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摄入单个引导 RNA 可通过激活 CRISPR 来诱导基因过度表达并延长秀丽隐杆线虫的寿命
秀丽隐杆线虫是一种用于研究发育和衰老遗传学的多功能模型生物，通过给线虫喂养表达特定 dsRNA 的细菌可以抑制其基因表达。之前已证实通过常规转基因技术过表达缺氧诱导因子 1 ( hif-1 ) 或热休克因子 1 ( hsf-1 ) 可延长线虫寿命。然而，目前尚不清楚其他基因过表达方法是否可行，尤其是随着基于 CRISPR 的技术的出现。本文中，我们表明，给经过基因改造以稳定表达 Cas9 衍生的合成转录因子的秀丽隐杆线虫喂养表达启动子特异性单向导 RNA (sgRNA) 的细菌也可以激活基因表达。我们证明，通过摄取针对 hif-1 或 hsf-1 各自启动子区域的 sgRNA 激活 CRISPR 可增加基因表达并延长秀丽隐杆线虫的寿命。此外，作为旨在使用 CRISPR 激活秀丽隐杆线虫的未来研究的计算机资源，我们提供了预测的启动子特异性 sgRNA 靶序列，用于超过 13,000 个秀丽隐杆线虫基因，并具有实验定义的转录起始位点。我们预计本文描述的方法和组件将有助于促进全基因组基因过表达研究，例如，通过将表达 sgRNA 的细菌喂给线虫来诱导转录，以识别衰老或其他感兴趣的表型的调节因子。
亨廷顿氏病动物模型中微小RNA表达的改变及潜在的治疗策略
摘要 回顾近年来的亨廷顿舞蹈症动物模型，发现许多microRNA在纹状体和大脑皮层中的表达水平发生改变，且大多下调。发生改变的microRNA包括miR-9/9*、miR-29b、miR- 124a、miR-132、miR-128、miR-139、miR-122、miR-138、miR-23b、miR-135b、miR- 181（均下调）和miR-448（上调），类似的变化此前也在亨廷顿舞蹈症患者中发现过。在动物细胞研究中，发生改变的microRNA包括miR-9、miR-9*、miR-135b、miR-222（均下调）和miR-214（上调）。在动物模型中，miR-155 和 miR-196a 的过表达导致突变型亨廷顿蛋白 mRNA 和蛋白质水平下降，纹状体和皮质中的突变型亨廷顿蛋白聚集体降低，并改善行为测试中的表现。miR-132 和 miR-124 的过表达也使行为测试中的表现得到改善。在动物细胞模型中，miR-22 的过表达增加了感染突变型亨廷顿蛋白的大鼠原代皮质和纹状体神经元的活力，并减少了 ≥ 2 µm 的亨廷顿蛋白富集灶。此外，miR-22 的过表达提高了用 3-硝基丙酸处理的大鼠原代纹状体神经元的存活率。外源性表达 miR-214、miR-146a、miR-150 和 miR-125b 会降低 Hdh Q111 / Hdh Q111 细胞中内源性亨廷顿蛋白 mRNA 和蛋白质的表达。有必要对亨廷顿氏病动物模型进行进一步研究，以验证这些发现，并确定特定的microRNA，它们的过度表达可抑制突变亨廷顿蛋白的产生和其他有害过程，并可能为治疗亨廷顿氏病患者和减缓其进展提供更有效的方法。关键词：动物模型；大脑皮层；亨廷顿蛋白；亨廷顿氏病；microRNA；神经退行性；纹状体；治疗策略
通过针对顺式调控元件突变的 FIND-IT 筛选优化大麦植酸酶基因表达
结果与讨论：发现了基因表达较高或较低的突变体，最终成熟谷物植酸酶活性 (MGPA) 较高或较低。田间试验和发芽期间的肌醇磷酸分析表明，PAPhy_a 不会影响试验条件下的农艺性能，但它确实缩短了发芽期间磷酸盐动员的滞后时间。较高的内源性 MGPA 可提高饲料用谷物质量，因为它可提高单胃动物的磷酸盐生物利用度。此外，由于 PAPhy_a 启动子的目标 CRE 基序与一系列种子表达基因（如关键的谷物和豆类储存基因）共享，因此当前结果展示了一种调节一系列种子基因的单个基因表达水平的概念。
兴趣的表达
