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实验室医学双弦DNA抗体（IgG）
指示：怀疑全身性红斑狼疮（SLE），尤其是在肾脏互动中。跟进SLE中的疾病活动或治疗效果。医学背景：抗DSDNA抗体是全身性红斑狼疮（SLE）的特定标记物，在60-80％的活动疾病患者中被检测到，尤其是在肾脏参与中。IgG型抗DSDNA抗体的高滴度通常反映疾病活性，并且可以用作某些SLE患者的活性标记。 在缓解过程中，抗体水平下降并且可能变为负，而上升水平可能表明即将到来的森林。IgG型抗DSDNA抗体的高滴度通常反映疾病活性，并且可以用作某些SLE患者的活性标记。在缓解过程中，抗体水平下降并且可能变为负，而上升水平可能表明即将到来的森林。
用夹子 - 苯噻吩〜trilex的氧化DNA裂解...
摘要：我们报告了一项系统研究，该研究对几种新型的Cu螯合夹式磷脂人工金属核酸酶（AMN）的杂种，以及三链DNA的序列 - 特异性裂解。这些AMN-TFO混合动力车的合成是基于在关键步骤中应用炔烃环加成单击反应（CUAAC）的应用。AMN通过5'-或3'-End或TFO伸展中间的不同接头连接。与富含靶嘌呤的序列有效地形成了三种杂种，并研究了其Cu复合体，以在抗坏血酸作为还原剂的情况下裂解dsDNA的能力。在所有情况下，我们都研究了AMN-TFO的性质和长度，抗坏血酸的时间，条件和量的影响，并发现了最佳的偶联物和程序，这些结合物和程序对目标序列进行了相当有效的（高达34％）的裂解，同时呈现非目标DSDNA完整。仅在一种情况下，在一个情况下发现了页面上裂解的足迹，这意味着裂解不会以单核苷酸精度进行。另一方面，这些AMN-TFO杂种可用于选择性降解目标dsDNA序列。这种设计的未来改进可能会提供更高的分辨率和选择性。
YM1蛋白晶体促进2型免疫力
群集定期间隔短的短质体重复序列（CRISPR）相关的核酸内切酶已彻底改变了生物技术，因为它们是可编程基因组编辑者的潜力。然而，大多数天然核酸酶及其变体都有局限性。在这里，我们报告了由祖先序列重建（ASR）设计的完全合成的CRISPR-核酸酶（CAS）核酸酶（CAS）核酸酶（CAS）核酸酶（α-Syncas），该核酸酶（ASR）显示出一组可靠且独特的靶向特性，在任何其他已知的CRISPR-CAS Cass 2 System中都找不到。我们表明α-同步是一种无PAM的核酸酶，能够催化DSDNA，ssDNA和SSRNA的RNA引导，特定的裂解。合成酶也能够通过补充DSDNA，ssDNA和SSRNA靶标激活DSDNA，SSDNA和SSRNA的序列非特异性降解。此外，α-同步在人类细胞和细菌中表现出强大的基因组编辑活性。α-同步三元和第四纪复合物的冷冻电子显微镜结构提供了一个框架，以了解其扩展的酶促活性的结构基础。几乎任何核酸序列的可编程多模式靶向的能力将α-同步区分开，这是扩展基于CRISPR的技术的有希望的新工具。
DNA 20 kb质粒和线性套件应用指南
C Reagents, Plate Layouts, and Methods................................................................................74 Reagent Set............................................................................................................................ 74 Plate Layouts.......................................................................................................................... 75方法................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 77 30厘米毛细管的条件方法................................................................................................................................................................................... Capillaries.....................................................80 Shutdown Method for 30 cm Capillaries............................................................................ 