。CC-BY 4.0国际许可证。根据作者/资助者提供了预印本(未经同行评审的认证)提供的,他已授予Biorxiv的许可证,以在2025年2月8日发布的此版本中在版权所有者中显示预印本。 https://doi.org/10.1101/2025.02.07.636998 doi:Biorxiv Preprint
摘要:Ikan Betok(Anabas testudineus,Bloch 1792)是FISHES之一,是Anabantidae家族的成员。Betok是Riau省的一种地方性鱼。关于Betok Fish的DNA条形码的科学研究仍然很少。这项研究旨在分析Betok Fish上细胞色素C氧化酶I(COI)的DNA条形码序列。方法,例如采样,总DNA提取,PCR,电泳,测序和数据分析。所研究的COI序列的大小为694 bp。BLASTN分析表明,Betok Fish的相似性最高为99.7%,而A. cobojinus的testudineus和最低的93.00%。有一个核苷酸基于COI序列(即核苷酸编号309)。这项研究可能会丰富Genebank中Betok Fish的DNA条形码数据库。关键字:Anabas testudineus,Betok Fish,COI,DNA条形码,RIAU。pendahuluan
Silico生物学中的摘要被认为是一种有效且适用的方法来启动各种研究,例如生物多样性分类学保护。在用于兰花物种的硅分类法中使用的系统发育分析可以提供有关遗传多样性和进化关系的数据。在分类学研究中可用于评估基因基因座特定靶标的一种特殊方法是DNA条形码。进行了这项研究,以使用MAT K,RBC L,RPO C1和NRDNA标记来确定特定的靶基因基因基因,用于使用系统发育分析在硅方法中使用Silico方法的Coelogyne属的DNA条形码。所有标记序列均从NCBI网站收集,并使用多种软件和方法进行分析,即用于样品序列对齐的Clustal X和用于系统发育树的结构和分析的Mega 11。恢复表明,建议使用的基因基因座是nrDNA基因基因座。系统发育分析表明,NRDNA基因基因座的使用能够将17种coelogyne物种与两个外群物种分开,即Cymbidium和Vanilla,然后与1,5-双磷酸羧化酶/氧合酶/氧合酶/氧合酶/氧合酶大型亚基(RBC l)一起,而其他基因群和其他polim subiN locase and n namely malsy matulase k(rbc l)(namely kita k)(namely malsy matuly k)(namy k'' RPO C1)提供了一种视觉植物树,其中两个外群物种与Coelogyne物种相同。因此,这项研究的结果可用作支持Coelogyne育种和保护计划的参考。版权所有:©2023,J。热带生物多样性生物技术(CC BY-SA 4.0)
昆虫是地球上种类最丰富的群体之一。它们构成了许多动物多样性,并在生态系统中起着至关重要的作用,包括授粉,害虫控制和分解。但是,仅描述了这种多样性的一部分。南非被认为是全球生物学上最多样化的国家之一,估计有44,000种昆虫物种。许多农作物依赖于昆虫传粉媒介,包括菜籽,苹果,橘子和向日葵。目前缺乏野生传粉媒介会威胁农作物的产量,但我们对南非昆虫多样性的了解却很少。相对于南非的生物多样性,几乎没有分类专家,用于昆虫识别的方法可能是耗时且昂贵的。DNA条形码为加速昆虫生物多样性研究提供了重要的研究工具。在这篇综述中,我们询问了公共DNA条形码粗体(生命数据系统的条形码)数据库中的“昆虫”记录,并返回了416 211个已发表的记录,分配给28239个独特的垃圾箱(条形码指数编号)。我们确定了五个分类订单,其垃圾箱比南部非洲已知的物种多(膜翅目,双翅目,thysanoptera,plecoptera和strepsiptera)。大多数条形码记录均来自豪登省,姆普马兰加和林波波的不适陷阱采样,而南非其他地区的采样仍然很差。我们建议需要进行全面的国家抽样努力,以及对分类专业知识的投资增加,以在物种遗失以灭绝之前生成有关昆虫生物多样性的关键基线数据。
