请在我们身份验证您的情况下等待...2016年贝叶斯分析学会的2016年奖项获得了这本著名的书,现在是第三版,被广泛认为是贝叶斯方法的主要文本,它因其实用和可访问的方法来分析数据和解决研究问题而受到赞扬。介绍先进的方法,文本具有从真实应用和研究中得出的众多工作示例,强调在本版中使用贝叶斯推断在实践中的实践中使用了四章,这些章节是关于非参数建模的四章,以及关于弱小的先验,避免边界的先验,跨越的先验,交叉竞争和预测信息的宣布,在三个方面使用的学生的最新章节:原则;对于研究生,它提出了贝叶斯建模和计算的有效当前方法;对于研究人员而言,它在应用统计数据中提供了各种贝叶斯方法的其他材料,包括数据集,选定练习的解决方案和软件说明,在书的网页上提供了一些研究人员,强调了在组织科学中使用贝叶斯方法进行数据分析的重要性。 但是,在采用贝叶斯方法时,仍然存在一些挑战和局限性。 例如,一个问题是贝叶斯方法需要指定先前的分布,这可能很困难,尤其是在使用复杂模型时。 Berger,J。2016年贝叶斯分析学会的2016年奖项获得了这本著名的书,现在是第三版,被广泛认为是贝叶斯方法的主要文本,它因其实用和可访问的方法来分析数据和解决研究问题而受到赞扬。介绍先进的方法,文本具有从真实应用和研究中得出的众多工作示例,强调在本版中使用贝叶斯推断在实践中的实践中使用了四章,这些章节是关于非参数建模的四章,以及关于弱小的先验,避免边界的先验,跨越的先验,交叉竞争和预测信息的宣布,在三个方面使用的学生的最新章节:原则;对于研究生,它提出了贝叶斯建模和计算的有效当前方法;对于研究人员而言,它在应用统计数据中提供了各种贝叶斯方法的其他材料,包括数据集,选定练习的解决方案和软件说明,在书的网页上提供了一些研究人员,强调了在组织科学中使用贝叶斯方法进行数据分析的重要性。但是,在采用贝叶斯方法时,仍然存在一些挑战和局限性。例如,一个问题是贝叶斯方法需要指定先前的分布,这可能很困难,尤其是在使用复杂模型时。Berger,J。一些研究人员提出了各种技术来提出专家判断以告知先前分布的技术。,例如,O'Hagan等。(2006)提供了先前启发的综合指南,包括技术和潜在的陷阱。其他研究的重点是开发使用贝叶斯先验的专家的信念的方法(例如,Johnson等,2010)。此外,还有各种可用的在线资源可以帮助进行贝叶斯分析。例如,Van de Schoot的在线统计培训提供了有关高级统计主题的教程和练习。总的来说,在组织科学中使用贝叶斯方法的使用变得越来越重要,但是它需要仔细考虑先前的分布和启发技术,以确保准确的结果。注意:我已经删除了一些特定的参考,并重点介绍了要点。让我知道您是否希望我保留更多原始文本!van de de Schoot-Hubeek,W.,Hoijtink,H.,Van de Schoot,R.,Zondervan-Zwijnenburg,M。&Lek,K。评估专家判断引发程序,以相关性和应用于贝叶斯分析。客观的贝叶斯分析:对主观贝叶斯分析的案例,批评和个人观点。Brown,L。D.经验贝叶斯和贝叶斯方法的现场测试,用于击球平均赛季预测。Candel,M。J.,Winkens,B。Monte Carlo研究在纵向设计中多级分析中的经验贝叶斯估计值的性能。Ibrahim,J。G.,Chen,M。H.,Gwon,Y。Ibrahim,J。G.,Chen,M。H.,Gwon,Y。darnieder,W。F.贝叶斯方法依赖数据依赖的先验。&Chen,F。权力先验:具有统计功率计算的理论和应用。Muthen,B。,Asparouhov,T。贝叶斯结构方程建模:使用数据依赖性先验对实体理论的更灵活的表示。Rietbergen,C.,Klugkist,I.,Janssen,K。J.,Moons,K。G.&Hoijtink,H。将历史数据纳入随机治疗试验的分析中,以及基于系统文献搜索和专家精力提示的知识的贝叶斯PTSD-Traigntory分析。van der Linden,W。J.在自适应测试中使用响应时间进行项目选择。Wasserman,L。使用数据依赖性先验对混合模型的渐近推断。请注意,我保留了您的消息的原始语言而不翻译。给定文本:释义此文本:数据(版本V1.0)。Zenodo(2020)。元素Google Scholar Chung,Y.,Gelman,A.,Rabe-Hesketh,S.,Liu,J。&Dorie,V。层次模型中协方差矩阵的点估计值较弱。J.教育。行为。Stat。