81 Capillary Rinse Method for 30 cm Capillaries.................................................................... 82 Conditioning Method for 50 cm Capillaries........................................................................ 83 Linear dsDNA Separation Method for 50 cm Capillaries....................................................84 Shutdown Method for 50 cm Capillaries............................................................................ 86
富集
Illumina无细胞的DNA准备富集是一种基于连接的测定法，该测定法使用单个杂交步骤进行快速文库制备（图2）。富集的无细胞DNA制备与来自Illumina的用户富集寡核苷酸兼容。使用来自Illumina的免费在线DesignStudio™工具，基于您指定的目标基因列表的来源自定义丰富面板。Dive designStudio工具与单链DNA（ssDNA）富集探针和双链DNA（DSDNA）富集V2探针兼容。为了增强内容可移植性，可以将无细胞的DNA准备富集与综合DNA技术和Twist Bioscience的DSDNA探针一起使用。该套件可容纳55-2000 kb ssDNA和70-2000 kb dsdna面板含量，从而实现灵活的研究设计。在〜8.5–9.5小时内准备好的测序库，只有〜2.5–3小时的动手时间，使研究人员可以在一天内从提取的CFDNA转变为测序。为了最大程度地效率和灵活性，该试剂盒与使用基于市售柱或珠的纯化方法直接从外周血或等离子体中提取的CFDNA兼容。
AccuBlue® 宽范围 RNA 定量试剂盒
该试剂盒非常适合定量 RNA，用于下一代测序 (NGS) 或逆转录 PCR (RT-PCR) 等敏感应用。与基于吸光度的测量不同，RNA Broad Range Dye 对 RNA 的选择性高于双链 DNA (dsDNA)，并且可以耐受样品中等摩尔量的 dsDNA，而不会对 RNA 定量产生显著影响（图 4）。仍然建议使用纯化的 RNA 样品。该测定还可用于定量小 RNA，例如 miRNA（图 5）以及单链 DNA (ssDNA)，尽管与 RNA 相比，ssDNA 发出的荧光信号较低（图 6）。与总 RNA 相比，该测定对 dsRNA 发出的信号非常低（图 7）。
CRISPR敲入协议 - 用于Jurkat细胞...
注意：确保将Cas9蛋白添加为反应中的最后材料。在KO的情况下，无需添加HDRT。表中Cas9与SGRNA的比率为1：3，对于1.8kb dsDNA，HDR为1μg。强烈建议每种特定设计对CAS9的实验优化：SGRNA比和Cas9蛋白和HDRT的量。Genscript建议通过测试1：1至1：4之间的RNP比率开始优化。我们建议最初可以将DsDNA的量设置在0.5μg和3μg之间（对于0.5kb和4KB之间的HDRT；如果HDRT长度超过此范围，则可能需要适当调整试剂的量）。为第一个实验分别设置负面对照，阳性对照和转染控制是最好的做法。
扩展了圆形，线性，单个
校验和可用于验证和快速查找关联的符号。例如，seguid校验和用27个字符的字符串独特地识别蛋白质序列。目标：原始SEGUID虽然对蛋白质序列和单链DNA（ssDNA）有效，但由于拓扑差异而不适用于cir和双链DNA（DSDNA）。挑战包括如何唯一代表线性dsDNA，圆形ssDNA和圆形dsDNA。为了满足这些需求，我们提出了SEGUID V2，它扩展了原始SEGUID以处理其他类型的序列。结论：SEGUID V2产生链和旋转不变校验和单链，双链，可能交错，线性和圆形DNA和RNA序列的校验。可自定义的字母键允许其他类型的序列。与使用base64的原始SEGUID相反，Seguid V2使用base64url编码SHA-1哈希。这可以确保可以在文件名中使用SEGUID V2校验和，无论平台和URL中，都可以使用最小的摩擦。可用性：SEGUID V2很容易适用于MIT许可下的主要程序和语言。JavaScript包装seguid可在NPM上找到，Python包装pyguid和cran上的r seguid。关键字：校验和hash，dna，rNA，蛋白质，sha-1，base64url，seguid