XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search Systemlycopersicum
番茄细菌性斑点病抗性育种进展与挑战
摘要：细菌性斑点病是番茄的一种严重病害，由至少四种黄单胞菌引起。这些菌种包括X. euvesicatoria（T1 菌种）、X. vesicatoria（T2 菌种）、X. perforans（T3 和 T4 菌种）和 X. gardneri，每组菌种的地理分布不同。目前，X. gardneri 和 X. perforans 是北美番茄的两种主要细菌性病原体，其中 X. perforans（T4 菌种）在东海岸占主导地位，而 X. gardneri 在中西部占主导地位。该病害可导致高达 66% 的产量损失。由于缺乏有效的化学防治措施和商业抗性品种，该病害的管理具有挑战性。尽管已经鉴定出主要的抗性基因（R）和数量抗性，但抗细菌性斑点病的番茄育种受到多种因素的阻碍，包括克服抗性的病原体新种群的出现、抗性的多基因控制、连锁累赘、抗性的非加性成分以及幼苗测定和田间抗性之间的低相关性。含有 Bs2 和 EFR 基因的转基因番茄对多个黄单胞菌种群均有效。然而，由于公众的担忧和复杂的监管流程，它尚未实现商业化。基因组学辅助育种、基于效应的基因组学育种和基因组编辑技术可能是实现番茄持久抗细菌性斑点病的新方法。本文的主要目的是了解番茄细菌性斑点病的现状，包括其分布和病原体多样性、疾病管理中的挑战、抗病来源、抗性遗传学和育种，以及新育种方法的未来前景。
栽培番茄（Solanum lycopersicum）无DNA基因组编辑及原生质体再生方法的建立
摘要 关键信息 我们建立了一种基于核糖核蛋白的CRISPR/Cas9无DNA基因组编辑方法在栽培番茄中应用，并获得了高突变率的转染原生质体再生突变植株。 摘要 近年来，基因组编辑作为一种研究和育种方法的应用为许多作物的性状改良提供了许多可能性。在栽培番茄（Solanum lycopersicum）中，迄今为止只建立了携带CRISPR/Cas9试剂的稳定的农杆菌介导转化方法。转染原生质体芽再生是基于核糖核蛋白的CRISPR/Cas9无DNA基因组编辑方法在栽培番茄中应用的主要瓶颈。在本研究中，我们报道了利用CRISPR/Cas9技术实现栽培番茄的无转基因育种方法，包括优化原生质体分离和克服转染原生质体芽再生障碍。结果表明，含0.1 mg/L IAA和0.75 mg/L玉米素的芽再生培养基为最佳激素组合，再生率可达21.3%。原生质体分离转染4个月后，成功获得高突变率的再生植株。获得的110株再生M 0 植株中，有35株（31.8%）同时发生SP和SP5G基因突变，SP或SP5G基因中至少一个等位基因的编辑效率高达60%。
使用16S rRNA和宏基因组续集的研究
番茄果实成熟是由关键基因的脱甲基触发的，这会改变其转录水平，从而启动和传播一系列的生理事件。未知的是，当使用后票后实践成熟水果以扩展保质期时，这些过程如何改变，因为这些实践通常会降低水果的质量。为了解决这个问题，评估了处理后处理诱导的果实DNA甲基甲基和转录组的变化，以及它们如何与成熟速度相关，并评估了乙烯，脱甲酸和类胡萝卜素等成熟指标。这项研究通过动态分子变化全面连接生理事件的变化。成熟的果实在20℃，12.5℃或5℃冷却后达到“转动”（t），将其与新鲜的水果“ FHT”进行了比较。储存在12.5℃的水果具有最大的表观遗传标记和基因表达的改变，超过了后冷却后引起的变化。果实生理和年代年龄在12.5℃下取消耦合，因为成熟时间是最长的。成熟到12.5℃的果实成熟并不是最新的。没有呼吸道或乙烯爆发，而是脱落酸含量很高。在甲基化组和转录组中明显明显的后脱水和“ FHT”之间的明显差异。在“ FHT”果实中光合基因和叶绿素水平的较高表达表现为光明，因为它影响了果实成熟的分子变化。最后，对由DNA甲基化调节的基因的 - 组数据的相关分析。总体而言，这些数据改善了我们对番茄果实成熟方式如何通过后票后实践改变的解释，并且期望长期有助于提高水果质量。
基于机器学习的番茄 ( Solanum lycopersicum ) 植物疾病分类 = 基于机器学习的番茄 ( Solanum lycopersicum )植物疾病分类
