XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemWildType
BRD4 降解剂可能有效抵消 AML 和 ALL 中白血病干细胞的治疗耐药性
图 1 BRD4 靶向药物对 AML 细胞增殖和存活的影响。（A）AML 细胞系和（B）从 AML 患者（FLT3 wt，n = 10；FLT3 ITD，n = 7）获得的原代 MNC 在对照培养基（co）或含有不同浓度 JQ1、dBET1 或 dBET6 的培养基中在 37°C 下孵育 48 小时。此后，测量 3 H-胸苷摄取量。细胞系的结果表示为对照（co）的百分比，代表三个独立实验的平均值 ± SD。原代 MNC 的结果表示为对照（co）的百分比，代表不同患者样本的平均值 ± SD。星号 (*)：与对照相比，p < .05。 (C) AML 细胞系和 (D) 原代 AML MNC（FLT3 wt，n = 2；FLT3 ITD，n = 2）在 37°C 下在对照培养基 (co) 或含有不同浓度 JQ1、dBET1 或 dBET6 的培养基中孵育 48 小时。然后，通过流式细胞术检查细胞以确定 Annexin V 阳性细胞的百分比。细胞系的结果以 Annexin V 阳性细胞的百分比表示，代表三个独立实验的平均值 ± SD。原代 MNC 的结果以 CD34 + /CD38 /Annexin V + 细胞（白血病干细胞）的百分比表示。星号 (*)：与对照相比，p < .05。AML，急性髓细胞白血病；FLT3 ITD，fms 样酪氨酸激酶 3 内部串联重复；FLT3 wt，fms 样酪氨酸激酶 3 野生型；MNC，单核细胞。
搜索策略分析莫里斯水迷宫中的5xfad阿尔茨海默氏症小鼠揭示了性别和年龄特异性的空间导航缺陷
摘要：空间迷失方向和导航障碍不仅是阿尔茨海默氏病中的第一个记忆，而且是非常特定的疾病。在啮齿动物中，莫里斯水迷宫用于研究空间导航和记忆。在这里，我们以性别和年龄依赖的方式检查了常用的5xFad阿尔茨海默氏症小鼠模型中的空间记忆。我们的发现分别在7个月大的5xFAD和12个月大的雄性5xFAD小鼠中表现出第一个空间学习术语。虽然使用逃生潜伏期对空间工作记忆进行评估提供了整体记忆性能的图片，但它不能解释动物如何解决空间任务。因此，对游泳策略进行了详细的分析，以更好地了解5xFAD和WT小鼠之间的行为差异。5XFAD小鼠使用定性和定量搜索策略模式与使用更多非空间策略的野生型动物相比，搜索策略模式并显示出同种形式的记忆定义。此外，对游泳策略的详细分析显示，在严重的参考记忆递减开始之前，在女性3个月大和7个月大的5xfad动物的女性3个月大和7个月大的5xfad动物的探针试验中，同类记忆降低了。总体而言，我们可以证明5xFAD小鼠的空间导航词是年龄和性别依赖性的，雌性小鼠受到严重影响。此外，搜索策略分类系统的实施允许对行为差异的早期检测，因此可能是5xFAD模型中临床前药物测试的有力工具。
具有功能完整蛋白质的DNA折纸纳米结构的位点特异性装饰
摘要：DNA折纸结构为具有纳米精度的单个生物分子的组织提供了灵活的Sca效果。当他们发现对多种生物应用的增加使用时，在定义的化学计量，高产量和保护蛋白质功能下的蛋白质的功能化仍然具有挑战性。在这项研究中，我们将单分子荧光显微镜与细胞生物学功能测定结合使用，以系统地评估DNA折纸结构特异性装饰的不同策略，重点介绍了效率，稳定量表，稳定量表和蛋白质功能。使用T细胞受体（TCR）的激活配体作为感兴趣的蛋白质，我们发现两种常用方法在化学计量和蛋白质功能方面表现不佳。While strategies employing tetravalent wildtype streptavidin for coupling of a biotinylated TCR-ligand yielded mixed populations of DNA origami structures featuring up to three proteins, the use of divalent (dSAv) or DNA-conjugated monovalent streptavidin (mSAv) allowed for site-speci fi c attachment of a single biotinylated TCR-ligand.通过共价DNA结合，最直接的装饰策略导致配体效力降低了3倍，这可能是由于电荷介导的蛋白质功能受损所致。在配体共轭物中，用电荷中性肽核酸（PNA）代替DNA作为耦合策略，在我们的研究中具有最佳的整体性能，因为它产生了最高的产率，没有多价DNA折纸结构和完全保留的蛋白质功能。在我们的研究中，我们旨在为静态定义的，定义的，特定于位置的DNA折纸结构的蛋白质，具有可供选择的蛋白质，可用于广泛的生物学应用。关键字：DNA折纸，DNA纳米结构，蛋白质结合，功能化，单分子荧光显微镜，T细胞活化D
