XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemVenn
迈向人机共创的社会理论
摘要 本文综合了当前理解人机交互的理论尝试，并介绍了七个前提，以理解我们日益强大、普及和可立即访问的算法所带来的新兴动态。希望这七个前提能够构建人机共创的社会理论。关注人机共创旨在强调两个因素。首先，我们的机器学习系统是社会化的。其次，人类思维和人工智能系统的共同进化性质，因为智能设备构成了我们认知支架不可或缺的一部分，从而塑造了我们对世界和自己的感知。这七个前提包括：社会结构的首要地位；人类对自由和自主的渴望；人工智能系统将成为我们认知/情感支架不可分割的一部分，并可以改变我们的自我理解；人类繁荣的哲学和人文基础作为人机交互的指导；心灵海绵信息过滤过程；价值观在人机交互中如何变化和出现的文化适应过程；人与人、人与自然、人与机交互的重叠维恩图。本文最后讨论了人类在与社会化机器纠缠中的能动性以及笛卡尔代理对心灵的看法的虚幻性。
Piezo1激活增加了治疗性...
图1。使用不同培养方法的EV产生具有不同的特征（A）在2D，3D和MSC的HS培养物的条件培养基中，进行了六个独立实验。bars代表五个独立重复的结果（*** p <0.001，** p <0.01）（b）主成分分析（PCA）的MSCS细胞的蛋白质组学数据和EV从2D，3D和HS中分离的MSC分离的EV，分析了三个独立的样品。（c）Venn图描绘了从2d 3D和HS中从MSC分离的EV中显着表达的蛋白质独特或剪切应力。（d）在2D，3D和HS中从MSC分离的EV中差异表达的剪切应力相关蛋白的数量。（E）在2D，3D和HS中从MSC分离的MSC和EV的细胞裂解物（Cl）中CD63的表达水平。Bars represent results from three independent replicates (* p < 0.05) (F Expression of Piezo1 protein in cell lysate (CL) of MSCs and EVs isolated from MSCs in 2D, 3D and HS Bars represent results from three independent replicates (* p < 0.05) (G) Western blot analysis o tetraspanin EV markers (CD63, CD9, CD81) in 3D and HS cultures, with no群体之间的可观察差异（h）MSC中的压电1和B-肌动蛋白表达的蛋白质印迹分析。
系统生物学 xOmicsShiny：用于跨组学数据分析和通路映射的 R Shiny 应用程序
摘要摘要：我们开发了 xOmicsShiny，这是一款功能丰富的 R Shiny 应用程序，它使生物学家能够全面探索跨实验和数据类型的组学数据集，重点是在通路层面揭示生物学见解。数据合并功能可确保灵活探索跨组学数据，例如转录组学、蛋白质组学、代谢组学和脂质组学。通路映射功能涵盖广泛的数据库，包括 WikiPathways、Reactome 和 KEGG 通路。此外，xOmicsShiny 为日常组学数据分析提供了多种可视化选项和分析任务，即 PCA、火山图、维恩图、热图、WGCNA 和高级聚类分析。该应用程序使用可定制的模块来执行各种任务，生成交互式图表和可发布的图表。这种动态模块化设计克服了 R Shiny 工具加载缓慢的问题，并允许研究和开发人员社区轻松扩展它。可用性和实施：R Shiny 应用程序公开发布于：http://xOmicsShiny.bxgenomics.com 。研究人员可以将自己的数据上传到服务器或使用预加载的演示数据集。源代码在 MIT 许可下提供于 https://github.com/interactivereport/xOmicsShiny 以供本地安装。该应用程序的完整教程可在 https://interactivereport.github.io/xOmicsShiny/tutorial/docs/index.html 获得。联系方式：yuhenry.sun@biogen.com 或 baohong.zhang@biogen.com 补充数据：补充数据可在 bioRxiv 在线获得。
ai/ml 对核调控的影响 - ONR