40,136–157(2015)。Google Scholar Gelman,A.,Jakulin,A.,Pittau,M。G.&Su,Y.-S。 logistic和其他回归模型的弱信息默认分布。ann。应用。Stat。2,1360–1383(2008)。MathScinetMath Google Scholar Gelman,A.,Carlin,J。 B.,Stern,H。S.&Rubin,D。B. 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Chem。 物理。 21,1087–1092(1953).ADS数学Google Scholar Hastings,W。K. Monte Carlo采样方法使用Markov链及其应用。 Biometrika 57,97–109(1970).Mathscinet Math Google Scholar Duane,S.,Kennedy,A。D.,Pendleton,B。J. &Roweth,D。Hybrid Monte Carlo。 物理。 Lett。 J. am。 Stat。 合作。J. Chem。物理。21,1087–1092(1953).ADS数学Google Scholar Hastings,W。K. Monte Carlo采样方法使用Markov链及其应用。Biometrika 57,97–109(1970).Mathscinet Math Google Scholar Duane,S.,Kennedy,A。D.,Pendleton,B。J.&Roweth,D。Hybrid Monte Carlo。物理。Lett。 J. am。 Stat。 合作。Lett。J.am。Stat。合作。b 195,216–222(1987)。&Wong,W。H.通过数据增强计算后验分布。82,528–540(1987)。 本文解释了当直接计算感兴趣参数的后验密度时,如何使用数据扩展。马尔可夫链蒙特卡洛手册(CRC,2011年)。 本书对MCMC及其在许多不同的应用中的使用进行了全面评论。Gelman,A。Burn-in MCMC,为什么我们更喜欢“热身”一词。 元建模,因果推理和社会科学(2017)。Gelman,A。 &Rubin,D。B. 使用多个序列从迭代模拟中推断。 Stat。 SCI。 7,457–511(1992)。 一般方法用于监测迭代模拟的收敛性。 J. Comput。 图。 Stat。 7,434–455(1998)。大型Google Scholar Roberts,G。O. Markov链链概念与采样算法有关。 马尔可夫链蒙特卡洛在实践中57,45-58(1996)。 (2020)提出了一种改进的\(\ hat {r} \)度量,用于评估马尔可夫链蒙特卡洛(MCMC)方法的收敛性。 他们建立在Bürkner(2017),Merkle和Rosseel(2015)和Carpenter等人的先前作品上。 (2017)。 关键参考包括Minka(2013),Hoffman等。 (2015),Liang等。 Q.82,528–540(1987)。本文解释了当直接计算感兴趣参数的后验密度时,如何使用数据扩展。马尔可夫链蒙特卡洛手册(CRC,2011年)。本书对MCMC及其在许多不同的应用中的使用进行了全面评论。Gelman,A。Burn-in MCMC,为什么我们更喜欢“热身”一词。元建模,因果推理和社会科学(2017)。Gelman,A。&Rubin,D。B.使用多个序列从迭代模拟中推断。Stat。SCI。 7,457–511(1992)。 一般方法用于监测迭代模拟的收敛性。 J. Comput。 图。 Stat。 7,434–455(1998)。大型Google Scholar Roberts,G。O. Markov链链概念与采样算法有关。 马尔可夫链蒙特卡洛在实践中57,45-58(1996)。 (2020)提出了一种改进的\(\ hat {r} \)度量,用于评估马尔可夫链蒙特卡洛(MCMC)方法的收敛性。 他们建立在Bürkner(2017),Merkle和Rosseel(2015)和Carpenter等人的先前作品上。 (2017)。 关键参考包括Minka(2013),Hoffman等。 (2015),Liang等。 Q.SCI。7,457–511(1992)。一般方法用于监测迭代模拟的收敛性。 J. Comput。 