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无色杆菌属细菌的全基因组测序揭示了其外来化合物生物降解的潜力
摘要：从自然环境中分离新的细菌菌株可以检测出具有潜在实际意义的微生物。可以使用经典的微生物学和分子生物学方法来表征此类微生物。目前，对新发现的微生物的研究基于测序技术。全基因组测序可以提供有关菌株来源、分类地位和表型特征的信息。这项研究是使用从玉米作物根际分离的细菌无色杆菌属 77Bb1 进行的。使用 Illumina 2 × 150 nt 技术对细菌基因组进行测序。使用生物信息学方法分析获得的序列，得到 57 个重叠群和包含 6,651,432 nt 的基因组。基于 16S rRNA 基因序列的系统发育分析使所分析的细菌能够归属为无色杆菌属。获得的基因组包含 4855 种具有功能分配的蛋白质基因。其中一些基因与外来生物的生物降解和代谢有关。在分析的基因组中发现了所有用于氨基苯甲酸降解的基因以及几乎所有用于苯甲酸和苯乙烯降解的基因，这表明分离的菌株具有用于天然生物修复方法的潜力。
CTS 氙气电穿孔系统
Gibco™ CTS™ Xenon™ 电穿孔仪器 Cat. No. A50301 建议细胞浓度 20 x 10⁶ 至 100 x 10⁶ 细胞/mL 电穿孔体积 1 mL； 5–25 mL 电穿孔室容量 1 mL 5–25 mL 电穿孔体积的运行时间 7–22 分钟 电穿孔脉冲电压范围 500–2,500 V 电穿孔脉冲宽度范围 1–30 ms 电穿孔脉冲间隔范围 500–1,000 ms 电穿孔脉冲数 1–10 支持 21 CFR 第 11 部分合规性 是，可进行软件升级（请咨询） 开放平台通信 - 统一架构 (OPC-UA) 兼容性 是 云连接实用程序 是 细胞搅拌器转速 60 rpm 预冷技术 Peltier 预冷温度设定范围 10–30°C 尺寸（高 x 宽 x 深），门完全打开时 43.1 x 26.5 x 21.2 英寸（109.5 x 67.4 x 53.9 厘米） 重量 154.3 磅（70 千克） 电气额定值 100–240 V， 1,200 VA 触摸显示屏 8 英寸电容式
CTS™ Xenon™ 电穿孔系统 - 用户指南...
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接受猪心脏异种移植的两个人类死者的综合多摩尼克分析显示，早期免疫细胞和细胞代谢反应中的强烈扰动
Eloi Schmauch 1,2* , Brian Piening 3* , Bo Xia 1,4* , Chenchen Zhu 5* , Jeffrey Stern 6,7* , Weimin Zhang 4* Alexa Dowdell 3 , Bao-Li Loza 8 , Maede Mohebnasab 9 , Loren Gragert 9b , Karen Khalil 6 , Brendan Camellato 4 , Michelli Faria de Oliveira 10 , Darragh O'Brien 11 , Elaina Weldon 6,7 , Xiangping Lin 5 , Hui Gao 8 , Larisa Kagermazova 4 , Jacqueline Kim 6,7 , Alexandre Loupy 12 , Adriana Heguy 13 , Sarah Taylor 10 , Florrie Zhu 4 , Sarah Gao 8 , Divya Gandla 8 , Kriyana Reddy 14 ，安德鲁·昌（Andrew Chang 8），罗勒·迈克尔（Basil Michael）5，lihua jiang 5，Ruiqi Jian 5，Navneet Narula 6,15，Suvi Linna-Kuosmanen 16，Minna Kaikkonen-Määttä1616，Marc Lorber 17，Marolis Kellis 1,18 Massimo Mangiola 6,7，Harvey Pass 20，Michael P. Snyder 5†，Robert A. Montgomery 6,7†，Jef D. Boeke 4†，Brendan J. Keating 4,6,7,7,8†
