高等教育技术研究所(I.S.T),高等教育和科学研究部,IADIAMBOLA AMPASAMPITO,PO BOX 8122,ANTANANARIVO 101,马达加斯加b物理学和数学工程的实验室(Madagascar b La and of Ensight and Mathimatical of Ensighon and Novernation and the Enviration) - la r r'1177 rue tue du o r'117 rue, -la r´eunion,法国
次生有机气溶胶(SOA),是由挥发性有机化合物(VOC)氧化的低挥发性产物形成的大气颗粒物,会影响空气质量和气候。当前的3D模型无法重新产生大气有机气溶胶中观察到的可变性。由于许多SOA模型描述是从环境室实验中推出的,因此我们代表大气条件的能力直接影响我们评估SOA的空气质量和气候影响的能力。在这里,我们开发了一种方法,该方法利用全球建模和详细的机制来设计室内实验,以模仿有机过氧自由基的大气化学(RO 2),这是VOC氧化的关键中间体。利用了数十年的实验实验,我们开发了一个定量描述RO 2化学的框架,并表明先前没有研究SOA形成的实验方法已经访问了相关的大气RO 2命运分布。我们展示了概念验证实验,这些实验证明了SOA实验如何访问一系列大气化学环境,并提出了几个方向供将来的研究。
我们审查了三级提供商和学校签署者的代码自我审查报告样本。审查发现,提供者正在很好地使用行动计划,重点是确保合规性和提高效力。一些第三级提供商尚未满足该法规的出版要求,并且需要支持才能合规。某些学校的自我审查过程受到人员配备变化的影响,强调了持续的构建能力建设活动的需求。
玛丽亚·鲁贾诺(Maria A. Rujano),格罗宁根大学医学科学博士学位,在埃克林(Ecrin)担任项目经理,为欧盟医疗保健数据研究倡议做出了贡献。凭借细胞和神经发育生物学的专业知识,她曾在著名的研究中心工作,包括Curie Institute和Institute Pasteur。化学博士学位Jan-Willem Boiten是Lygaturation的高级计划经理。 拥有超过20年的跨生命科学合作经验,他正在协调荷兰和欧洲一级的大规模生物医学数据基础设施计划。 克里斯蒂安·奥曼(Christian Ohmann)拥有数学博士学位,医学临时检查和“理论手术”领域的关联。 他是德国海因里希海因大学杜塞尔多夫医学院临床试验中心(KKS)的负责人(1999- 2014年),目前与ECRIN有关临床试验数据共享和ECRIN网络委员会的咨询。 ECRIN的高级数据经理Steve Canham具有18年的临床试验数据系统和管理方面的专业知识。 以前,他领导伦敦癌症研究所的IT团队(2002-11)。 Sergio Contrino是ECRIN数据项目的负责人。 是培训的电子工程师,曾在剑桥大学,遗传学系和欧洲生物信息学研究所(EBI)担任高级软件开发人员。 Romain David,海洋学和数据挖掘博士学位,是Erinha的研究人员和数据管家。 他是研究数据联盟(RDA)的共同主席(例如,化学博士学位Jan-Willem Boiten是Lygaturation的高级计划经理。拥有超过20年的跨生命科学合作经验,他正在协调荷兰和欧洲一级的大规模生物医学数据基础设施计划。克里斯蒂安·奥曼(Christian Ohmann)拥有数学博士学位,医学临时检查和“理论手术”领域的关联。他是德国海因里希海因大学杜塞尔多夫医学院临床试验中心(KKS)的负责人(1999- 2014年),目前与ECRIN有关临床试验数据共享和ECRIN网络委员会的咨询。ECRIN的高级数据经理Steve Canham具有18年的临床试验数据系统和管理方面的专业知识。以前,他领导伦敦癌症研究所的IT团队(2002-11)。Sergio Contrino是ECRIN数据项目的负责人。是培训的电子工程师,曾在剑桥大学,遗传学系和欧洲生物信息学研究所(EBI)担任高级软件开发人员。Romain David,海洋学和数据挖掘博士学位,是Erinha的研究人员和数据管家。他是研究数据联盟(RDA)的共同主席(例如,拥有20年的环境信息系统专业知识,他专门研究数据挖掘,图形方法和合适的数据管理。敏感数据)。Jonathan Ewbank于2021年加入Erinha担任总干事,在担任Marseille-Luminy免疫学中心(法国)25年后。Claudia Filippone是一名病毒学家,在Erinha担任高级科学计划经理。