图。 Stat。 7,434–455(1998)。大型Google Scholar Roberts,G。O. Markov链链概念与采样算法有关。 马尔可夫链蒙特卡洛在实践中57,45-58(1996)。 (2020)提出了一种改进的\(\ hat {r} \)度量,用于评估马尔可夫链蒙特卡洛(MCMC)方法的收敛性。 他们建立在Bürkner(2017),Merkle和Rosseel(2015)和Carpenter等人的先前作品上。 (2017)。 关键参考包括Minka(2013),Hoffman等。 (2015),Liang等。 Q.一般方法用于监测迭代模拟的收敛性。J. Comput。图。Stat。7,434–455(1998)。大型Google Scholar Roberts,G。O. Markov链链概念与采样算法有关。马尔可夫链蒙特卡洛在实践中57,45-58(1996)。(2020)提出了一种改进的\(\ hat {r} \)度量,用于评估马尔可夫链蒙特卡洛(MCMC)方法的收敛性。他们建立在Bürkner(2017),Merkle和Rosseel(2015)和Carpenter等人的先前作品上。(2017)。关键参考包括Minka(2013),Hoffman等。(2015),Liang等。 Q.(2015),Liang等。Q.Q.新方法利用排序差异,折叠和本地化技术来增强\(\ hat {r} \)的准确性。此外,本综述强调了贝叶斯建模中变异推理方法的重要性,尤其是随机变体,这些变体是大型数据集或复杂模型的流行近似贝叶斯推理方法的基础。(2013),Kingma和BA(2014),Li等。 (2008),Forte等。 (2018),Mitchell和Beauchamp(1988),George和McCulloch(1993),Ishwaran和Rao(2005),Bottolo和Richardson(2010),Ročková和George(2014),Park和Park和Casella(2008),以及Carvalho等。 (2014)。 用于回归分析中的稀疏信号。 该框架利用连续的收缩先验来实现全局稀疏性,同时控制每个系数的正则化量。 该方法已广泛应用于各个领域,包括贝叶斯惩罚回归和多元变量选择。 其他相关研究包括为高斯状态空间模型的随机模型规范搜索,在结构化添加回归模型中进行功能选择的尖峰和刻录式先验以及多个高斯图形模型的贝叶斯推断。 L. F. B., Reich, B. J., Fuentes, M. & Dominici, F. Spatial variable selection methods for investigating acute health effects of fine particulate matter components are explored in the context of Biometrics (2015).MathSciNet MATH Google Scholar Additionally, research on Bayesian fMRI time series analysis with spatial priors is presented by Penny, W. D., Trujillo-Barreto, N. J. &Friston,K。J. Neuroimage(2005)。 咨询。 临床。(2013),Kingma和BA(2014),Li等。(2008),Forte等。 (2018),Mitchell和Beauchamp(1988),George和McCulloch(1993),Ishwaran和Rao(2005),Bottolo和Richardson(2010),Ročková和George(2014),Park和Park和Casella(2008),以及Carvalho等。 (2014)。 用于回归分析中的稀疏信号。 该框架利用连续的收缩先验来实现全局稀疏性,同时控制每个系数的正则化量。 该方法已广泛应用于各个领域,包括贝叶斯惩罚回归和多元变量选择。 其他相关研究包括为高斯状态空间模型的随机模型规范搜索,在结构化添加回归模型中进行功能选择的尖峰和刻录式先验以及多个高斯图形模型的贝叶斯推断。 