1申请范围巴基斯坦安全印刷公司（Pvt。）ltd以下称为“采购代理”，邀请符合条件的顾问的兴趣表达顾问资格预先资格在巴基斯坦在巴基斯坦建立安全纸制造和钞票生产设施，此后有资格标准：2符合条件的顾问i。顾问可以是巴基斯坦的公司，公司，公共或半公开机构，也可以是“ C”或合资企业中提到的任何合格的外国。II。 在合资企业的情况下，合资伙伴签订的协议的副本应与其运作的条件，其持续时间（如果有）限制（如果有）授权代表和责任的人。 iii。 如果合资伙伴之间发生任何诉讼或仲裁程序，则采购机构不得影响任何诉讼或仲裁程序。 iv。 合资企业的至少一个合作伙伴应满足本协议中详细介绍的资格预审标准，或者双方都可以累计符合资格预审标准，在这些标准中，双方的能力都将加在一起进行评估。 在这两种情况下，每个合资伙伴应遵守“参考第7条第7.2（i）条或7.2（ii）第7条中提到的标准之一”，v。v。合资伙伴应提名一名单一项目经理，并共同执行项目，并应通过合法的授权委员会的律师签署的律师签署的权力来证明该授权。 vi。 vii。 VIII。 ix。II。在合资企业的情况下，合资伙伴签订的协议的副本应与其运作的条件，其持续时间（如果有）限制（如果有）授权代表和责任的人。iii。如果合资伙伴之间发生任何诉讼或仲裁程序，则采购机构不得影响任何诉讼或仲裁程序。iv。合资企业的至少一个合作伙伴应满足本协议中详细介绍的资格预审标准，或者双方都可以累计符合资格预审标准，在这些标准中，双方的能力都将加在一起进行评估。在这两种情况下，每个合资伙伴应遵守“参考第7条第7.2（i）条或7.2（ii）第7条中提到的标准之一”，v。v。合资伙伴应提名一名单一项目经理，并共同执行项目，并应通过合法的授权委员会的律师签署的律师签署的权力来证明该授权。vi。vii。VIII。 ix。VIII。ix。合资企业提交的任何EOI均应指示各方提出的任务的一部分，并且未经采购机构的书面书面批准并符合当局发布的任何指示。合资企业应通过其授权人员共同提交EOI，双方应分别和共同负责履行其本咨询分配的义务，并确保在此处完成所有可交付成果。邀请表达利益的邀请均可开放所有前瞻性咨询公司，但要遵守各个国家成立机构或为该特定贸易或业务建立的法定机构的任何成立或许可规定。如果以下情况，顾问可能没有资格：a）他被宣布为破产，或者在公司或公司的情况下
1。单细胞定量表达报告（SCQERS）
●将细胞和质粒混合到预燃烧的（ICE）1毫米比色杯以进行电穿孔（例如），非常小心地避免气泡（如果需要时，可以避免使用气泡，以避免气泡，移液器<25 ul）。将比色杯保持在冰上。●电塑料（例如Biorad Gene脉冲器，2 kV，200 𝛀，25 UF）。点击比色杯以消除气泡，并先用吸收纸从比色杯中擦拭冰/水。时间常数应在4.0至4.3 ms范围内。短时常数带有火花，表明出现问题。如果发生这种情况，请重复，减少质粒的量并注意气泡。●成功进行电穿孔后，立即添加475 UL恢复介质（例如SOC），转移到1.5 ml管，并在37℃下摇动。●串行稀释电穿孔，板块在氨苄青霉素板上的转化为0.1％，以评估转化效率。●您可以将电穿孔的细胞保持在4C，直到确认高效率，也可以用氨苄青霉素在LB中过夜（通常在250毫升250 mL烧瓶中，37C，37C，轨道振荡器200 rpm）。●确认高效率后（您应该在0.1％板中看到> 1000个菌落，对应于1m> 1m的转化剂），制作甘油库存以备将来使用，并通过mini或MIDI Prep纯化质粒或MIDI PREP，适用于下游克隆
意向书 (eoi)
（任务 1） 1. 背景和目标 绿色气候基金 (GCF) 资助的“在尼泊尔建设具有复原力的丘里亚地区”(BRCRN) 项目于 2019 年 11 月在 GCF 第 24 次董事会会议上获得批准。尼泊尔政府 (GoN) 森林和环境部 (MoFE) 和尼泊尔粮食及农业组织 (FAO) 作为执行实体共同实施该项目。除了执行机构外，粮农组织还是指定的认可实体，因此，负责向 GCF 全面实施该项目，覆盖尼泊尔东南部地区 26 个关键河流系统，覆盖科西、马德西和巴格马蒂省的部分地区。该项目旨在促进广泛采用具有气候复原力的土地使用做法，应对森林砍伐和森林退化挑战，更好地维护森林生态系统，并增强对气候引发的灾害的复原力。