她的研究经验着重于欧洲和非洲的病毒出现和人畜共患病。Erinha的欧洲项目经理Claire Connellan专注于传染病爆发研究(Isidore)项目的综合服务,旨在增强大流行的准备。拥有项目管理和政策制定方面的专业知识,她拥有伦敦国王学院的国际和平与安全硕士学位。Ilse Custers是一名药物化学家(VU阿姆斯特丹)和卫生经济学家(庞贝·法布拉大学)。她目前正在担任Lygature的项目经理,管理项目建立基础架构的健康和基因组数据共享。Rick Van Nuland博士是专注于卫生研究基础设施的Lygature计划经理,并在UTRECHT大学医学中心和斯坦福大学接受了分子癌生物学家的培训。 Michaela Th。 Mayrhofer是培训的社会科学家。 她的博士学位研究了生物库治理的模式。 她的研究重点在于GDPR的合规性,人工智能道德规范以及建立和促进生物医学研究中的ELSI最佳实践。 自2019年以来,她一直领导BBMRI-ERIC的ELSI服务与研究部门。Rick Van Nuland博士是专注于卫生研究基础设施的Lygature计划经理,并在UTRECHT大学医学中心和斯坦福大学接受了分子癌生物学家的培训。Michaela Th。 Mayrhofer是培训的社会科学家。 她的博士学位研究了生物库治理的模式。 她的研究重点在于GDPR的合规性,人工智能道德规范以及建立和促进生物医学研究中的ELSI最佳实践。 自2019年以来,她一直领导BBMRI-ERIC的ELSI服务与研究部门。Michaela Th。Mayrhofer是培训的社会科学家。她的博士学位研究了生物库治理的模式。她的研究重点在于GDPR的合规性,人工智能道德规范以及建立和促进生物医学研究中的ELSI最佳实践。自2019年以来,她一直领导BBMRI-ERIC的ELSI服务与研究部门。Petr Holub是Masaryk大学计算机科学副教授。自2015年以来,他已成为BBMri-Eric的首席IT官。他具有科学的背景(2001年计算量子化学专业的MSC)和计算机科学(2005年的博士学位,专门研究计算机网络,自组织和多媒体处理)。evaGarcíaálvarez在BBMRI-ERIC担任IT科学家和项目经理。她从圣地亚哥大学(De Santiago de Costela)获得了分子医学博士学位,在那里她研究了癌症中体细胞病毒整合的基因组景观。Emmanuel Bacry毕业于écoleNormaleSupérieure(ENS),并拥有数学博士学位。他目前是巴黎 - 杜普大学的CNRS研究主任,也是法国健康数据中心的科学总监。他领导了Ecole Polytechnique的大数据与数据科学计划超过4年(2016-19)。收到:2024年2月6日。修订:2024年4月19日©作者2024。牛津大学出版社出版。这是根据Creative Commons Attribution许可条款(https://creativecommons.org/licenses/4.0/)分发的一篇开放访问文章,该文章允许在任何媒介中不受限制地重复使用,分发和再现,前提是适当地引用了原始工作。
这些信息和任何技术或其他建议是真诚地提出的,并且据信在准备之日起是正确的。此信息和建议的收件人必须对其目的的适用性做出自己的决心。在任何情况下,Evonik均不承担任何因使用或依赖此信息和建议而造成的损害或损失。evonik明确拒绝任何形式的任何陈述和保证,无论是明示的还是暗示的,就特定目的的准确性,完整性,非侵权,非侵权性,适销性和适合性(即使Evonik意识到了此类目的),涉及提供的任何信息和建议。引用其他公司使用的任何商品名称既不是建议,也不是对相应产品的认可,也不暗示无法使用类似产品。evonik保留随时或随后通知的任何时间对信息和/或建议进行任何更改的权利。acematt®,Addid®,Aerosil®,Airase®,Albidur®,Carbowet®,Dynol™,Nanocryl®,Silikoftal®,Silikophen®,Silikophen®,Silikopon®,Silikopur®,Silikopur®,Silikopur®,Silikotop®,Silikotop®,Sipernat®,Sipernat®,Surfynol® ®是Evonik Industries或其子公司的注册商标。Evonik支持您选择最适合的产品并通过我们的应用技术组优化当前配方。