INCB161734：一种新颖，有效和口服的可生物可利用KRAS G12D选择性抑制剂在KRAS G12D突变肿瘤中表现出抗肿瘤活性
INCB161734与具有皮摩尔亲和力（K D）的开关II袋中的G12D突变体的GDP和GTP形式结合，并且对野生型（WT）KRAS的选择性> 80倍。INCB161734在无细胞测定中（IC 50 <3 nm）中有效抑制SOS1依赖性GDP/GTP交换活性，并且对G12D与WT KRAS的选择性> 40倍。此外，使用G12D突变体与WT癌症衍生的细胞系，在各种细胞测定中，INCB161734在WT中表现出高于WT的高选择性。INCB161734有效抑制ERK磷酸化（KRAS活性的相关性），在7个小鼠G12D细胞系中，平均IC 50中的平均IC 50中的14.3 nm（范围：1.9-45.2 nm）；在14 wt细胞系中，在1μM（最大测试浓度）下观察到平均21.5％的抑制作用。同样，INCB161734抑制G12D突变细胞系的增殖，平均IC 50中的154 nm中的IC 50（范围：8.3-318 nm）横跨相同的7人G12D细胞系；在相同的14 wt细胞系中，在1μm处观察到<30％的抑制作用（平均13％）。用INCB161734处理在PDAC细胞系（G12D HPAC）中诱导caspase 3/7裂解，EC 50 <100 nm； WT细胞系中的caspase 3/7切割（NCI-H838）未以高达5μm的剂量诱导。此外，INCB161734在G12D HPAC细胞系中诱导细胞周期停滞（S期抑制），IC 50 12.8 nm； WT NCI-H838细胞系中的S期抑制仅以更高的剂量发生（IC 50>3.3μm）。
纤维化特征的自动定量测定肉芽肿
在人类和非人类灵长类动物（NHP）中可以找到三种肉芽肿类型：经典的案例肉芽肿，纤维化肉芽肿和非杀伤性肉芽肿（Barry等，2009）。常规的斑性颗粒瘤在分枝杆菌感染后已在活性疾病和潜在疾病中进行了广泛报道，显示了三层结构：坏死中心，可行的细胞区域和外部纤维化边缘（Adams，1976; Russell，1976; Russell，2007; Barry等，2007; Barry等，2009; Silva Miranda; Silva Miranda et al。）。由于很难从人类肺部获得活检样本，因此多年来动物模型已得到改善，以更紧密地复制人类的病理进展，通常应用于肉芽肿研究。小鼠是一种实际动物模型，用于研究各种分枝杆菌，甚至MM后感染肉芽肿动力学的动物模型（Carlsson等，2010）。重要的是，尽管小鼠没有再现人类结核病病理学，尤其是有组织的肉芽肿，但小鼠模型仍然是与结核病相关的研究最实用，最广泛使用的动物模型 - 尤其是慢性肉芽肿性疾病的转基因小鼠模型，它们具有正常的颗粒瘤形成和cytokine aveos image imaze imaze aversim and aveos aveos aveos aveos average averman and schisso pigg（ Iuvone等人，1994年，Kunkel等人，1996年；通过使用MM - 泽布拉夫感染系统，Swaim等。记录，斑马鱼肉芽肿也发生了案例坏死，类似于人类结核性肉芽肿，其中RD缺陷型MM诱导的肉芽肿是单独的，非杀伤性的，可能是非杀伤性的，并且很可能与Wildtype Mm -Mm -Mm -Intypected Intypected Intypected Intypece and -Shaim Al and and and。迄今为止，已经建立了各种动物模型，并用于探索分枝杆菌 - 主机的相互作用以及肉芽肿形成和发育的决定因素。这些模型产生了宝贵的信息，并提高了我们对宿主关系关系的理解。
大米粉笔谷物5调节谷物质量的自然变化