L. F. B., Reich, B. J., Fuentes, M. & Dominici, F. Spatial variable selection methods for investigating acute health effects of fine particulate matter components are explored in the context of Biometrics (2015).MathSciNet MATH Google Scholar Additionally, research on Bayesian fMRI time series analysis with spatial priors is presented by Penny, W. D., Trujillo-Barreto, N. J. &Friston,K。J. Neuroimage(2005)。 咨询。 临床。(2008),Forte等。(2018),Mitchell和Beauchamp(1988),George和McCulloch(1993),Ishwaran和Rao(2005),Bottolo和Richardson(2010),Ročková和George(2014),Park和Park和Casella(2008),以及Carvalho等。(2014)。用于回归分析中的稀疏信号。该框架利用连续的收缩先验来实现全局稀疏性,同时控制每个系数的正则化量。该方法已广泛应用于各个领域,包括贝叶斯惩罚回归和多元变量选择。其他相关研究包括为高斯状态空间模型的随机模型规范搜索,在结构化添加回归模型中进行功能选择的尖峰和刻录式先验以及多个高斯图形模型的贝叶斯推断。L. F. B., Reich, B. J., Fuentes, M. & Dominici, F. Spatial variable selection methods for investigating acute health effects of fine particulate matter components are explored in the context of Biometrics (2015).MathSciNet MATH Google Scholar Additionally, research on Bayesian fMRI time series analysis with spatial priors is presented by Penny, W. D., Trujillo-Barreto, N. J.&Friston,K。J. Neuroimage(2005)。咨询。临床。Google Scholar Smith,M.,Pütz,B。,Auer,D。&Fahrmeir,L。Neuroimage(2003)中还讨论了通过空间贝叶斯变量选择评估大脑活动。Google Scholar此外,检查了Zhang,L。,Guindani,M.,Versace,F。&Vannucci,M。Neuroimage(2014)的时空非参数贝叶斯变量选择模型用于聚类相关时间课程。判断中信息处理的研究采用了各种方法,如Bolt等人的研究中所见,他们探讨了两种戒烟剂在联合使用的有效性,理由是J.Psychol。80,54–65,2012)。在类似的脉中,Billari等。基于贝叶斯范式内的专家评估(人口统计学51,1933–1954,2014)开发了随机人群预测模型。其他研究已经深入研究了暂时的生活变化及其对离婚时间的影响(Fallesen&Breen,人口统计学53,1377-1398,2016)。同时,Hansford等人。分析了美国律师将军在最高法院的政策领域的位置(Pres。螺柱。49,855–869,2019)。此外,研究重点是使用健康行为综合模型来预测限制“自由糖”消耗(Phipps等人,食欲150,104668,2020)。此外,研究还将贝叶斯统计数据引入了健康心理学,并强调了其在该领域的潜在好处(Depaoli等人,Health Psychol。修订版11,248–264,2017)。Psychol。Gen. 142,573–603,2013; Lee,M。D.,J。 数学。Gen. 142,573–603,2013; Lee,M。D.,J。数学。贝叶斯估计的应用已显示在各种情况下取代传统的t检验,包括认知建模和生态研究(Kruschke,J。Exp。Psychol。55,1-7,2011)。此外,层次结构的贝叶斯模型已在生态学中用于建模种群动态和推断环境参数(Royle&Dorazio,生态学的分层建模和推断)。