摘要。马蹄蟹或咪咪(Misshoe Crab),通常被称为马蹄蟹是一种古老的动物,可以生存到现在为止,因此被称为活化石。马杜拉(Madura)可以找到马匹螃蟹,但还没有全面的数据。需要关于马蹄蟹物种的准确数据来确定这种古老动物的潜力,尤其是从马杜拉岛的水域中。仍然需要仔细的收集,分类和识别物种以及描述新物种的过程,以可持续地管理马杜拉沿海资源的潜力。物种识别是最耗时,困难的,并且通常会造成数据收集和分析的障碍。可以根据马蹄蟹形态来识别马蹄蟹物种,但需要一种可靠,有效的方法是非常复杂的。当前正在发展的马蹄蟹鉴定方法之一是使用DNA条形码的分子分析。这项研究是使用DNA条形码分子分析来识别物种的首次尝试,以研究Madura岛作为马蹄蟹遗传多样性的来源,并有望可用于管理马蹄蟹资源。这项研究的目的是找出马杜拉岛上的条形码马蹄蟹物种的DNA。线粒体基因组DNA(mtDNA)的遗传标记物细胞色素氧化酶I用于分析遗传多样性。通过使用软件Mega X进行系统发育树和遗传多样性的重建。研究结果表明,样本与癌圆形圆形葡萄干99%密切相关。
©作者2023。Open Access本文是根据Creative Commons Attribution 4.0 International许可获得许可的,该许可允许以任何媒介或格式使用,共享,适应,分发和复制,只要您对原始作者和来源提供适当的信誉,请提供与创意共享许可证的链接,并指出是否进行了更改。本文中的图像或其他第三方材料包含在文章的创意共享许可中,除非在信用额度中另有说明。如果本文的创意共享许可中未包含材料,并且您的预期用途不受法定法规的允许或超过允许的用途,则您需要直接从版权所有者那里获得许可。要查看此许可证的副本,请访问http://创建ivecommons。org/licen ses/by/4。0/。Creative Commons公共领域奉献豁免(http://创建ivecommons。Org/publi cdoma in/Zero/1。0/1。0/)适用于本文中提供的数据,除非在数据信用额度中另有说明。
*上课迟到5分钟即为迟到 参与度 (5%) 经常参与 (4) 参与度一般 (2-3) 很少参与 (1) 从不参与 (0) 2 作业 (15%) 按时提交作业 (1%)
要解决正在进行的全球生物多样性危机,必须以强大的信息为基础保护方法(Buxton等,2021)。动物福利,渔业管理,海鲜可追溯性以及许多其他组织在很大程度上依赖于精确识别鱼(Ward等,2009)。常规的形态分类法仅限于描述隐性物种,少年或加工的海鲜物品(Costa&Carvalho,2007年)。关于垂钓者捕获率和物种组成的统计数据已被广泛用于监测商业和娱乐性重要物种的丰富性变化(Beaudreau&Levin,2014; Florisson,2015; Kroloff,2016; Kroloff,2016; Thurstan et al。,2016; Quinn,2018; Quinn,2018; Chan et al.Chan et al。,2019年; Re.e rece and''DNA条形码,使用线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(COI)基因已成为可靠的方法
该协议集合描述了达尔文生命项目中DNA条形码的标准操作程序。SOP涵盖了海洋生物协会的大型藻类和海洋生物,真菌和地衣的条形码,牛津大学的生物,爱丁堡皇家植物园的植物和地衣在伦敦自然历史博物馆的植物和地衣。
结果 PCR 扩增:共进行了 32 次扩增;28S 8 次、CO1 8 次、CO2 16 次(分为两个独立试验,每次试验 8 次扩增)。 28S rRNA 基因: • 100% 的扩增成功,但 25% 的扩增显示轻微错误引导,37.5% 的扩增显示严重错误引导(表 2)。 • 在可用的 28S 序列中,37.5% 可组装为共识序列。 CO1 基因: • 100% 的扩增成功,但 12.5% 的扩增显示严重错误引导。 • CO1 序列被证明是最成功的,在创建共识序列方面的成功率为 75%。 CO2 基因: • CO2 基因的前 8 次扩增显示 0% 的成功率,因此修改了 PCR 方案。 • CO2 扩增被证明是最不成功的,第二轮扩增成功率为 75%,其中 66.7% 出现严重错误引导。• 未生成 CO2 序列。