在孟加拉国，番茄种植面临重大挑战，因为它易受各种微生物、寄生虫和细菌感染。通常，这些疾病的早期症状首先出现在根部和叶子中，使及时检测变得复杂。这项研究解决了及时准确检测番茄植株疾病的挑战，这对于有效的植物保护管理至关重要。传统的人工检查方法既耗时又主观，导致实施必要的保护措施的延误。因此，使用图像处理技术和机器学习算法快速可靠地检测番茄植株叶片中的疾病，旨在简化化学应用反应的检测过程。在不同光强度、视线角度和距离下捕获了一个包含 250 张番茄植株叶片图像的数据集。应用图像增强技术来增加数据集，共得到 529 张图像。这些图像被转换为 LAB 彩色图像，然后使用 OTSU 算法分割叶片图像并估计受影响患病区域的百分比。还从分割的叶片图像中提取了各种纹理特征以创建训练数据集。机器学习算法，包括支持向量机 (SVM)、K 近邻 (KNN) 和决策树，都使用该数据集进行训练和评估，以将图像分类为健康或患病。二次 SVM 算法为该数据集提供了 97.7% 的最高测试准确率。这种非破坏性处理对于提高疾病检测效率和减少番茄生产损失有着巨大的希望，无论是在孟加拉国当地还是全球。
转录因子的基因沉默，敲除和过表达
摘要背景：番茄（Solanum lycopersicum L.）是全球经济上有价值的作物。由于使用无菌性雄性会降低F1种子产量的成本，因此男性不育的创新对于番茄育种具有重要意义。中止的微孢子基因（AMS）编码为基本的螺旋 - 环螺旋（BHLH）转录因子编码，以前已被指定为拟南芥和水稻中tape虫发育的必不可少的基因。确定SLAM基因的功能（来自S. lycopersicum的AMS基因），并验证它是否是产生番茄中雄性无菌性的潜在候选基因，我们使用病毒诱导的基因沉默（VIGS），CRIS/CAS9介导的介导的基因组编辑和过度表达技术来通过AgrobstermaTer transfote transfortium tomato tonrestim tonrection tonrys tomato。结果：在这里，来自S. lycopersimum的1806 bp的全长猛击基因（登录号MK591950.1）从花粉cDNA克隆。花粉颗粒染色的结果表明，猛击的不可行的花粉比例 - 沉默（75％）， - 敲除（89％）和超过表达植物（60％）明显高于野生型植物（小于10％； p <0.01）。在三种情况下，不可生存的花粉颗粒的形态似乎是四方，循环，萎缩，萎缩或以其他方式形状的形态，而野生型的形态则显得椭圆形和丰满。更重要的是，QRT-PCR分析表明，在大满贯和敲除的植物的花药中的猛击的表达明显低于野生型的表达（p <0.01），但在大量过表达的植物中的表达（p <0.01）（p <0.01）。
通用rRNA耗竭用于任何有机体的转录组分析
表1。从八个物种制备的无核能总RNA文库中检测到的％rRNA值和基因数量。通用的人/小鼠/大鼠参考RNA，牛胎盘RNA，番茄和小麦叶RNA以及从沉淀的绿藻细胞中提取的RNA和内部成年酵母菌培养物用作输入（每位图书馆100 ng）。每个库的数据分析使用了3000万读对（150 bp配对）。修剪大奖！v0.6.6，Star v2.6.1d，Samtools v1.9和farmaturecounts v2.0.1用于修剪，对齐，过滤/索引和读取计数分配。RRNA基因/外显子的分类及其读取是基于UCSC基因组浏览器的注释和retoMasker rRNA轨道的基础。 用于分析的参考基因组是组件GRCH38（H。SAPIENS），CRCM39（M。MUSCULUS），RNOR_6.0（R。NORVEGICUS），ARS-UCD1.2（B. Taurus），SL3.0，SL3.0，SL3.0（S. lycopersicum），IWGSC（iwgsc），IWGSC（iwgsc），iwgsc（iwgscim），chlamans，C。c. c. c. c. c. c. c. anasen nasunson。 Reinhardtii）来自Ensembl和Refseq的ASM18296V3（C. albicans）。 tpm，百万分的成绩单。RRNA基因/外显子的分类及其读取是基于UCSC基因组浏览器的注释和retoMasker rRNA轨道的基础。用于分析的参考基因组是组件GRCH38（H。SAPIENS），CRCM39（M。MUSCULUS），RNOR_6.0（R。NORVEGICUS），ARS-UCD1.2（B. Taurus），SL3.0，SL3.0，SL3.0（S. lycopersicum），IWGSC（iwgsc），IWGSC（iwgsc），iwgsc（iwgscim），chlamans，C。c. c. c. c. c. c. c. anasen nasunson。 Reinhardtii）来自Ensembl和Refseq的ASM18296V3（C. albicans）。tpm，百万分的成绩单。
CAS9商业番茄品种的基因组编辑