通过包括Gimenez等人在内的各种研究人员的工作进一步开发了这种方法。(在标记人群中建模的人口统计过程中,3)和King等。(贝叶斯分析人群生态学)。研究还研究了贝叶斯方法在生态学中的使用,例如使用汉密尔顿蒙特卡洛(Monnahan等人,方法ECOL。Evol。8,339–348,2017)。贝叶斯对生态学的重要性的重要性已被埃里森(Elison)等研究人员(ecol。Lett。 7,509–520,2004)。 最后,已经探索了通过设计启发将专家意见整合到贝叶斯统计模型中,突出了其为先验知识提供信息并提高模型准确性的潜力(Choy等,生态学90,265-277,2009)。 也已经讨论了有关使用贝叶斯评估诊断人群下降的诊断人群下降的方法(King等,J。R. Stat。 Soc。 系列C 57,609–632,2008)。 在2008年至2020年的一系列出版物中介绍了统计生态技术的全面综述。 - Dennis等。 -McClintock等。Lett。7,509–520,2004)。最后,已经探索了通过设计启发将专家意见整合到贝叶斯统计模型中,突出了其为先验知识提供信息并提高模型准确性的潜力(Choy等,生态学90,265-277,2009)。也已经讨论了有关使用贝叶斯评估诊断人群下降的诊断人群下降的方法(King等,J。R. Stat。Soc。系列C 57,609–632,2008)。 在2008年至2020年的一系列出版物中介绍了统计生态技术的全面综述。 - Dennis等。 -McClintock等。系列C 57,609–632,2008)。在2008年至2020年的一系列出版物中介绍了统计生态技术的全面综述。- Dennis等。-McClintock等。总而言之,对判断中信息处理的研究以及贝叶斯统计在各个领域的应用,使人们对这些概念及其对决策和人口建模的影响有了更深入的了解。这些作品涵盖了种群建模的各个方面,包括贝叶斯估计,综合人群模型和遗传关联研究。关键论文包括: - King and Brooks(2008)关于贝叶斯对具有异质性和模型不确定性的封闭种群的估计。(2006)使用生态数据估计密度依赖性,过程噪声和观察误差。(2012)基于多阶段随机步行开发了一个一般的离散时间框架,用于动物运动。-Aeberhard等。(2018)对渔业科学的州空间模型进行了综述。其他值得注意的贡献包括: - Isaac等。(2020)讨论了大规模物种分布模型的数据集成。-McClintock等。(2020)提出了一种使用隐藏的马尔可夫模型来发现生态状态动力学的方法。- King(2014)审查了统计生态及其应用。- Andrieu等。(2010)引入了粒子马尔可夫链蒙特卡洛方法,用于复杂的种群建模。这些研究表明,从人口生存能力分析到遗传关联研究,在理解生态系统中采用的统计技术的多样性,强调了该领域数据整合和高级建模方法的重要性。提出一种利用转移学习以提高数据质量的方法。基因组学,统计和机器学习的交集在理解复杂的生物系统中变得越来越重要。最近的研究探索了多摩智数据集的整合,以发现对人类健康和疾病的新见解。由Argelaguet等人建立了整合多派数据集的框架,该框架采用贝叶斯方法来识别生物学过程的关键因素。该方法已应用于包括单细胞转录组学在内的各个领域,如Yau和Campbell的工作所示,他们使用贝叶斯统计学习来分析大型数据集。研究的另一个领域涉及在英国生物库中对跨树木结构的常规医疗数据进行遗传关联的分析。诸如Stuart和Satija的研究表明,将单细胞分析与基因组学相结合以揭示有关复杂生物系统的新信息的潜力。深层生成模型的发展也促进了单细胞转录组学的进步,如Lopez等人的工作所证明的那样,后者应用了深层生成模型来分析大型数据集。此外,与Wang等人一起,对单细胞转录组学中数据降解和转移学习的研究已显示出令人鼓舞的结果。最近的研究还强调了科学研究中可重复性和公平原则(可访问,可互操作和可重复使用)的重要性。这包括诸如癌症基因组图集和Dryad&Zenodo之类的举措,旨在促进开放研究实践。提出了功能性变分贝叶斯神经网络。机器学习技术(包括变异自动编码器)的应用也在理解复杂的生物系统方面变得越来越重要。正如Paszke等人的评论中所述,变化自动编码器为将基因组学和统计数据与深层生成模型的整合提供了有希望的方法。总体而言,多摩智数据集,机器学习技术和统计分析的进步的整合已经开辟了新的途径,以理解复杂的生物系统并揭示了对人类健康和疾病的新见解。