。CC-BY 4.0国际许可证。根据作者/资助人提供了预印本(未经同行评审的认证)提供的,他已授予Biorxiv的许可证,以在2025年2月25日发布的此版本中在版权所有者中显示预印本。 https://doi.org/10.1101/2025.01.30.635633 doi:biorxiv preprint
动机:精确药物利用患者特定的多模式数据来改善预防,诊断,预后和疾病治疗。提前的精确医学需要复杂,异质和潜在高维数据来源(例如多摩学和临床数据)的非平凡整合。在文献中,已经提出了几种方法来管理丢失的数据,但通常仅限于一部分患者的特征子集的恢复。在很大程度上被忽略的问题是当一个或多个患者完全缺少其中一个或多个数据来源时,这是临床实践中相对常见的状况。结果:我们提出了Miss类似网络融合(MISS-SNF),这是一种新型的通用数据集成方法,旨在在患者相似性网络的背景下管理完全缺失的数据。miss-snf通过利用从SNF算法借来的非线性消息通讯策略来整合不完整的单峰患者相似性网络。Miss-SNF能够恢复缺失的患者相似性,并且是“任务不可知论”,从某种意义上说,可以整合无监督和监督预测任务的部分数据。对来自癌症基因组图集(TCGA)的九个癌症数据集的实验分析表明,Miss-SNF达到最先进的方法会导致恢复相似性并识别出在临床上相关变量中富集的患者亚组,并具有差异性生存率。可用性和实现:在R中实现的MISS-SNF代码可在https://github.com/ anacletolab/misssnf上找到。此外,截肢实验表明,MISS-SNF监督了对整体生存和无进展间隔事件的预测,完全缺少数据的结果可与所有数据可用时获得的结果相当。
专利通过为发现和激励研究和开发的投资提供法律保护,在药物发现过程中起着至关重要的作用。通过确定专利数据资源中的模式,研究人员可以深入了解药物和生物技术行业的市场趋势和优先事项,并提供有关更基本方面的其他观点,例如潜在的新药目标的出现。在本文中,我们使用了专利富集工具PEMT,提取,整合和分析稀有疾病(RD)和阿尔茨海默氏病(AD)的专利文献。接下来是对基础专利景观的系统审查,以破译这些疾病的专利趋势和应用。为此,我们讨论了参与AD和RD药物发现研究的著名组织。这使我们能够从特定的组织(制药或大学)观点中了解AD和RD的重要性。接下来,我们分析了专利与个体治疗靶标的有关的历史重点,并将其与市场情景相关联,从而确定了疾病的突出靶标。最后,我们在专利的帮助下确定了两种疾病中的药物重新利用活动。这导致确定现有的重新定位药物和适用于指示区域的新型潜在治疗方法。这项研究表明,专利文件从法律发现,设计和研究的扩大适用性,因此为未来的药物发现工作提供了宝贵的资源。此外,这项研究是为了理解专利文档中基础数据的重要性,并提出了为基于机器学习的应用程序准备数据的必要性。
图1。进化多目标优化为多层设计提供了合适的框架。在这项工作中,我们研究了如何通过多物镜优化方法将机器学习模型(例如PMPNN,AlphaFold2/af2rank和ESM-1V)直接集成到蛋白质序列设计中,称为非主体分类遗传算法II(NSGA-II)。左:首先,通过突变操作员提出了新的设计候选。在这里,该操作员由ESM-1V组成,ESM-1V用于对残基位置进行排列,以及用于重新设计最小Nativelike-NativelikeTose的ProteinMPNN(PMPNN)。中间:然后使用源自AlphaFold2和PMPNN置信度指标的目标函数对设计候选者进行评分。右:最后,得分的候选人被分类为连续的帕累托阵线(这里编号为F1至F5),NSGA-II从最佳战线中选择了最佳战线的候选人。为了证明该框架的有效性,我们对RFAH的多层设计问题进行了深入的分析,RFAH是一种小的折叠式蛋白质,其C末端结构域可以在全-αRFAHα状态和全βrfahβ状态之间互连。在中间面板的两个RFAH状态的卡通表示中,以绿色表示可设计的位置(残基119至154);请注意,N端结构域在RFAHβ态的带状表示中未显示(请参见方法)。