该项目为期七年，于 2020 年 5 月 12 日启动，将于 2027 年 5 月 11 日完成。在筹备阶段，粮农组织提供了大量技术支持，以制定河流系统的详细计划，即关键生态系统恢复计划 (CERP)。另一方面，财政部在联邦一级建立并主持了一个项目管理单位 (PMU) 和三个省级支持团队，即各省的省级项目管理单位 (PPMU)。PPMU 负责在各级政府、民间社会组织 (CSO) 和社区组织 (CBO) 等利益相关者的积极参与下实施项目。林业和环境部已委派政府工作人员填补 PMU 和 PPMU 中一些已获批准的职位，负责 BRCRN 项目的日常实施。由于财政部委派的工作人员在数量和技术能力方面不足以实施项目活动，因此必须分配额外的人力资源来满足要求。为此，BRCRN 打算从一家合格的服务提供商（一家咨询公司）采购服务，以提供所需的人力资源来填补这一空白，并支持 PMU 和 PPMU 实施项目。2. 咨询公司的工作范围
AHNAK在肌萎缩性横向硬化症中的差异表达。
我们使用GEO2R使用了微阵列数据集GSE56808（3）和GSE26276（4）对ALS患者细胞和组织的这种差异基因表达分析。GSE56808是使用Affymetrix人基因组U133加上2.0阵列技术生成的，n = 6个对照成纤维细胞，n = 6 ALS患者成纤维细胞；使用了平台GPL570。GSE26276是使用Affymetrix人基因1.0 ST阵列技术生成的，N = 3对照骨骼肌和n = 3 ALS患者骨骼肌；使用了平台GPL6244。P值调整的Benjamini -Hochberg方法用于对差异表达进行排名，但原始的P值用于评估全局差异表达的统计显着性。对数字转换，并使用了NCBI生成的平台注释类别。使用两尾t检验进行了统计检验，以评估患者和对照成纤维细胞之间的AHNAK表达是否显着差异。
肌萎缩性侧硬化症中serpina3的差异表达。
影响运动神经元的神经退行性疾病，包括肌萎缩性侧索硬化症（ALS），没有治疗方案，通常是致命的（1，2）。我们利用了无偏的全转录组差异基因表达分析的力量，利用原代患者细胞和组织来发现其使用已发表的数据定义ALS的基因（3，4）。我们发现，在ALS患者的主要运动神经元中编码SERPIN家族A成员3的Serpina3的显着差异表达。serpina3在ALS患者的骨骼肌中也有差异表达。与对照运动神经元相比，ALS患者运动神经元的SERPINA3转录本在ALS患者运动神经元中存在明显更高的水平。这些分析将开始定义ALS的转录格局。
pDCD6在肌萎缩性侧硬化症中的差异表达。
我们使用GEO2R使用了微阵列数据集GSE56808（3）和GSE68608（4）对ALS患者细胞和组织的这种差异基因表达分析。GSE56808是使用Affymetrix人基因组U133加上2.0阵列技术生成的，n = 6个对照成纤维细胞，n = 6 ALS患者成纤维细胞；使用了平台GPL570。GSE68608是使用Affymetrix人类基因组U133加上2.0阵列技术的n = 3运动神经元和n = 8 ALS患者运动神经元的2.0阵列技术；使用了平台GPL570。P值调整的Benjamini -Hochberg方法用于对差异表达进行排名，但原始的P值用于评估全局差异表达的统计显着性。对数字转换，并使用了NCBI生成的平台注释类别。使用两尾t检验进行了统计检验，以评估患者和对照成纤维细胞之间的PDCD6表达是否显着差异。
IL-27 表达调控及其对抗病毒适应性免疫的影响
IL-27 是 IL-6/IL-12 细胞因子超家族的成员，主要由抗原呈递细胞分泌，特别是树突状细胞、巨噬细胞和 B 细胞。IL-27 具有抗病毒活性，可调节针对病毒的先天和适应性免疫反应。IL-27 在病毒感染环境中的作用尚不明确，促炎和抗炎功能均有描述。在这里，我们讨论了 IL-27 在几种人类疾病病毒感染模型中的作用的最新进展。我们重点介绍了 IL-27 表达调控的重要方面、感染不同阶段的关键细胞来源及其对细胞介导免疫的影响。最后，我们讨论了在人类慢性病毒感染的背景下更好地定义 IL-27 的抗病毒和调节（促炎与抗炎）特性的必要性。