概率建模的最新进展导致了几种将深度学习与贝叶斯推论相结合的技术的发展。该领域的一个关键概念是变异自动编码器(VAE),它通过将其映射到较低维度的空间中来了解输入数据的概率分布。Hinton等人引入的Beta-Vae框架将VAE限制为学习基本的视觉概念。研究人员还探索了贝叶斯方法在神经网络中的应用,例如高斯过程和周期性随机梯度MCMC。例如,尼尔在神经网络上的贝叶斯学习方面的工作突出了神经网络与高斯过程之间的联系。此外,已证明将深层合奏用于预测不确定性估计在各种任务中都是有效的。最近的预印象提出了新的新技术,包括功能变分贝叶斯神经网络和细心的神经过程。后者使用注意机制从输入数据中学习相关特征。res。另一项研究的重点是开发更可扩展和可解释的模型,例如标准化流量和周期性随机梯度MCMC。该领域在理解深度学习的理论基础上,包括神经网络与高斯过程之间的联系,也看到了重大进展。Mackay和Williams的作品为贝叶斯倒退网络提供了一个实用的框架,而Sun等人。总的来说,这些进步有助于我们理解概率建模及其在深度学习中的应用。Hoffman,M。D.&Gelman,A。 No-U-Turn采样器:在汉密尔顿蒙特卡洛(Monte Carlo)的自适应设置路径长度。 J. Mach。 学习。 15,1593–1623(2014)。MathScinetMath Google Scholar Liang,F。&Wong,W。H. Evolutionary Monte Carlo:CP模型采样和更改点问题的应用。 Stat。 Sinica 317-342(2000).liu,J。S.&Chen,R。动态系统的顺序蒙特卡洛方法。 J. am。 Stat。 合作。 93,1032–1044(1998).MathScinet Math Google Scholar Sisson,S.,Fan,Y。 &Beaumont,M。近似贝叶斯计算手册(Chapman and Hall/CRC 2018)。 J. R. Stat。 Soc。 系列B 71,319–392(2009).MathScinet Math Google Scholar Lunn,D。J.,Thomas,A。,Best,N。&Spiegelhalter,D。Winbugs - 贝叶斯建模框架:概念,结构和可扩展性。 Stat。 计算。Hoffman,M。D.&Gelman,A。No-U-Turn采样器:在汉密尔顿蒙特卡洛(Monte Carlo)的自适应设置路径长度。J. Mach。 学习。 15,1593–1623(2014)。MathScinetMath Google Scholar Liang,F。&Wong,W。H. Evolutionary Monte Carlo:CP模型采样和更改点问题的应用。 Stat。 Sinica 317-342(2000).liu,J。S.&Chen,R。动态系统的顺序蒙特卡洛方法。 J. am。 Stat。 合作。 93,1032–1044(1998).MathScinet Math Google Scholar Sisson,S.,Fan,Y。 &Beaumont,M。近似贝叶斯计算手册(Chapman and Hall/CRC 2018)。 J. R. 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................................................................................................................ 107 图 4.7:调节健康与健康关系的两个主要个人层面变量的交互图 ............................................................................................................................. 110 图 6.1:将宽格式数据转换为长格式,以便用单变量表示多变量结果 ......................................................................................................................... 127