Elvina Ildusovna Minsagirova Chuvash State University Un.n.lyanov,Moskovsky Prospekt 15,Chuvash Republicsary,俄罗斯,428015,Minsagirovaelvina@ gmail.com。https://orcid.org/0000-0003-4597-6675 Iskander Marselavich Sharafutdinov“ Chuvash无声无息,以I. N. Ulyanov” Moskovsky Proospekt 15,Chuvash Republic,Cheboksary,Cheboksary,428015,Russia,Russia。choteeasy@mail。ru。https://orcid.org/0009-0001-1257-0137 MD Limon Hossain Cardiology居民,I.M. Sechenov First Moscow州立医科大学(Sechenov University),Trubetskaya Str。 莫斯科,俄罗斯联邦,119991,俄罗斯。 limon07.lh@mail.ru。 https://orcid.org/0009-0009-6254-4664 Maksim Olegovich Milovanov Pirogogov俄罗斯国家研究医科大学(RNROMU),Ostrovityanova街1号,俄罗斯俄罗斯莫斯特莫斯科省1号Ostrovityanova Street,俄罗斯,117997,117997,MILOVANOVANOVMAXMAXUM@m ruuuu。 https://orcid.org/0009-0001-8361-946 Anastasia vladimirovna Milovanova国家预算医疗机构,儿童城市多克林式42号,分支机构2号,莫斯科市卫生部2号,Golubinskina Street 23,Moscow,Moscow,Moscow,俄罗斯,俄罗斯114.143343.143。 https://orcid.org/0009-0004-4394-9248 Tatyana Alekseevna Smorodina联邦政府高等教育教育“俄罗斯联邦卫生部的库尔斯克州立医科大学”,俄罗斯联邦卫生部,3 Karl Marx Str。 marvel.enot32@yandex.ru。 https://orcid.org/0009-0000-1205-2201 Timur Lenarovich Sultanov Chuvash State University以I.N.的名字命名 Ulyanov,Moskovsky Prospekt 15,Chuvash Republic,Cheboksary,俄罗斯,428015,Tima_Sultanov_01@ Mail.ru。https://orcid.org/0009-0001-1257-0137 MD Limon Hossain Cardiology居民,I.M.Sechenov First Moscow州立医科大学(Sechenov University),Trubetskaya Str。 莫斯科,俄罗斯联邦,119991,俄罗斯。 limon07.lh@mail.ru。 https://orcid.org/0009-0009-6254-4664 Maksim Olegovich Milovanov Pirogogov俄罗斯国家研究医科大学(RNROMU),Ostrovityanova街1号,俄罗斯俄罗斯莫斯特莫斯科省1号Ostrovityanova Street,俄罗斯,117997,117997,MILOVANOVANOVMAXMAXUM@m ruuuu。 https://orcid.org/0009-0001-8361-946 Anastasia vladimirovna Milovanova国家预算医疗机构,儿童城市多克林式42号,分支机构2号,莫斯科市卫生部2号,Golubinskina Street 23,Moscow,Moscow,Moscow,俄罗斯,俄罗斯114.143343.143。 https://orcid.org/0009-0004-4394-9248 Tatyana Alekseevna Smorodina联邦政府高等教育教育“俄罗斯联邦卫生部的库尔斯克州立医科大学”,俄罗斯联邦卫生部,3 Karl Marx Str。 marvel.enot32@yandex.ru。 https://orcid.org/0009-0000-1205-2201 Timur Lenarovich Sultanov Chuvash State University以I.N.的名字命名 Ulyanov,Moskovsky Prospekt 15,Chuvash Republic,Cheboksary,俄罗斯,428015,Tima_Sultanov_01@ Mail.ru。