1。简介番茄（Solanum lycopersicum l。）是世界上几乎每个国家的田野和温室条件中广泛种植的世界主要蔬菜作物之一（Singh等，2017）。商业生产的西红柿被新鲜食用或用于生产番茄的产品。除了成为维生素A，C，K和钾的良好来源外，西红柿还与许多健康益处有关，因为其丰富的代谢物（如植物营养素，番茄红素和类胡萝卜素）（Tanambell等人，2019年）。其在食品行业的高消费和利用率导致番茄产量稳定，尤其是近年来。番茄也被用作模型植物，以了解水果质量改善，植物生殖增强和植物功能基因组学的遗传背景（Khan等，2006）。
在肥胖症治疗中的新兴使用Ozempic®
摘要本研究旨在回顾有关西红柿，类胡萝卜素，尤其是番茄红素的当前知识，突出了其健康益处以及可持续使用番茄加工行业的可能性。属于甲壳虫家族，西红柿（Solanum lycopersicum L.）是世界上最消耗的蔬菜之一，以Natura形式和工业化产品都赞赏。番茄行业产生了大量的废物，其管理不足会带来环境障碍，以及浪费有价值的生物活性化合物，例如高抗氧化剂番茄红素，其消耗与某些类型的癌症和心血管疾病的降低风险有关。创新和可持续的提取方法，例如使用绿色溶剂和超临界液体辅助技术，超声波和其他技术，以优化 - 生产的使用，从而为循环经济和可持续性做出贡献。有必要促进克服当前的挑战并促进解决方案，以减少环境影响，高效且可持续的提取，降低成本降低和提取技术的可扩展性，旨在为各种应用获得价值增值产品。关键字：西红柿；番茄红素；生物活性化合物；可持续提取；生产工业。属于Solanaceae家族，番茄（Solanum lycopersicum L.）是全球播放的蔬菜之一，既欣赏新鲜和加工产品。摘要本研究旨在回顾有关西红柿和类胡萝卜素（尤其是番茄红素）的当前知识，突出了它们的健康益处以及对西红柿加工行业的副产品的可持续利用。番茄行业产生了大量的废物，不正确的管理可能会引起环境问题，除了导致失去有价值的生物活性化合物（例如番茄红素）。番茄红素具有较高的抗氧化能力，其消耗与某些类型的癌症和心血管疾病的风险降低有关。创新和可持续的提取方法，包括使用绿色溶剂和绿色溶剂和技术，例如超临界液体，超声辅助和其他新兴技术，以优化这些副产品的价值，从而有助于循环经济和可持续性。需要进一步的研究来克服当前的挑战，并促进解决方案，以减少环境影响，实现高效且可持续的提取，降低成本以及提高提取技术的可伸缩性，从而为各种应用获得高价值产品。关键字：番茄；番茄红素；生物活性化合物；可持续提取；工业副产品。Resumen Este estudio tiene como objetivo revisar el conocimiento actual sobre el tomate y los carotenoides, especialmente el licopeno, destacando sus beneficios para la salud y las posibilidades de aprovechamiento sostenible de los subproductos de la industria del procesamiento del tomate.属于Solanáceas家族，El Tomate（Solanum lycopersicum L.）是世界上消费最多的蔬菜之一，以其新鲜的形式非常赞赏
番茄野生近缘种在培育无病品种中的作用
摘要：栽培番茄（Solanum lycopersicum）是世界上经济价值最高、种植最广泛的蔬菜作物之一。然而，番茄植株经常受到生物和非生物胁迫的影响，从而降低产量并影响果实品质。栽培番茄的表型多样性很明显，特别是园艺性状，但遗传多样性相当狭窄。针对病毒、真菌、细菌和线虫等不同病原体的主要抗病基因主要来自野生番茄品种，并渗入栽培番茄中。在这里，我们列出了在 S. pimpinellifolium、S. habrochaites、S. peruvianum、S. chilense、S. pennellii、S. galapagense、S. arcanum 和 S. neorickii 中发现的主要病虫害抗性基因，并展望了当前对番茄野生近缘种的了解与所需了解之间的差距。
番茄工程可生产出更大、含糖量更高的果实
北京中国农业科学院遗传学家领导的团队利用 CRISPR-Cas9 技术识别了番茄品种 Solanum lycopersicum 中控制糖含量的一对基因：钙依赖性蛋白激酶 27（SlCDPK27 或 SlCPK27）及其同源物 SlCDPK26。研究人员称，这些基因通过降解负责蔗糖生产的酶，充当番茄的“糖制动器”。只需使这两个基因失活，新品种的果实中的葡萄糖和果糖含量就会比普通的大规模生产番茄高出 30%。更重要的是，这样做不会导致果实大小或总量发生可测量的变化。基因改变不会降低产量，他们发现的唯一其他差异是番茄产生的种子更少，而且更小。他们认为消费者可能会喜欢这个附加功能。