一种基因组和临床注释的患者衍生的异种移植资源，用于非小细胞肺癌的临床前研究。
摘要◥患者衍生的异种移植（PDX）模型是一个有效的临床前临床平台，用于测试用于癌症治疗药的新型药物和药物组合的效率。在这里，我们描述了79个基因组和临床注释的肺癌PDX的存储库，可从杰克逊实验室获得，其针对组织病理学特征，突变促纤维，基因表达和拷贝数字的广泛表征。大多数PDX是非小细胞肺癌（NSCLC）的模型，包括37个肺腺癌（LUAD）和33个肺部菌群细胞癌（LUSC）模型。存储库中的其他肺癌模型包括四个小细胞癌，两个大细胞神经内分泌癌，两个腺泡癌和一个多形癌。模型在收集中有对具有酪氨酸激酶抑制剂的靶向疗法的抗药性。
实时监测爪蟾鸡蛋提取物中单个DNA分子的压实
DNA压实是在有丝分裂过程中凝结和分辨率的凝结和分辨率所必需的，但是单个染色质因子对该过程的相对贡献知之甚少。我们使用高速爪蟾卵提取物和光学镊子开发了一种生理，无细胞的系统，以研究实时有丝分裂染色质纤维的形成，并在单个DNA分子上进行力诱导的拆卸。与将DNA压缩约60％的相间提取物相比，中期提取物将DNA的长度降低了90％以上，这反映了这两种情况下全染色体形态的差异。抑制核小体组装的核心组蛋白伴侣ASF1的耗竭，将中期纤维压实的最终程度降低了29％，而接头组蛋白H1的耗竭效果更大，将总压实降低了40％。 与对照组相比，两种耗竭都降低了压实率，导致了更短的分解时间，并提高了力诱导的纤维拆卸速度。 相比之下，中期提取物中冷凝蛋白的耗竭强烈抑制纤维组件，从而导致瞬态压实事件在高力下迅速逆转。 总的来说，这些发现支持了一种投机模型，在该模型中，冷凝蛋白在有丝分裂DNA压实中起主要作用，而核心和接头组蛋白起作用，可在循环挤出过程中减少滑移并调节DNA压实程度。抑制核小体组装的核心组蛋白伴侣ASF1的耗竭，将中期纤维压实的最终程度降低了29％，而接头组蛋白H1的耗竭效果更大，将总压实降低了40％。与对照组相比，两种耗竭都降低了压实率，导致了更短的分解时间，并提高了力诱导的纤维拆卸速度。相比之下，中期提取物中冷凝蛋白的耗竭强烈抑制纤维组件，从而导致瞬态压实事件在高力下迅速逆转。总的来说，这些发现支持了一种投机模型，在该模型中，冷凝蛋白在有丝分裂DNA压实中起主要作用，而核心和接头组蛋白起作用，可在循环挤出过程中减少滑移并调节DNA压实程度。
实时监测爪蟾鸡蛋提取物中单个DNA分子的压实
DNA压实是在有丝分裂过程中凝结和分辨率的凝结和分辨率所必需的，但是单个染色质因子对该过程的相对贡献知之甚少。我们使用高速爪蟾卵提取物和光学镊子开发了一种生理，无细胞的系统，以研究实时有丝分裂染色质纤维的形成，并在单个DNA分子上进行力诱导的拆卸。与将DNA压缩约60％的相间提取物相比，中期提取物将DNA的长度降低了90％以上，这反映了这两种情况下全染色体形态的差异。抑制核小体组装的核心组蛋白伴侣ASF1的耗竭，将中期纤维压实的最终程度降低了29％，而接头组蛋白H1的耗竭效果更大，将总压实降低了40％。 与对照组相比，两种耗竭都降低了压实率，导致了更短的分解时间，并提高了力诱导的纤维拆卸速度。 相比之下，中期提取物中冷凝蛋白的耗竭强烈抑制纤维组件，从而导致瞬态压实事件在高力下迅速逆转。 总的来说，这些发现支持了一种投机模型，在该模型中，冷凝蛋白在有丝分裂DNA压实中起主要作用，而核心和接头组蛋白起作用，可在循环挤出过程中减少滑移并调节DNA压实程度。