图 1：AI/ML 技术的维恩图 ................................................................................................................ 9 图 2：Gartner 人工智能技术成熟度曲线 ................................................................................................ 12 图 3：由于 ML 分类算法的性质，即使是强大的测试也可能无法检测到缺陷。在此示例中，两个缺陷位于测试用例之间，因此未被发现。 ................................ 15 图 4：ML 组件开发生命周期 ...................................................................................................... 17 图 5：[25] 引入的快速梯度符号法，但也是一个可能具有误导性的示例 [26] ............................................................................................................................. 23 图 6：对抗性 T 恤可以避免被 YOLOv2 系统检测到 [27] .................................................................... 24 图 7：示例 ROC 曲线 ............................................................................................................................. 80 图 8：显示 ML 分类器（垂直线）和基本事实（红色代表 FALSE，绿色代表 TRUE）的二元分类器 ............................................................................................................. 81 图 9：准确率（左）是所有检测到的正例中真正例的比例，召回率（右）是所有基本事实正例中真正例的比例。 ........................................... 81 图 10：IoU = 0.5 的示例预测 .............................................................................................. 83 图 11：基于 CBI 的可靠性声明的示例 CAE 结构 .............................................................................. 87 图 12：使用贝叶斯推理可以增加对产品的信心 ...................................................................... 88 图 13：满足第 B.3.2.1 节中所述约束的两个示例先验分布 ......................................................................................................... 89 图 14：安全监视器架构 ............................................................................................................. 91 图 15：监视器可行性 ............................................................................................................................. 91
基于RNA-Seq的转录组学和GC-MS定量分析揭示了Clausena Lansium（Lour。）针对白色念珠菌
