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康普茶生产过程中的氧气管理：基质的作用，微生物活性和过程参数
Thierry Tran，FrançoisVerdier，Antoine Martin，HervéAlexandre，Cosette Grandvalet等。食品微生物学，2022，105，pp.104024。10.1016/j.fm.2022.104024。hal-03648386
加纳沃尔塔地区HO市消耗的水的微生物质量和矿物质含量
背景：水质和安全是人类发展和福祉的基础。因此，这项研究的目的是确定加纳沃尔塔地区首都HO中水的细菌学和矿物质含量。方法：由于消费率高及其假定质量，从1月至2月对小香囊，瓶装和自来水进行了采样，这些质量是从整个市政当局的五个不同地点随机采用的。水质评估方案被用来确定样品的细菌学和矿物质含量，而ANOVA则用于确定统计差异和显着性在p <0.05。结果：自来水的最大异养板计数为9.95±0.64×10 5菌落形成单元（CFU）/ml，囊囊水为7.46±0.09×10 6 CFU/ml，瓶装水的瓶装水为1.10±0.56×10 5 cfu/ml，nut nut nut nut nut，对于MacConkey琼脂，最大生长分别为2.94±0.03×10 6，9.42±1.67×10 6，和2.31±0.77×10 5 cfu/ml的水龙头，小袋和瓶装水。木糖赖氨酸脱氧胆酸琼脂表明最大生长为1.84±0.34×10 3，5.72±0.06×10 6，分别用于TAP，SACHET和瓶装水。pH，浊度，颜色和电导率等物理参数在加纳标准管理局设定的建议范围内。但是，自来水记录的浊度最高，瓶装水分别记录了最高和最少的pH和浊度。与瓶装水样品相比，小香囊和自来水是最不健康的。此外，矿物分析表明，瓶装水中的磷酸盐（po₄砂），氯化物（Cl-）和钠（Na）在瓶装水中，总铁（Fe）相对较高，在几个Tap和sachet水样中，后者的氨（NH 3）也最高。结论：总体而言，水龙头，小香囊和瓶装水样表现出各种水平的微生物和矿物质含量，而物理参数相对在推荐水平范围内。
微生物生态学（C002774）
该课程是主计划生物学中生态集群的一部分。课程一般微生物学；真菌学，社区和系统生态学；生物学学士学位课程的疾病和原始学为本课程奠定了基础。该课程概述了微生物在不同生态系统和分子技术中的作用，以研究微生物多样性（理论和实践），生态系统功能和进化。问题：微生物发生了什么类型的环境，微生物如何相互相互作用以及与其他生物相互作用，微生物在哪种方式影响环境，我们如何在管理环境（土壤卫生，水净化）中使用微生物的特性，在农业或生物技术中。
东京抗菌抗性一项健康研讨会
1-益生菌2-选择和育种3-疫苗4-饲养习惯该小组认为植物生成产品由于成分而昂贵且复杂。测试也非常耗时且昂贵。疫苗的开发需要考虑到生产和试验所需的时间。应探索微生物对益生菌的抗性的可能性。在2023年，印度尼西亚从制造商那里收集了一些益生菌样本。选定的种子测试了抗性发展的可能机制。
预测氨基酸组成的微生物生长条件
在实验室中生长微生物的能力可以使其遗传学的可重复研究和工程化。不幸的是，由于识别培养条件所需的努力，生命树中的大多数微生物仍然没有耕种。对指导实验测试的可行生长条件的预测将是非常可取的。虽然可以通过注释的基因在计算上预测碳和能源，但很难预测其他生长的要求，例如氧，温度，盐度和pH。在这里，我们开发了基于基因组的计算模型，能够预测氧耐受性（92％平衡精度），最佳温度（r 2 = 0.73），盐度（r 2 = 0.81）和pH（r 2 = 0.48），而新的分类微生物家族无需功能基因注释。使用15,596种细菌和古细菌的生长条件和基因组序列，我们发现氨基酸频率可预测生长需求。只有两个氨基酸可以预测氧气耐受性，其精度为88％。使用蛋白质的细胞定位来计算氨基酸频率改善了pH的预测（r 2增加0.36）。由于这些模型不依赖于特定基因的存在或不存在，因此可以将它们应用于不完整的基因组中，仅需要10％的完整性。我们应用模型来预测所有85,205种测序细菌和古细菌的增长需求，发现未养殖物种富含嗜热，厌氧菌和嗜酸菌。这项工作指导了对不同微生物实验室种植的生长限制的识别。最后，我们将模型应用于具有元基因组组装的基因组的3,349个环境样品，并表明社区中的个别微生物具有不同的增长需求。
