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秀丽隐杆线虫是一种用于研究发育和衰老遗传学的多功能模型生物,通过给线虫喂养表达特定 dsRNA 的细菌可以抑制其基因表达。之前已证实通过常规转基因技术过表达缺氧诱导因子 1 ( hif-1 ) 或热休克因子 1 ( hsf-1 ) 可延长线虫寿命。然而,目前尚不清楚其他基因过表达方法是否可行,尤其是随着基于 CRISPR 的技术的出现。本文中,我们表明,给经过基因改造以稳定表达 Cas9 衍生的合成转录因子的秀丽隐杆线虫喂养表达启动子特异性单向导 RNA (sgRNA) 的细菌也可以激活基因表达。我们证明,通过摄取针对 hif-1 或 hsf-1 各自启动子区域的 sgRNA 激活 CRISPR 可增加基因表达并延长秀丽隐杆线虫的寿命。此外,作为旨在使用 CRISPR 激活秀丽隐杆线虫的未来研究的计算机资源,我们提供了预测的启动子特异性 sgRNA 靶序列,用于超过 13,000 个秀丽隐杆线虫基因,并具有实验定义的转录起始位点。我们预计本文描述的方法和组件将有助于促进全基因组基因过表达研究,例如,通过将表达 sgRNA 的细菌喂给线虫来诱导转录,以识别衰老或其他感兴趣的表型的调节因子。
1申请范围巴基斯坦安全印刷公司(Pvt。)ltd以下称为“采购代理”,邀请符合条件的顾问的兴趣表达顾问资格预先资格在巴基斯坦在巴基斯坦建立安全纸制造和钞票生产设施,此后有资格标准:2符合条件的顾问i。顾问可以是巴基斯坦的公司,公司,公共或半公开机构,也可以是“ C”或合资企业中提到的任何合格的外国。II。 在合资企业的情况下,合资伙伴签订的协议的副本应与其运作的条件,其持续时间(如果有)限制(如果有)授权代表和责任的人。 iii。 如果合资伙伴之间发生任何诉讼或仲裁程序,则采购机构不得影响任何诉讼或仲裁程序。 iv。 合资企业的至少一个合作伙伴应满足本协议中详细介绍的资格预审标准,或者双方都可以累计符合资格预审标准,在这些标准中,双方的能力都将加在一起进行评估。 在这两种情况下,每个合资伙伴应遵守“参考第7条第7.2(i)条或7.2(ii)第7条中提到的标准之一”,v。v。合资伙伴应提名一名单一项目经理,并共同执行项目,并应通过合法的授权委员会的律师签署的律师签署的权力来证明该授权。 vi。 vii。 VIII。 ix。II。在合资企业的情况下,合资伙伴签订的协议的副本应与其运作的条件,其持续时间(如果有)限制(如果有)授权代表和责任的人。iii。如果合资伙伴之间发生任何诉讼或仲裁程序,则采购机构不得影响任何诉讼或仲裁程序。iv。合资企业的至少一个合作伙伴应满足本协议中详细介绍的资格预审标准,或者双方都可以累计符合资格预审标准,在这些标准中,双方的能力都将加在一起进行评估。在这两种情况下,每个合资伙伴应遵守“参考第7条第7.2(i)条或7.2(ii)第7条中提到的标准之一”,v。v。合资伙伴应提名一名单一项目经理,并共同执行项目,并应通过合法的授权委员会的律师签署的律师签署的权力来证明该授权。vi。vii。VIII。 ix。VIII。ix。合资企业提交的任何EOI均应指示各方提出的任务的一部分,并且未经采购机构的书面书面批准并符合当局发布的任何指示。合资企业应通过其授权人员共同提交EOI,双方应分别和共同负责履行其本咨询分配的义务,并确保在此处完成所有可交付成果。邀请表达利益的邀请均可开放所有前瞻性咨询公司,但要遵守各个国家成立机构或为该特定贸易或业务建立的法定机构的任何成立或许可规定。如果以下情况,顾问可能没有资格:a)他被宣布为破产,或者在公司或公司的情况下
我们使用GEO2R使用了微阵列数据集GSE56808(3)和GSE26276(4)对ALS患者细胞和组织的这种差异基因表达分析。GSE56808是使用Affymetrix人基因组U133加上2.0阵列技术生成的,n = 6个对照成纤维细胞,n = 6 ALS患者成纤维细胞;使用了平台GPL570。GSE26276是使用Affymetrix人基因1.0 ST阵列技术生成的,N = 3对照骨骼肌和n = 3 ALS患者骨骼肌;使用了平台GPL6244。P值调整的Benjamini -Hochberg方法用于对差异表达进行排名,但原始的P值用于评估全局差异表达的统计显着性。对数字转换,并使用了NCBI生成的平台注释类别。使用两尾t检验进行了统计检验,以评估患者和对照成纤维细胞之间的AHNAK表达是否显着差异。
