印度被评为一个巨大的多样性国家,在全球范围内的36个宣称的地点中忍受了四个生物多样性热点(de Mandal等,2015; Rajkhowa等,2015)。四个地区是喜马拉雅山脉,印度 - 伯马地区,西高止山脉和桑达兰。被标记为热点的竞技场以其丰富而离散的生物组合目睹生物学活动的闻名,但担心灭绝的恐惧被标记为生物多样性热点。印度的整体调查报告说,在印度已经记录了91,000种动物和45,500种植物。负责创造多种光环的主要因素是气候,温度,土壤质量,降雨百分比,并且许多河流的存在可用于植被覆盖,而居住在土壤中的微生物(Rathour等,2017)。生物多样性区域中的土壤饰有独特的自然环境,其中,居民的特殊微生物具有独特的特征,也涉及植物生长等。有可能
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根瘤菌是土壤细菌,可以与豆科植物建立氮固定共生。作为水平传播的共生体,根瘤菌的生命周期包括土壤中的自由生活阶段和植物相关的共生阶段。在整个生命周期中,根瘤菌暴露于与它们相互作用的无数其他微生物中,从而调节其拟合度和共生性能。在这篇综述中,我们描述了根茎与其他微生物之间相互作用的多样性,这些微生物在根际,结节开始和结节中可能发生。这些根瘤菌 - 微生物相互作用中的某些是间接的,并且发生某些微生物的存在以一种以根瘤菌的方式反馈的植物生理学的存在。我们进一步描述了这些相互作用如何对根瘤菌施加显着的选择性压力并修改其进化轨迹。对复杂的生物环境中根茎的生态进化动力学进行更广泛的研究可能会揭示出这种认真的共生相互作用的引人入胜的新方面,并为未来的农艺应用提供了关键的知识。
合成微生物群落(Syncom)生物传感器是一种有前途的技术,用于检测和响应环境线索和靶分子。Syncom生物传感器使用工程的微生物来创建一个更复杂和多样化的传感系统,从而使它们能够以增强的灵敏度和准确性对刺激做出反应。在这里,我们给出了Syncom生物传感器的定义,超越了他们的建筑工作,并讨论了当前的生物传感技术。我们还强调了开发和优化Syncom生物传感器以及在农业和食品经营中的潜在应用,生物治疗发展,家庭感应,城市和环境监测以及One Health Foundation的挑战和未来。我们认为,Syncom生物传感器可以实时和遥控的方式使用,以感知不断动态的环境的混乱。
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我们描述了一种分析复杂微生物种群遗传多样性的新型分子方法。该技术基于通过变性梯度凝胶电泳 (DGGE) 分离编码 16S rRNA 的聚合酶链式反应扩增基因片段,这些片段的长度相同。对不同微生物群落的 DGGE 分析表明,分离模式中存在多达 10 个可区分的条带,这些条带很可能来自构成这些种群的许多不同物种,从而生成了种群的 DGGE 图谱。我们表明,可以识别仅占总种群 1% 的成分。使用针对硫酸盐还原菌 16S rRNA 的 V3 区特异性的寡核苷酸探针,可以通过杂交分析识别某些微生物种群的特定 DNA 片段。对在有氧条件下生长的细菌生物膜的基因组 DNA 进行分析表明,尽管硫酸盐还原菌具有厌氧性,但它们仍存在于这种环境中。我们获得的结果表明,该技术将有助于我们了解未知微生物种群的遗传多样性。
重金属污染由于其持续性,更高的毒性和顽固性而成为全球严重关注的问题。这些有毒的金属威胁着环境的稳定性和所有生物的健康。重金属还通过食用受污染的食物并对人类健康造成有毒作用,进入人类食物链。因此,必须对HMS污染的土壤进行修复,并且需要在更高的优先级上解决。使用微生物被认为是打击HMS不利影响的有前途的方法。微生物有助于恢复恶化环境的自然状况,并具有长期的环境影响。微生物修复可防止HMS的浸出和动员,并且还使HMS的提取变得简单。因此,在这种情况下,最近的技术进步允许将生物修复用作补救污染土壤的必要方法。微生物使用不同的机制,包括生物呼吸,生物蓄积,生物含量,生物转化,生物胆碱化和生物矿化,以减轻HMS的影响。因此,在此评论中,在此综述中保持有毒的HMS探讨细菌,真菌和藻类在污染土壤的生物修复中的作用。本综述还讨论了可用于提高微生物效率以补救HMS污染土壤的各种方法。它还强调了在未来的研究计划中必须解决的不同研究差距,以改善生物修复效率。