Sechenov First Moscow州立医科大学(Sechenov University),Trubetskaya Str。莫斯科,俄罗斯联邦,119991,俄罗斯。 limon07.lh@mail.ru。 https://orcid.org/0009-0009-6254-4664 Maksim Olegovich Milovanov Pirogogov俄罗斯国家研究医科大学(RNROMU),Ostrovityanova街1号,俄罗斯俄罗斯莫斯特莫斯科省1号Ostrovityanova Street,俄罗斯,117997,117997,MILOVANOVANOVMAXMAXUM@m ruuuu。 https://orcid.org/0009-0001-8361-946 Anastasia vladimirovna Milovanova国家预算医疗机构,儿童城市多克林式42号,分支机构2号,莫斯科市卫生部2号,Golubinskina Street 23,Moscow,Moscow,Moscow,俄罗斯,俄罗斯114.143343.143。 https://orcid.org/0009-0004-4394-9248 Tatyana Alekseevna Smorodina联邦政府高等教育教育“俄罗斯联邦卫生部的库尔斯克州立医科大学”,俄罗斯联邦卫生部,3 Karl Marx Str。 marvel.enot32@yandex.ru。 https://orcid.org/0009-0000-1205-2201 Timur Lenarovich Sultanov Chuvash State University以I.N.的名字命名 Ulyanov,Moskovsky Prospekt 15,Chuvash Republic,Cheboksary,俄罗斯,428015,Tima_Sultanov_01@ Mail.ru。莫斯科,俄罗斯联邦,119991,俄罗斯。limon07.lh@mail.ru。https://orcid.org/0009-0009-6254-4664 Maksim Olegovich Milovanov Pirogogov俄罗斯国家研究医科大学(RNROMU),Ostrovityanova街1号,俄罗斯俄罗斯莫斯特莫斯科省1号Ostrovityanova Street,俄罗斯,117997,117997,MILOVANOVANOVMAXMAXUM@m ruuuu。https://orcid.org/0009-0001-8361-946 Anastasia vladimirovna Milovanova国家预算医疗机构,儿童城市多克林式42号,分支机构2号,莫斯科市卫生部2号,Golubinskina Street 23,Moscow,Moscow,Moscow,俄罗斯,俄罗斯114.143343.143。https://orcid.org/0009-0004-4394-9248 Tatyana Alekseevna Smorodina联邦政府高等教育教育“俄罗斯联邦卫生部的库尔斯克州立医科大学”,俄罗斯联邦卫生部,3 Karl Marx Str。marvel.enot32@yandex.ru。https://orcid.org/0009-0000-1205-2201 Timur Lenarovich Sultanov Chuvash State University以I.N.的名字命名 Ulyanov,Moskovsky Prospekt 15,Chuvash Republic,Cheboksary,俄罗斯,428015,Tima_Sultanov_01@ Mail.ru。https://orcid.org/0009-0000-1205-2201 Timur Lenarovich Sultanov Chuvash State University以I.N.的名字命名Ulyanov,Moskovsky Prospekt 15,Chuvash Republic,Cheboksary,俄罗斯,428015,Tima_Sultanov_01@ Mail.ru。https://orcid.org/0009-0006-8145-8460收到:11/20/2024接受:02/19/2025发布:03/12/2025 doi:http:///doi.org/doi.org/10.5281/zenodo。14911524