摘要 回顾近年来的亨廷顿舞蹈症动物模型,发现许多microRNA在纹状体和大脑皮层中的表达水平发生改变,且大多下调。发生改变的microRNA包括miR-9/9*、miR-29b、miR- 124a、miR-132、miR-128、miR-139、miR-122、miR-138、miR-23b、miR-135b、miR- 181(均下调)和miR-448(上调),类似的变化此前也在亨廷顿舞蹈症患者中发现过。在动物细胞研究中,发生改变的microRNA包括miR-9、miR-9*、miR-135b、miR-222(均下调)和miR-214(上调)。在动物模型中,miR-155 和 miR-196a 的过表达导致突变型亨廷顿蛋白 mRNA 和蛋白质水平下降,纹状体和皮质中的突变型亨廷顿蛋白聚集体降低,并改善行为测试中的表现。miR-132 和 miR-124 的过表达也使行为测试中的表现得到改善。在动物细胞模型中,miR-22 的过表达增加了感染突变型亨廷顿蛋白的大鼠原代皮质和纹状体神经元的活力,并减少了 ≥ 2 µm 的亨廷顿蛋白富集灶。此外,miR-22 的过表达提高了用 3-硝基丙酸处理的大鼠原代纹状体神经元的存活率。外源性表达 miR-214、miR-146a、miR-150 和 miR-125b 会降低 Hdh Q111 / Hdh Q111 细胞中内源性亨廷顿蛋白 mRNA 和蛋白质的表达。有必要对亨廷顿氏病动物模型进行进一步研究,以验证这些发现,并确定特定的microRNA,它们的过度表达可抑制突变亨廷顿蛋白的产生和其他有害过程,并可能为治疗亨廷顿氏病患者和减缓其进展提供更有效的方法。关键词:动物模型;大脑皮层;亨廷顿蛋白;亨廷顿氏病;microRNA;神经退行性;纹状体;治疗策略
当前的基因治疗模型涉及逆转录病毒介导的遗传材料转移到源自各种体细胞组织的细胞中,包括造血系统的细胞,成纤维细胞,肝细胞,内皮细胞和成肌细胞(1、2)。我们先前已经描述了一种通过小鼠皮肤成纤维细胞逆转录病毒感染的基因产物传递方法(3)。我们先前在成纤维细胞研究中使用的转导基因是人和狗因子IX cDNA(3,4)。尽管在组织培养中可以实现高水平的持续性,而当在啮齿动物的同种异体移植中移植时,这些成纤维细胞仅在短时间内就产生了大量因子IX(3,5)。从理论上讲,体内表达的短期可能归因于不同的因素:(i)宿主对外源性因子IX的免疫反应; (ii)移植后外国细胞的破坏; (IIM)一旦将转导细胞移植到动物的转移基因的转录基因转录的特异性下降。已经表明(3,5),植入改良的成纤维细胞后,对人类因子IX的抗体存在,这至少可以解释,部分原因是第IX因子的短期。在这项工作中,使用不同的启动子来控制8-半乳糖苷酶的表达,我们证明,在组织培养中,长期表达可以轻松获得,但指导感兴趣基因转录的启动子的类型可能是决定体内长期表达的关键因素之一。
我们使用GEO2R使用了微阵列数据集GSE56808(3)和GSE68608(4)对ALS患者细胞和组织的这种差异基因表达分析。GSE56808是使用Affymetrix人基因组U133加上2.0阵列技术生成的,n = 6个对照成纤维细胞,n = 6 ALS患者成纤维细胞;使用了平台GPL570。GSE68608是使用Affymetrix人类基因组U133加上2.0阵列技术的n = 3运动神经元和n = 8 ALS患者运动神经元的2.0阵列技术;使用了平台GPL570。P值调整的Benjamini -Hochberg方法用于对差异表达进行排名,但原始的P值用于评估全局差异表达的统计显着性。对数字转换,并使用了NCBI生成的平台注释类别。使用两尾t检验进行了统计检验,以评估患者和对照成纤维细胞之间的PDCD6表达是否显着差异。
结果与讨论:发现了基因表达较高或较低的突变体,最终成熟谷物植酸酶活性 (MGPA) 较高或较低。田间试验和发芽期间的肌醇磷酸分析表明,PAPhy_a 不会影响试验条件下的农艺性能,但它确实缩短了发芽期间磷酸盐动员的滞后时间。较高的内源性 MGPA 可提高饲料用谷物质量,因为它可提高单胃动物的磷酸盐生物利用度。此外,由于 PAPhy_a 启动子的目标 CRE 基序与一系列种子表达基因(如关键的谷物和豆类储存基因)共享,因此当前结果展示了一种调节一系列种子基因的单个基因表达水平的概念。
影响运动神经元的神经退行性疾病,包括肌萎缩性侧索硬化症(ALS),没有治疗方案,通常是致命的(1,2)。我们利用了公正的,整个转录组差异基因表达分析的力量,利用原代患者细胞和组织来发现其表达使用已发表的数据定义零星ALS的基因(3,4)。我们在ALS患者的原代运动神经元中发现了PREX1的显着差异表达,编码了磷脂酰肌醇-3,4,5-三磷酸RAC交换因子1。prex1在从ALS患者中分离出的成纤维细胞中也有差异表达。与对照,未固定的成纤维细胞相比,ALS患者成纤维细胞的PREX1转录本在ALS患者成纤维细胞中存在较高水平。这些分析将开始定义ALS的转录格局。