在大米（Oryza sativa）谷物发育期间出现的热应激会降低谷物质量，这通常表现为增加的谷物粉笔。尽管对热应激对谷物产量的影响进行了充分研究，但由于量化晶粒质量的探索程度不如谷物产量，因此在热应激下稻米质量的遗传基础较少。为了解决这个问题，我们使用了基于图像的比色测定法（红色，R;绿色，g）进行全基因组关联分析，以鉴定暴露于热应激的水稻晶粒中表型变异的基因基因座。我们发现从成熟谷物图像得出的R与G像素比（RG）有效地区分了来自对照（28/24°C）的半透明晶粒和热应激（36/32°C）植物。我们的分析产生了一种新型的基因，即米粉晶粒5（OSCG5），该基因调节热应激下的晶粒粉笔的自然变化。OSCG5编码一种晶粒特异性，表达的蛋白质未知功能。OSCG5转录本丰度的加入表现出较高的粉笔性，这与应力下的RG值较高有关。这些发现在热应激下相对于野生型（WT）的OSCG5敲除（KO）突变体的粉笔增加了。过表达OSCG5的植物的晶粒不如KOS，但在热应激下与WT相当。与WT和OE相比，KO突变体相对于对照组具有更大的热敏感性。共同表明，OSCG5的自然变化可能在热应激下有助于水稻质量。
抗病毒研究-HIV耐药性数据库</div>
背景：体外通过实验对于抗逆转录病毒（ARV）药物的发展至关重要。Methods: We created an online database containing data from 102 published studies in which HIV-1 or HIV-2 was cultured with increasing concentrations of the FDA-approved nucleoside RT inhibitors (NRTIs), nonnucleoside RT inhibitors (NNRTIs), integrase strand transfer inhibitors (INSTIs), protease inhibitors (PIs), capsid inhibitor （CAI）Lenacapavir和核苷RT易位抑制剂（NRTTI）Islatravir。We summarized the mutations selected in the subset of passage experiments with NRTIs lamivudine (3TC), emtricitabine (FTC), abacavir (ABC), tenofovir (TFV), and zidovudine (AZT), NNRTIs doravirine (DOR), efavirenz (EFV), and rilpivirine （RPV），Instis Bictegravir（BIC），CaboteGravir（Cab）和Dolutegravir（DTG）和Pis Atazanavir（ATV），Darunavir（DRV）和Lopinavir（LPV）。将选择在体外选择的突变与在接受相同ARV的人中选择的突变进行了比较。结果：27个研究描述了89个用3TC，FTC，ABC，TFV或AZT传递的野生型分离株的实验； 16项研究描述了89个通过EFV，RPV或DOR传递的实验。 11项研究描述了76个通过BIC，CAB或DTG进行的实验。六项研究描述了33个通过ATV，LPV或DRV传递的实验。除了几个例外，在两个或多个实验中选择的突变是在接受相同ARV的人中选择的最常见的突变之一。结论：我们创建了一个已发表的ARV体外选择实验的数据库。突变通常可以预测在接受相同ARV的人中观察到的突变。但是，体外和体内环境之间的突变频率存在显着差异。
使用术中对比度的定量分析 -
目的：对比增强的超声（CEU）血液动力学与成人型弥漫性神经胶质瘤的分子生物标志物，特别是异氯酸酯脱氢酶（IDH）之间的关系，尚不清楚。进行了这项研究，以使用定量指标对成人型弥漫性神经胶质瘤的血管化进行全面描述。此外，它旨在识别任何具有术中预测IDH突变状态的变量。方法：这项前瞻性研究招募了2021年11月至2022年9月之间成人型弥漫性神经胶质瘤的患者。进行了术中CEU，并记录了90秒的CEUS视频。血液动力学参数，包括峰值增强（PE）差异，是根据感兴趣区域的时间强度曲线计算的。对CEUS参数进行了差异分析，相对于分子生物标志物和等级。分析了各种参数的接收器操作特征曲线，以评估这些参数预测IDH突变状态的能力。结果：评估了60例成人型弥漫性神经胶质瘤的患者。所有血液动力学参数除了增加时间外，都表现出IDH突变剂和IDH-WildType成人型弥漫性神经胶质瘤之间的显着差异。PE差异作为区分IDH-WildType和IDH突变的神经胶质瘤的最佳指标，曲线下的面积为0.958（95％置信区间，0.406至0.785）。此外，血液动力学参数揭示了成年型弥漫性神经胶质瘤的级别和类型的显着差异。结论：术中可以使用血液动力学参数来有效区分IDH-野生型和IDH突变的成人型弥漫性胶质瘤。此外，定量CEU还为神经外科医生提供了动态灌注信息，以提供各种类型和等级的成人型弥漫性神经胶质瘤。
