynaecologists of Canada TID =three times daily TMP = trimethoprim TMP/SMX =Cotrimoxazole, Septra, Bactrim or trimethoprim/sulfamethoxazole UTI =尿路感染YR（S）=年份致谢：玛格丽特·金（Margaret Jin）撰写。由Marlys Lebras（2019，2024）更新。临床医生工具：感谢我们的审稿人：洛伦·雷格（Loren Regier）（2019，2024），布伦特·詹森（Brent Jensen）（2019，2024），朱莉娅·贝勒姆（Julia Bareham）（2019），杰西卡·维斯坦丁（Jessica Visentin）（2024），塔尼亚·尼亚斯特（Tanya Nystrom）（2024）（2024），克里斯汀·施密特（Kristin Schmidt），克里斯汀·施密特（Kristin Schmidt），克里斯汀·施密特（Kristin Schmidt）（2024），玛格丽特·吉恩（2024），玛格丽特·吉恩（Margaret Jin）（2024），Marc leggge（2024）。披露：作者没有报告任何利益冲突。免责声明：rxfiles学术细节是萨斯喀彻温大学药房和营养学院的一部分。这项工作的内容代表了作者的研究，经验和观点，而不是萨斯喀彻温大学的研究。作者，萨斯喀彻温大学或任何参与此工作授权的准备或出版的任何其他当事方都不是在此处包含的信息是准确或完整的，并且对任何错误或遗漏或从使用此类信息中获得的结果概不负责。任何材料的使用都将暗示确认此免责声明，并释放萨斯喀彻温大学，其雇员，仆人或代理商的任何责任。读者被鼓励确认此处包含的其他来源的信息。
Paul F. Parker Medal
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医学微生物学讲义ppt
微生物学基础：临床方法 - 第三版 由 Johana Meléndez 教授等编写 医学微生物学简介，作者：Andrew Dodgson 博士 本书是了解医学微生物学的综合资源，涵盖了基本概念和临床方法。 关键概念包括： - 研究导致人类疾病的微生物（病毒、细菌、真菌和寄生虫） - 正常菌群：人体皮肤和粘膜上有益微生物的存在 - 污染：培养物中存在在采集样本时不存在的生物 - 定植：生物在某个部位存在但没有引起疾病或症状 - 感染：生物侵入身体部位、繁殖并引起组织反应、症状或疾病 将生物分类为界、门、属、种对于理解医学微生物学也至关重要。其中包括： - 病毒：体型小，无法独立复制，难以治疗（例如流感、艾滋病毒/艾滋病） - 细菌：能够独立复制，导致医院中见到的大多数感染，并用抗生素治疗 - 真菌：复杂、大型生物，也会导致疾病（例如肺炎、尿路感染） 了解这些概念对于医疗保健专业人员有效地诊断、预防和治疗感染至关重要。 细菌可分为真菌和霉菌，导致一系列疾病，例如鹅口疮、足癣、侵袭性和过敏性曲霉病。许多疾病都是机会性的。 对细菌进行分类至关重要，因为不同类型的细菌会导致不同的疾病，并且对抗生素有不同的反应。为了对细菌进行分类，我们根据它们的微观外观对它们进行分组，然后根据生化反应等特性进一步将它们分为不同种类。 革兰氏染色法通过使用结晶紫和其他化学物质对载玻片进行染色来帮助区分细菌。这种方法可以确定细菌是革兰氏阳性还是革兰氏阴性，这会影响其抗生素耐药性。革兰氏染色还提供有关细菌细胞壁形状的信息，将它们分为四个主要类别：G+ 杆菌、G+ 球菌、G- 杆菌和 G- 球菌。这种初步鉴定对于诊断疾病和选择适当的抗生素很有用。 微生物学是研究微生物（包括细菌、病毒、真菌和其他微观生命形式）的科学分支。医学微生物学领域专门研究人类传染病的原因和影响。 微生物分类 ----------------------------- 微生物分为几类： * **原生生物**：包括原生动物等单细胞生物的群体。 * **病毒**：此类包括病毒，它们是可导致人类传染病的非细胞生命系统。 * **DNA 病毒和 RNA 病毒**：病毒类别的子类别，以其遗传物质（DNA 或 RNA）区分。 * **真核生物**：包括单细胞真核生物（如藻类和原生动物）的群体。 * **原核生物**：此类别包括细菌，即没有细胞核的原核细胞。 * **真菌**：一类微生物，包括对人类有致病性的真菌。 * **蓝藻**：蓝藻的一个子类别。 * **藻类**：一组光合真核生物。 * **细菌**：此类包括革兰氏阴性细菌，其具有特征性的细胞壁结构，由外膜和含有胞壁酸的薄内肽聚糖层组成。 * **原生动物**：原生生物的一个子类别，包括对人类有致病性的单细胞动物生物。细菌类内的分类 --------------------------- -- 细菌类进一步分为三个亚类： 1. **暗细菌**：此类细菌的细胞壁为革兰氏阴性，由外膜和含有胞壁酸的薄内肽聚糖层组成。 2. **无氧光合细菌和有氧光合细菌**：暗细菌亚类的子类别。 微生物命名法 ------------------------------ 在微生物学中，使用二名法来识别物种。该系统为每种物种分配一个通用名称和一个特定名称。例如，*炭疽芽孢杆菌* 和 *破伤风梭菌* 分别是炭疽杆菌和破伤风杆菌的科学名称。 细菌的大小 ------------------ 细菌的大小通常以微米 (μm) 或毫米 (mm) 为单位。大多数致病菌的尺寸在 0.1 到 10 μm 之间。用于测量微生物的其他单位包括纳米和埃。 细菌的形态 ------------------------- 细菌是通过二分裂繁殖的原核细胞，二分裂是一种无性繁殖，细胞分成两个相同的子细胞。它们同时具有 DNA 和 RNA，可根据形状进行分类： 1. **球形（球菌）**：此类细菌呈球形。 2. **杆状（细菌、杆菌和梭菌）**：细菌类的子类别，包括长度不一的杆状体。 3. **螺旋形（弧菌、螺旋体、螺旋体）**：杆状细菌的一个子类别。 淋病奈瑟菌的电子显微照片 ---------------------------------------------- 电子显微照片是使用电子显微镜拍摄的高分辨率图像。这张显微照片显示的是*淋病奈瑟菌*的形态，它是一种导致淋病的致病菌。杆状细菌的排列 -------------------------------------- 杆状细菌可以排列成不同的形状，包括： 1. **单杆**：单个杆状细菌。 2. **链杆菌**：一种具有特征形状的杆状细菌。螺旋形式 ---------- ---- 弧菌是一种螺旋状的细菌，外观类似逗号。细菌有各种形式，包括霍乱弧菌和螺旋体，它们都是盘绕的形状。致病菌种如小螺旋体会导致鼠咬热，而幽门螺杆菌会导致胃溃疡。螺旋体是一类细菌，包括密螺旋体、钩端螺旋体和伯氏疏螺旋体，其特征是细胞薄而柔韧，有规则的扭曲。细胞壁对于细菌的刚性和渗透保护至关重要，由革兰氏阳性菌中的肽聚糖组成。所讨论的细菌不能运动，也没有荚膜，属于革兰氏阴性。它们对各种抗生素高度敏感，需要活细胞才能在其中繁殖。从形态上看，这些立克次体与某些细菌有相似之处，具有包围原生质物质和致密颗粒的限制膜。另一方面，衣原体也是革兰氏阴性菌，缺乏必要的能量产生机制，因此是细胞内寄生虫。它们表现出两种不同的形态：原生体和初始体。实验室诊断采用多种方法：1. 细菌镜检 2. 常规细菌学检测 3. 抗生素敏感性检测，以检测细菌对药物的反应 4. 血清学评估抗体存在 5. 生物技术，用于识别特定的生物过程 6. DNA 技术检测，如 PCR（聚合酶链反应），可检测各种生物体的 DNA 或 RNA，例如 HIV。血清学评估抗体的存在 5. 用于识别特定生物过程的生物技术 6. DNA 技术测试，如 PCR（聚合酶链反应），可检测来自各种生物体（例如 HIV）的 DNA 或 RNA。血清学评估抗体的存在 5. 用于识别特定生物过程的生物技术 6. DNA 技术测试，如 PCR（聚合酶链反应），可检测来自各种生物体（例如 HIV）的 DNA 或 RNA。