规范场论是高能物理 (HEP) 领域的基础理论,在解决量子色动力学、电弱统一、希格斯机制甚至超标准模型物理等若干关键问题中发挥着至关重要的作用。在时空格子上离散化规范场论可得到格子场论,该理论能够对无法解析求解的复杂物理系统进行强大的数值模拟。因此,人们在开发经典硬件和算法方面取得了巨大进步,其中马尔可夫链蒙特卡罗 (MCMC) 技术是最受欢迎的技术之一。尽管经典数值方法取得了巨大成功,但由于所谓的符号问题,一些问题在某些重要参数范围内变得难以解决。最近的理论研究表明,可以通过利用量子算法来绕过这些障碍 [1,2]。例如,已经开发出几种针对 (1+1)、(2+1) 和 (3+1) 维规范场论的资源高效量子算法 [3-10]。然而,到目前为止,仅使用目前可用的噪声中型量子 (NISQ) 设备 [17] 对 (1+1) [11-15] 和 (2+1) [16] 的情况进行了原理验证演示。要实现使用量子计算机计算 (3+1) 维现象的宏伟目标,需要在量子硬件和控制方案上做出重大改进。由费米实验室领导的超导量子材料与系统 (SQMS) 中心致力于在量子计算和传感领域带来变革性进步。其核心目标是解决当前量子设备固有的退相干挑战,为增强型量子处理器和传感器铺平道路。该计划的核心是在 SQMS 中心内开发基于三维 (3D) 超导腔的数字量子计算系统,旨在解决重要的 HEP 问题。这些系统利用最初为加速器物理设计的 3D 超导射频 (SRF) 腔,与传统的 2D 超导设备相比具有明显的优势。首先,3D 腔的基本模式拥有超过两秒的寿命,使其非常适合存储和操纵量子信息 [18]。其次,高效的控制和读出方案显着降低了低温和室温硬件开销。最后,对大型希尔伯特空间的固有访问提供了直接编码“qudits”的潜力,与传统的两级(量子位)编码相比,在模拟中具有优势 [19]。本过程安排如下。在第 2 节中,我们简要回顾了超导电路,特别是用于 transmon 量子位的电路量子电动力学 (cQED) 架构。在第 3 节中,我们介绍了 3D SRF 量子计算系统,并在第 4 节中讨论了最近的实验进展,最后在第 5 部分进行总结性发言。
1. 小分子药物设计。小分子药物又称化学药物,是种类最广泛的药物。小分子药物设计分为两个阶段:从头设计和先导化合物优化。• 从头设计。从头药物设计旨在从头开始生产具有理想药理特性的新型、多样化药物分子。关键挑战是有效地遍历离散的化学空间。具体而言,为了规避药物分子的离散性质并减轻强力试错策略,[2]将离散药物分子放宽为可微分支架树 (DST),以使基于梯度的数值优化能够直接更新可微分分子,从而实现基于梯度的药物分子优化。实证研究表明,所提出的 DST 方法具有更高的样本效率,能够在数千次评估(Oracle 调用)中识别所需的分子。Oracle 调用可以是体内实验,也可以是体外实验,而且成本总是很高。这意味着我们的方法将大大降低药物设计的成本。此外,受遗传算法优越但不稳定的性能(由于随机游走行为)的启发,强化遗传算法 [ 1 ] 被设计用于抑制随机游走行为,该算法利用强化学习对有希望的搜索分支进行优先排序并智能地导航离散空间。 生成的分子可以紧密结合与某些重大疾病密切相关的目标蛋白,例如 PDB ID 为 7l11 的靶标,它是 SARS-COV-2(2019-NCOV)主蛋白酶。 此外,为了量化不确定性并彻底探索化学空间,多约束分子采样(MIMOSA)[ 15 ]将药物设计问题公式化为从药物空间上的目标分布中抽样的采样问题。 理想的药物分子具有较大的概率,然后设计一种马尔可夫链蒙特卡洛(MCMC)方法与预训练的图神经网络相结合,从目标分布中采样。 与最强基线相比,它获得了高达 49% 的改进。 • 先导化合物优化。先导化合物优化的目的是通过改善先导化合物的药学特性(如降低毒性、改善吸收)并保持其与先导化合物的相似性来增强先导化合物(通常是从头设计中最有前途的分子)。关键挑战在于满足多个约束条件。为了明确增强相似性约束,复制和细化策略(CORE)[17]旨在利用注意机制从输入的药物分子中选择现有的子结构(子结构是基本构建块),而不是在整个子结构空间中搜索。除了在多个任务中不断改进之外,CORE 在具有稀有子结构的分子中取得了尤为出色的表现,成功率提高了 11%。此外,先导化合物优化需要输入和输出药物分子的大小保持一致。为了满足这一要求,提出了带分子奖励的深度生成模型 (MOLER) [ 14 ],将约束条件代入学习目标中的可微损失函数中。这是一种与模型无关的方法,可以增强几乎所有深度生成模型。
