1 清华大学生命科学学院、膜生物学国家重点实验室、北京生物结构前沿研究中心、IDG/麦戈文脑研究所、新基石科学实验室,北京 100084。
肝细胞癌(HCC)具有较高的致死率和致残率,严重危害人类的生命。化学药物和化疗药物在HCC治疗中一直存在副作用、耐药性等问题,不能满足临床治疗的需要。因此寻找新型低毒高效的抗肝细胞癌药物并探究其作用机制成为当前HCC治疗中亟待解决的问题。已有多项研究报道了inotodiol的抗癌作用,本研究针对inotodiol在HCC细胞中的抗癌作用及其分子机制,旨在深入探究其抗癌作用。采用CCK8实验检测细胞存活率,划痕实验检测细胞迁移能力,克隆形成实验检测克隆形成能力,流式细胞术分析细胞凋亡和细胞周期。通过动物实验验证inotodiol对HCC的抑制作用。同时采用western blotting检测凋亡、细胞周期及MAPK/ERK通路相关蛋白。结果表明inotodiol具有促进细胞凋亡、抑制细胞增殖、迁移和克隆形成的能力,当CDK2、CDK4、CDK6和Cyclin D的表达受到抑制时,细胞周期被阻滞在G1期。此外,inotodiol表现出诱导细胞凋亡的作用,其特点是Bax表达增加,Bcl-2、Bcl-XL和MCL1表达减少,PARP1和caspase 3的剪切启动,以及MAPK/ERK通路的抑制。动物实验表明inotodiol具有抑制裸鼠肿瘤生长的能力,同时对小鼠的体重和脏器无明显影响。总之,本文提出的研究结果有力地表明,inotodiol 可以成为治疗肝细胞癌 (HCC) 的有希望的候选药物。
成人和儿童都通过反馈来学习将环境事件和选择与奖励联系起来,这一过程称为强化学习 (RL)。然而,用于评估儿童 RL 相关神经认知过程的任务有限。这项研究在记录事件相关电位 (ERP) 的同时,在青春期前儿童 (8-12 岁) 中验证了概率奖励学习任务的儿童版,重点关注:(1) 奖励-反馈敏感性 (额叶奖励相关积极性,RewP),(2) 对反馈的晚期注意力相关反应 (顶叶 P300),以及 (3) 注意力转向喜爱的刺激 (N2pc)。从行为上讲,正如预期的那样,青春期前儿童可以学习刺激-奖励结果关联,但表现水平各不相同。与学习优秀的学生相比,学习较差的学生表现出更大的 RewP 振幅。学习策略(即赢-输-留下-转移)由反馈诱发的 P300 振幅反映。最后,注意力会转移到待选择的刺激上,这一点由 N2pc 证明,但不会像成年人那样转移到奖励更高的刺激上。这些发现为青少年 RL 背后的神经过程提供了新的见解。
摘要 针对癌症的单一疗法常常由于固有或获得性耐药性而失败。通过同时瞄准多个靶点,药物组合可以产生协同作用,从而提高药物有效性并降低耐药性。基于组学数据整合的计算模型已用于识别协同组合,但预测药物协同作用仍然是一个挑战。在这里,我们介绍了 DIPx,这是一种基于生物驱动的肿瘤和药物特异性通路激活评分 (PAS) 个性化预测药物协同作用的算法。我们使用两个独立的测试集在 AstraZeneca-Sanger (AZS) DREAM 挑战数据集中训练和验证了 DIPx:测试集 1 包含训练集中已经存在的组合,而测试集 2 包含训练集中不存在的组合,从而表明该模型能够处理新组合。预测的和观察到的药物协同作用之间的 Spearman 相关系数在测试集 1 中为 0.50(95% CI:0.47–0.53),在测试集 2 中为 0.26(95% CI:0.22–0.30),而挑战赛中表现最佳方法的 Spearman 相关系数分别为 0.38(95% CI:0.34–0.42)和 0.18(95% CI:0.16–0.20)。我们有证据表明,更高的协同作用与药物靶标之间的更高功能相互作用相关,并且这种功能相互作用信息可被 PAS 捕获。我们说明了如何使用 PAS 提供潜在的生物学解释,即激活介导联合药物协同作用的途径。总之,DIPx 可以成为个性化预测药物协同作用和 34 探索与联合药物作用相关的激活途径的有用工具。35