抽象背景微生物必须对其环境变化做出反应。分析函数的鲁棒性(即性能稳定性)这种动态扰动在实验室和工业环境中都引起了极大的兴趣。最近,一种能够评估各种功能的鲁棒性的定量方法,例如在不同条件,时间范围和种群中为在96孔板中生长的微型ISM开发了各种功能的鲁棒性。在微静电板中,环境变化缓慢且未定义。动态微型单细胞培养(DMSCC)实现了微环境的精确维护和操纵,同时使用活细胞成像随着时间的推移跟踪单细胞。在这里,我们将DMSCC和鲁棒性量化方法结合在一起,以评估在几秒钟或几分钟内发生变化的性能稳定性。结果,酿酒酵母CEN.PK113-7D,具有用于细胞内ATP水平的生物传感器,暴露于葡萄糖盛宴饥饿周期,每种状况在20小时内持续1.5至48分钟。开发并应用了半自动图像和数据分析管道,以评估种群,亚种群和单细胞分辨率的各种功能的性能和鲁棒性。我们观察到特定生长速率的降低,但振荡间隔更长的细胞内ATP水平增加。持续48分钟振荡的细胞表现出最高的平均ATP含量,但随着时间的流逝,稳定性最低,在人群中的异质性最高。结论所提出的管道使随着时间的时间和种群内的动态环境中的功能稳定性进行了研究。该策略允许并行化和自动化,并且很容易适应新的生物,生物传感器,培养条件和振荡频率。对微生物对不断变化环境的反应的见解将指导应变开发和生物处理优化。关键词酿酒酵母,种群异质性,动态环境,尺度降低,生物传感器,活细胞成像,微流体单细胞培养,营养振荡
微生物刺激素可作为生物和非生物胁迫保护剂和生长促进剂,在气候变化的背景下,在农业中也变得越来越重要。寻找能够在各种田间条件下帮助减少化学投入的新产品是新的挑战。在这项研究中,我们测试了两种具有互补作用模式的微生物生长促进剂(Azotobacter chroococcum 76A 和 Trichoderma afroharzianum T22)的组合是否可以帮助番茄适应最佳水和氮需求减少 30% 的情况。在最佳水和营养条件下,微生物接种物可提高番茄产量 (+48.5%)。此外,微生物应用提高了胁迫条件下的叶片水势 (+9.5%),降低了叶片整体温度 (-4.6%),并增加了地上部鲜重 (+15%),表明该组合可在有限的水和氮供应下充当植物水分关系的积极调节剂。在胁迫条件下施用 A. chroococcum 76A 和 T. afroharzianum T22 可显著增加根际微生物种群,这表明这些接种物可增强土壤微生物丰度,包括本地有益微生物的丰度。采样时间、有限的水和氮状况以及微生物接种均会影响根际土壤中的细菌和真菌种群。总体而言,这些结果表明,所选微生物群落可作为植物生长促进剂和胁迫保护剂,可能通过土壤微生物多样性和相对丰度的功能性变化触发适应机制。
海洋生物膜是全球无处不在的表面相关微生物群落,由于其独特的结构和功能,引起了人们的关注。The aim of this study is to provide a comprehensive overview of the current scienti fi c understanding, with a speci fi c focus on naturally occurring bio fi lms that develop on diverse marine abiotic surfaces, including microplastics, sea fl oor sediments, subsurface particles, and submerged arti fi cial structures susceptible to biocorrosion and biofouling induced by marine bio fi LMS。本文介绍了有关海洋环境中这些表面相关微生物群落的多样性,结构,功能和动态的最新进展和发现,突出了它们的生态和生物地球化学维度,同时也是为了进一步研究海洋生物生物LMS的灵感。