衰老和免疫力中的TGF-β途径
作为生物年龄，它们会经历逐渐的细胞和分子变化，并伴随着许多生理功能的下降。因此，它们对年龄相关疾病和状况的敏感性增加（López-Otín等，2013; Son等，2019; Melzer等，2020）。衰老领域中的许多基本发现都来自于小型自由生命的线虫C.秀丽隐杆线虫（Murphy and Hu，2013年）的研究。秀丽隐杆线虫已被用作模型有机体数十年来，由于其寿命短，大约3周，尺寸小，透明的身体，易于实验的实验室维护，遗传障碍和保守的生物学途径（Brenner，1974; C.秀丽隐杆线虫测序联盟，1998年）。大约83％的秀丽隐杆线虫蛋白质组具有人类同源物（Lai等，2000），超过50％的人蛋白质编码基因在秀丽隐杆线虫中具有同源物（Sonnhammer和Durbin，1997; Kuwabara and Durbin; Kuwabara和O'Neil，2001; Harris等，2004; Harris等，2004）。胰岛素/IGF-1样信号通路（IIS）是调节秀丽隐杆线虫寿命的第一个途径。Div>随后发现编码唯一胰岛素/IGF-1样受体（Kimura等，1997）的突变，与Wildtype（WT）相比，寿命增加了一倍（Kenyon等，1993）。在秀丽隐杆线虫中的进一步研究揭示了调节衰老的其他途径的作用，包括AMP激活的蛋白激酶（AMPK）和雷帕霉素（MTOR）的机械靶标（Zhang等，2020）。此外，转化生长因子β（TGF-β）途径正在成为寿命和健康衰老的调节剂，需要进一步研究。面临衰老最大程度影响的系统之一是免疫系统，其中与年龄相关的下降称为免疫衰老。这种下降表现出感染易感性的增加，疫苗接种反应降低以及癌症和自身免疫性疾病的风险增加。导致哺乳动物这些生理的潜在变化是：免疫细胞库减少，细胞内在缺陷对淋巴细胞的固有缺陷以及增加的炎症（Akha，2018）。衰老和免疫力可以通过共同的分子机制来调节，例如IIS，TGF-β，MTOR和核因子Kappa B（NF-κB）
CVM 院内
先前已从皮肤活检中收获了原代真皮犬成纤维细胞。使用人类端粒酶逆转录酶 (hTERT) 对真皮犬成纤维细胞进行永生化，以从每个供体 (PDK4 野生型或 wt/wt、PDK4 杂合子或 wt/del、PDK4 纯合子或 del/del) 中创建永生化细胞系。这些细胞将在含有 10% 胎牛血清和 1% 抗生素抗真菌剂的 Dulbecco 改良 Eagle 培养基的 6 孔板中接种和培养。将使用 QuickExtractTM DNA 提取溶液提取 DNA。将使用 Thermo Scientific NanoDropTM 1000 分光光度计对 DNA 进行分光光度定量。提取 DNA 后，将对 PDK4wt/wt 和 PDK4del/del 细胞中的 PDK4 基因进行 PCR 扩增。扩增后，将使用 DNA Clean & Concentrator™-25 试剂盒纯化 PCR 产物以进行裸 DNA 切割反应。兽医学学生将测试一种名为 KKH 的新酶，它是 Cas9 变体，可在不同的 PAM 或识别位点切割 DNA。我们使用计算方法确定 KKH 将在 PDK4 基因中所需的切割位点切割，从而有效地为插入双链寡脱氧核苷酸 (dsODN) 探针腾出空间。该 DNA 片段将通过同源重组将缺失的 16 个碱基对添加到基因中。已经设计了两个 dsODN，它们包含“丢失的外显子”序列以及与 DCM1 相关的缺失的 16 个碱基对，并将通过核转染反应测试它们是否掺入细胞 DNA 中。dsODN1 由 DCM1 突变两侧的 300 个碱基组成，dsODN2 由突变两侧的 350 个碱基组成。正向和反向引物组将由 Integrated DNA Technologies（IDT，美国爱荷华州科勒尔维尔）合成。将对每个引物组进行 PCR 梯度，退火范围为 dsODN1 的 55°C 至 67°C 和 dsODN2 的 54°C 至 64°C。目标是将缺失的 PDK4 片段插入切割的 DNA 中，并将在体内缺失 16 个碱基对的成纤维细胞中使用核转染试验进行测试。此后，将从细胞中提取 DNA 并评估整合效果。