抑制核小体组装的核心组蛋白伴侣ASF1的耗竭，将中期纤维压实的最终程度降低了29％，而接头组蛋白H1的耗竭效果更大，将总压实降低了40％。与对照组相比，两种耗竭都降低了压实率，导致了更短的分解时间，并提高了力诱导的纤维拆卸速度。相比之下，中期提取物中冷凝蛋白的耗竭强烈抑制纤维组件，从而导致瞬态压实事件在高力下迅速逆转。总的来说，这些发现支持了一种投机模型，在该模型中，冷凝蛋白在有丝分裂DNA压实中起主要作用，而核心和接头组蛋白起作用，可在循环挤出过程中减少滑移并调节DNA压实程度。
在胰腺癌异种移植模型中使用 Seribantumab 和 DARPin-毒素融合共同靶向 HER3 和 EpCAM 的可行性
1 乌普萨拉大学免疫学、遗传学和病理学系，瑞典乌普萨拉 751 85 2 肿瘤治疗学研究中心，化学和应用生物医学科学研究院，托木斯克国立研究型理工大学，托木斯克 634050，俄罗斯 3 俄罗斯科学院 Shemyakin-Ovchinnikov 生物有机化学研究所分子免疫学实验室，莫斯科 117997，俄罗斯 4 乌普萨拉大学药物化学系，瑞典乌普萨拉 751 23 5 乌普萨拉大学生命科学实验室，瑞典乌普萨拉 751 23 6 生物纳米光子实验室，生物医学工程物理研究所 (PhysBio)，国立研究核大学‘MEPhI’，莫斯科 115409，俄罗斯 7 谢切诺夫大学生物医学工程中心，莫斯科 119991，俄罗斯 * 通讯作者： anzhelika.vorobyeva@igp.uu.se
转运蛋白介导的药物输送
摘要：横纹肌肉瘤（RMS）是儿童中最常见的软组织肉瘤。高级和转移性疾病患者的预后仍然很差，幸存者承受着长期副作用的负担。因此，需要更有效，更毒性的疗法。表面蛋白是基于抗体的疗法的理想靶标，例如双科抗体，抗体 - 药物缀合物或嵌合抗原受体（CAR）T细胞。RMS的特定表面目标很少。 在这里，我们基于表面/膜蛋白的差异离心富集进行了表面体系，并通过LC-MS在六个融合阳性（FP）RMS细胞系，Five Five融合 - 阴性（FN）RMS RMS RMS RMS和三个RMS患者患者患者患者衍生的Xenogogrofts（PDX）上进行检测。 在三个RMS组中总共检测到699个蛋白质。 基于表达水平和与正常MRC-5细胞和成肌细胞表达的比较，然后进行统计分析，突出了已知的RMS靶标，例如FGFR4，NCAM1和CD276/B7-H3，并揭示了AGRL2，JAM3，JAM3，JAM3，MEGF10，MEGF10，GPC4，gpc4，CADM2，CADM2，CADM2，cadm2，rem nime。 在RMS组织中研究了 L1CAM的表达，并在80％以上的肺泡RMS肿瘤中观察到了强L1CAM表达，这使其成为基于抗体RMS抗体疗法的可行靶标。RMS的特定表面目标很少。在这里，我们基于表面/膜蛋白的差异离心富集进行了表面体系，并通过LC-MS在六个融合阳性（FP）RMS细胞系，Five Five融合 - 阴性（FN）RMS RMS RMS RMS和三个RMS患者患者患者患者衍生的Xenogogrofts（PDX）上进行检测。在三个RMS组中总共检测到699个蛋白质。基于表达水平和与正常MRC-5细胞和成肌细胞表达的比较，然后进行统计分析，突出了已知的RMS靶标，例如FGFR4，NCAM1和CD276/B7-H3，并揭示了AGRL2，JAM3，JAM3，JAM3，MEGF10，MEGF10，GPC4，gpc4，CADM2，CADM2，CADM2，cadm2，rem nime。L1CAM的表达，并在80％以上的肺泡RMS肿瘤中观察到了强L1CAM表达，这使其成为基于抗体RMS抗体疗法的可行靶标。
异种移植：利用动物拯救人类生命
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