通过诱导的极化监测土壤柱实验中的原位微生物生长和衰减
自然界中的微生物广泛参与许多地球化学过程，例如矿物风化（Doetterl等，2018）和有机污染物的生物降解（Kimak等，2019）。为了更好地理解这些过程，对微生物的密度进行定量很重要，由于营养的可用性，尤其是在生长和衰减阶段的情况下，这大大变化。特异性生长与细菌的衰减速率与养分之间的关系通常是使用最初由Monod（1941，1949）开发的动力学模型来建模的。在多孔培养基中获取微生物密度的传统方法基于原位采样（一种侵入性方法）和废水孔隙 - 水微生物分析。由于细菌倾向于附着在晶粒表面上，因此孔隙水微生物分析低估了细菌计数（Drake等，1998）。因此，开发一种可以非侵入性监测微生物密度的方法被认为是重要的。
肠道微生物和免疫反应对不同类型的饮食纤维的功能分析：迈向个性化饮食干预的一步
和短链脂肪酸的产生。为了测试这一点，采用了纵向跨界研究设计，其中健康的成年女性消耗了三种不同的饮食纤维补充剂：inulin（果酸 - 寡糖），vitafiber（Isomalto-oligosacacachiely）和一周的介入时间为2周的洗手间。每种补充剂每天消耗总共15克可溶性纤维。样品，通过16S rRNA测序和使用核磁共振测量的短链脂肪酸的16S rRNA测序和粪便水平分析肠道菌群的组成。使用光流式细胞仪进行干预后SCFA水平较高的参与者的子集研究了外周血单核细胞中的表型变化。结果表明，整个肠道细菌群落对纤维引起的变化的实质稳定性和韧性。但是，每种补充剂对肠道细菌α和β多样性，SCFA产生和免疫变化都有特定的影响。inulin始终发挥了在个体中最明显的作用，并且某些分类单元被确定为响应二氨蛋白的潜在产生指标。对于其他纤维补充剂没有观察到这种区分特征。需要进一步的大规模研究来确认这些发现。总体而言，我们的研究意味着个性化的饮食纤维干预措施可以量身定制，以促进有益细菌的生长，以最大程度地提高SCFA生产和相关的健康益处。
在五个同胞欧洲草食动物的Sun，X。的粪便中的微生物群落组成；保姆，朱迪思； Ruytinx，Joske； Wassen，Martin J.；
fi g u r e 5在草食动物粪便中不同模式的真菌群落的功能表征。（a）在营养模式下相对丰度（> 1％）。（b）公会模式下预测的功能分布的组成； （c）在公会模式下对应于功能组的家庭层面上特定主要的真菌分类单元的相对丰度（第一级标题是真菌物种及其所在的类别；次级标题是与真菌相对应的官能团）。不同的字母表示在p <.05级别（n = 6）的显着差异;表S14列出了真菌公会模式下的比较统计结果；表S15列出了确切的p值。
在模拟的环境辐射和微生物孵育条件下研究单个羧酸盐富含甲基甲基分子的稳定性
了解环境溶解的有机物（DOM）依赖于能够导航其固有复杂性的方法的发展。尽管分析技术一直在不断提高，从而改善了散装和分级DOM的见解，但单个化合物类别的命运几乎不可能通过当前技术跟踪。以前，我们报道了羧酸盐富含甲基分子（CRAM）化合物的合成，该化合物与以前可用的标准相比，与DOM共享更相似的分析特征。在这里，我们采用我们的合成式烤箱化合物并将它们与选择的一组策划的一组购买的分子以及选择的生物学或化学相关性的附加策划的一组购买的分子一起，采用我们的合成的CRAM化合物，将常规使用DOM用作批量材料。辐照实验通常表明，在饱和碳主链上仅携带羧酸和/或酒精的化合物对光化学降解具有最具耐药性，但在DOM的存在下，某些具有CRAM样式和化学功能的化合物也更稳定。在微生物孵化中，在各种水生环境中8个月后，我们的所有合成cram均完全稳定。这些实验集为环境中提议的CRAM的稳定性提供了支持，并提供了一个平台，可以使用该平台，可以使用多种多样的分子来帮助探测DOM的稳定性。