。cc-by 4.0国际许可证(未经同行评审证明)获得的是作者/资助者,他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可,以永久显示预印本。是
图S2。 通过蛋白质印迹评估的GADD45αshRNA的沉默效率。 gADD45α蛋白表达水平在(a)MHCC -97H和(b)用NC和三个靶向GADD45α的SHRNA后的HUH7细胞中。 基于GADD45α蛋白的表达,SH2的沉默是最重要的,用于随后的实验。 数据表示为平均值±SD(n = 3)。 ** p <0.01。 GADD45α,生长停滞和DNA损伤诱导α; NC,阴性对照; SH,短发夹。图S2。通过蛋白质印迹评估的GADD45αshRNA的沉默效率。gADD45α蛋白表达水平在(a)MHCC -97H和(b)用NC和三个靶向GADD45α的SHRNA后的HUH7细胞中。基于GADD45α蛋白的表达,SH2的沉默是最重要的,用于随后的实验。数据表示为平均值±SD(n = 3)。** p <0.01。GADD45α,生长停滞和DNA损伤诱导α; NC,阴性对照; SH,短发夹。
(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。该版本的版权持有人本版本发布于2023年5月15日。 https://doi.org/10.1101/2023.05.10.540284 doi:Biorxiv Preprint
具有CRISPR-CAS9的基因组工程中的长期障碍一直无法衡量Cas9编辑结果及其在单细胞分辨率下的功能效应。在这里,我们提出了Superb-Seq,这是一种利用T7原位转录和单细胞RNA测序的新技术,以共同测量靶向靶标Cas9编辑及其对基因表达的影响。我们在10,000 k562细胞上进行了高级seq,靶向了四个用七个引导RNA的染色质重塑基因。Superb-Seq在所有七个目标站点和其他36个非目标位点上确定了11,891个编辑事件。尽管选择了七个指南的高特异性,但其中有六个导致靶向脱靶编辑,频率从0.03%到18.6%的细胞范围不等。在USP9X的第一个内含子中,明显的脱靶编辑破坏了该基因的表达和超过150个下游基因。总而言之,由于罕见和常见的编辑事件的结合,CAS9非目标是普遍存在的,主要发生在靶向基因的内含子内,并且可以对基因表达产生广泛的影响。Superb-Seq使用现成的套件,标准设备,并且不需要病毒,这将使全基因组CRISPR屏幕能够在不同的细胞类型中以及与临床相关的指南的功能表征。
yarrowia lipolytica是异源蛋白质产生的替代酵母。Based on auto-cloning vectors, a set of 18 chromogenic cloning v ectors w as dev eloped, each containing one of the excisa b le auxotr ophic selecti v e markers URA3 e x, LYS5 e x, and LEU2 e x, and one of six different promoters: the constitutive pTEF, the phase dependent hybrid pHp4d, and the来自PEYK1和PEYL1 deri v ati v es的红氨酸诱导启动子。这些V eTor允许提高感兴趣基因的克隆速度。同时,通过废除细丝并引入了赖氨酸(LYS-)的合理性,开发了一种新的RPROT受体菌株JMY8647,这是基因工程的附加标记。使用此克隆str at gy,这是根茎的最佳靶向序列,如确定。与用野生型ROL信号序列相比,在八个靶向序列中,SP6信号序列在脂肪酶活性中提高了23%。使用杂种Ythritol-inducib le pr opters phu8eyk和peyl1-5ab(1.9和2.2次)与constituti v e ptef pr emoter进行比较时,使用YTHRITOL-Inducib le premoters phu8eyk和Peyl1-5ab(Peyl1-5ab)进行。 两次拷贝str ains在PTEF单子镜菌株上产生3.3倍的脂肪酶活性(266.7对79.7 mu/mg)。。两次拷贝str ains在PTEF单子镜菌株上产生3.3倍的脂肪酶活性(266.7对79.7 mu/mg)。
1 Childhood Genetic Diseases, Sorbonne University, Inserm, Armand-Trousseau Hospital, Paris, F-75012, France 2 Genomic Medicine Service, Public Assistance Hospitals de Paris (AP-HP), University of Paris, Cochin Hospital, Paris, F-75014, France 3 Service of Oto-Rhin-Laryngology and Cervico-Facial Surgery, AP-HP, Bicêtre Le Kremlin-Bicêtre医院,F-94270,法国4 Institut Mondor de Recherche Biomedique,Paris-Paris-Es-Créteil大学,INSERM U955,CNRS ERL7240,Hénri-Mondor Hospital,Créteil,France france france for Persir forsir forsir forsir forsity persisy