异常激活的激酶信号通路驱动髓母细胞瘤 (MB) 的侵袭和播散。大多数促肿瘤激酶信号通路都参与丝裂原活化蛋白激酶 (MAPK) 细胞外调节激酶 (ERK1/2) 通路。MB 细胞侵袭过程中 ERK1/2 的激活状态尚不清楚,其在侵袭控制中的作用尚不清楚。我们为 MB 细胞中的 MAPK ERK1/2 通路建立了一种合成激酶活化重定位传感器 (SKARS),用于实时测量药物反应。我们使用 3D 侵袭试验和器官型小脑切片培养来测试生理相关组织环境中的药物效果。我们发现肝细胞生长因子 (HGF)、表皮生长因子 (EGF) 或碱性成纤维细胞生长因子 (bFGF) 导致 MB 细胞中核 ERK1/2 快速激活,这种激活持续数小时。与 BCR/ABL 激酶抑制剂达沙替尼同时治疗可完全抑制由 HGF 和 EGF 诱导的核 ERK1/2 活性,但不能抑制由 bFGF 诱导的核 ERK1/2 活性。核 ERK1/2 活性增加与侵袭速度呈正相关。达沙替尼阻断了大多数细胞中的 ERK 相关侵袭,但我们也观察到 ERK1/2 活性低的快速侵袭细胞。这些 ERK1/2 低、快速移动的细胞呈现圆形形态,而 ERK 高、快速移动的细胞呈现间充质形态。达沙替尼有效阻断了 EGF 诱导的增殖,但仅适度抑制组织侵袭,这表明一部分细胞可能通过非间充质运动逃避达沙替尼的侵袭抑制。因此,生长因子诱导的 ERK1/2 核活化与 MB 细胞中的间充质运动和增殖有关,并且可以通过 BCR/ABL 激酶抑制剂达沙替尼阻断。
。cc-by 4.0国际许可(未经Peer Review尚未获得认证)是作者/资助者,他已授予Biorxiv的许可证,以永久显示预印本。这是该版本的版权所有,该版本发布于2025年1月20日。 https://doi.org/10.1101/2024.03.28.587096 doi:biorxiv preprint
图 5:(a) n 型聚合物(区域随机 x+y,其中 x:R 1 =C 12 H 25 ,R 2 =H;y:R 1 =H,R 2 = C 12 H 25 )和 N-DMBI 的化学结构,用于证明 O 2 消耗。 (b) 掺杂 P(FBDOPV-2T-C 12 )的 ESR 光谱,在室温下于 t0 搅拌(黑线),在 100°C 下搅拌 5 至 90 分钟,在室温下之后(红线),溶于无水氯苯(ESR 管在充满氩气的手套箱中制备,O 2 < 10 ppm,黑暗条件)。信号(c)线宽和(d)强度(双重积分)随室温下于 t0 搅拌时间的变化
在脊椎动物发育过程中,心脏主要来自中胚层,其心脏神经rest细胞的至关重要的贡献迁移到心脏并形成各种心血管衍生物。在此,通过将大量和单细胞RNA-seq与ATAC-Seq整合在一起,我们确定了由关键转录因子EGR1,SOX9A,TFAP2A和ETS1组成的迁移性心脏rest细胞的基因调节亚电路。值得注意的是,我们表明表达经典神经Crest基因SOX10的细胞对于成年斑马鱼的适当心脏再生至关重要。此外,在伤口边缘受伤后重新激活了迁移心脏rest基因亚电路的所有转录因子的表达。一起,我们的结果揭示了一个发展对于心脏神经克雷斯特命运确定至关重要的发育基因调节网络,在再生过程中重新激活了关键因素。
Fabian Paul,Largent,Evi Costens,University,Bonn Martin Ziller,Sonja Steelzle-Feix,Nanion在技术上
PBOB KCNN4-EGFP F2 5'AACCCAGCCAGCAGTCCAAGATGGTGAGCAAGG GCGAGGAGCTGT 3' PBOB KCNN4-EGFP R2 5'CTACTTGTACAGCTCGTCCATGCCG 3' pBOB-jGCaMP7s-F 5'ATGGGTTCTCATCATCATCATC 3' pBOB-jGCaMP7s-R 5'TTACTTCGCTGTCACTATTG TACA 3'mNlrp3 R258W-F 5'TATCCACTGCTGGGAGGTGAGCCTC 3' mNlrp3 R258W-R 5'GAGGCTCACCTCCCAGCAGTGGATA 3' mNlrp3 D301N-F 5'TGGATGGCTTTAATGAGCTACAAGG 3' mNlrp3 D301N-R 5'CCTTGTAGCTCATTAAAGCCATCCA 3' mNlrp3 T 346M-F 5'CTGCTCATAACGATGAGGGCCGGTAG 3' mNlrp3 T346M-R 5'CTACCGGCCTCATCGTTATGAGCAG 3' 409