摘要：白色念珠菌（白色念珠菌）引起的感染以及对常用药物的抗性增加导致多种粘膜疾病和全身感染性疾病。我们以前证实了克劳西纳兰斯的精油（lour。）skeels种子（CSEO）对白色念珠菌具有抗真菌活性，但是化学成分与抗真菌活性之间的详细机制尚不清楚。在这项研究中，使用气相色谱 - 质谱 - 含量 - 含量分析（包括sabinene，α-苯坦率，β-苯烷基，4-替酮和β-氧化酚）的五个挥发性成分的定量分析。肉汤稀释和动力学生长方法证明，CSEO对抗氟康唑 - 白色念珠菌的抗真菌活性比其主要成分（Sabinene和4-Terpineol）更好。为了进一步研究抑制性机制，基于RNA-Seq确定了白色念珠菌对CSEO，Sabinene和4-甲酸治疗的转录反应。从基因的角度来看，差异表达基因的Venn图和聚类分析模式显示了CSEO和4-甲状腺抗C.白色念珠菌活性的机制可能相似。功能富集分析表明，CSEO调节粘附，菌丝和生物膜形式相关的基因，这可能是CSEO抑制抗氟康是抗康辅酰梭菌生长的活性机制。总体而言，我们先揭示了CSEO对白色念珠菌的化学成分与抗真菌活性之间的分子机制。skeels种子。这项研究提供了克服白色念珠菌抗唑的耐药性并促进兰斯氏梭菌（Lour。）
数学0212
日主题日主题1简介/计算器用法25 CH1 - 概率和统计的性质2分数 - 评论26 CH2 - FREQ ISTRIST。和图3代数介绍27 CH3 - 数据说明4求解方程I 28 CH4 - 概率和计数规则5求解方程II（带有根）29 CH4 - 条件概率6公式6公式30 CH5 30 CH5 - 离散概率分布7速率/比率/比率/比例/比例/比例31 CH5 - 二进制分配8 Word Esserta 32 Ch6 - pranastion 32 CH6 - 正常分布3 32 pet p p pr anders Pressials 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 33米转换/转换iii 34评论11剂量35工作期间12审查36测试＃2 1 13工作期37 CH7 - conf间隔和样本尺寸1 14测试＃1 38 CH7 - 浓度间隔和样本尺寸2 15计数（带有多规则，阶乘）39 CH8 - CH8 - CH8 - 假设测试1 16置换率/组合测试1 17 ch8 ch8 ch8 ch8/ven and 1 17 – Phessights 2 17 – Physoths 2 17 – Phessights 2 17 – Pyseply 2 17概率介绍42假设检验/CONC间隔回顾19中心趋势/变异性43 CH10 - 相关和回归PT 1 20间接面积，Z-Table 44 CH10的介绍44 CH10 - 相关和回归PT 2 21应用2 21正态分布45 CH 11 - CHI-SQUARE和ANOVA 22评论46评论46评论23审查47审查47工作周期47工作周期
用黄体和富马酸亚铁补充黄河鲤鱼饮食：生长性能，消化酶活性，皮肤色素沉着和肠道菌群
在这项研究中，研究了叶黄素和富马酸亚铁对黄河鲤鱼（Cyprinus carpio）的影响，旨在评估皮肤色素沉着，肠道消化酶，肠道微生物多样性和生长性能。设计了三种实验饮食，包括对照组，一组150mg/kg叶黄素）以及叶黄素和富马酸铁蛋白酶混合物（150mg/kg叶黄素和100mg/kg富马酸铁酸铁酸铁酸酯）。用实验饮食喂食42天的鲤鱼（n = 135; 25.0±2.0g）。结果表明，与对照组相比，与对照组（P <0.05相比，与蓝色（b*），颜色差异（δe）和Chroma（δe）和乳头较高的值相比，蛋白质的无关指数（ISI）和内脏指数（ISI）和内脏指数（VSI）增加，伴随着蓝色（B*），色差（δe）和Chroma（CH*）的较高价值（与对照组相比（P <0.05）相比，身体颜色的显着变化。同时，在混合物组中观察到淀粉酶，脂肪酶和胰蛋白酶的较高活性（p <0.05）。高通量测序和维恩图表明，叶黄酸或亚铁富马酸盐对鲤鱼的肠道微生物群具有明显的影响。与对照组相比，与混合物组相比，用混合物组的鲤鱼中的静脉细菌和黄杆菌的丰度显着增加。总而言之，在饲料中添加叶黄素和富马酸亚铁可以改变黄河鲤鱼的皮肤色素沉着和肠道微生物组成，从而增强鱼类的着色效果和消化功能。这些发现为优化饲料配方和水产养殖管理提供了宝贵的见解，这可以有助于提高黄河鲤鱼的质量和农业效率。
循环肿瘤 DNA 突变分析及配对...