for Persir persiration persir persirice crame,crénri-bord Hospital,france for persir cumpiritiation pessir, AP-HP,Sorbonne University,Armand-Trousseau医院,巴黎,F-75012,法国6儿科,Chu Grenoble Alpes,Grenoble,Grenoble,F-38500,F-38500,F-38500,7肺气学和儿科过敏症服务法国克雷特尔市CréteilIntermunal医院中心,法国94000,9分子遗传学,AP-HP,AP-HP,Armand-Trousseau医院,巴黎,F-75012,巴黎10号,巴黎10染色体遗传学,AP-HP,AP-HP,Trousseau,Trousseau医院,巴黎,HONT HOSTER CERMENT,FRASE HOSTER SURM SUUN SUUN Surry Surry intercortial Surrim intercorter Intercorment Intercorment Interri criri-cerrim criri surry-criri-criri-criri-criri incer intercrien incrigh克雷特尔(Créteil),克雷特尔(Créteil),F-94000,法国
Anders Etzerodt 1,Jakob S. Pedersen 3,4,6,Russell W. Jenkins 7.8.9,SørenE. Degn 1,SørenK. Moestrup 1,Anders Etzerodt 1,Jakob S. Pedersen 3,4,6,Russell W. Jenkins 7.8.9,SørenE. Degn 1,SørenK. Moestrup 1,
Duchenne肌肉营养不良(DMD)是一种X连锁疾病,是由DMD基因突变引起的,导致逐渐浪费肌肉和无力。目前无法治愈DMD。BL10-MDX小鼠是临床前DMD研究中最常用的模型,但与DMD患者相比,它表现出温和的疾病表型,从而限制了研究的可转换性。较新的D2-MDX小鼠在很小的时候就具有更严重的表型,并且可以更好地概括人类疾病。将这些小鼠模型与定量RT-PCR,稳定且可靠的参考基因进行比较是必不可少的。We aimed to evaluate the stability and reliability of a panel of nine candidate reference genes ( Actb, Ap3d1, Gapdh, Hmbs, Htatsf1, Pak1ip1, Rpl13a, Sdha and Zfp91 ) in the gastrocnemius, diaphragm and heart of mice from both strains and their corresponding wild types aged 4 to 52 weeks.使用Genorm,最佳门将,三角肌和Normfinder分析数据。我们发现HTATSF1,PAK1IP1和ZFP91是合适的参考基因,用于在营养不良和健康小鼠中基因表达的标准化,无论组织类型或年龄如何。在我们的手中,ACTB,GAPDH和RPL13A不适合作为参考基因,表现出组织,年龄或疾病特定的表达变化。这项研究强调了选择合适的参考基因的重要性,因为它们的稳定性在特定的实验设置之间可能有所不同。
EBI2受体的内源配体,氧化酚7α,25OHC,至关重要的免疫反应,受CH25H,CYP7B1和HSD3B7酶的细节调节。淋巴样细胞和T细胞卵泡中的卵泡树突状细胞保持7α,25OHC的梯度,基质细胞增加,树突状细胞降低了其浓度。该梯度对于淋巴组织中适当的B细胞定位至关重要。在多发性硬化症的动物模型中,实验性自身免疫性脑脊髓炎,7α的水平,25OHC迅速增加了中枢神经系统的迅速增加,驱动EBI2通过血脑屏障(BBB)表达免疫细胞的迁移。要探索脑中的血管细胞是否表达这些酶,我们检查了正常的小鼠脑微孔塞尔,并研究了它们在炎症过程中表达的变化。EBI2在内皮细胞,周细胞/平滑肌细胞和星形胶质细胞端层中大量表达。CH25H,CYP7B1和HSD3B7在每种细胞类型中都被多样检测,这表明它们在氧化酚7α,25OHC合成和在不同条件下的梯度维持和梯度维持。在EBI2中出现了明显的物种特异性差异以及小鼠和人类BBB形成细胞之间的酶水平。在急性炎症条件下,EBI2和合成酶调节下发生在大脑中,基于酶的大小和方向。最后,在体外星形胶质细胞迁移模型中,CYP7B1抑制剂氯吡唑以及EBI2拮抗剂NIBR189抑制了脂多糖诱导的细胞迁移,表明EBI2及其在炎症下脑细胞迁移的脑细胞迁移中的配体受到了侵略。
抽象目标:人乳头瘤病毒(HPV)是头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)的危险因素,该癌症目前正在全球范围内增加。与45岁患者相比,HNSCC患者的HPV DNA和P16表达的患病率<45岁。方法:自2005年以来在贝斯卡孙大学医院出席的39名患者在这项回顾性研究中包括了HNSCC。HPV DNA,并使用石蜡嵌入的组织通过免疫组织化学确定p16表达。包括来自贝斯卡恩大学医院的38名45岁患者的匹配组。结果:HPV感染的总体患病率为11.7%。HPV16是4/39和5/38例患者中唯一检测到的基因型,而P16分别在6/39和4/38岁的患者中表达了<45岁和45岁。HPV16是4/39和5/38例患者中唯一检测到的基因型,而P16分别在6/39和4/38岁的患者中表达了<45岁和45岁。