MCMC.QPCRCCR软件包。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>2 amp.ff。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 4 Beckham.Data。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div> 。 div>2 amp.ff。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 div>。 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生成模型一直是机器学习研究中特别受关注的一个领域,成功的模型架构极大地改进了生成模型,包括变分自编码器 (VAE)、生成对抗网络 (GAN) 和可逆神经网络 (INN) [1-3]。除其他应用外,生成模型在事件生成中的应用也得到了广泛研究 [4-6]。与马尔可夫链蒙特卡洛 (MCMC) 技术 [7-11] 相比,生成模型的优势不仅限于提高推理速度,而后者迄今为止已成为领先的 LHC 模拟和解释方法。此外,生成模型可以进行端到端训练,从而实现更全面的应用,如展开 [12-14]、异常检测 [15-19] 等等 [20]。然而,这些神经网络 (NN) 的参数空间巨大,使其能够模拟复杂的交互,但这也导致对计算资源的需求巨大。流行的 NN 架构的规模早已达到计算可行性的边界。量子机器学习 (QML) 将量子计算的强大功能引入现有的机器学习基础,以建立并利用量子优势,从而实现量子算法独有的性能提升。虽然基于门的量子计算与经典计算有很大不同,但已经构建了许多与上述经典生成网络等效的模型,包括量子自动编码器 [ 21 ] 和量子 GAN [ 22 – 27 ]。值得注意的例外是 INN [ 28 , 29 ],它们尚未转移到 QML 领域。此类网络将成为量子神经网络 (QNN) 阵列的理想补充。虽然经典 INN 中雅可比行列式的可处理性使它们能够执行密度估计,这从本质上防止了模式崩溃,但通常无法有效地计算完整的雅可比矩阵 [ 30 ]。 INN 中完全可处理的雅可比矩阵(QNN 可用)将允许高效学习主要数据流形 [31-34],为可解释的表示学习和对底层过程的新洞察开辟机会。基于耦合的 INN 架构已通过经验证明对消失梯度问题更具弹性 [28],这使它们可以直接受益于具有许多参数的深度架构。然而,到目前为止列出的许多 INN 应用已经需要大量的训练资源。目前的研究表明,量子模型可以避免这种对巨大参数空间的需求。它们在表达力方面胜过常规 NN,能够用少得多的参数表示相同的变换 [35-39]。这一理论基础得到了几个专门构建的 QML 电路实例的支持,这些电路为专门设计的问题提供了比经典解决方案更有效的解决方案 [ 40 – 43 ]。QNN 已经成功应用于相对有限的高能物理问题 [ 21 , 25 , 44 – 46 , 46 – 51 ] 以及非 QML 方法 [ 52 – 56 ]。然而,据我们所知,尚未尝试构建可逆 QNN,该 QNN 可通过其可逆性用作生成任务的密度估计器。通过这项工作,我们旨在填补与经典 INN 量子等价的剩余空白,开发量子可逆神经网络 (QINN)。我们展示了如何将 QNN 流程中的每个步骤设计为可逆的,并展示了模拟网络估计分布密度的能力。作为原理证明,我们将我们的模型应用于最重要、研究最多的高能物理过程之一的复杂模拟 LHC 数据,pp → Z j → ℓ + ℓ − j,
图3。径向极化的QD激光是从杂种W TM -SLR纳米腔实现的。(a)在线性尺度上针对不同输入泵脉冲能的正常检测角度收集的发射光谱。插图:输出发射强度是对数字尺度上输入泵脉冲能量的函数。(b)激光发射光束的远场图案。白色箭头显示输出激光模式的极化方向。(c)在选定的极化方向下的光束轮廓。白色箭头在检测器前显示线性偏振器的偏振方向。(d)在p偏振光下的小波vector上模拟带结构。黑色圆圈指示k x = 0的w tm -slr模式。红色圆圈表示在非零K x处的W TM -SLR边带。(E)在W TM -SLR边带处模拟电场(| E | 2,单位为V 2 /M 2)。在模拟中将入射光E 0的电场设置为1 V/m。