摘要：循环肿瘤DNA（ctDNA）是一种常规的液体活检样本，可通过采集来动态监测疾病状态。然而，其潜在的临床价值以及与腹水样本或肿瘤活检的一致性对于卵巢癌患者还有待进一步评估。因此，本研究比较了ctDNA、配对肿瘤组织和腹水样本之间的突变谱，以探讨它们在卵巢癌中的可能临床价值。使用靶向下一代测序筛查卵巢癌患者18个外周血样本、6个配对腹水样本和8个配对肿瘤组织中的突变。使用公共数据库进行功能分析。使用WebGestalt进行基因本体论和通路富集分析。使用cBioPortal for Cancer Genomics评估治疗靶点。使用Chilibot和检索相互作用基因/蛋白质的搜索工具来获取关键基因及其功能相互作用。使用维恩图对三类样本进行比较分析。在ctDNA样本中共发现104个癌症相关突变基因，在肿瘤组织中共发现95个基因，在腹水样本中共发现44个基因。通过Chilibot分析获得了一个涵盖10个基因的簇，即NOTCH2、NOTCH3、赖氨酸甲基转移酶2A、PTEN、雄激素受体、DNA活化蛋白激酶催化亚基、肝细胞核因子1同源框A、SRC、胰岛素受体底物2和SRY盒转录因子10。该基因组可能具有监测卵巢癌转移和确定治疗靶点的潜力
研究论文 LncRNA XIST 充当 MicroRNA-520 海绵，通过 CeRNA 网络介导 BAX 来调节 NSCLC 细胞中的顺铂耐药性
背景：近年来，LncRNA作为竞争性内源性RNA（ceRNA）的一员，在肺癌耐药中发挥着重要作用。本研究旨在利用全面的ceRNA网络识别顺铂耐药肺癌细胞的潜在生物标志物。方法：GSE6410（GPL-201）分析了A549 NSCLC细胞中顺铂耐药基因表达变化。GSE43249（GPL-14613）包括源自顺铂耐药A549肺细胞的非编码RNA表达谱。在线分析工具GEO2R分析了差异表达的mRNA和miRNA（DEmRNA和DEmiRNA）。为了探索差异表达mRNA的功能富集意义，我们使用了GO（基因本体）和KEGG（京都基因和基因组百科全书）通路分析。通过 miRDB、Targetscan、Starbase 和 miRWalk 寻找靶向 miRNA，采用 Kaplan-Meier 曲线法对靶向 RNA 的临床生存率进行分析（ P<0.05），Starbase 数据库预测了潜在的 lncRNA 介导的靶向 miRNA。最后利用 cytoscape3.7.2 构建了 lncRNA、miRNA、mRNA 的新型 ceRNA 网络。结果：118 个差异表达的 mRNA 构成了介导的 ceRNA 网络的基础。DAVID 和 Kaplan-Meier 筛选出凋亡调节因子 BAX，维恩图显示 8 个 miRNA 共同调控 BAX。Starbase 预测 lncRNA XIST 介导的 miRNA。最后，lncRNA XIST 可能是调节肺癌细胞顺铂耐药性的有用生物标志物，进一步探讨了 BAX 可能影响肿瘤浸润免疫细胞。结论：LncRNA XIST在BAX调控顺铂耐药过程中与miRNA 520竞争性结合，参与p53信号通路引起细胞凋亡。
2024; 15(3): 632-644. doi: 10.7150/jca.89581 研究论文探索头颈部鳞状细胞癌的预后免疫微环境相关基因
目的：头颈部鳞状细胞癌 (HNSCC) 具有较高的局部和远处转移率。在肿瘤组织中，肿瘤细胞与肿瘤微环境 (TME) 之间的相互作用与癌症的发展和预后密切相关。因此，筛选 HNSCC 中的 TME 相关基因对于了解转移模式至关重要。方法：我们的研究主要依赖于一种名为使用表达数据估计恶性肿瘤中的基质和免疫细胞 (ESTIMATE) 的新算法。从 TCGA 数据库中获取外显子模型每百万映射片段的每千碱基片段 (FPKM) 数据和 HNSCC 临床数据，并确定 HNSCC 组织的纯度以及基质和免疫细胞浸润的特征。此外，根据免疫、基质和 ESTIMATE 评分筛选差异表达基因 (DEG)，并评估它们的蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络和 ClueGO 功能。最后，确定了 HNSCC 中与免疫相关的 DEG 的表达谱。在高侵袭性口腔癌细胞系 (SCC-25、CAL-27 和 FaDu) 和口腔癌组织中验证了差异基因表达。结果：我们的分析发现免疫和 ESTIMATE 评分均与 HNSCC 的预后显着相关。此外，使用 Venn 算法进行交叉验证显示 433 个基因显着上调，394 个基因显着下调。所有 DEG 都与 ESTIMATE 和免疫评分相关。使用通路富集分析观察到细胞因子-细胞因子受体相互作用和趋化因子信号通路的富集。在分析了 PPI 网络的关键子网络后，我们初步筛选了 25 个基因。生存分析揭示了 CCR4、CXCR3、P2RY14、CCR2、CCR8 和 CCL19 与生存的关系以及它们与 HNSCC 中免疫浸润相关转移的关系。结论：使用 ESTIMATE 对基质和免疫细胞进行评分后，筛选了相关 TME 相关基因的表达谱，并确定了与生存相关的 DEG。这些 TME 相关基因标记物可作为 HNSCC 中的预后指标和指示转移性状的标记物，具有宝贵的实用性。